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Conception d’un solveur haute performance de systèmes linéaires creux couplant des méthodes multigrilles et directes pour la résolution des équations de Maxwell 3D en régime harmonique discrétisées par éléments finis

Chanaud, Mathieu 18 October 2011 (has links)
Cette thèse présente une méthode parallèle de résolution de systèmes linéaires creux basée sur un algorithme multigrille géométrique. Les estimations de la solution sont calculées par méthode directe sur le niveau grossier ou par méthode itérative de type splitting sur les maillages raffinés; des opérateurs inter-grilles sont définis pour interpoler les solutions approximatives entre les différents niveaux de raffinements. Ce solveur est utilisé dans le cadre de simulations électromagnétiques en 3D (équations de Maxwell en régime harmonique discrétisées par éléments finis de Nédélec de premier ordre) en tant que méthode stationnaire ou comme préconditionneur d’une méthode de Krylov (GMRES). / Multigrid algorithm. The system is solved thanks to a direct method on the coarse mesh anditerative splitting method on refined meshes; inter-grid operators are defined to interpolate theapproximate solutions on the different refinement levels. Applied to 3D electromagnetic simulations(Nédélec first order finite element approximation of time harmonic Maxwell equations) thissolver is used either as a stationary method or as a preconditioner for a Krylov subspace method(GMRES).
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On the use of low-rank arithmetic to reduce the complexity of parallel sparse linear solvers based on direct factorization techniques / Utilisation de la compression low-rank pour réduire la complexité des solveurs creux parallèles basés sur des techniques de factorisation directes.

Pichon, Grégoire 29 November 2018 (has links)
La résolution de systèmes linéaires creux est un problème qui apparaît dans de nombreuses applications scientifiques, et les solveurs creux sont une étape coûteuse pour ces applications ainsi que pour des solveurs plus avancés comme les solveurs hybrides direct-itératif. Pour ces raisons, optimiser la performance de ces solveurs pour les architectures modernes est un problème critique. Cependant, les contraintes mémoire et le temps de résolution limitent l’utilisation de ce type de solveur pour des problèmes de très grande taille. Pour les approches concurrentes, par exemple les méthodes itératives, des préconditionneurs garantissant une bonne convergence pour un large ensemble de problèmes sont toujours inexistants. Dans la première partie de cette thèse, nous présentons deux approches exploitant la compression Block Low-Rank (BLR) pour réduire la consommation mémoire et/ou le temps de résolution d’un solveur creux. Ce format de compression à plat, sans hiérarchie, permet de tirer profit du caractère low-rank des blocs apparaissant dans la factorisation de systèmes linéaires creux. La solution proposée peut être utilisée soit en tant que solveur direct avec une précision réduite, soit comme un préconditionneur très robuste. La première approche, appelée Minimal Memory, illustre le meilleur gain mémoire atteignable avec la compression BLR, alors que la seconde approche, appelée Just-In-Time, est dédiée à la réduction du nombre d’opérations, et donc du temps de résolution. Dans la seconde partie, nous présentons une stratégie de reordering qui augmente la granularité des blocs pour tirer davantage profit de la localité dans l’utilisation d’architectures multi-coeurs et pour fournir de tâches plus volumineuses aux GPUs. Cette stratégie s’appuie sur la factorisation symbolique par blocs pour raffiner la numérotation produite par des outils de partitionnement comme Metis ou Scotch, et ne modifie pas le nombre d’opérations nécessaires à la résolution du problème. A partir de cette approche, nous proposons dans la troisième partie de ce manuscrit une technique de clustering low-rank qui a pour objectif de former des clusters d’inconnues au sein d’un séparateur. Nous démontrons notamment les intérêts d’une telle approche par rapport aux techniques de clustering classiquement utilisées. Ces deux stratégies ont été développées pour le format à plat BLR, mais sont également une première étape pour le passage à un format hiérarchique. Dans la dernière partie de cette thèse, nous nous intéressons à une modification de la technique de dissection emboîtée afin d’aligner les séparateurs par rapport à leur père pour obtenir des structures de données plus régulières. / Solving sparse linear systems is a problem that arises in many scientific applications, and sparse direct solvers are a time consuming and key kernel for those applications and for more advanced solvers such as hybrid direct-iterative solvers. For those reasons, optimizing their performance on modern architectures is critical. However, memory requirements and time-to-solution limit the use of direct methods for very large matrices. For other approaches, such as iterative methods, general black-box preconditioners that can ensure fast convergence for a wide range of problems are still missing. In the first part of this thesis, we present two approaches using a Block Low-Rank (BLR) compression technique to reduce the memory footprint and/or the time-to-solution of a supernodal sparse direct solver. This flat, non-hierarchical, compression method allows to take advantage of the low-rank property of the blocks appearing during the factorization of sparse linear systems. The proposed solver can be used either as a direct solver at a lower precision or as a very robust preconditioner. The first approach, called Minimal Memory, illustrates the maximum memory gain that can be obtained with the BLR compression method, while the second approach, called Just-In-Time, mainly focuses on reducing the computational complexity and thus the time-to-solution. In the second part, we present a reordering strategy that increases the block granularity to better take advantage of the locality for multicores and provide larger tasks to GPUs. This strategy relies on the block-symbolic factorization to refine the ordering produced by tools such as Metis or Scotch, but it does not impact the number of operations required to solve the problem. From this approach, we propose in the third part of this manuscript a new low-rank clustering technique that is designed to cluster unknowns within a separator to obtain the BLR partition, and demonstrate its assets with respect to widely used clustering strategies. Both reordering and clustering where designed for the flat BLR representation but are also a first step to move to hierarchical formats. We investigate in the last part of this thesis a modified nested dissection strategy that aligns separators with respect to their father to obtain more regular data structure.
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Methode multigrilles parallèle pour les simulations 3D de mise en forme de matériaux / Methode multigrilles parallèle pour les simulations 3D de mise en forme de matériaux

Vi, Frédéric 16 June 2017 (has links)
Cette thèse porte sur le développement d’une méthode multigrilles parallèle visant à réduire les temps de calculs des simulations éléments finis dans le domaine de la mise en forme de pièces forgées en 3D. Ces applications utilisent une méthode implicite, caractérisées par une formulation mixte en vitesse/pression et une gestion du contact par pénalisation. Elles impliquent de grandes déformations qui rendent nécessaires des remaillages fréquents sur les maillages tétraédriques non structurés utilisés. La méthode multigrilles développée suit une approche hybride, se basant sur une construction géométrique des niveaux grossiers par déraffinement de maillage non emboîtés et sur une construction algébrique des systèmes linéaires intermédiaires et grossiers. Un comportement asymptotique quasi-linéaire et une bonne efficacité parallèle sont attendus afin de permettre la réalisation de simulations à grand nombre de degrés de liberté dans des temps plus raisonnables qu’aujourd’hui. Pour cela, l’algorithme de déraffinement de maillages est compatible avec le calcul parallèle, ainsi que les opérateurs permettant les transferts de champs entre les différents niveaux de maillages partitionnés. Les spécificités des problèmes à traiter ont mené à la sélection d'un lisseur plus complexe que ceux utilisés plus fréquemment dans la littérature. Sur la grille la plus grossière, une méthode de résolution directe est utilisée, en séquentiel comme en calcul parallèle. La méthode multigrilles est utilisée en tant que préconditionneur d’une méthode de résidu conjugué et a été intégrée au logiciel FORGE NxT et montre un comportement asymptotique et une efficacité parallèle proches de l’optimal. Le déraffinement automatique de maillages permet une compatibilité avec les remaillages fréquents et permet à la méthode multigrilles de simuler un procédé du début à la fin. Les temps de calculs sont significativement réduits, même sur des simulations avec des écoulements particuliers, sur lesquelles la méthode multigrilles ne peut être utilisée de manière optimale. Cette robustesse permet, par exemple, de réduire de 4,5 à 2,5 jours le temps de simulation d’un procédé. / A parallel multigrid method is developed to reduce large computational costs involved by the finite element simulation of 3D metal forming applications. These applications are characterized by a mixed velocity/pressure implicit formulation with a penalty formulation to enforce contact and lead to large deformations, handled by frequent remeshings of unstructured meshes of tetrahedral. The developed multigrid method follows a hybrid approach where the different levels of non-nested meshes are geometrically constructed by mesh coarsening, while the linear systems of the intermediate and coarse levels result from the algebraic approach. A close to linear asymptotical behavior is expected along with parallel efficiency in order to allow simulations with large number of degrees of freedom under reasonable computation times. These objectives lead to a parallel mesh coarsening algorithm and parallel transfer operators allowing fields transfer between the different levels of partitioned meshes. Physical specificities of metal forming applications lead to select a more complex multigrid smoother than those classically used in literature. A direct resolution method is used on the coarsest mesh, in sequential and in parallel computing. The developed multigrid method is used as a preconditioner for a Conjugate Residual algorithm within FORGE NxT software and shows an asymptotical behavior and a parallel efficiency close to optimal. The automatic mesh coarsening algorithm enables compatibility with frequent remeshings and allows the simulation of a forging process from beginning to end with the multigrid method. Computation times are significantly reduced, even on simulations with particular material flows on which the multigrid method is not optimal. This robustness allows, for instance, reducing from 4.5 to 2.5 days the computation of a forging process.

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