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Production of amylopectin and high-amylose starch in separate potato genotypes /

Hofvander, Per, January 2004 (has links) (PDF)
Diss. (sammanfattning) Uppsala : Sveriges lantbruksuniversitet, 2004. / Härtill 5 uppsatser.
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Pheromone-mediated communication disruption in Guatemalan potato moth, Tecia solanivora Povolny /

Bosa Ochoa, Carlos Felipe, January 2005 (has links) (PDF)
Licentiatavhandling (sammanfattning) Alnarp : Sveriges lantbruksuniversitet. / Härtill 2 uppsatser.
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Modelagem da recomendação de nitrogênio, fósforo e potássio e métodos de aplicação de fósforo para a cultura da batata / Modeling of nitrogen recommendation, phosphorus and potassium and phosphorus application methods for the potato crop

Santos, Luiz Paulo Dornelas 22 July 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-23T18:24:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1068714 bytes, checksum: 915f17e2ec40208ac88b1e9c3744c3cd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-23T18:24:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1068714 bytes, checksum: 915f17e2ec40208ac88b1e9c3744c3cd (MD5) Previous issue date: 2016-07-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As recomendações oficiais para fertilização da cultura da batata necessitam de melhorias no manejo da adubação, como a inclusão das influências de variedades e da produtividade esperada sobre a demanda de nutrientes. Além disso, a fosfatagem tem sido amplamente utilizada em olerícolas no Brasil. No entanto, há carência de informações quanto à eficácia da fosfatagem versus a adubação localizada nesse grupo de plantas. Assim, um experimento foi realizado com o objetivo de estimar dados de extração e de partição de nutrientes visando propor um sistema de recomendação de nitrogênio (N), fósforo (P) e potássio (K) para a cultura da batata (FERTICALC Batata). Para as variedades Ágata, Atlantic, FL2215, FL2027, FL1867, FL2221, Asterix, BRSIPR Bel, Cupido, Nicolet, Acumulator, Verdi e Taurus foram determinados o teor de matéria seca, o coeficiente de utilização biológica dos nutrientes (CUB) e o índice de colheita (IC). As taxas de recuperação de nutrientes pela planta e para modelagem de suprimento de nutrientes pelo solo foram obtidos a partir de dados da literatura. Outros dois experimentos foram propostos para avaliar aspectos produtivos e nutricionais da batateira submetida a doses e métodos de aplicação de P. Nesses os tratamentos consistiram de duas doses de P (300 e 600 kg ha -1 de P 2 O 5 ) combinadas com cinco métodos de aplicação de P, os quais consistiram de frações da dose de P aplicadas à lanço ou localizadas no sulco de plantio. Os métodos de aplicação foram: 100/0, 75/25, 50/50, 25/75 e 0/100 (percentagem da dose distribuída a lanço / percentagem da dose localizada aplicada no sulco de plantio) e um tratamento controle sem P. Foi adotado o esquema fatorial (2 x 5) + 1 (duas doses x cinco métodos de aplicação, mais um tratamento sem P), no delineamento em blocos casualizados com quatro repetições. O FERTICALC Batata mostrou-se eficiente para recomendar nutrientes para a cultura e as simulações demostraram que a produtividade, a finalidade de uso e as variedades influenciam as doses de N, P 2 O 5 e K 2 O recomendadas. A aplicação do fertilizante fosfatado localizado no sulco de plantio aumenta a produtividade, o acúmulo de P e as eficiências agronômica e de recuperação do nutriente pela cultura. / Official recommendations for potato crop fertilization need to be improved as the inclusion of the influences of varieties and the desired productivity on the demand for nutrients. In addition, the broadcast fertilization with phosphorus (P) has been widely used in Brazil in vegetable crops. However, there is lack of information about the broadcast fertilization versus localized in this group of plants. Thus, an experiment was conducted in order to obtain data extraction and nutrient partitioning to propose a nitrogen recommendation system (N), phosphorus (P) and potassium (K) for the potato (FERTICALC Potato). For Ágata varieties Atlantic, FL2215, FL2027, FL1867, FL2221, Asterix, BRSIPR Bel, Cupido, Nicolet, Acumulator, Verdi and Taurus were determined the dry matter content, the coefficient of biological utilization of nutrients (CUB) and the index collection (IC). Information amounts of nutrients by the plant recovery rates and to supply nutrients by soil modeling were obtained from the literature. Two other experiments were proposed to assess production and nutritional aspects of potato subjected to doses and P. methods of applying these treatments consisted of two doses of P (300 and 600 kg ha -1 P 2 O 5 ) combined with five application methods P, which consisted of P dose fractions applied to stretch or located in the planting furrow. The application methods were: 100/0, 75/25, 50/50, 25/75 and 0/100 (percentage of the dose distributed to haul / percentage of the applied dose located in the furrow), and a control treatment without P. was adopted factorial (2 x 5) + 1 (two doses x five application methods, plus a treatment without P), in a randomized block design with four replications. The FERTICALC Potato was efficient to recommend nutrients for culture and demonstrated simulations that productivity, the purpose of use and varieties influence doses of N, P 2 O 5 and K 2 O recommended. The application of phosphate fertilizer located in the planting furrow increases productivity, the accumulation of P and agronomic efficiency and nutrient recovery by the potato.
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Respostas morfofisiológicas e agronômicas de batata à aplicação de reguladores de crescimento em condições de verão / Morphophysiological and agronomic responses of potatoes to application of growth regulators in summer conditions

Araujo, Fernanda Ferreira de 23 February 2018 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-04-11T18:35:36Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2269796 bytes, checksum: 359867f02ec52728e20f089208e27d89 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-11T18:35:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2269796 bytes, checksum: 359867f02ec52728e20f089208e27d89 (MD5) Previous issue date: 2018-02-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Um dos fatores que restringem a obtenção de maiores índices de produtividade na cultura da batata está relacionado com o crescimento excessivo dos caules e massa foliar, que é favorecido pelas altas temperaturas do verão, levando a redução da produtividade e menor teor de matéria seca dos tubérculos. Uma prática de manejo que pode ser utilizada para obter equilíbrio entre o crescimento da parte vegetativa e o órgão de reserva das plantas é a utilização de produtos reguladores ou retardantes do crescimento vegetal, os quais atuam inibindo a biossíntese de giberelina. O paclobutrazol e o trinexapac-ethyl são reguladores de crescimento utilizado na agricultura com finalidade de controlar o crescimento vegetativo, visando à redução do porte das plantas. Diante do exposto, o objetivo desse trabalho foi avaliar o crescimento e produção da batata cultivar Markies em função da aplicação dos reguladores de crescimento, paclobutrazol (PBZ) e trinexapac-ethyl (TE), em condições de verão. Foram conduzidos dois experimentos independentes. No primeiro experimento, PBZ a 0,125 e 0,250 L ha -1 e TE a 1,0 e 2,0 L ha -1 foram aplicados na forma de pulverização foliar, aos 35 dias após o plantio. No segundo, PBZ a 0,1; 1,0; 10 e 100 mg L -1 e TE a 1,0; 10; 100 e 1000 mg L -1 foram aplicados nas batatas-semente brotadas antes do plantio. Na aplicação via foliar, os reguladores de crescimento foram eficientes em antecipar o processo de tuberização. As plantas tratadas com PBZ e TE exibiram células epidérmicas maiores e uma única camada de células do mesofilo paliçádico mais alongadas. O tratamento com PBZ nas duas doses foi eficiente em aumentar o índice de clorofila das folhas e reduzir o tamanho das plantas, porém reduziu a massa fresca e seca total dos tubérculos, produção total por planta e a gravidade especifica dos tubérculos. No segundo experimento, o PBZ foi eficiente em reduzir o tamanho das plantas e aumentar o índice de clorofila, flavonoides e balanço de nitrogênio das folhas. As duas doses maiores (10 e 100 mg L -1 ) de PBZ atrasaram a emergência da parte aérea, o início da tuberização das plantas, reduziram o número de tubérculos por planta e o teor de amido dos tubérculos. As folhas exibiram células epidérmicas maiores, células do mesofilo paliçádico mais alongadas e mesófilo esponjoso mais espesso. Nos dois experimentos, o TE não foi eficiente em reduzir o comprimento das plantas, mostrando a sua seletividade somente a determinadas espécies. / One of the factors that restrict the obtaining of higher productivity indices in the potato crop is related to the excessive growth of stems and foliar mass, which is favored by high temperatures, leading to reduced productivity and lower dry matter content of tubers. A management practice that can be used to achieve a balance between the growth of vegetative part and the reserve organ of the plants is the use of plant growth retarding or regulating products, which act to inhibit the biosynthesis of gibberellin. Paclobutrazol and trinexapac-ethyl are growth regulators used in agriculture to control vegetative growth, aiming at reducing the size of plants and stimulating reproductive capacity. In view of the above, the objective of this work was to evaluate the growth, dry matter partition and production of potato cv. Markies as a function of growth regulators, paclobutrazol (PBZ) and trinexapac-ethyl (TE). Two independent experiments were conducted. In the first experiment, PBZ at 0.125 and 0.250 L ha -1 and TE at 1.0 and 2.0 L ha -1 were applied as foliar sprays at 35 days after planting. In the second, PBZ at 0.1; 1.0; 10 and 100 mg L -1 and TE at 1.0; 10; 100 and 1000 mg L -1 were applied to seed potatoes sprouted before planting. In the foliar application, treatments with growth regulators anticipated the tuberization process in potato plants, when compared to the control. PBZ treatment at both doses was efficient in increasing leaf chlorophyll content and reducing plant size, but it reduced the fresh and dry mass of the tubers, total yield per plant and the specific gravity of the tubers. Plants treated with PBZ and TE exhibited larger epidermal cells and a single layer of large and elongated palisade mesophyll cells. Treatments with PBZ were observed a thicker spongy mesophyll tissue. In the second experiment, the PBZ was efficient in reducing plant size and increasing the chlorophyll, flavonoid and nitrogen balance index of the leaves. The two higher doses (10 and 100 mg L -1 ) of PBZ delayed the emergence of aerial part, the beginning of plant tuberization, reduced the number of tubers per plant and the starch content of the tubers. Leaves from PBZ-treated seed potatoes at doses 10 and 100 mg L -1 exhibited larger epidermal cells, more elongated palisade mesophyll cells and thicker spongy mesophyll. In both experiments, the TE was not efficient in reducing the size of the plants, showing their selectivity only to certain species.
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Transcriptoma Global e de Genes Alvo da Rota de Biossíntese de Glicoalcalóides em Novas Variedades de Solanum tuberosum L.

Mariot, Roberta Fogliatto January 2015 (has links)
Batatas (Solanum tuberosum) juntamente com arroz, trigo e milho, são as culturas mais consumida no mundo. A inclusão de novas variedades de S. tuberosum para consumo humano e sob a forma de ração necessita avaliação quanto sua segurança. Normas internacionais citam glicoalcalóides (GA) como tóxicos-chave em avaliação de novas variedades de batatas. Portanto, o objetivo do trabalho foi propor um modelo de avaliação da segurança de novas variedades de batata, incluindo geneticamente modificados, baseado no transcriptoma e análise comparativa de variedades com histórico de segurança. Adicionalmente, pretendeu-se determinar genes referência para análise transcricional de tubérculos. E ainda, caracterizar os genes glycoalkaloid metabolism (GAMEs), que fazem parte da biossíntese de GA e relacionar sua expressão com o total de glicoalcalóides (TGA) em diferentes genótipos de tubérculos de batatas. Para tanto, construiu-se um banco de dados com RNAseq de 90 tubérculos de batatas com grande variabilidade genética e natural. O banco de dados também foi utilizado para ranquear candidatos a genes normalizadores, baseado no intervalo interquartil (IQR), que, posteriormente, tiveram sua estabilidade calculada pelo: geNorm, NormFinder e BestKeeper. O conteúdo de TGA foi medido em cromatografia líquida de alta eficiência com espectrômetro de massa (CLAE-EM) e a expressão dos GAMEs foi determinada por reação de transcriptase reversa quantitativa seguida da reação em cadeia da polimerase (RT-qPCR). Para análise da região promotora utilizou-se: Plant Pan – Plant Promoter Analysis Navigator. Através dos resultados obtidos e analisados, podemos afirmar que o modelo, quando devidamente validado e finalizado, pode ser considerado bastante promissor. Os genes C2, SEC3 e CUL3A foram considerados como excelentes normalizadores para tubérculos de batata. A expressão dos GAMEs foi maior em tubérculos com maior conteúdo de TGA, e com exceção do GAME7, os genes GAME4, GAME6, GAME8ab, GAME11 e GAME12 demonstraram ser estatisticamente (α = 0,05) mais expressos em amostras com maior teor de TGA e menos em amostras com menor TGA, confirmando a relação destes genes com a produção de glicoalcalóides. Na análise de fatores de transcrição dos GAMEs muitos elementos cis relacionados a estresse biótico e abiótico, e regulação por luz foram encontrados, além de muitas cópias desses elementos cis nas regiões promotoras de todos os GAMEs. Os resultados obtidos no presente trabalho são importantes para um melhor entendimento da formação e regulação dos GA em tubérculos de batatas, auxiliando na predição e prevenção de formação deste composto. / Potato (Solanum tuberosum) is the third most important food crop in the world after rice and wheat in terms of human consumption. The introduction of new varieties of S. tuberosum for food or feed requires the checking of not only substances of pro-nutritional functioning on the human body, but should examine the content of toxic compounds, such as glycoalkaloids (GA), as an international norm recommendation for new potatoes varieties evaluation, including genetic modified. For this reason, the goal of the present work was build a food safety assessment model based on transcriptomics, and comparative with history of safe human consumption. Besides, we intended to determined reference genes for transcriptional analysis of potato tuber, and characterized glycoalkaloid metabolism (GAME) genes that partake of GA biosynthesis pathway. The correlation between the expression of GAME genes and total glycoalkaloids (TGA) content in different genotypes of potato tubers was evaluated. To do so, a database was build with RNASeq data from 90 potato tubers with large genotype and natural variability. These database were also used to ranking the candidates to be reference genes based on Interquartile Range (IQR). The stability of candidates for reference genes were evaluated by geNorm, NormFinder and BestKeeper. The content of TGA were measured on high performance liquid chromatography acoplated on mass spectrometry (LC-MS). Later, Reverse Transcriptase quantitative Polymerase Chain Reactions (RT-qPCR) determined the expression of GAME genes. For the promoter region analysis of GAMEs were used “Plant Pan – Plant Promoter Analysis Navigator”. It is possible affirmed that the food safety assessment model after a properly validation will be promising. The best reference genes for transcriptional analysis studies of potato tubers were C2, SEC3 and CUL3A. The expression of GAME4, GAME6, GAME7, GAME8ab, GAME11, and GAME12 were higher in tubers with high TGA content, and, exception for GAME7, the other GAME genes demonstrate statically (α = 0,05) higher expression on samples with high TGA and lower on samples with low TGA content, confirming that there is a relation between GAME genes and GA biosynthesis. On transcription factors analysis of GAME genes several cis-elements related to abiotic and biotic stress, and light regulated were found, also many copies of these factors in all GAME promoter region. All these results are very helpful to better understand GA formation and regulation on potato tubers, helping to predict and prevent the formation of these toxic.
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Separace vybraných frakcí kyselých proteinů z hlíz brambor (Solanum tuberosum L.) pomocí chromatografických technik / Separation of selected acidic proteins fractions from potato (Solanum tuberosum L.) tubers by chromatographic techniques

LORENC, František January 2013 (has links)
This diploma thesis deals with acidic proteins contained in the potato (Solanum tuberosum) tubers, or rather about their separation with chromatography techniques. For the analysis were chosen tubers of two czech potato varieties, Adéla and Westamyl. From the concentrated potato juice were eliminated basic and most of the patatin proteins with the gravity column chromatography. In the next step were applied the chromatography techniques on the anion and hydroxyapatite columns by the fast protein liquid chromatography (FPLC) system. On the anion column were separated protein fractions which contained proteins of molecular weight in the range of 15 kDa to 60 kDa (Adéla) and 15 kDa to 100 kDa (Westamyl). The most abundant were the proteins with molecular weight 15 kDa a 20 kDa. In the last step was used the mass spectrometry for the identification of chosen protein fractions.
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Inoculação de Azospirillum brasilense e adubação nitrogenada nas culturas da mandioca e batata / Inoculation of Azospirillum brasilense and Nitrogenated Fertilization in Cultures of Cassava and Potato

Silva, Jessica Aparecida da 25 July 2018 (has links)
Submitted by Jessica Aparecida da silva (jessica.apsilva1@gmail.com) on 2018-09-19T23:56:46Z No. of bitstreams: 1 minha dissertação.pdf: 2167197 bytes, checksum: 607a2fc0ec51ef585c61c9a979cb6a64 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Lucia Martins Frederico null (mlucia@fca.unesp.br) on 2018-09-20T13:11:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_ja_me_botfca.pdf: 1665636 bytes, checksum: 0bec742dde8b81c49cc7ae9f4bb81861 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-20T13:11:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_ja_me_botfca.pdf: 1665636 bytes, checksum: 0bec742dde8b81c49cc7ae9f4bb81861 (MD5) Previous issue date: 2018-07-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Uma tecnologia que permite reduzir a adubação nitrogenada mineral aplicada nas culturas é a inoculação das plantas com Azospirillum brasilense, uma bactéria que proporciona benefícios para as plantas que vão além da fixação biologia do nitrogênio atmosférico (N2). Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar o estado nutricional, o acúmulo de matéria seca (MS), a partição de carboidratos e açúcares redutores, a produtividade e a eficiência de uso do N absorvido pelas plantas de mandioca e batata em resposta a inoculação de Azospirillum brasilense em combinação com a adubação nitrogenada. Foram conduzidos quatro experimentos, ou seja, dois em solo natural e dois em solo estéril envolvendo as culturas da batata e da mandioca. Para cada experimento o delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso, no esquema fatorial 2x4, com quatro repetições. Nos experimentos com mandioca (solo natural e estéril) os tratamentos foram representados por 2 formas de fornecimento de Azospirillum brasilense (1 - Com aplicação de Azospirillum brasilense; 2 - Sem aplicação de Azospirillum brasilense), combinadas com quatro doses de N (0, 50, 100 e 200 mg dm-3 de N). Nos experimentos com batata (solo natural e estéril) as formas de inoculação de Azospirillum brasilense foram as mesmas da mandioca, mas as doses de N foram de (0, 75, 150 e 300 mg dm-3 de N). Cada parcela foi representada por um vaso de 38 dm3 contendo uma planta de mandioca e para a batata foi utilizado vasos de 25L. A esterilização do solo foi realizada em autoclave. Na mandioca, as doses de N foram aplicadas metade aos 15 e metade aos 40 dias após a emergência e na batata o N foi parcelado entre 1/3 no plantio, 1/3 aos 15 e 1/3 aos 40 dias após a emergência. Nos tratamentos com inoculação de Azospirillum brasilense foram aplicados 20 ml do produto comercial (Nod) contendo 2,0 x 108 células viáveis por ml, das estirpes Ab-V5 e Ab-V6. Portanto é recomendado a inoculação do A.brasilense para a cultura da mandioca, pois teve aumento da produtividade quando inoculado com a bactéria, entre vários fatores. É recomendado realizar a inoculação da cultura da mandioca com A. brasilense, porque a inoculação da bactéria aumenta o crescimento e a produtividade da mandioca. Na cultura da batata não há razão para se realizar a inoculação das plantas com A. brasilense, porque a inoculação da bactéria não promove benefícios para essa cultura. / CNPq: 134540/2016-6
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Cytokinin interconversion by StCKP1 controls potato tuber dormancy

Bromley, Jennifer Rachael January 2009 (has links)
Worldwide production of potatoes is in excess of 350 million metric tonnes per annum, of which 60% is intended for human consumption. Since the period of tuber dormancy before tuber buds sprout is usually shorter than the optimal market storage period, control of sprouting is essential. To prolong dormancy, tubers are either stored at low temperatures and/or are treated with chemical sprout inhibitors, the use of which subject to increasing scrutiny in the European Union due to their impact upon the environment. Cytokinins, a group of plant growth regulators, are known to play a central role in tuber bud sprouting and tuber initiation from stolon tips in Solanum tuberosum L. although it is unclear when and how cytokinins act to regulate dormancy. The interconversion of cytokinins is incompletely understood. Enzymes identified to date have higher affinities for aminopurines than their cytokinin equivalents. A novel cytokinin binding protein Solanum tuberosum Cytokinin Phosphorylase 1 (StCKP1), has been identified in tuberising stolon tips which shares regions of homology with members of the nucleosidase and phosphoribosyl transferase family. The composition of cytokinin N9 conjugates in tuber bud and surrounding tissue is known to change on transition from a dormant state, with an increase in base and riboside types observed. Analysis of transcripts indicates an increase in abundance of StCKP1 on tuberisation of stolon tips, and high abundance in the periderm of dormant tubers. Analysis of protein abundance by immunoblotting echoes this finding and indicates StCKP1 begins to accumulate in stolon tips shortly before tuberisation, matching binding activity. Transgenic analysis of the cytological reporter gene uidA under the control of two identified promoter regions indicates StCKP1 is expressed predominantly in tuber tissue. Analysis of StCKP1 activity by HPLC and LC-MS-MS shows that StCKP1 catalyses the interconversion of free base and riboside. KMs determined for cytokinin and aminopurine substrates indicate that StCKP1 has a higher affinity for cytokinin substrates and, of these cytokinins, displays a higher affinity for the free base catalysing ribosylation of the N9 to form the corresponding riboside. Desiree cultivars over-expressing StCKP1 under the CaMV 35S promoter exhibited an increased rate of tuberisation of stolon tips and an increase in the length of the dormant period following lifting. Over-expression of StCKP1 was found in particular to increase the chill sensitive period of dormancy, confirming results of StCKP1 knock-down by RNAi. Transcript abundance of StCKP1 at tuberisation in other cultivars including King Edward and Maris Peer was found to correlate with the dormancy characteristics prescribed by the European Cultivated Potato Database and the British potato variety database.
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Transcriptoma Global e de Genes Alvo da Rota de Biossíntese de Glicoalcalóides em Novas Variedades de Solanum tuberosum L.

Mariot, Roberta Fogliatto January 2015 (has links)
Batatas (Solanum tuberosum) juntamente com arroz, trigo e milho, são as culturas mais consumida no mundo. A inclusão de novas variedades de S. tuberosum para consumo humano e sob a forma de ração necessita avaliação quanto sua segurança. Normas internacionais citam glicoalcalóides (GA) como tóxicos-chave em avaliação de novas variedades de batatas. Portanto, o objetivo do trabalho foi propor um modelo de avaliação da segurança de novas variedades de batata, incluindo geneticamente modificados, baseado no transcriptoma e análise comparativa de variedades com histórico de segurança. Adicionalmente, pretendeu-se determinar genes referência para análise transcricional de tubérculos. E ainda, caracterizar os genes glycoalkaloid metabolism (GAMEs), que fazem parte da biossíntese de GA e relacionar sua expressão com o total de glicoalcalóides (TGA) em diferentes genótipos de tubérculos de batatas. Para tanto, construiu-se um banco de dados com RNAseq de 90 tubérculos de batatas com grande variabilidade genética e natural. O banco de dados também foi utilizado para ranquear candidatos a genes normalizadores, baseado no intervalo interquartil (IQR), que, posteriormente, tiveram sua estabilidade calculada pelo: geNorm, NormFinder e BestKeeper. O conteúdo de TGA foi medido em cromatografia líquida de alta eficiência com espectrômetro de massa (CLAE-EM) e a expressão dos GAMEs foi determinada por reação de transcriptase reversa quantitativa seguida da reação em cadeia da polimerase (RT-qPCR). Para análise da região promotora utilizou-se: Plant Pan – Plant Promoter Analysis Navigator. Através dos resultados obtidos e analisados, podemos afirmar que o modelo, quando devidamente validado e finalizado, pode ser considerado bastante promissor. Os genes C2, SEC3 e CUL3A foram considerados como excelentes normalizadores para tubérculos de batata. A expressão dos GAMEs foi maior em tubérculos com maior conteúdo de TGA, e com exceção do GAME7, os genes GAME4, GAME6, GAME8ab, GAME11 e GAME12 demonstraram ser estatisticamente (α = 0,05) mais expressos em amostras com maior teor de TGA e menos em amostras com menor TGA, confirmando a relação destes genes com a produção de glicoalcalóides. Na análise de fatores de transcrição dos GAMEs muitos elementos cis relacionados a estresse biótico e abiótico, e regulação por luz foram encontrados, além de muitas cópias desses elementos cis nas regiões promotoras de todos os GAMEs. Os resultados obtidos no presente trabalho são importantes para um melhor entendimento da formação e regulação dos GA em tubérculos de batatas, auxiliando na predição e prevenção de formação deste composto. / Potato (Solanum tuberosum) is the third most important food crop in the world after rice and wheat in terms of human consumption. The introduction of new varieties of S. tuberosum for food or feed requires the checking of not only substances of pro-nutritional functioning on the human body, but should examine the content of toxic compounds, such as glycoalkaloids (GA), as an international norm recommendation for new potatoes varieties evaluation, including genetic modified. For this reason, the goal of the present work was build a food safety assessment model based on transcriptomics, and comparative with history of safe human consumption. Besides, we intended to determined reference genes for transcriptional analysis of potato tuber, and characterized glycoalkaloid metabolism (GAME) genes that partake of GA biosynthesis pathway. The correlation between the expression of GAME genes and total glycoalkaloids (TGA) content in different genotypes of potato tubers was evaluated. To do so, a database was build with RNASeq data from 90 potato tubers with large genotype and natural variability. These database were also used to ranking the candidates to be reference genes based on Interquartile Range (IQR). The stability of candidates for reference genes were evaluated by geNorm, NormFinder and BestKeeper. The content of TGA were measured on high performance liquid chromatography acoplated on mass spectrometry (LC-MS). Later, Reverse Transcriptase quantitative Polymerase Chain Reactions (RT-qPCR) determined the expression of GAME genes. For the promoter region analysis of GAMEs were used “Plant Pan – Plant Promoter Analysis Navigator”. It is possible affirmed that the food safety assessment model after a properly validation will be promising. The best reference genes for transcriptional analysis studies of potato tubers were C2, SEC3 and CUL3A. The expression of GAME4, GAME6, GAME7, GAME8ab, GAME11, and GAME12 were higher in tubers with high TGA content, and, exception for GAME7, the other GAME genes demonstrate statically (α = 0,05) higher expression on samples with high TGA and lower on samples with low TGA content, confirming that there is a relation between GAME genes and GA biosynthesis. On transcription factors analysis of GAME genes several cis-elements related to abiotic and biotic stress, and light regulated were found, also many copies of these factors in all GAME promoter region. All these results are very helpful to better understand GA formation and regulation on potato tubers, helping to predict and prevent the formation of these toxic.
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lnoculação de Azospirillum brasilense e adubação nitrogenada nas culturas da mandioca e batata / Inoculation of Azospirillum brasilense and Nitrogenated Fertilization in Cultures of Cassava and Potato

Silva, Jessica Aparecida da 25 July 2018 (has links)
Submitted by Jessica Aparecida da silva (jessica.apsilva1@gmail.com) on 2018-09-27T17:00:50Z No. of bitstreams: 1 Minha dissertação.pdf: 2165191 bytes, checksum: 9b962ff31e02957c8895b16531465b22 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Lucia Martins Frederico null (mlucia@fca.unesp.br) on 2018-09-27T18:43:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_ja_me_botfca.pdf: 1865945 bytes, checksum: 22fdbeba04189d23bb83889c45bdb0b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-27T18:43:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_ja_me_botfca.pdf: 1865945 bytes, checksum: 22fdbeba04189d23bb83889c45bdb0b8 (MD5) Previous issue date: 2018-07-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Uma tecnologia que permite reduzir a adubação nitrogenada mineral aplicada nas culturas é a inoculação das plantas com Azospirillum brasilense, uma bactéria que proporciona benefícios para as plantas que vão além da fixação biologia do nitrogênio atmosférico (N2). Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar o estado nutricional, o acúmulo de matéria seca (MS), a partição de carboidratos e açúcares redutores, a produtividade e a eficiência de uso do N absorvido pelas plantas de mandioca e batata em resposta a inoculação de Azospirillum brasilense em combinação com a adubação nitrogenada. Foram conduzidos quatro experimentos, ou seja, dois em solo natural e dois em solo estéril envolvendo as culturas da batata e da mandioca. Para cada experimento o delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso, no esquema fatorial 2x4, com quatro repetições. Nos experimentos com mandioca (solo natural e estéril) os tratamentos foram representados por 2 formas de fornecimento de Azospirillum brasilense (1 - Com aplicação de Azospirillum brasilense; 2 - Sem aplicação de Azospirillum brasilense), combinadas com quatro doses de N (0, 50, 100 e 200 mg dm-3 de N). Nos experimentos com batata (solo natural e estéril) as formas de inoculação de Azospirillum brasilense foram as mesmas da mandioca, mas as doses de N foram de (0, 75, 150 e 300 mg dm-3 de N). Cada parcela foi representada por um vaso de 38 dm3 contendo uma planta de mandioca e para a batata foi utilizado vasos de 25L. A esterilização do solo foi realizada em autoclave. Na mandioca, as doses de N foram aplicadas metade aos 15 e metade aos 40 dias após a emergência e na batata o N foi parcelado entre 1/3 no plantio, 1/3 aos 15 e 1/3 aos 40 dias após a emergência. Nos tratamentos com inoculação de Azospirillum brasilense foram aplicados 20 ml do produto comercial (Nod) contendo 2,0 x 108 células viáveis por ml, das estirpes Ab-V5 e Ab-V6. Portanto é recomendado a inoculação do A.brasilense para a cultura da mandioca, pois teve aumento da produtividade quando inoculado com a bactéria, entre vários fatores. É recomendado realizar a inoculação da cultura da mandioca com A. brasilense, porque a inoculação da bactéria aumenta o crescimento e a produtividade da mandioca. Na cultura da batata não há razão para se realizar a inoculação das plantas com A. brasilense, porque a inoculação da bactéria não promove benefícios para essa cultura. / CNPq: 134540/2016-6

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