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Caracterização molecular de alelos-S e de locos microssatélites em Prunus salicina (Lindl.) / Molecular characterization of alleles-S and of microsatellite locus in Prunus salicina (Lindl.)MOTA, Monalize Salete 31 July 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-07-31 / The production of plum is an important commodity around the world. In Brazil,
the state of Rio Grande do Sul is the major producer. However, despite the great
potential for cultivation, some factors are limiting for increasing the production, such
as: a) climate variability; b) use of inadequate stocks; c) pollination of most cultivar is
self-incompatible d) doubtful genetic history of the plant material. Considering these
problems, the aim of this work was to identify allele-S related to gametophytic self-
incompatibility in Prunus salicina (Lindl.) and to perform the molecular
characterization of cultivars by means of microsatellites locus. For these purposes
eleven cultivars of Japanese plum [Santa Rosa, Santa Rita, Reubennel, Pluma 7,
América, Rosa Mineira, Amarelinha, The First, Gulfblaze (Clone São Paulo),
Gulfblaze (Clone Guaíba) e Harry Pickstone] were analysed by Polymerase Chain
Reaction (PCR) using three pairs of primers specific for amplifying the alleles-S and
primers for five microsatellite locus. The experiments were performed in the
Laboratório de Cultura de Tecidos de Plantas Caracterização Molecular, of the
Departamento de Botânica da Universidade Federal de Pelotas. In the amplification
of alleles-S was observed that the reaction mix for PCR, the PCR conditions, and
primers combination, allowed an effective characterization of alleles-S in the cultivars
of P. salicina and the identification of pollinators more compatible to commercial
cultivars. Sequencing analysis of some amplified alleles-S revealed high similarity to sequences of nucleotides already identified in other studies with Prunus spp. In the
analysis of five microsatellite locus thirty polymorphisms were obtained allowing a
clear identification of Japanese plum genotypes, elucidating the homonymy between
the cultivars Gulfblaze (Clone São Paulo) and Gulfblaze (Clone Guaíba). However,
the polymorphisms were not sufficient for obtaining a reasonable estimation of the
genetic variability and grouping analysis of the Japanese plums evaluated. / A cultura de ameixeira tem papel de destaque na fruticultura mundial. No
Brasil, o Estado do Rio Grande do Sul se destaca como maior produtor. Porém,
mesmo apresentando elevado potencial de cultivo, alguns fatores têm limitado o
aumento da produção, entre eles: a) a variabilidade de clima; b) o uso de porta-
enxertos inadequados; c) a incapacidade de autopolinização da maioria das
cultivares d) e a idoneidade genética do material vegetal. Diante disso, o objetivo
deste trabalho foi identificar alelos-S relacionados à auto-incompatibilidade
gametofítica em Prunus salicina (Lindl.) e caracterizar molecularmente as cultivares
por meio de locos microssatélites. Para tal fim foram analisadas 11 cultivares de
ameixeira japonesa [Santa Rosa, Santa Rita, Reubennel, Pluma 7, América, Rosa
Mineira, Amarelinha, The First, Gulfblaze (Clone São Paulo), Gulfblaze (Clone
Guaíba) e Harry Pickstone], por meio de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR)
com três pares de primers específicos para amplificação de alelos-S e primers para
cinco locos de microssatélites. Os experimentos foram desenvolvidos no Laboratório
de Cultura de Tecidos de Plantas Caracterização Molecular, do Departamento de
Botânica da Universidade Federal de Pelotas. Na amplificação de alelos-S,
constatou-se que as concentrações e condições de PCR utilizadas, bem como às combinações de primers, permitiram a efetiva caracterização de alelos-S nas
cultivares de P. salicina estudadas, bem como, a escolha das polinizadoras mais
compatíveis com as cultivares produtoras. O seqüenciamento de alguns dos alelos-S
amplificados revelou elevada similaridade com seqüências de nucleotídeos já
identificados em outros trabalhos com Prunus spp.. Na análise de cinco locos de
microssatélites obteve-se um total de 30 polimorfismos possibilitando uma clara
identificação dos genótipos de ameixeira japonesa, esclarecendo caso de
homonímia entre as cultivares Gulfblaze (Clone São Paulo) e Gulfblaze (Clone
Guaíba), no entanto, os polimorfismos não foram suficientes para obter uma boa
estimativa da variabilidade genética e análise de agrupamento dos genótipos de
ameixeira japonesa avaliados.
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