Orientador: Antonio Leão Castilho / Abstract: The present study was divided into two chapters that aimed to verify the spatiotemporal abundance of juveniles and adults, analyzing how the variation of the environmental factors (salinity, water temperature, rainfall, phi, organic matter) affect the distribution patterns and describe the population dynamics of Litopenaeus schmitti in Cananéia, south coast of the São Paulo state, Brazil. With a shrimp boat the shrimp and environmental factors were sampled monthly from July 2012 to May 2014, covering both the marine and estuarine environment. In the laboratory, shrimps were separated according to sex, measured on carapace length (CC) and classified for gonadal development stage. Growth and longevity were estimated from the von Bertalanffy equation and the sex ratio was tested by applying the Binomial test. A total of 1102 individuals were collected, 273 juveniles and 829 adults, with CC ranging from 16.7 to 39.6 mm in males and 16.7 to 44.9 mm in females. Adults were captured predominantly in sampling stations with marine influence, while juveniles were found in all sampling stations, especially those with estuarine influence. The presence of the majority of juvenile individuals in the estuarine environment evidences the importance of the estuary in the ontogeny and protection of the species, since this environment presents physical barriers (wide variation of salinity) for its predators. The environmental factor that most influenced the juveniles was the temperature and the... (Complete abstract click electronic access below) / Resumo: O presente estudo foi dividido em dois capítulos que tiveram como objetivos verificar a abundância espaço-temporal de juvenis e adultos, analisando como a variação dos fatores ambientais (salinidade, temperatura da água, pluviosidade, phi, matéria orgânica) afetam os padrões de distribuição da espécie, e descrever a dinâmica populacional de Litopenaeus schmitti em Cananéia, litoral sul do estado de São Paulo, Brasil. Com um barco camaroeiro os camarões e os fatores ambientais foram amostrados mensalmente de julho de 2012 a maio de 2014, abrangendo tanto o ambiente marinho quanto o estuarino. Em laboratório, os camarões foram separados quanto ao sexo, mensurados quanto ao comprimento da carapaça (CC) e classificados quanto ao estágio de desenvolvimento gonadal. O crescimento e a longevidade foram estimados a partir da equação de Von Bertalanffy e a razão sexual foi testada aplicando-se o teste Binomial. Um total de 1102 indivíduos foi coletado, sendo 273 juvenis e 829 adultos, com o CC variando de 16,7 a 39,6 mm nos machos e 16,7 a 44,9 mm nas fêmeas. Os adultos foram capturados predominantemente nas estações amostrais com influência marinha, enquanto que os juvenis foram encontrados em todas as estações amostrais, com destaque as que possuíam influência estuarina. A presença da maioria dos indivíduos juvenis no ambiente estuarino evidencia a importância do estuário na ontogenia e proteção da espécie, uma vez que este ambiente apresenta barreiras físicas (ampl... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

A fragmentação e a redução do habitat são as principais causas do declínio populacional e de biodiversidade no mundo, seguidas pela sobrecaça. Essas perturbações levaram a família Cracidae ao posto de família de aves mais ameaçada das Américas. Diversos programas de reintrodução já foram conduzidos com cracídeos no Brasil, a começar pela reintrodução do mutum-do-sudeste (Crax blumenbachii Spix, 1825) na Fazenda Macedônia (FM) em Ipaba, MG. O objetivo deste trabalho foi estimar o tamanho e a densidade populacional e a razão sexual dos mutuns existentes na FM e analisar o uso da paisagem pela espécie. Os dados foram coletados ao longo de 6 meses por transecção linear (esforço amostral: 280 km) e analisados segundo protocolos de amostragem por distância linear e ocupação. O tamanho populacional foi estimado em 34 (10 111) indivíduos e a densidade em 2,36 (1,58 7,79) indivíduos/km². Entretanto, a proporção de área utilizada foi estimada em 21%, indicando que a densidade para as áreas realmente ocupadas pode ser mais alta. A intensidade de uso da área parece estar correlacionada principalmente à densidade do sub-bosque e à oferta de suplementação alimentar. A taxa de crescimento populacional foi estimada em -0,047 (-0,137 0,018), o que indica um declínio. É possível que este declínio esteja ligado ao tamanho reduzido da população, que a torna mais susceptível à estocasticidade demográfica, ambiental e genética e ao efeito Allee. Os mesmos fatores também podem estar provocando um desvio na razão sexual, estimada em 0,35 (0,20 0,47). / Fragmentation and habitat loss are the two main causes of population and biodiversity decline, followed by overhunting. Such impacts made the Cracidae family the most endangered bird family in American continents. In Brazil, many reintroduction programs focused on cracids. The first one reintroduced the Red-billed Curassow (Crax blumenbachii Spix, 1825) in Ipaba, MG, Brazil. This work aimed to estimate the population size and density, the sex ratio and the landscape use of the Red-billed Curassow population reintroduced in Ipaba. We collected the data along 6 months through line-transects, totalizing 280 km of effort. The analysis followed distance sampling and occupancy protocols. We estimated the population size in 34 (10 111) birds and the density was 2.36 (1.58 7.79) birds/ha. However, we estimated the proportion of area effective used in 21%, what means that the density for such area might be higher. Apparently, the intensity of habitat use is mostly correlated to the understory density and to food supplementation. We estimated the population growth rate in -0.047 (-0.137 0.018), what indicates a decrease. Its possible that the population is declining due to its size, once small populations are more likely to suffer because of demographic, environmental and genetic stochasticity and Allee effect. The same factors might explain the skewed sex ratio, estimated in 0.35 (0.20 0.47).

A fragmentação e a redução do habitat são as principais causas do declínio populacional e de biodiversidade no mundo, seguidas pela sobrecaça. Essas perturbações levaram a família Cracidae ao posto de família de aves mais ameaçada das Américas. Diversos programas de reintrodução já foram conduzidos com cracídeos no Brasil, a começar pela reintrodução do mutum-do-sudeste (Crax blumenbachii Spix, 1825) na Fazenda Macedônia (FM) em Ipaba, MG. O objetivo deste trabalho foi estimar o tamanho e a densidade populacional e a razão sexual dos mutuns existentes na FM e analisar o uso da paisagem pela espécie. Os dados foram coletados ao longo de 6 meses por transecção linear (esforço amostral: 280 km) e analisados segundo protocolos de amostragem por distância linear e ocupação. O tamanho populacional foi estimado em 34 (10 111) indivíduos e a densidade em 2,36 (1,58 7,79) indivíduos/km². Entretanto, a proporção de área utilizada foi estimada em 21%, indicando que a densidade para as áreas realmente ocupadas pode ser mais alta. A intensidade de uso da área parece estar correlacionada principalmente à densidade do sub-bosque e à oferta de suplementação alimentar. A taxa de crescimento populacional foi estimada em -0,047 (-0,137 0,018), o que indica um declínio. É possível que este declínio esteja ligado ao tamanho reduzido da população, que a torna mais susceptível à estocasticidade demográfica, ambiental e genética e ao efeito Allee. Os mesmos fatores também podem estar provocando um desvio na razão sexual, estimada em 0,35 (0,20 0,47). / Fragmentation and habitat loss are the two main causes of population and biodiversity decline, followed by overhunting. Such impacts made the Cracidae family the most endangered bird family in American continents. In Brazil, many reintroduction programs focused on cracids. The first one reintroduced the Red-billed Curassow (Crax blumenbachii Spix, 1825) in Ipaba, MG, Brazil. This work aimed to estimate the population size and density, the sex ratio and the landscape use of the Red-billed Curassow population reintroduced in Ipaba. We collected the data along 6 months through line-transects, totalizing 280 km of effort. The analysis followed distance sampling and occupancy protocols. We estimated the population size in 34 (10 111) birds and the density was 2.36 (1.58 7.79) birds/ha. However, we estimated the proportion of area effective used in 21%, what means that the density for such area might be higher. Apparently, the intensity of habitat use is mostly correlated to the understory density and to food supplementation. We estimated the population growth rate in -0.047 (-0.137 0.018), what indicates a decrease. Its possible that the population is declining due to its size, once small populations are more likely to suffer because of demographic, environmental and genetic stochasticity and Allee effect. The same factors might explain the skewed sex ratio, estimated in 0.35 (0.20 0.47).

Informações sobre o uso do espaço são importantes para o entendimento de processos ecológicos que envolvem uma espécie e a determinação de seu estado de conservação. Tais informações são escassas para o gênero Mazama, o mais diverso entre os cervídeos neotropicais, sendo que desenvolver metodologias para obtenção de dados ecológicos do gênero torna-se fundamental para qualquer ação de manejo envolvendo o grupo. O estudo do DNA fecal surge como uma ferramenta importante para viabilizar a coleta sistemática de informações sobre o gênero. Assim, o presente trabalho visou a estimar a área de vida e a seleção de hábitat do veado-catingueiro, comparando duas metodologias, com intuito de avaliar a aplicação do DNA fecal como alternativa para se estudar a espécie. O trabalho contou com 6 animais que tiveram suas localizações obtidas a cada 13 horas por colares GPS, no período de um ano. Nesse mesmo período e na mesma área, foram coletadas mensalmente amostras fecais, gerando um total de 830 amostras, cujo DNA foi extraído para identificação genética. A espécie das amostras foi determinada com o uso de um marcador mitocondrial (cit-b), e a identificação individual, com um painel de 11 microssatélites. Os valores de área de vida pelo método do MPC 95% variaram de 33 ha a 97 ha, e pelo método Kernel com 95% das localizações, variaram de 17 ha a 77 ha. Observou-se que as áreas de vida são alocadas nos diferentes habitats da região conforme o disponível (p = 0,072), porém são utilizadas internamente de forma selecionada (p=0,001). Neste nível, a espécie apresentou preferência pelos hábitats de cerrado e campo cerrado e evitou o campo (p < 0,005). Foram identificadas 670 amostras de veado-catingueiro e 15 genótipos únicos. A análise espacial das fezes também sugeriu uso desproporcional dos hábitats em relação à sua disponibilidade, sendo que a comparação direta entre os dois métodos revelou iguais distribuições no nível de espécie (p=0,178). As amostras individualizadas sugeriram um padrão de alta sobreposição de área de uso por diferentes indivíduos, mas avanços são necessários para melhor elucidar a questão. Perante os resultados observados, entende-se que há muito em se avançar na análise molecular das fezes que, realizada em larga escala, pode fornecer respostas importantes anteriormente inviáveis para espécies florestais. / Space use information is a key element to understand the ecological processes regarding a species and its conservation status. Such information is scarce for the genus Mazama, the most diverse group among Neotropical deer. The development of methods to obtain ecological data is fundamental to management actions concerning the group. The study of fecal DNA emerges as an important tool to enable systematic information collection about Mazama genus. Therefore, the present study aimed to estimate the home range and habitat selection of brown brocket deer comparing two methodologies in order to assess the application of fecal DNA as an alternative to study this species. Six animals were monitored with GPS collars and their location data was collected every 13 hours within one year time. Fecal samples were collected monthly in the same period and in the same area, generating a total of 830 samples whose DNA was extracted for genetic identification. The species identification was determined by a mitochondrial marker (cit-b) and individuals were identified applying a panel of 11 microsatellites. Home range was 33-97 h by MPC 95% and 17-77 h by Kernel 95%. Home rages are allocated in different habitats as available in the region (p = 0.072), but its use is internally selected (p = 0.001). At this level, the species showed preference for \"cerrado\" and \"campo cerrado\" habitats and avoidance to open field areas (p < 0.005). Genetics analysis identified 670 brown brocket deer samples and 15 unique genotypes. Feces spatial analysis suggested disproportionate use of habitats in relation to their availability in the field and the direct comparison between the two methods revealed equal distributions at the species level (p = 0.178). The genotyped samples suggested an overlapping home range pattern for different individuals, but advances are needed to further elucidate the issue. There is need for improvements in feces molecular analysis and, if held on large scale, it can provide important and previously unviable answers for forest species.

O polimorfismo cromático é bastante comum em diversos grupos animais, podendo ser determinado geneticamente ou induzido por pistas ambientais. A existência de padrões de cor distintos em uma espécie pode variar de acordo com o tamanho e o sexo dos indivíduos na população. Além disso, os mesmos podem se diferenciar em suas características morfológicas e reprodutivas, as quais, por sua vez, estão associadas a aspectos comportamentais, ecológicos ou fisiológicos distintos. Dessa forma, diferentes estratégias de vida, caracterizadas por custos/benefícios específicos, podem ser selecionadas para cada padrão de cor. O camarão carídeo Hippolyte obliquimanus é um membro importante da fauna de águas costeiras tropicais, vivendo em associação com bancos de algas. Apresenta dois padrões de cor distintos: o primeiro é formado por animais com coloração homogênea marrom-esverdeada (M-E), rosa (R) ou preta (P); e o segundo por animais de coloração disruptiva (D), caracterizados por indivíduos com uma listra longitudinal transparente no abdômen ou por bandas circulares coloridas ao longo do corpo. O presente trabalho teve como principal objetivo avaliar possíveis mecanismos reguladores da condição polimórfica em H. obliquimanus. Para isso, foram estabelecidos três objetivos específicos, sendo que o primeiro visava quantificar a distribuição espacial dos padrões de cor entre as macroalgas Sargassum spp. e Galaxaura marginata. As algas foram coletadas em praias no Canal de São Sebastião (SP) e seguidamente processadas em laboratório, onde foram agitadas em água do mar para o desprendimento dos camarões. A densidade total de camarões (ind.kg-1 de fital) foi maior em Sargassum spp. que em G. marginata, e os morfótipos de cor se distribuíram diferentemente entre as algas. Os animais de coloração homogênea marrom-esverdeada foram mais abundantes em Sargassum spp., e os de coloração homogênea rosa e preta em G. marginata, enquanto que os animais de padrão disruptivo distribuíram-se igualmente entre as duas algas. Esses resultados indicam que a distribuição dos morfótipos está relacionada ao padrão de cor do substrato ao qual se assemelham, tornando-os possivelmente mais crípticos contra a predação. O segundo objetivo proposto foi testar em laboratório se os padrões de distribuição dos morfótipos observados em campo seriam resultado de seleção de habitat por parte dos camarões ou por um processo de alteração cromática dos mesmos, uma vez em contato com a alga hospedeira. Para testar a primeira hipótese, foram realizados experimentos de múltipla-escolha com os padrões de cor homogêneos M-E e R, sendo oferecidos ao mesmo tempo volumes iguais das algas Sargassum spp. e G marginata. Os animais marrom-esverdeados selecionaram Sargassum spp., enquanto que os de coloração rosa não mostraram preferência entre as algas. A hipótese de alteração cromática foi testada através de um experimento com os padrões de cor M-E e R, os quais foram confinados em volumes iguais e individuais das mesmas algas utilizadas anteriormente, bem como de mímicas confeccionadas com fita plástica. Em apenas cinco dias, os camarões de ambos os padrões de cor modificaram a sua coloração quando em contato com a espécie de alga cuja coloração não correspondia à sua. Nenhuma alteração cromática consistente foi observada nos animais confinados às algas mímicas, sugerindo que para os padrões de cor homogêneos, a mudança de cor é obtida através da alimentação. Dessa forma, a distribuição natural dos morfótipos é parcialmente mediada pela seleção de um habitat específico e por um processo de alteração cromática. Tal plasticidade aparentemente contribui para a redução do risco de predação na espécie. Por fim, o terceiro objetivo proposto foi caracterizar cada um dos padrões de cor de acordo com o seu tamanho, razão sexual e respectivos parâmetros reprodutivos, a fim de testar a existência de possíveis custos adicionais na manutenção da condição polimórfica na espécie. Os padrões de cor homogêneos e disruptivos não variaram quanto ao tamanho da carapaça, mas as suas frequências foram diferentes entre os sexos, sendo que os padrões homogêneos prevaleceram nas fêmeas e o padrão disruptivo nos machos. Além disso, não foram detectados custos reprodutivos adicionais associados à condição polimórfica na espécie, uma vez que nenhum dos parâmetros reprodutivos medidos foi diferente entre os padrões de cor. A manutenção de uma coloração disruptiva pelos machos, não correspondente a qualquer uma das algas, é consistente com o sistema de acasalamento por busca simples sugerido para a espécie. Nesse sistema, os machos são móveis e acasalam com o maior número de fêmeas possível, não investindo tempo e energia na guarda da mesma. Dessa forma, é provável que os custos associados à reprodução sejam diferentes para machos e fêmeas, em conformidade com a Hipótese do Nicho Dimórfico. Análises de morfometria geométrica, realizadas em camarões machos disruptivos e homogêneos, mostraram a existência de diferenças morfológicas entre os mesmos. Machos disruptivos são mais hidrodinâmicos, o que, conjuntamente com os demais resultados, sugere que estes camarões têm maior mobilidade e exercem uma função diferenciada na população. / Color morphs are commonplace in a variety of animals, and may be either genetically constrained or induced by environmental cues. They are often associated to size or sex of individuals in a given population, and may signal different behavioral, ecological or physiological attributes. Hence, alternative morph-specific strategies, involving particular cost/benefit ratios, can be selected. The tropical caridean shrimp Hippolyte obliquimanus is an important species in coastal habitats, usually associated to macroalgal beds. Two main different color morphs are easily distinguished: homogeneous, either greenish-brown (G-B), pink (P) or black (B); and disruptive (D), characterized by a transparent longitudinal band, or circular colored bands, along the body. The purpose of this study was to evaluate possible mechanisms regulating the polymorphic condition in H. obliquimanus. For that, three specific objectives were set up. First, the distribution of color morphs in two dominant shallow subtidal macroalgae, Sargassum spp. and Galaxaura marginata, was assessed. Algal samples were obtained at different sites in the São Sebastião Channel (SP), and processed shortly after to sort out shrimps. The total shrimp density was highest in Sargassum spp. and color morphs were unevenly distributed between the two algae. G-B homogeneous individuals were more abundant in Sargassum spp., while P and B ones were more abundant in G. marginata. Disruptive shrimps were equally distributed. These results indicate that distribution of color morphs is related to the color of the substrate, making these shrimps more cryptic, and hence less susceptible to predators. Second, laboratory trials were conducted to test whether field observations are due to (i) habitat selection or (ii) chromatic alteration upon contact with the host alga. To test the first hypothesis, multiple-choice experiments were run using G-B and P individuals, offering the same volume of both Sargassum and Galaxaura. G-B shrimps did select Sargassum, while P animals did not show any preference. The same morphs were used to test the second hypothesis, but now confined with equal volumes of each of the algae above and their respective plastic ribbon-tape mimics, matching their color as close as possible. In just 5 d, both morphs changed their color upon contact with natural algae of unmatched coloration. No consistent color change was observed for shrimps in contact with algal mimics, suggesting that, for homogeneous morphs, chromatic change is achieved through feeding. Therefore, the natural distribution of color morphs is at least partially explained by these two processes combined. Such plasticity apparently contributes to reduce predation risk. Lastly, color morphs were characterized according to size, sex-ratio and key reproductive parameters to verify if polymorphism in this species implies in added costs. Size of homogeneous and disruptive morphs did not differ, but homogeneous shrimps were predominantly females and disruptive individuals mostly males. No morph-specific reproductive costs were identified, since reproductive parameters did not change between morphs. The maintenance of disruptive males, lacking substrate-matching coloration, is consistent with the simple-search mating system, in which highly mobile males mate with the highest possible number of females, not investing in time or energy in guarding. If so, reproductive costs of males and females are expected to be different, in accordance with the Dimorphic Niche Hypothesis. Geometric morphometric analysis comparing disruptive and homogeneous males evidenced significant differences in body shape. Disruptive shrimps are more streamlined, further suggesting they may in fact be more mobile and play a differential role in the population.

Informações sobre o uso do espaço são importantes para o entendimento de processos ecológicos que envolvem uma espécie e a determinação de seu estado de conservação. Tais informações são escassas para o gênero Mazama, o mais diverso entre os cervídeos neotropicais, sendo que desenvolver metodologias para obtenção de dados ecológicos do gênero torna-se fundamental para qualquer ação de manejo envolvendo o grupo. O estudo do DNA fecal surge como uma ferramenta importante para viabilizar a coleta sistemática de informações sobre o gênero. Assim, o presente trabalho visou a estimar a área de vida e a seleção de hábitat do veado-catingueiro, comparando duas metodologias, com intuito de avaliar a aplicação do DNA fecal como alternativa para se estudar a espécie. O trabalho contou com 6 animais que tiveram suas localizações obtidas a cada 13 horas por colares GPS, no período de um ano. Nesse mesmo período e na mesma área, foram coletadas mensalmente amostras fecais, gerando um total de 830 amostras, cujo DNA foi extraído para identificação genética. A espécie das amostras foi determinada com o uso de um marcador mitocondrial (cit-b), e a identificação individual, com um painel de 11 microssatélites. Os valores de área de vida pelo método do MPC 95% variaram de 33 ha a 97 ha, e pelo método Kernel com 95% das localizações, variaram de 17 ha a 77 ha. Observou-se que as áreas de vida são alocadas nos diferentes habitats da região conforme o disponível (p = 0,072), porém são utilizadas internamente de forma selecionada (p=0,001). Neste nível, a espécie apresentou preferência pelos hábitats de cerrado e campo cerrado e evitou o campo (p < 0,005). Foram identificadas 670 amostras de veado-catingueiro e 15 genótipos únicos. A análise espacial das fezes também sugeriu uso desproporcional dos hábitats em relação à sua disponibilidade, sendo que a comparação direta entre os dois métodos revelou iguais distribuições no nível de espécie (p=0,178). As amostras individualizadas sugeriram um padrão de alta sobreposição de área de uso por diferentes indivíduos, mas avanços são necessários para melhor elucidar a questão. Perante os resultados observados, entende-se que há muito em se avançar na análise molecular das fezes que, realizada em larga escala, pode fornecer respostas importantes anteriormente inviáveis para espécies florestais. / Space use information is a key element to understand the ecological processes regarding a species and its conservation status. Such information is scarce for the genus Mazama, the most diverse group among Neotropical deer. The development of methods to obtain ecological data is fundamental to management actions concerning the group. The study of fecal DNA emerges as an important tool to enable systematic information collection about Mazama genus. Therefore, the present study aimed to estimate the home range and habitat selection of brown brocket deer comparing two methodologies in order to assess the application of fecal DNA as an alternative to study this species. Six animals were monitored with GPS collars and their location data was collected every 13 hours within one year time. Fecal samples were collected monthly in the same period and in the same area, generating a total of 830 samples whose DNA was extracted for genetic identification. The species identification was determined by a mitochondrial marker (cit-b) and individuals were identified applying a panel of 11 microsatellites. Home range was 33-97 h by MPC 95% and 17-77 h by Kernel 95%. Home rages are allocated in different habitats as available in the region (p = 0.072), but its use is internally selected (p = 0.001). At this level, the species showed preference for \"cerrado\" and \"campo cerrado\" habitats and avoidance to open field areas (p < 0.005). Genetics analysis identified 670 brown brocket deer samples and 15 unique genotypes. Feces spatial analysis suggested disproportionate use of habitats in relation to their availability in the field and the direct comparison between the two methods revealed equal distributions at the species level (p = 0.178). The genotyped samples suggested an overlapping home range pattern for different individuals, but advances are needed to further elucidate the issue. There is need for improvements in feces molecular analysis and, if held on large scale, it can provide important and previously unviable answers for forest species.

O polimorfismo cromático é bastante comum em diversos grupos animais, podendo ser determinado geneticamente ou induzido por pistas ambientais. A existência de padrões de cor distintos em uma espécie pode variar de acordo com o tamanho e o sexo dos indivíduos na população. Além disso, os mesmos podem se diferenciar em suas características morfológicas e reprodutivas, as quais, por sua vez, estão associadas a aspectos comportamentais, ecológicos ou fisiológicos distintos. Dessa forma, diferentes estratégias de vida, caracterizadas por custos/benefícios específicos, podem ser selecionadas para cada padrão de cor. O camarão carídeo Hippolyte obliquimanus é um membro importante da fauna de águas costeiras tropicais, vivendo em associação com bancos de algas. Apresenta dois padrões de cor distintos: o primeiro é formado por animais com coloração homogênea marrom-esverdeada (M-E), rosa (R) ou preta (P); e o segundo por animais de coloração disruptiva (D), caracterizados por indivíduos com uma listra longitudinal transparente no abdômen ou por bandas circulares coloridas ao longo do corpo. O presente trabalho teve como principal objetivo avaliar possíveis mecanismos reguladores da condição polimórfica em H. obliquimanus. Para isso, foram estabelecidos três objetivos específicos, sendo que o primeiro visava quantificar a distribuição espacial dos padrões de cor entre as macroalgas Sargassum spp. e Galaxaura marginata. As algas foram coletadas em praias no Canal de São Sebastião (SP) e seguidamente processadas em laboratório, onde foram agitadas em água do mar para o desprendimento dos camarões. A densidade total de camarões (ind.kg-1 de fital) foi maior em Sargassum spp. que em G. marginata, e os morfótipos de cor se distribuíram diferentemente entre as algas. Os animais de coloração homogênea marrom-esverdeada foram mais abundantes em Sargassum spp., e os de coloração homogênea rosa e preta em G. marginata, enquanto que os animais de padrão disruptivo distribuíram-se igualmente entre as duas algas. Esses resultados indicam que a distribuição dos morfótipos está relacionada ao padrão de cor do substrato ao qual se assemelham, tornando-os possivelmente mais crípticos contra a predação. O segundo objetivo proposto foi testar em laboratório se os padrões de distribuição dos morfótipos observados em campo seriam resultado de seleção de habitat por parte dos camarões ou por um processo de alteração cromática dos mesmos, uma vez em contato com a alga hospedeira. Para testar a primeira hipótese, foram realizados experimentos de múltipla-escolha com os padrões de cor homogêneos M-E e R, sendo oferecidos ao mesmo tempo volumes iguais das algas Sargassum spp. e G marginata. Os animais marrom-esverdeados selecionaram Sargassum spp., enquanto que os de coloração rosa não mostraram preferência entre as algas. A hipótese de alteração cromática foi testada através de um experimento com os padrões de cor M-E e R, os quais foram confinados em volumes iguais e individuais das mesmas algas utilizadas anteriormente, bem como de mímicas confeccionadas com fita plástica. Em apenas cinco dias, os camarões de ambos os padrões de cor modificaram a sua coloração quando em contato com a espécie de alga cuja coloração não correspondia à sua. Nenhuma alteração cromática consistente foi observada nos animais confinados às algas mímicas, sugerindo que para os padrões de cor homogêneos, a mudança de cor é obtida através da alimentação. Dessa forma, a distribuição natural dos morfótipos é parcialmente mediada pela seleção de um habitat específico e por um processo de alteração cromática. Tal plasticidade aparentemente contribui para a redução do risco de predação na espécie. Por fim, o terceiro objetivo proposto foi caracterizar cada um dos padrões de cor de acordo com o seu tamanho, razão sexual e respectivos parâmetros reprodutivos, a fim de testar a existência de possíveis custos adicionais na manutenção da condição polimórfica na espécie. Os padrões de cor homogêneos e disruptivos não variaram quanto ao tamanho da carapaça, mas as suas frequências foram diferentes entre os sexos, sendo que os padrões homogêneos prevaleceram nas fêmeas e o padrão disruptivo nos machos. Além disso, não foram detectados custos reprodutivos adicionais associados à condição polimórfica na espécie, uma vez que nenhum dos parâmetros reprodutivos medidos foi diferente entre os padrões de cor. A manutenção de uma coloração disruptiva pelos machos, não correspondente a qualquer uma das algas, é consistente com o sistema de acasalamento por busca simples sugerido para a espécie. Nesse sistema, os machos são móveis e acasalam com o maior número de fêmeas possível, não investindo tempo e energia na guarda da mesma. Dessa forma, é provável que os custos associados à reprodução sejam diferentes para machos e fêmeas, em conformidade com a Hipótese do Nicho Dimórfico. Análises de morfometria geométrica, realizadas em camarões machos disruptivos e homogêneos, mostraram a existência de diferenças morfológicas entre os mesmos. Machos disruptivos são mais hidrodinâmicos, o que, conjuntamente com os demais resultados, sugere que estes camarões têm maior mobilidade e exercem uma função diferenciada na população. / Color morphs are commonplace in a variety of animals, and may be either genetically constrained or induced by environmental cues. They are often associated to size or sex of individuals in a given population, and may signal different behavioral, ecological or physiological attributes. Hence, alternative morph-specific strategies, involving particular cost/benefit ratios, can be selected. The tropical caridean shrimp Hippolyte obliquimanus is an important species in coastal habitats, usually associated to macroalgal beds. Two main different color morphs are easily distinguished: homogeneous, either greenish-brown (G-B), pink (P) or black (B); and disruptive (D), characterized by a transparent longitudinal band, or circular colored bands, along the body. The purpose of this study was to evaluate possible mechanisms regulating the polymorphic condition in H. obliquimanus. For that, three specific objectives were set up. First, the distribution of color morphs in two dominant shallow subtidal macroalgae, Sargassum spp. and Galaxaura marginata, was assessed. Algal samples were obtained at different sites in the São Sebastião Channel (SP), and processed shortly after to sort out shrimps. The total shrimp density was highest in Sargassum spp. and color morphs were unevenly distributed between the two algae. G-B homogeneous individuals were more abundant in Sargassum spp., while P and B ones were more abundant in G. marginata. Disruptive shrimps were equally distributed. These results indicate that distribution of color morphs is related to the color of the substrate, making these shrimps more cryptic, and hence less susceptible to predators. Second, laboratory trials were conducted to test whether field observations are due to (i) habitat selection or (ii) chromatic alteration upon contact with the host alga. To test the first hypothesis, multiple-choice experiments were run using G-B and P individuals, offering the same volume of both Sargassum and Galaxaura. G-B shrimps did select Sargassum, while P animals did not show any preference. The same morphs were used to test the second hypothesis, but now confined with equal volumes of each of the algae above and their respective plastic ribbon-tape mimics, matching their color as close as possible. In just 5 d, both morphs changed their color upon contact with natural algae of unmatched coloration. No consistent color change was observed for shrimps in contact with algal mimics, suggesting that, for homogeneous morphs, chromatic change is achieved through feeding. Therefore, the natural distribution of color morphs is at least partially explained by these two processes combined. Such plasticity apparently contributes to reduce predation risk. Lastly, color morphs were characterized according to size, sex-ratio and key reproductive parameters to verify if polymorphism in this species implies in added costs. Size of homogeneous and disruptive morphs did not differ, but homogeneous shrimps were predominantly females and disruptive individuals mostly males. No morph-specific reproductive costs were identified, since reproductive parameters did not change between morphs. The maintenance of disruptive males, lacking substrate-matching coloration, is consistent with the simple-search mating system, in which highly mobile males mate with the highest possible number of females, not investing in time or energy in guarding. If so, reproductive costs of males and females are expected to be different, in accordance with the Dimorphic Niche Hypothesis. Geometric morphometric analysis comparing disruptive and homogeneous males evidenced significant differences in body shape. Disruptive shrimps are more streamlined, further suggesting they may in fact be more mobile and play a differential role in the population.

Orientador: Eleonore Zulnara Freire Setz / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-14T15:46:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Baumgarten_JulioErnesto_D.pdf: 1897672 bytes, checksum: 3d8693a668105a0d846b4f1309afcd25 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: As características do habitat são um fator determinante na definição da riqueza e abundância das comunidades. A associação dos organismos com ambientes específicos é determinada pelas demandas e possibilidades de exploração dos recursos de cada espécie. Morcegos da família Phyllostomidae são animais com grande mobilidade que utilizam o vôo através da vegetação para localizar e ter acesso dos seus principais recursos. Os filostomideos formam um grupo de mamíferos fortemente associados às florestas tropicais. A região sul da Bahia representa a maior área contínua com cobertura florestal sob o domínio atlântico que ainda permanece no nordeste brasileiro. Essas florestas remanescentes são, de fato, um mosaico composto por florestas nativas e plantações sombreadas de cacau (Theobroma cacaó), localmente conhecidas como cabrucas. O presente estudo investiga como a fauna de morcegos se distribui neste mosaico complexo em uma paisagem fragmentada da região cacaueira abordando a questão a partir de duas escalas distintas. Em uma paisagem desse mosaico no município de Ilhéus, BA, foi investigado: (1) como a riqueza, abundância, diversidade e composição de espécies de morcegos se comportam na conversão de florestas em cabrucas, (2) como estes parâmetros sofrem influência da distância da cabruca a floresta mais próxima e (3) as alterações destes padrões em cabrucas mais intensamente manejadas, com maior desbaste da cobertura de dossel. Em uma escala menor, foi investigada a importância do arranjo espacial da vegetação do subosque de florestas nativas e cabrucas, em sítios localizados nos municípios de Ilhéus e Una, na estruturação das assembléias de morcegos, considerando-se, principalmente as características morfológicas das espécies presentes. Para tanto foi desenvolvido um método, baseado no uso de fotografias, de onde foram extraídas métricas descritoras da complexidade e grau de obstrução da vegetação presente nos sítios amostrados. As respostas dos morcegos a esses descritores foram comparadas às respostas das assembléias de pequenos mamíferos escansoriais e aves frugívoras de subosque encontradas em estudos anteriores realizados nos mesmos sítios de amostragem. Os resultados corroboram estudos anteriores mostrando que as comunidades de morcegos em cabrucas do sul da Bahia são mais ricas, diversas e abundantes e com composição de espécies diferenciada das florestas, sendo importantes matrizes capazes de manter uma grande quantidade de espécies em uma escala de paisagem. Ao contrário do previsto, o aumento da intensidade de manejo ou da distância da floresta parece não afetar os padrões das variáveis estudadas para a comunidade como um todo ou para as espécies mais abundantes nas florestas. A riqueza de morcegos foi significativa e negativamente correlacionada ao grau de obstrução e à complexidade da vegetação do subosque. Espécies de morcegos com características morfológicas que implicam um vôo energeticamente mais custoso tenderam a não estarem presentes em habitats mais densos e complexos. Morcegos, aves frugívoras e pequenos mamíferos escansoriais respondem de forma diferente aos descritores utilizados, sugerindo formas diferentes de percepção e exploração dos recursos presentes no subosque das florestas da região. / Abstract: Habitat features play a major role influencing species richness and abundance in local communities. The association between a given organism and habitat types is closely determined by the way each species exploits the available resources. Phyllostomide bats comprise a group of species with great mobility, performing highly maneuverable flights trough complex and clutter vegetation in order to detect and access their main food resources. As conspicuous features of the Neotropical forests in general, these bats comprise speciose assemblages along the Atiantic rainforest, a biome drastically reduced, fragmented and disturbed. In the southern region of Bahia state lies the largest areas of the Atlantic forests remaining from the entire northeastern Brazil, although these remnants comprise in fact a mosaic of native forests and shade cacao plantations (Theobroma cacao), locally known as cabrucas. The present study investigates how the Phyllostomidae bats are distributed along this complex forest mosaic, approaching this question in two different spatial scales. At the landscape scale, it was investigated how the richness, abundance, diversity and composition of bat species are influenced by (1) the conversion of native forests into cabrucas; (2) according to the distance of a given cabruca to a native forest remnants and by (3) differences in management intensity among shade plantations, mostly determined by the level of canopy cover left. At a lower spatial scale, the question investigated focused on whether the spatial arrangement of the understory vegetation in a given site could influence the structure of bat assemblages, taking into account morphological features of the species locally present. To accomplish for this goal, a new method was developed to extract a range of metrics needed to describe the complexity and clutter level of the vegetation at each sampling site. The outcomes of the bat assemblages were compared with those achieved for scant small mammals and understory frugivorous bird assemblages sampled along the same sites. Overall, the results corroborate previous studies showing that cabrucas comprise richer, more abundant, more diverse and distinct bat assemblages than those reported for the forest habitats, being important matrix habitats maintaining rich assemblages in a landscape scale. Apparently, neither the distance from a native forest nor the management intensity of a given cabruca seems to influence the bat structure patterns. Nevertheless, at a lower spatial scale, bat species richness was significantly and negatively correlated with the obstruction and complexity level of the understory vegetation. Bat species with morphological features associated with flights that are energetically more costly tended to be absent from more dense and clutter habitats. Bats, birds and small mammals showed different responses relatively to the spatial descriptors applied, probably reflecting differences in the way that each biological group perceive and exploit the understory space and its associated resources. / Doutorado / Doutor em Ecologia

Orientadores: Eleonore Zulnara Freire Setz, José Eduardo Mantovani / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-20T00:59:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Penteado_MarcelJoseFranco_D.pdf: 10454343 bytes, checksum: d8c60e67c27ebfc4bdb666229a8d4b1e (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O puma (Puma concolor) e a jaguatirica (Leopardus pardalis) são dois dos felídeos com maior distribuição geográfica no continente americano, ocorrendo em biomas que vão desde regiões muito secas até florestas tropicais. Assim como todos os predadores de porte médio e grande, necessitam de grandes áreas para sobreviver e são particularmente vulneráveis a extinções locais em ambientes fragmentados, onde seu desaparecimento pode levar a altas densidades de pequenos mamíferos predadores, ou mesopredadores, e ao empobrecimento dos níveis tróficos mais baixos. Além da perda de habitat, estas espécies sofrem com a falta de informações sobre sua ecologia, incluindo área de vida, uso de habitat e padrões de deslocamento e dispersão, essenciais para elaborar planos de manejo e estratégias de conservação eficientes. O presente trabalho analisou algumas destas informações em duas áreas com níveis significativos de impactos antrópicos (municípios de Paulínia, Cosmópolis, Americana e Atibaia), através do monitoramento de um puma por radiotelemetria GPS e três jaguatiricas por radiotelemetria VHF. Descrevemos a área de vida do puma com 11.400ha. Identificamos seleção para ambientes com cobertura vegetal arbórea e uso de matas ciliares como rotas de deslocamento. Também verificamos que seu nível de atividade decresce conforme a noite avança. Foi possível determinar locais prefereciais de predação através da análise de clusters, com indicações de que o puma monitorado identificou os melhores locais para predação de animais de maior porte. Também estimamos a área de vida para três jaguatiricas, variando entre 153 e 680ha, dentro do intervalo descrito para áreas de floresta tropical, mas muito inferior à descrita para outras áreas do continente americano, como o Pantanal e Iguaçú. Também verificamos preferência por ambientes com cobertura vegetal densa. Considerando os resultados obtidos, estratégias eficientes para a preservação destas espécies dependem da manutenção de áreas de mata nativa, interligadas por corredores de deslocamento, que permitam o trânsito destes animais entre eles e o contato e fluxo gênico entre populações distintas / Abstract: The cougar (Puma concolor) and the ocelot (Leopardus pardalis) are broadly distributed in the Americas, and occurs in biomes ranging from dry areas to tropical forests. As all medium to large sized predators, they need large landscapes to survive, and may be particularly vulnerable to local extinction in fragmented landscapes, where their disappearance can lead to higher densities of small mammalian predators, or mesopredators, and the impoverishment of lower trophic levels. Besides the loss of habitat, these species suffer from a lack of information about its ecology, including home range, habitat use and patterns of movement and dispersion, essential to develop effective management action plans and conservation strategies. The present study examined some of this information in two areas with significant levels of human impacts (municipalities in Paulínia, Cosmópolis, Americana and Atibaia), by monitoring a cougar by GPS radio telemetry and three ocelots by VHF radio telemetry. We describe the cougar's home range with 11.400ha (100% MCP). We found string selection for habitats with dense forest cover, and use of riparian areas as travel routes. We also found that their activity level decreases as the night progresses. We determinate preferecial predation sites by cluster analysis, with indications that the tracked cougar identified the best places to predation of larger animals. We also estimate the home range for three ocelots, ranging between 153 and 680ha (100% MCP) within the range reported for tropical forest, but much lower than that reported for other areas of the Americas, including brazilian Pantanal and Iguaçú. We also observed a preference for environments with dense vegetation. Considering these results, efficient strategies for the preservation of these species depend on maintaining areas of native forest, connected by movement corridors, allowing the transit of these animals between them and the contact and gene flow between different populations / Doutorado / Ecologia / Doutor em Ecologia

Informações sobre o tamanho da área de vida, o uso e seleção de habitat contribuem para o entendimento da ecologia das espécies e por isso acabam servindo como importantes referências para o manejo e conservação. Apesar de no Hemisfério Norte muitos estudos abordarem área de vida e uso de habitat em Strigiformes, na região Neotropical, informações dessa natureza ainda são escassas na literatura. No presente estudo, quatro indivíduos machos da corujinha-do-mato (Megascops choliba) foram monitorados por radiotelemetria durante cerca de seis meses em uma área de cerrado (lato sensu) no interior do Estado de São Paulo. Apesar das diferenças dos habitats utilizados, o tamanho médio da área de vida de M. choliba segundo o mínimo polígono convexo (51,2 ± 26,9 ha) foi semelhante à de espécies do mesmo gênero na América do Norte. A grande variação individual encontrada no tamanho das áreas de vida pode ser explicada pelos tipos de habitats utilizados e também pelo status social dos indivíduos. No período noturno, a corujinha-do-mato preferiu fisionomias de cerrado semi-abertas e fechadas e, além disso evitou fisionomias abertas. No período diurno, habitats com vegetação mais densa e fechada como matas de galeria e manchas de Pinus invasor foram preferencialmente utilizados para uso como abrigo. O uso desses locais durante o dia, provavelmente está ligado à maior cobertura vegetal dessas áreas que podem fornecer proteção contra predadores e também microclimas adequados. / Information on home ranges and habitat use and selection is useful to understand species ecology and therefore may help to establish species management and conservation plans. Despite the large numbers of Northern Hemisphere studies addressing Strigiformes home range and habitat use, the same is not applied to Neotropical owl species, what makes such information still scarce. In this study, four males of Tropical Screech-Owls (Megascops choliba) were radio-tracked for about six months in a cerrado (lato sensu) region in state of São Paulo, southeastern Brazil. Despite the differences in used habitats between species from the two hemispheres, the mean home range size of Tropical Screech-Owls (51.2 ± 26.9 ha) appears to be similar to North American Megascops species. The considerable individual variation in home range sizes may be related to types of habitats and individual social status. At night, the Tropical Screech-Owls preferred semi-open and closed savannas and, moreover, avoided open savannas. Habitats with dense vegetation, such as gallery forests and invasive pine forests were preferentially used for daytime roost. Use of these sites during the day is probably associated to higher vegetation cover which can provide protection against predators and suitable microclimates