Thesis (Ph. D.)--Oregon State University, 2007. / Printout. Includes bibliographical references (leaves 133-145). Also available on the World Wide Web.

The theses serves as a comparison of different ways in the intensity of Brassica napus protection through the vegetational period. There were various protection types evaluated and their harmfulness was specified. Theses confronts the production of greenhouse gases emissions. The result is the surface unit emissive burden assesment and its conversion into the Brassica napus yield unit. These conclusions are based on the practical experiment which was realised in the farm located in Krty-Hradec village.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-04-06T17:42:20Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1006529 bytes, checksum: 7480e1c923178c38b0f2c5a20b2d49e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-06T17:42:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1006529 bytes, checksum: 7480e1c923178c38b0f2c5a20b2d49e7 (MD5) Previous issue date: 2016-09-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Os fungos fitopatogênicos são um grupo importante de microrganismos responsáveis por perdas significativas na agricultura em todo o mundo. A capacidade que alguns apresentam de infectar todas as partes da planta, bem como a capacidade de sobrevivência no solo os torna um importante grupo de fitopatógenos. O controle de doenças causadas por fungos geralmente requer medidas que utilizam tratamentos químicos, o que gera um impacto ambiental e à saúde humana. Micovírus são vírus que infectam fungos. Alguns micovírus apresentam capacidade de tornar seus hospedeiros hipovirulentos e ainda são capazes de transferir essa propriedade a outros isolados compatíveis. O controle de fungos fitopatogênicos com micovírus constitui uma alternativa que pode reduzir o uso do controle químico. Além disso, pode ser eficaz contra doenças para as quais não há controle químico nem plantas resistentes disponíveis. Assim o objetivo desse trabalho foi acessar a diversidade de micovírus associada a fungos fitopatogênicos e estudar o impacto desses vírus sobre a fisiologia dos hospedeiros. Foi investigada a presença de micovírus em isolados fúngicos obtidos em coleções de culturas, feira livre e também do campo em plantas sintomáticas. Dos 42 isolados fúngicos analisados, 11 (26%) continham dsRNA. Todos com distintos padrões de dsRNA, observados por eletroforese em gel de agarose. Em um isolado de Chalara elegans, agente causal da podridão negra em raiz, foi detectado presença de partículas icosaédricas com 33 nanômetros de diâmetro. SDS-PAGE a partir do purificado viral revelou a presença de três proteínas estruturais com massa molecular estimada em 38, 40 e 45 kDa. Também foi realizada a caracterização molecular e biológica de um micovírus obtido a partir do fungo Sclerotinia sclerotiorum isolado Ss24, agente causal do mofo branco, doença presente em diversas espécies de plantas. O genoma possui 2.700 nucleotídeos e apresenta uma única sequência aberta de leitura (ORF) que codifica uma RNA polimerase dependente de RNA, com domínios conservados na superfamília de RdRps de mitovirus, um grupo de vírus que replica em mitocôndrias das células hospedeiras. Análises filogenéticas indicam que o vírus detectado é um novo membro do gênero Mitovirus. Análise do perfil de bandas de dsRNA obtido a partir do isolado Ss24 sugere que há uma co-infecção por mais de um micovirus. Uma linhagem isogênica obtida por reprodução sexuada do isolado Ss24 revelou um padrão diferente do seu parental. Ambos, parental (Ss24) e isolado isogênico (Ss24MVF) foram comparados quanto produção de escleródios, ácidos totais, ácido oxálico, taxa de crescimento, morfologia e pigmentação das colônias e patogenicidade em plantas de Phaseolus vulgaris, Capsicum annuum e Nicotiana benthamiana. Os resultados revelaram que o isolado Ss24 foi severamente debilitado em todas as características fisiológicas analisadas quando comparado com o isolado Ss24MVF. Maior concentração de mitocôndrias nas hifas também foi observado no isolado Ss24. Em conjunto estes resultados confirmam que os vírus que infectam fungos estão distribuídos nas diferentes espécies de fungos. A presença de determinados segmentos de dsRNA pode conduzir o fenótipo da hipovirulência em fungos. Uma análise mais aprofundada sobre as características destes micovírus podem levar ao desenvolvimento de ferramentas para estudos sobre os mecanismos de patogenicidade dos fungos, bem como a utilização desses vírus como agentes de controle biológico. / The phytopathogenic fungi are an important group of microorganisms responsible for significant losses in agriculture throughout the world. The ability that some have to infect all parts of the plant, as well as the ability to survive in the soil becomes an important phytopathogens group. The control of disease caused by fungi usually requires measures using chemical treatments leading an environmental impact and to human health. Mycovirus are viruses that infect fungi. Some mycovirus present ability to make their hipovirulentos hosts and are still able to transfer that property to other compatible isolated. The control of pathogenic fungi with mycovirus is an alternative that can reduce the use of chemical control. Furthermore, it may be effective against diseases for which no chemical control or resistant plants available. So the aim of this study was to access the mycovirus diversity associated with pathogenic fungi and to study the impact of these viruses on the physiology of the host. The presence of mycovirus in fungal isolates from culture collections, free fair and also the field in symptomatic plants was investigated. Of the 42 fungal isolates analyzed, 11 (26%) contained dsRNA. All isolates showed patterns different dsRNA observed by agarose gel electrophoresis. A strain Chalara elegans, the causal agent of black rot on root was detected the presence of icosahedral particles 33 nanometers in diameter. SDS-PAGE from purified viral revealed the presence of three structural proteins with molecular weight estimated at 38, 40 and 45 kDa. Was performed the molecular and biological characterization of a mycovirus obtained from the fungus Sclerotinia sclerotiorum strain Ss24, causal agent of white mold, disease present in several plant species. The genome has 2.700 nucleotides and a single open reading frame sequence (ORF) encoding a RNA-dependent RNA polymerase with conserved domains of the superfamily of RdRps mitovirus, a group of viruses that replicate in mitochondria of host cells. Phylogenetic analysis indicate that the virus detected is a new member of the genus Mitovirus. Analysis of the profile segments dsRNA obtained from strain Ss24 suggests that there is coinfection by more than one mycovirus. An isogenic strain obtained by sexual reproduction (Ss24MVF) revealed a different pattern of their parent strain. Both Ss24 and isogenic strains Ss24MVF were compared for sclerotia, total acid, oxalic acid production, growth rate, morphology and pigmentation of colonies and pathogenicity in plants of Phaseolus vulgaris, Capsicum annuum and Nicotiana benthamiana. The results revealed that the strain Ss24 was severely impaired in all analyzed physiological characteristics compared with the single Ss24MVF. Higher concentration of mitochondria in hyphae were observed on strain Ss24. Together, these results confirm that viruses that infect fungi are distributed in different species of fungi. The presence of certain segments of dsRNA can drive the phenotype of hypovirulence fungi. A detailed analysis of the characteristics this is mycovirus can lead to the development of tools for studies on fungi pathogenic mechanisms, and the use of these viruses as biological control agents.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:05:20Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo4542_1.pdf: 1133484 bytes, checksum: 03b12c365166ce3194891b4f41966c86 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2005 / Dentre as doenças que afetam a cultura do feijão, o mofo branco causado por Sclerotinia sclerotiorum é uma das mais importantes, principalmente em sistemas de cultivo que adotam a agricultura irrigada. Quatro isolados de Sclerotinia sclerotiorum, sendo três provenientes de plantas cultivadas com sintomas do mofo branco (Ss11-feijão; Ss17-alface e Ss5-soja) e um de solo (806), foram avaliados quanto a patogenicidade a plantas de feijão, variedade IPA-10. Todos os isolados testados revelaram-se patogênicos e apenas o isolado Ss5 foi estatisticamente inferior aos demais. Também foi avaliado o controle biológico in vitro pelo método de pareamento em placas de Petri utilizando-se oito isolados de Trichoderma e um de Ulocladium atrum, além do controle químico in vitro, por meio do crescimento micelial dos isolados de S. sclerotiorum em meio BDA, acrescido dos fungicidas Cercobin (Tiofanato metílico), Rovral (Iprodione) e Derosal (Carbendazim) em quatro concentrações distintas do ingrediente ativo (1, 10, 50 e 100 ppm). Com exceção de U. atrum, todos os isolados de Trichoderma revelaram potencial antagônico contra S. sclerotiorum, destacando-se T. harzianum (3601) como o de melhor desempenho. Quanto ao controle químico, Cercobin (Tiofanato metílico) foi o mais eficiente inibindo de forma satisfatória o crescimento micelial do patógeno, sendo este fungicida e o isolado 3601 selecionados para a comparação entre os controles químico e biológico in vivo de S. sclerotiorum em plantas de feijão, variedade IPA-10, em casa-de-vegetação. O antagonista foi aplicado ao solo veiculado em arroz autoclavado, numa concentração de 2 g/Kg de solo em diferentes períodos (antes do patógeno, juntamente com o patógeno e após o patógeno), enquanto o fungicida foi aplicado de acordo com as recomendações do fabricante. Houve diferença estatística entre os tratamentos, sendo a aplicação do fungicida e do antagonista realizadas antes do patógeno os mais eficientes, reduzindo o percentual de patogenicidade em 32,94% e 37,04%, respectivamente

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-11-06T10:45:38Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 540165 bytes, checksum: 9877027d82d0ea9a1113de35015c86b7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-06T10:45:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 540165 bytes, checksum: 9877027d82d0ea9a1113de35015c86b7 (MD5) Previous issue date: 2018-07-23 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O mofo-branco (MB), causado pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, é a principal doença do feijoeiro no outono-inverno. A resistência genética é uma das principais ferramentas no manejo do MB. Nosso objetivo foi avaliar o desempenho, a resistência de campo ao MB e as características envolvidas na resistência de escape com o uso de linhagens/cultivares de feijão selecionados de ensaios de Valor de Cultivo e Uso (VCUs) conduzidos entre 2008 e 2016 em áreas com histórico dessa doença. Dois ensaios (Viçosa e Oratórios) foram conduzidos no outono-inverno de 2017, com irrigação por aspersão, em área com histórico de MB. Doze linhagens/cultivares foram selecionadas nos VCUs por apresentarem resistência parcial ao MB; as cultivares Pérola e Estilo, por apresentarem resistência moderada; e as cultivares Ouro Negro, Majestoso e Ouro Vermelho, por apresentarem suscetibilidade ao MB. Também foram incluídas linhagens internacionais com reconhecida resistência parcial ao MB: A 195, G 122 e Cornell 605. O delineamento foi em blocos ao acaso, com quatro repetições. A pressão de MB foi alta em Oratórios e moderada/alta em Viçosa, com produtividades médias de 2733 e 2453 kg.ha -1 , respectivamente. As linhagens CNFC 10432 e CNFP 11990, selecionadas como parcialmente resistentes ao MB, ficaram entre as mais produtivas e com as plantas mais altas. Além disso, essas duas linhagens apresentaram menores IMB, ISMB, acamamento e produção de escleródios. As linhagens internacionais, especialmente A 195 e G 122, ficaram no grupo com menor IMB e ISMB, mas foram menos produtivas que as linhagens selecionadas para resistência parcial ao MB. O fechamento de fileiras só diferenciou as linhagens internacionais que são do tipo I dos demais genótipos que são dos tipos II e III. A associação entre IMB e ISMB foi muito alta (r > 0,90). A baixa produtividade das linhagens internacionais reconhecidamente resistentes ao MB e a suscetibilidade de algumas linhagens à antracnose, a qual camuflou os sintomas de MB, explicam a baixa ou a inexistência de correlação entre produtividade e ISMB. O acamamento apresentou correlação positiva com ISMB: foi moderada em Oratórios e fraca em Viçosa. A correlação entre fechamento de fileiras e ISMB foi positiva e moderada. Altura de plantas e ISMB correlacionaram-se fracamente (r = -0,20) em Oratórios e não significativamente em Viçosa. Os resultados sugerem que acamamento e fechamento de fileiras tiveram maior associação com ISMB que altura de plantas. As linhagens CNFC 10432 e CNFC 11990 apresentam alta produtividade, resistência parcial ao MB e características de plantas que favorecem essa resistência. / White mold (WM), caused by fungus Sclerotinia sclerotiorum, is the main common bean disease of fall-winter. Genetic resistance is one of the main tools in WM management. Our objective was to evaluate the performance, the field resistance to WM and the characteristics involved in resistance of escape with the use of bean lines/cultivars selected from trials of Value for Cultivation and Use (VCUs) conducted between 2008 and 2016 in areas with history of this disease. Two trials (Viçosa and Oratórios) were conducted in the fall-winter of 2017, with sprinkler irrigation, in an area with a history of WM. Twelve lines/cultivars were selected in the VCUs because they presented partial resistance to WM; the cultivars Pérola and Estilo, for presenting moderate resistance; and the cultivars Ouro Negro, Majestoso and Ouro Vermelho, due to their susceptibility to WM. International lines with recognized partial resistance to WM were also included: A 195, G 122 and Cornell 605. The randomized complete block design with four replicates was used. The WM pressure was high in Oratórios and moderate/high in Viçosa, with average yield of 2733 and 2453 kg.ha -1 , respectively. The lines CNFC 10432 and CNFP 11990, selected as partially resistant to WM, were among the most yield and with the highest plants. In addition, these two lines presented the lowest WMI, WMSI, lodging and sclerotia production. The international lines, especially A 195 and G 122, were in the group with lower WMI and WMSI, but were less yield than the lines selected for partial resistance to WM. The canopy closure only differentiated the international lines that are of type I of the others genotypes that are of types II and III. The association between WMI and WMSI was very high (r > 0.90). The low yield of international lines with recognized resistance to WM and the susceptibility of some lines to anthracnose, which camouflaged WM symptoms, explain the low or no correlation between yield and WMSI. The lodging presented positive correlation with WMSI: was moderate in Oratórios and weak in Viçosa. The correlation between canopy closure and WMSI was positive and moderate. Canopy height and WMSI presented weak correlation (r = -0.20) in Oratórios and was non-significant in Viçosa. The results suggest that lodging and canopy closure had greater association with WMSI than canopy height. The lines CNFC 10432 and CNFC 11990 present high yield, partial resistance to WM and characteristics of plants that favor this resistance.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-13T12:06:52Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 907973 bytes, checksum: 02a626fc75495ec20f6054c31c8939c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-13T12:06:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 907973 bytes, checksum: 02a626fc75495ec20f6054c31c8939c7 (MD5) Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Um dos fatores limitantes na produção da soja é o fungo Sclerotinia sclerotiorum, causador da podridão branca da haste (PBH). A produtividade é comprometida quando há condições de temperaturas entre 18 e 22 Co e umidade relativa acima de 80%. Ainda não é conhecido genótipo imune à S. sclerotiorum. Contudo, muitos estudos em casa de vegetação com o método de inoculação straw test tem sido feitos para seleção de genótipos com resistência fisiológica ao fungo. A associação genômica ampla (GWAS) vem facilitando a detecção de genes e QTLs (Quantitative Trait Loci) responsáveis por características agronômicas, por meio da utilização de marcadores SNPs (single nucleotide polymorphism). Nosso objetivo foi realizar GWAS em 146 cultivares brasileiras e identificar SNPs, QTLs e genes relacionados com a resistência fisiológica à PBH em soja. Foram obtidos notas e o comprimento de lesão aos 3, 7, 10 e 14 dias após inoculação (DAI). Com a progressão da doença obtida a partir da diferença entre os dias de avaliação de comprimento de lesão e com as notas, pôde-se observar 25 e 10 SNPs significativos em 2016 e 2017, respectivamente, distribuídos em 14 cromossomos diferentes. Houve 6 SNPs localizados em QTLs já descritos. Haplótipos baseados nos marcadores significativos confirmaram a baixa contribuição dos SNPs quando analisados separadamente para resistência fisiológica à PBH. Com base nos SNPs detectados neste estudo, foram confirmados 67 genes candidatos em 2016 e 23 genes candidatos em 2017 para resistência a doenças. Esses resultados reforçam o fato de que esta é uma característica complexa, relacionada com muitos genes. Os resultados ainda sugerem que sob diferentes condições ambientais o patógeno é capaz de suprimir genes da soja, aumentando a susceptibilidade da cultura ao fungo. No entanto, ainda são necessários estudos de validação dos SNPs encontrados para utilização em seleção assistida e programas de melhoramento no futuro. / One of the limiting factors on soybean production is the White Mold (WM), caused by fungus Sclerotinia sclerotiorum. Yield is compromised when conditions are temperature between 18 and 22 Co and relative humidity above 80%. Moreover, immune genotype is unknow to S. sclerotiorum. However, many greenhouses studies using the straw test method have been done to select genotypes with physiological resistance to the fungus. Genome wide association studies (GWAS) has been making it easier to detect genes and QTLs (Quantitative Trait Loci) responsible for agronomic traits, by using SNPs (single nucleotide polymorphism) markers. Our objective was to do GWAS in 146 Brazilians cultivars and to identify SNPs, QTLs and genes associated with WM physiological resistance in soybean. Notes and lesion length were obtained at 3, 7, 10 and 14 days after inoculation (DAI). With the disease progression obtained from the difference between the days of evaluation of lesion length and with the notes, it can be observed 25 and 10 significant SNPs in 2016 and 2017, respectively, distributed in 14 different chromosomes. There were 6 SNPs located in QTLs already described. Haplotypes based on significant markers have confirmed the low contribution of SNPs when analyzed separately for physiological resistance to WM. Based on detected SNPs in this study, 67 candidate genes in 2016 and 23 candidate genes in 2017 were confirmed for resistance to diseases. These results reinforce the fact that physiological resistance to WM is a complex trait, associated with many genes. The results still suggest that in different conditions the pathogen is capable of suppressing soybean genes, increasing the susceptibility of the crop to the fungus. However, more studies are necessary for validation of SNPs found for use in assisted selection and breeding programs in the future.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-05T15:38:29Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 489618 bytes, checksum: 7609724ea0ef2f3496bf38ea80688185 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-05T15:38:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 489618 bytes, checksum: 7609724ea0ef2f3496bf38ea80688185 (MD5) Previous issue date: 2015-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O mofo-branco (MB), causado pelo fungo Sclerotinia sclerotiorum, é doença séria em lavouras irrigadas de feijão. O uso de cultivares com resistência parcial ao MB faz parte do manejo da doença, e pode reduzir aplicações de fungicida para seu controle. Avaliou-se a possibilidade de se reduzir as aplicações de fungicida em genótipo com resistência parcial ao MB. Ensaios foram conduzidos em três municípios (Coimbra, Viçosa e Oratórios) da Zona da Mata de Minas Gerais, no outono-inverno, com irrigação por aspersão, em área com histórico de MB. Os tratamentos foram dispostos no arranjo fatorial 3 x 4: genótipos (VC 17, Pérola ou BRSMG Madrepérola) e aplicações de fungicida (0, 1, 2 ou 3). A linhagem VC 17 está entre os genótipos com maior resistência de campo ao MB. A cultivar Pérola apresenta resistência moderada e a cultivar BRSMG Madrepérola é suscetível. O fungicida fluazinam (0,625 L/ha) foi aplicado na floração e repetido entre 7 e 10 dias depois. Foi usado o delineamento em blocos ao acaso, com quatro repetições. Em média, a intensidade (incidência + severidade) do MB variou de baixa (Coimbra) a moderada/alta (Oratórios); e a produtividade de grãos, de 2638 a 3556 kg/ha. Em Viçosa e Oratórios a pressão da antracnose foi alta, e esse foi um dos fatores responsáveis pela menor produtividade dos genótipos Pérola e VC 17, em relação à cultivar BRSMG Madrepérola. Em Viçosa, o VC 17 exibiu menos sintomas de MB que as cultivares Pérola e BRSMG Madrepérola. Em Coimbra e Oratórios, os sintomas de MB nos genótipos VC 17 e Pérola foram semelhantes, mas, em geral, esses genótipos foram menos prejudicados por essa doença que a cultivar BRSMG Madrepérola. Em Oratórios, houve significativa redução dos sintomas de MB com duas aplicações do fungicida, independente do genótipo, enquanto em Coimbra só a BRSMG Madrepérola teve redução do MB, com uma aplicação do fungicida. Em Viçosa, a cultivar BRSMG Madrepérola teve redução da doença com até duas aplicações do fluazinam, enquanto a cultivar Pérola apresentou redução do MB com uma aplicação. Nesse município, o VC 17 não teve redução do MB com o uso de fungicida. Portanto, os resultados de Coimbra, em que houve baixa pressão de MB, e de Viçosa (baixa/moderada intensidade de MB) sustentam, parcialmente, a nossa hipótese de que genótipos com alta resistência parcial ao MB necessitam de menor número de aplicações de fungicida em relação a genótipos com baixa resistência parcial. Entretanto, os resultados obtidos em Oratórios, onde a intensidade do MB foi moderada/alta não sustentam nossa hipótese. Os efeitos da antracnose, além dos efeitos do MB, influenciaram a produtividade, o que comprometeu, em parte, o nosso estudo. Logo, estudos adicionais, com bom controle de doenças foliares, sobretudo com alta pressão do MB, são necessários para testar com maior precisão essa hipótese. / White mold (WM), caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum, is a serious disease in irrigated bean crops. The use of cultivars with partial resistance to WM is part of disease management, and can reduce fungicide applications for its control. We evaluated the possibility of reducing fungicide applications in genotype with partial resistance to WM. Trials were conducted in three districts (Coimbra, Viçosa and Oratórios) of Zona da Mata region, State of Minas Gerais, in the fall-winter, with sprinkler irrigation in an area with a history of WM. The treatments were arranged in factorial 3 x 4: genotypes (VC 17 Pérola or BRSMG Madrepérola) and fungicide applications (0, 1, 2 or 3). The line VC 17 is among the genotypes with higher field resistance to WM. The cultivar Pérola has intermediate resistance and the cultivar BRSMG Madrepérola is susceptible. The fungicide fluazinam (0.625 L/ ha) was applied in the flowering and repeated between 7 and 10 days after. A randomized block design with four replications was used. On average the intensity (severity + incidence) of WM ranged from low (Coimbra) to moderate/high (Oratórios); and grain yield, from 2638 to 3556 kg/ha. In Viçosa and Oratórios, the pressure of anthracnose was high, and this was one of the factors responsible for the lower yield of the genotypes Pérola and VC 17, in relation to the cultivar BRSMG Madrepérola. In Viçosa, the line VC 17 showed fewer symptoms of WM than the cultivars Pérola and BRSMG Madrepérola. In Coimbra and Oratórios, the symptoms of WM in the genotypes VC 17 and Pérola were similar, but in general these genotypes were less affected by this disease than the cultivar BRSMG Madrepérola. In Oratórios, symptoms of WM reduced significantly with two fungicide applications, regardless of the genotype, while in Coimbra only BRSMG Madrepérola has a reduction of WM with one fungicide application. In Viçosa, the cultivar BRSMG Madrepérola had reduction of disease with up to two fluazinam applications, while the cultivarPérola had reduction of WM with one application. In this district, the line VC 17 had no reduction of WM with fungicide. Therefore, the results of Coimbra, where there was low pressure of WM, and Viçosa (low/moderate intensity of WM) support, in part, our hypothesis that genotypes with high partial resistance to WM require fewer fungicide applications compared to genotypes with low partial resistance. However, the results obtained in Oratórios, where the intensity of WM was moderate/high did not support our hypothesis. The effects of anthracnose, besides the effects of WM affected yield, which compromised, in part, our study. Thus, additional studies with good control of foliar diseases, especially with high pressure of WM, are required to test this hypothesis with higher accuracy.

This dissertation contains three research chapters conducted on Sclerotinia stem rot (SSR) of canola (Brassica napus L.). This disease is caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum and is considered endemic in canola-producing areas of North Dakota. The first research chapter presents results of a study that evaluated the role of eight phenotyping scoring systems and nine variant calling and filtering methods in detection of QTL associated with response to SSR. The study, conducted on two doubled-haploid mapping populations, showed that using multiple phenotypic data sets derived from lesion length and plant mortality and imputing missing genotypic data increased the number of QTL detected without negatively affecting the effect (R2) of QTL. Nineteen QTL were detected on chromosomes A02, A07, A09, C01, and C03 in this study. The second research chapter presents results of a work that assessed the role of temperature regimes and wetness duration on S. sclerotiorum ascospore germination and ascosporic infection efficiency. This study showed that optimum ascospore germination occurred at 21 °C while it significantly decreased at 10 and 30 °C. Infection efficacy experiments indicated that extreme temperatures and interrupting wet periods were detrimental for the disease development. A logistic regression model with 75% accuracy was developed for the disease perdition. The third research chapter presents results of a study that evaluated the role of temperature on mycelial growth of 19 S. sclerotiorum isolates collected from different geographical regions and on SSR development on plant introduction (PI) lines with different levels of resistance. Mycelial growth and disease development peaked at 25 °C. While lesion expansion on resistant cultivars and the susceptible check was negatively affected at 30 °C, the disease developed significantly on the PI with a high level of susceptibility. Results of these studies provide insights into integrated management strategies of SSR.

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