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Gene networks from genome wide association studies for pigs reproductive traits / Redes gênicas a partir de estudos de associação genômica ampla para características reprodutivas de suínos

Verardo, Lucas Lima 31 July 2015 (has links)
Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-11-20T15:05:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 16390235 bytes, checksum: bf9c167c7ae478892635d42c1cdc9bff (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-20T15:05:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 16390235 bytes, checksum: bf9c167c7ae478892635d42c1cdc9bff (MD5) Previous issue date: 2015-07-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Características reprodutivas em suínos como numero de natimortos (SB), numero total de nascidos (TNB) e numero de tetos (NT) são amplamente incluídos em programas de melhoramento devido suas importâncias na indústria. Ao contrário da maioria dos estudos de associação, que consideram fenótipos contínuos com um enfoque Gaussiano, estas características são conhecidas como variáveis discretas, podendo assim, potencialmente seguir outras distribuições como a Poisson. Além disso, apesar de haver vários estudos de associação genômica ampla (GWAS) sendo realizados, somente alguns vem explorando os significados biológicos dos genes identificados nestes estudos. O presente trabalho, usando análises pós-GWAS, fornece uma valiosa fonte de informações sobre genes identificados a partir de estudos de associação para características reprodutivas. As analises de distribuição em modelos genômicos demonstraram a importância em considerar modelos de contagem para SB. Além do mais, diferentes grupos de SNPs e blocos de QTL relevantes entre e dentro de cada estudo foram identificados, direcionando para a possibilidade de diferentes grupos de genes estarem desempenhando funções biológicas relacionadas a uma única característica. Deste modo, destacamos que a diversidade genômica entre populações/ambientes deve ser observada em programas de melhoramento de modo que populações de referência especificas para cada população/ambiente sejam consideradas em estudos genômicos. Com base nestes resultados, nós demonstramos a importância das análises pós-GWAS aumentando o entendimento biológico de genes relevantes para características complexas. / Reproductive traits in pigs, such as number of stillborn (SB), total number born (TNB) and number of teats (NT), are widely included in breeding programs due their importance to the industry. As opposite to most association studies that consider continuous phenotypes under Gaussian assumptions, these traits are characterized as discrete variable, which could potentially follow other distributions, such as the Poisson. In addition, even though many genome wide association studies (GWAS) have been performed, only a few studies have explored biological meanings of genes identified. The present study provided a rich information resource about genes identified using genome wide association approaches for reproductive traits. The distribution analyses in genomic models, highlighted the importance in consider counting models for SB. Moreover, different sets of relevant SNPs and QTL blocks across and within the studies were identified leading to the possibility of different set of genes playing biological roles related to a single complex trait. Thereby, we highlighted the genomic diversity across population/environments to be observed in breeding programs in such a way that population/environments specific reference populations might be considered in genomic analyses. Based on these results, we demonstrated the importance of post-GWAS analyses increasing the biological understanding of relevant genes for complex traits.
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Lamina de agua em baias de gestação para suinos

Lagana, Christine 29 June 1995 (has links)
Orientador: Irenilza A. Naas / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-20T11:22:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Lagana_Christine_M.pdf: 1124995 bytes, checksum: 761d9cdde8ebb42aca5f3fbadc4ffc4b (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: A maioria dos problemas relacionados com a produção de porcas gestantes,criadasem confinamento em climas quentes, é devido a incidência de estresse pelas altas temperaturas. O acesso à água faz com que haja possibilidade de ser alcançada a sensação de conforto térmico, pela otimização das trocas térmicas por condução e por evaporação. Em porcas gestantes o estresse térmico produz altos níveis de aborto e de leitões mumificados, bem como baixos níveis de desempenho dos leitões, alterando também os níveis hormonais de LH e de progesterona da fêmea. O objetivo principal deste trabalho foi procurar entender e interpretar o desempenho de porcas gestantes, no sistema que utiliza uma lâmina de água corrente na baia, permitindo o acesso constante .a água como fonte de troca térmica, e de conforto. Foram estudados os efeitos de dois tipos de instalações para gestação de fêmeas. O primeiro método, foi o sistema tradicionalmente usado com piso de concreto, comparado a um segundo que utiliza uma canaleta de água corrente, de dimensões de um metrode largura em toda a extensão da baia, e do 'galpão; quinze centímetros de profundidade, sendo cinco centímetros de lâmina d' água. Foram tomados dados ambientais das baias, diariamente durante toda a gestação, à partir da fixação do embrião, até a parição. Foram também avaliados os parâmetros de produtividade, no nascimento dos leitões, como: número de descartados (somatória de abortos, de leitões mumificados e deformados), bem como número de leitões por parto e peso médio de leitões vivos.Tanto o microclima, bem como a resposta produtiva da porca não tiveram diferenças significativas, mas a sensação de conforto é ressaltada devido à um menor número de animais descartados / Abstract: Most problems related to gestating sows production, housed in hot weather is due to high environmental temperatures. The acess of water, other than drinking water, provides the possibility of reaching thermal conforto As the evaporation swine system is defficient and it only improves the heat exchange when water is spayed on its skin. In gestation sows , the heat stress produces higher levels of abortion, and fossiles piglets and also alters the levei of LH, and progesteron. The main objective of this research was to understand the performance of the gestating sows in the system that utilizes the running water pool, permiting a constant access to this water, as a refreshing optional thermal confort for gestating sows in hot weather. The dimensions were one meter large in the whole extension of the building, ten centimeters of depth, being tive of running water. Environmental data was collected daily during the gestating period, after the embrio fixation, up to birth. There were also evaluated productivity parameters at the piglets birth / Mestrado / Ambiencia / Mestre em Engenharia Agrícola
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Processo de compostagem : alternativa complementar para tratamento de camas biologicas de dejetos de suinos

Goulart, Rosimery Maciel January 1997 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnologico / Made available in DSpace on 2012-10-17T00:15:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Estudo comparativo entre dois sistemas de compostagem: sistema de Leiras Estáticas Aeradas e, sistema de Leiras reviradas, utilizando camas de dejetos de suínos. Com o objetivo de ressaltar a importância da utilização de camas de serragem na diminuição dos dejetos líquidos de suínos. Com posterior utilização deste material como fertilizante orgânico.
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Efeito da adição do ácido butírico e da fitase na digestabilidade de nutrientes em suínos na fase crescimento / Effect of the addtion of butyric acid and phytase in the digestibility of nutrients in growing pigs

Machinsky, Taiane Golfetto January 2008 (has links)
A baixa disponibilidade das fontes minerais, entre eles o cálcio e o fósforo, são um dos atuais problemas enfrentados na suinocultura, pois além de seus custos adicionais com a suplementação nas rações, uma parte significativa destes minerais é eliminada com as fezes, acirrando ainda mais os efeitos de poluição. Para amenizar estes efeitos, algumas estratégias nutricionais são apontadas como a suplementação de ácidos orgânicos e enzimas. A utilização de ácido butírico e fitase na alimentação de suínos pode proporcionar diversos efeitos no trato digestório, entre os quais aumentar a digestibilidade dos minerais. Neste trabalho foi testada a inclusão do butirato de sódio 84% (0 ou 0,3%) e da fitase exógena de origem bacteriana Escherichia coli (0 ou 500 FTU/kg) em dietas com dois níveis de cálcio (0,5 ou 0,72%) cujo objetivo foi avaliar a retenção aparente de cálcio e fósforo, além do desempenho e metabolizabilidade dos demais nutrientes em suínos na fase crescimento. Foram utilizados 32 suínos, machos, castrados, de linhagem comercial, com peso inicial de 25 kg. Utilizou-se um esquema fatorial 2X2x2 em um delineamento completamente casualizado, com 4 repetições. As variáveis analisadas foram consumo de ração, ganho de peso, conversão alimentar, digestibilidade total aparente da matéria seca (CDMS), proteína bruta (CDPB), energia bruta (CDEB), cinzas (CDCz), a metabolizabilidade da energia bruta (CMEB), o coeficiente de retenção de nitrogênio (CRN) e o balanço de cálcio e fósforo. Para os resultados de desempenho, observou-se que os níveis de cálcio influenciaram o consumo de ração. Já o ganho de peso foi afetado pelos níveis de cálcio e fitase. No entanto, não houve diferença significativa para a conversão alimentar. Para a digestibilidade dos nutrientes observou-se apenas que o CDPB foi maior quando houve a inclusão de ácido butírico na dieta. Para o balanço de minerais, verificou-se que os níveis de cálcio influenciaram o balanço de cálcio e fósforo, onde o menor nível proporcionou maior digestibilidade e retenção destes minerais. O conteúdo de cálcio também interferiu na excreção de fósforo pela urina, que foi maior quando seus níveis eram menores. A presença de fitase melhorou a digestibilidade e retenção do cálcio e fósforo, reduzindo suas perda nas fezes complexados ao fitato. Os resultados encontrados permitem concluir que os níveis de cálcio da dieta interferiram no balanço de cálcio e fósforo em suínos na fase crescimento e que a adição da fitase melhorou suas retenções. Já a adição do ácido butírico contribuiu para melhorar a digestibilidade da proteína bruta. / The low availability of mineral sources, including calcium and phosphorus, are one of the current problems in pig nutrition, as well as its additional costs with the dietary supplement, a significant proportion of these minerals is eliminated with the faeces, with further effects on environmental pollution. To mitigate these effects, the nutritional supplementation of organic acids and enzymes are some strategies proposed. The use of butyric acid and phytase in feed for pigs may provide different effects in digestive tract, including enhancement the digestibility of mineral. This work tested the inclusion of sodium butyrate 84% (0 or 0.3%) and Escherichia coli phytase (0 or 500 FTU / kg) in diets with two calcium levels (0.5 or 0.72%) with the purpose of evaluating the calcium and phosphorus apparent retention, beyond performance and nutrients metabolizability in growing pigs. In this study were used 32 male castrated commercial pigs, with initial weight of 25 kg. Experimental diets were assigned in a 2X2x2 factorial arrange in a completely randomized design, with 4 repetitions. The responses evaluated were feed intake, weight gain, feed conversion, dry matter, crude protein, energy, ash apparent total tract digestibility (ATTD), energy metabolizability, nitrogen retention coefficient, calcium and phosphorus balance. For the results of animal performance, it was observed that calcium levels influenced the feed intake, and calcium and phytase levels affected the weight gain. However, there was no significant difference in feed conversion. Digestibility of nutrients was unaffected by treatments, except for a slight increase in crude protein ATTD with the inclusion of butyric acid in the diet. For Ca and P balance, it was found that calcium levels influenced the calcium and phosphorus balance, where the lowest level provided higher digestibility and retention. The calcium content also interfered in the urine excretion of phosphorus, which was higher with the lower calcium level. The addition of phytase improved calcium and phosphorus digestibility and retention, reducing its loss in faeces. The results show that the calcium levels in the diet interfered in the calcium and phosphorus balance in growing pigs and that the addition of phytase improved their retention and this triggers a possibility of formulating diets with lower calcium levels.
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Regressão quantílica aplicada ao estudo de seleção genômica para características assimétricas de suínos / Quantile regression applied to genomic selection for asymmetric traits in pigs

Santos, Patricia Mendes dos 26 February 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2016-07-29T10:26:42Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 886084 bytes, checksum: 700517bd341297c23be0bbb3a9d8637b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-29T10:26:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 886084 bytes, checksum: 700517bd341297c23be0bbb3a9d8637b (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Em programas de melhoramento, seja para predição do mérito genético individual ou para identificar regiões genômicas responsáveis por fenótipos de interesse econômico, o uso de informações dos marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) tem se tornado uma importante ferramenta e para tanto, diferentes métodos estatísticos têm sido empregados. Dentre os métodos comumente utilizados, destaca-se o método Lasso bayesiano (BLASSO) que, como as demais metodologias apresentadas na literatura, estima apenas o efeito dos marcadores em termos do valor médio da característica de interesse. Porém, em algumas situações, os fenótipos avaliados não possuem distribuição simétrica e, portanto, uma modelagem considerando a estimação dos efeitos de marcadores em diferentes níveis da variável de interesse pode ser mais adequada. Uma metodologia alternativa e ainda pouco explorada na seleção genômica, é a Regressão Quantílica Regularizada, a qual incorpora naturalmente o estudo de diferentes níveis da distribuição dos valores fenotípicos, bem como a seleção de variáveis e a regularização do processo de estimação. Diante do exposto, este trabalho propõe a utilização da Regressão Quantílica Regularizada, visando predizer os valores genéticos de suínos para as características de rendimento de carcaça (RCARC), espessura de bacon (EBACON) e espessura de toucinho imediatamente após a última costela na linha dorso-lombar (ETUC) em diferentes níveis da distribuição dessas variáveis. Os resultados obtidos por esta metodologia, em termos de acurácia, da classificação dos animais para seleção e efeitos de marcadores, foram comparados com aqueles advindos do método BLASSO. Para tanto, foram utilizados dados de uma população F 2, referente a 345 suínos, obtidos pelo cruzamento das raças Piau x Comercial. As funções quantílicas foram ajustadas para (r = 0,05 a r = 0,95 ), e para fins de comparação das metodologias, considerou-se nos ajustes via RQR além dos valores do parâmetro de encolhimento (λ) estimado a partir do método BLASSO, um grid de valores considerando valores variando de 0 até o valor fornecido pelo BLASSO, com intervalo de 0,5. Os modelos de regressão quantílica se apresentaram como uma alternativa interessante quando o interesse é predizer os valores genômicos dos animais, uma vez que os mesmos apresentaram valores de acurácia maiores ou iguais àqueles obtidos pelo BLASSO. Além disso, os resultados dos métodos para as variáveis ETUC e EBACON foram semelhantes e para RCARC foram diferentes no que se refere à classificação dos animais. Quanto ao padrão dos efeitos de marcadores, os resultados encontrados pelos métodos para as variáveis foram diferentes. / In breeding programs, used to predict the individual genetic merit or to identify genomic regions responsible for phenotypes of economic interest, the use of information from SNP markers (Single Nucleotide Polymorphisms) has become an important tool and due to it, different statistical methods have been employed. Among the methods commonly used for this purpose, the most used is the Bayesian Lasso method called BLASSO that, like other methods presented in the literature, only estimates the markers effect related to the average value of the characteristic of interest. However, in some situations, the evaluated phenotypes don’t have symmetrical distribution and thus a modeling considering estimation of the effect on markers in different levels of variable of interest may be more suitable. An alternative methodology and still not much explored in genomic selection, is the regularized quantile regression, which naturally includes the study of different levels of the phenotypic values distribution as well as the selection of variables and the regularization of the estimation process. Given the situation above, this paper proposes the use of regularized quantile regression, aiming to predict the genetic values of pigs for characteristics carcass yield (CY), bacon depth (BD) and midline backfat thickness immediately after the last rib dorsolumbar (LRBF) at different levels of the distribution of these variables. Moreover, the results obtained by this method, in terms of accuracy of classification and selection of animals for significance markers are compared with those arising from the usual method, (BLASSO). To obtain this result, we used data from an F 2 population of 345 pigs, obtained by crossing the Piau x Commercial race. The quantile functions were adjusted for (r = 0.05 to r = 0.95) and for comparison of methodologies, considered in RQR via adjustments in addition to the values of the shrinkage parameter (λ) estimated from the BLASSO method, a grid values are values ranging from 0 to the value provided by BLASSO with an interval of 0,5. The quantile regression models were presented as an interesting alternative when interest is to predict the genomic values of the animals, since they had higher accuracy than or equal to those obtained by BLASSO. Moreover, the results of the methods for LRBF and BD variables were similar and were CY different as regards the classification of the animals. Regarding the pattern of markers effects, the results found by the methods for the variables were different.
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Valor nutricional do farelo de arroz desengordurado e desfitinizado em dietas para suínos em crescimento / Nutritional value of dephytinizated defatted rice bran in diets for growing pigs

Dadalt, Julio Cezar January 2012 (has links)
A inclusão de alimentos alternativos em dietas para animais monogástricos vem se tornando uma prática cada vez mais comum na indústria de rações. A inclusão do farelo de arroz desengordurado em rações de suínos tem sido alvo de estudos por muitos pesquisadores, já que este ingrediente apresenta valores elevados de proteína bruta e fósforo e seu baixo conteúdo de óleo minimiza os problemas relacionados à peroxidação. No entanto, seu uso é limitado nas dietas de não ruminantes, devido a grande quantidade de fatores antinutricionais presentes, principalmente o ácido fítico. Objetivou-se com o presente trabalho avaliar o valor nutricional do farelo de arroz desengordurado desfitinizado (FADD) na dieta de suínos em crescimento e compará-lo ao farelo de arroz desengordurado (FAD) suplementado ou não com fitase. Trinta e seis suínos, machos castrados, de linhagem comercial, foram distribuídos em gaiolas metabólicas, em dois períodos de 10 dias, com 5 dias de adaptação e 5 dias de coleta total de fezes e urina. Os pesos iniciais dos suínos nos dois períodos foram 29 ± 0,73 e 37 ± 0,55 kg, respectivamente. O delineamento foi em blocos incompletos, sendo o bloco o período, com cinco tratamentos e sete repetições. A dieta referência foi substituída em 30% pelos ingredientes testes originados de uma mesma partida. Duas dietas referência, com e sem fitase, à base de milho e farelo de soja, foram usadas com o objetivo de estudar a influência da dieta referência na digestibilidade da energia. Dentre as três combinações estudadas, o FADD foi o ingrediente com maior valor de energia digestível (2545 kcal/kg), metabolizável (2519 kcal/kg) e proteína digestível (12,18%). A inclusão de 1310 FTU de uma fitase de origem bacteriana melhorou a utilização do cálcio, do fósforo e aumentou a digestibilidade da matéria seca e da proteína bruta do FAD, não tendo diferido, no entanto, do FADD. O FAD sem fitase teve os menores coeficientes de digestibilidade em todas as respostas obtidas. O uso de 439 FTU de fitase na dieta referência não influenciou no cálculo da energia do FAD. O processo de desfitinização pode ser uma alternativa ao uso do FAD + fitase, visto que melhora a qualidade nutricional deste ingrediente. Fitase não só melhororu o aproveitamento de Ca e P, como também a energia e a proteína da dieta. / The evaluation of alternative foods has become a common pratice in monogastric animals diets. The inclusion of defatted rice bran in pig diets has been investigated by many researchers, since this ingredient has high levels of crude protein and phosphorus and its low oil content minimizes problems related to peroxidation. However, its use is limited in the non-ruminants diets, due to large amounts of antinutritional factors, especially phytate. The aim of this study was evaluate the nutritional value of dephytinizated defatted rice bran (DDRB) in growing pigs diets and compare it to the defatted rice bran (DRB) with or without phytase supplemented. Thirty-six barrow pigs, from a commercial lineage, were distributed in metabolic cages, into two periods of 10 days, with 5 days for adaptation and 5 days of total feces and urine collection. Pigs initial weights in the two periods were 29 ± 0,73 e 37 ± 0,55 kg, respectively. The experimental design was made by incomplete blocks, and the block was the period. The reference diet was replaced by 30% by the ingredients test from the same origin. Two reference diets, with and without phytase, formulated based on corn and soybean meal, were used to evaluate the influence of the reference diet on energy digestibility. Among the three combinations studied, the DDRB was the ingredient with the highest digestible energy (2545 kcal/kg), metabolizable energy (2519 kcal/kg) and digestible protein (12,18%). The inclusion of 1310 FTU bacterial phytase increased utilization of calcium, phosphorus and improved the digestibility of dry matter and crude protein of FAD, with no differences from DDRB however. The DRB without phytase had the lowest digestibility coefficients for all the responses. The use of 439 FTU phytase in the reference diet did not influence the DRB energy calculation. Dephytinization process may be an alternative for the use of FAD + phytase, since this improves nutritional quality of this ingredient. Phytase improved not only Ca e P, but also energy and protein digestibility.
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Avaliação da eficácia de ovos hiperimunizados (igY) no controle de diarreia pós-desmame em leitões / Evaluation of the efficacy of eggs hiperimmunized (IGY) in control of diarrhoea in post-weaned piglets

Rosa, Daniele Pozzebon da January 2014 (has links)
A mudança na alimentação de leitões, no desmame, está associada a um período de estresse e jejum que resulta em depleção do trato gastrointestinal prejudicando a absorção de nutrientes e também oportunizando a multiplicação de bactérias patogênicas causadoras de diarreia. Escherichia coli enterotoxigênica (ETEC) é uma das principais causas de diarreia pós desmame em leitões e acarreta grandes perdas econômicas na fase de creche. Com a restrição gradual do uso de antibióticos pelo mercado, é necessário pesquisar aditivos alimentares que proporcionem proteção aos leitões e evitem quedas de desempenho. A imunização passiva, através do uso de gemas de galinhas hiperimunizadas (IgY) é uma alternativa atraente aos antibióticos. O objetivo do presente estudo foi avaliar a eficácia de um produto comercial chamado GLOGIGEN® Jump Start, à base de gemas de ovos de galinhas hiperimunizadas (IgY), no controle à diarreia causada por Escherichia coli enterotoxigênica (ETEC) F4 e F18 em leitões recém-desmamados. Os animais foram desafiados com 1010UFC/leitão de E. coli F4 e F18 e ciclos de calor por três dias consecutivos a partir do primeiro dia de experimento. Com 22 dias de idade, 32 leitões recém-desmamados foram distribuídos em grupos. O grupo I, como controle negativo não foi desafiado com ETEC e recebeu colistina como antibiótico promotor de crescimento, óxido de zinco e sulfato de cobre. Os outros três grupos foram desafiados com ETEC tendo 0,2% de GLOBIGEN® na dieta (Grupo II), 4% de inclusão de PSS (Grupo III) e um controle positivo(Grupo VI). Avaliou-se o desempenho por 24 dias, escore e matéria seca fecal a partir do segundo dia de inoculação, por 10 dias consecutivos. Também foram recolhidas amostras de fezes durante os oito primeiros dias de experimento, no 15º e no 24º dias para determinar o número de células de ETEC excretadas, pela técnica de PCR quantitativo e para a detecção da presença das fímbrias F4 e F18 e das enterotoxinas STa, STb e LT pela reação de cadeia polimerase (PCR) multiplex. O Grupo II apresentou maior peso corporal e ganho de peso (p<0,05) do que o Grupo VI e não diferiu do Grupo I (p>0,05) e melhor eficiência alimentar do que o Grupo III (p<0,05). O uso do GLOBIGEN® resultou em fezes moles (escore ≤ 1) que os animais do Grupo III e IV (p<0,05) e reduziu a excreção de F4 e F18 (p<0,05) em relação ao Grupo VI. A presença das enterotoxinas foi menor no Grupo II provavelmente relacionada à menor excreção das ETEC. A associação F18/STa/STb e F4/LT foi observada. Os resultados deste estudo sugerem que o GLOBIGEN® age eficientemente no controle à diarreia podendo ser uma alternativa ao uso de antimicrobianos em leitões recém-desmamados. / The change in the piglets’ feeding, at weaning, is associated with a stress and fasting period that results in depletion of the gastrointestinal tract impairing the absorption of nutrients and also giving opportunity to the multiplication of pathogenic bacteria causing diarrhea. Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) is a major cause of diarrhoea in piglets after weaning and brings great economic losses in the nursery phase. With the gradual restriction of the use of antibiotics by the market, it is necessary to search for food additives that provide protection to piglets and avoid performance drops. Passive immunization through the use of egg yolks of hyperimmunized chickens (IgY) is an attractive alternative to antibiotics.The objective of this trial was to evaluate the effect of a commercial product based on egg-yolk from hens hyperimmunized (GLOBIGEN® Jump Star) to control diarrhoea caused by enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) F4 and F18 in weaned pigs. The animals were challenged with both 1010 CFU/piglet E. coli F4 and F18 and heat cycles for three consecutive days from the first day of the experiment. Thirty-two 22-d-old weaned piglets were divided into groups. Group I as a negative control was unchallenged and received colistin as growth promoter, zinc oxide and copper sulfate. The other three groups were challenged with ETEC were fed a diet with 0.2% GLOBIGEN ® (Group II), including 4% DPP (Group III) and a positive control (Group VI). For 24d evaluated the performance, score and faecal dry matter for 10 consecutive days from second day of the challenged. Fecal samples were also collected during the first eight days of the experiment, later in the 15th and 24th days to determine to determine the number of CFU of ETEC in excreted faeces by the technique of quantitative Polymerase Chain Reaction (PCR) and detecting the presence of fimbriae F4 and F18 and enterotoxin STa, STb and LT by PCR multiplex., Group II provided higher body weight and weight gain (p<0.05) compared with the Group IV, Group I did not differ (p>0.05) and feed efficiency higher than Group III (p<0.05). The use of GLOBIGEN® results soft feces (score ≤ 1) recovering in less time than animals of Groups III and IV (p<0.05) and excretion of F18 and F4 (p<0.05) was lower compared with the Group IV. The presence of toxins was lower in Group II, probably related to excretion reduced of fimbriae. The F18/STa/STb and F4/LT association was observed. The results of the study suggest that GLOBIGEN® acts effectively in control of diarrhoea and can be an alternative to the use of antimicrobials in weanling piglets.
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Avaliação de programas nutricionais com redução do nível de proteína bruta e fósforo total da dieta para suínos nas fases de crescimento e terminação / Evaluation of nutritional programs reducing dietary crude protein and total phosphorus levels in growing-finishing pigs

Monteiro, Alessandra Nardina Trícia Rigo January 2014 (has links)
Para a formulação de dietas para suínos comumente utilizam-se exigências nutricionais tabeladas, que são estabelecidas com uma margem de segurança para que todos os animais expressem a máxima resposta, o que pode resultar em maior quantidade de nutrientes excretados. O objetivo deste trabalho foi avaliar programas nutricionais com redução da proteína bruta (PB) e fósforo total (PT) da dieta, através de simulações do software de modelagem InraPorc®, sobre o desempenho e características de carcaça e carne de suínos durante as fases de crescimento e terminação. Cada fase foi dividida em dois períodos. Foram utilizados 40 fêmeas e 40 machos castrados, distribuídos em delineamento em blocos casualizados com dois tratamentos e 10 repetições/tratamento de quatro a . Foram formuladas dietas para cada uma das quatro fases, sendo um dos tratamentos (D1) ajustado pelo modelo InraPorc®, em que se reduziu os níveis de PB e PT, e outro (D2) com uma dieta controle, formulada com níveis nutricionais recomendados por Rostagno et al. (2011). Não houve diferença (P>0,05) no ganho de peso diário (GPD), consumo de ração (CRD) e conversão alimentar (CA) nas fases de crescimento e na terminação II, nem no período total do experimento. Na média, o GPD e o CRD foram de 0,919 e 2,46 kg/dia, respectivamente. Os tratamentos não influenciaram (P>0,05) o consumo de água diário (média de 5,96 litros/dia) e a produção de dejetos (3,88 litros/dia). Nas estimativas de balanço de nitrogênio (N) e fósforo (P), não houve diferença estatística na ingestão de P nas fases de crescimento, e na excreção de P na fase de crescimento II. Na terminação, os animais que receberam a dieta ajustada apresentaram menor (P<0,05) ingestão e excreção de P; os animais do D1 e D2 ingeriram 1157 e 1265 g de P/suíno, respectivamente e a excreção média foi de 628,4 e 726,4 g/suíno, respectivamente. Houve diferença (P<0,05) na ingestão e excreção de N em todas as fases. A ingestão total foi de 5,83 e 6,92 kg de N/suíno e a excreção média foi 3,22 e 4,26 kg/suíno na D1 e D2, respectivamente. A retenção de N e P não foi influenciada (P>0,05) pelos tratamentos. As características de carcaça e de qualidade da carne não foram afetadas (P>0,05) pela dieta. O custo médio total com alimentação foi 6,25% menor (P<0,05) e a receita líquida foi 28,9% superior quando os animais consumiram a dieta com ajuste dos níveis nutricionais. Os resultados demonstram que o ajuste nutricional é uma alternativa viável para as dietas comerciais praticadas no Brasil. / For formulating pig diets are commonly used tabulated nutritional requirements which are established with a margin of safety for all animals express the maximum response, which may result in greater amount of nutrients excreted. The aim of this study was to evaluate nutritional programs, reducing dietary crude protein (CP) and total phosphorus (TP) levels, through InraPorc® modelling software on performance, carcass traits and meat quality of growing-finishing pigs.40 females and 40 barrows were used, distributed in a randomized block design with initial BW and sex serving as the blocking factors, with 2 treatments and 10 replicates/treatment, with four animals per experimental unit. The growing and finishing periods were divided in two phases each. Diets were formulated for each phase, being one (D1) of the treatments adjusted by InraPorc® model, reducing the dietary CP and TP levels. The other treatment (D2) was a control diet formulated with tabulated values (Rostagno et al., 2011). There was no effect (P>0.05) on average daily gain, feed intake and gain to feed ratio in growing and finishing phases, neither in all experimental period. On average, the GPD and the CRD were 0.919 and 2.46 kg / day, respectively. Treatments did not affect (P > 0.05) the daily water consumption (average of 5.96 liters / day) and the production of manure (3.88 liters/day). On estimates of nitrogen (N) and phosphorus (P) balance, there was no statistical difference in P intake during the growing phase, and P excretion in growing phase II. At finishing, the animals that received the adjusted diet had lower (P<0.05) intake and excretion of P; animals of D1 and D2 ingested 1157 and 1265 g P/pig, respectively, and the average excretion was 628.4 and 726.4 g/pig, respectively. There were differences (P<0.05) in N intake and excretion in all phases. The total intake was 5.83 and 6.92 kg N/pig and the mean excretion was 3.22 and 4.26 kg/pig in D1 and D2, respectively. The retention of N and P was not influenced (P>0.05) by treatments. Carcass characteristics and meat quality were not affected (P> 0.05) by diet. The average total feed cost was 6.25% lower (P<0.05) and net revenue was 28.9% higher when animals consumed the diet with nutritional levels of adjustment. The results showed that the nutritional adjustment is a viable alternative to commercial diets used in Brazil.
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Efeito da adição do ácido butírico e da fitase na digestabilidade de nutrientes em suínos na fase crescimento / Effect of the addtion of butyric acid and phytase in the digestibility of nutrients in growing pigs

Machinsky, Taiane Golfetto January 2008 (has links)
A baixa disponibilidade das fontes minerais, entre eles o cálcio e o fósforo, são um dos atuais problemas enfrentados na suinocultura, pois além de seus custos adicionais com a suplementação nas rações, uma parte significativa destes minerais é eliminada com as fezes, acirrando ainda mais os efeitos de poluição. Para amenizar estes efeitos, algumas estratégias nutricionais são apontadas como a suplementação de ácidos orgânicos e enzimas. A utilização de ácido butírico e fitase na alimentação de suínos pode proporcionar diversos efeitos no trato digestório, entre os quais aumentar a digestibilidade dos minerais. Neste trabalho foi testada a inclusão do butirato de sódio 84% (0 ou 0,3%) e da fitase exógena de origem bacteriana Escherichia coli (0 ou 500 FTU/kg) em dietas com dois níveis de cálcio (0,5 ou 0,72%) cujo objetivo foi avaliar a retenção aparente de cálcio e fósforo, além do desempenho e metabolizabilidade dos demais nutrientes em suínos na fase crescimento. Foram utilizados 32 suínos, machos, castrados, de linhagem comercial, com peso inicial de 25 kg. Utilizou-se um esquema fatorial 2X2x2 em um delineamento completamente casualizado, com 4 repetições. As variáveis analisadas foram consumo de ração, ganho de peso, conversão alimentar, digestibilidade total aparente da matéria seca (CDMS), proteína bruta (CDPB), energia bruta (CDEB), cinzas (CDCz), a metabolizabilidade da energia bruta (CMEB), o coeficiente de retenção de nitrogênio (CRN) e o balanço de cálcio e fósforo. Para os resultados de desempenho, observou-se que os níveis de cálcio influenciaram o consumo de ração. Já o ganho de peso foi afetado pelos níveis de cálcio e fitase. No entanto, não houve diferença significativa para a conversão alimentar. Para a digestibilidade dos nutrientes observou-se apenas que o CDPB foi maior quando houve a inclusão de ácido butírico na dieta. Para o balanço de minerais, verificou-se que os níveis de cálcio influenciaram o balanço de cálcio e fósforo, onde o menor nível proporcionou maior digestibilidade e retenção destes minerais. O conteúdo de cálcio também interferiu na excreção de fósforo pela urina, que foi maior quando seus níveis eram menores. A presença de fitase melhorou a digestibilidade e retenção do cálcio e fósforo, reduzindo suas perda nas fezes complexados ao fitato. Os resultados encontrados permitem concluir que os níveis de cálcio da dieta interferiram no balanço de cálcio e fósforo em suínos na fase crescimento e que a adição da fitase melhorou suas retenções. Já a adição do ácido butírico contribuiu para melhorar a digestibilidade da proteína bruta. / The low availability of mineral sources, including calcium and phosphorus, are one of the current problems in pig nutrition, as well as its additional costs with the dietary supplement, a significant proportion of these minerals is eliminated with the faeces, with further effects on environmental pollution. To mitigate these effects, the nutritional supplementation of organic acids and enzymes are some strategies proposed. The use of butyric acid and phytase in feed for pigs may provide different effects in digestive tract, including enhancement the digestibility of mineral. This work tested the inclusion of sodium butyrate 84% (0 or 0.3%) and Escherichia coli phytase (0 or 500 FTU / kg) in diets with two calcium levels (0.5 or 0.72%) with the purpose of evaluating the calcium and phosphorus apparent retention, beyond performance and nutrients metabolizability in growing pigs. In this study were used 32 male castrated commercial pigs, with initial weight of 25 kg. Experimental diets were assigned in a 2X2x2 factorial arrange in a completely randomized design, with 4 repetitions. The responses evaluated were feed intake, weight gain, feed conversion, dry matter, crude protein, energy, ash apparent total tract digestibility (ATTD), energy metabolizability, nitrogen retention coefficient, calcium and phosphorus balance. For the results of animal performance, it was observed that calcium levels influenced the feed intake, and calcium and phytase levels affected the weight gain. However, there was no significant difference in feed conversion. Digestibility of nutrients was unaffected by treatments, except for a slight increase in crude protein ATTD with the inclusion of butyric acid in the diet. For Ca and P balance, it was found that calcium levels influenced the calcium and phosphorus balance, where the lowest level provided higher digestibility and retention. The calcium content also interfered in the urine excretion of phosphorus, which was higher with the lower calcium level. The addition of phytase improved calcium and phosphorus digestibility and retention, reducing its loss in faeces. The results show that the calcium levels in the diet interfered in the calcium and phosphorus balance in growing pigs and that the addition of phytase improved their retention and this triggers a possibility of formulating diets with lower calcium levels.
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Valor nutricional do farelo de arroz desengordurado e desfitinizado em dietas para suínos em crescimento / Nutritional value of dephytinizated defatted rice bran in diets for growing pigs

Dadalt, Julio Cezar January 2012 (has links)
A inclusão de alimentos alternativos em dietas para animais monogástricos vem se tornando uma prática cada vez mais comum na indústria de rações. A inclusão do farelo de arroz desengordurado em rações de suínos tem sido alvo de estudos por muitos pesquisadores, já que este ingrediente apresenta valores elevados de proteína bruta e fósforo e seu baixo conteúdo de óleo minimiza os problemas relacionados à peroxidação. No entanto, seu uso é limitado nas dietas de não ruminantes, devido a grande quantidade de fatores antinutricionais presentes, principalmente o ácido fítico. Objetivou-se com o presente trabalho avaliar o valor nutricional do farelo de arroz desengordurado desfitinizado (FADD) na dieta de suínos em crescimento e compará-lo ao farelo de arroz desengordurado (FAD) suplementado ou não com fitase. Trinta e seis suínos, machos castrados, de linhagem comercial, foram distribuídos em gaiolas metabólicas, em dois períodos de 10 dias, com 5 dias de adaptação e 5 dias de coleta total de fezes e urina. Os pesos iniciais dos suínos nos dois períodos foram 29 ± 0,73 e 37 ± 0,55 kg, respectivamente. O delineamento foi em blocos incompletos, sendo o bloco o período, com cinco tratamentos e sete repetições. A dieta referência foi substituída em 30% pelos ingredientes testes originados de uma mesma partida. Duas dietas referência, com e sem fitase, à base de milho e farelo de soja, foram usadas com o objetivo de estudar a influência da dieta referência na digestibilidade da energia. Dentre as três combinações estudadas, o FADD foi o ingrediente com maior valor de energia digestível (2545 kcal/kg), metabolizável (2519 kcal/kg) e proteína digestível (12,18%). A inclusão de 1310 FTU de uma fitase de origem bacteriana melhorou a utilização do cálcio, do fósforo e aumentou a digestibilidade da matéria seca e da proteína bruta do FAD, não tendo diferido, no entanto, do FADD. O FAD sem fitase teve os menores coeficientes de digestibilidade em todas as respostas obtidas. O uso de 439 FTU de fitase na dieta referência não influenciou no cálculo da energia do FAD. O processo de desfitinização pode ser uma alternativa ao uso do FAD + fitase, visto que melhora a qualidade nutricional deste ingrediente. Fitase não só melhororu o aproveitamento de Ca e P, como também a energia e a proteína da dieta. / The evaluation of alternative foods has become a common pratice in monogastric animals diets. The inclusion of defatted rice bran in pig diets has been investigated by many researchers, since this ingredient has high levels of crude protein and phosphorus and its low oil content minimizes problems related to peroxidation. However, its use is limited in the non-ruminants diets, due to large amounts of antinutritional factors, especially phytate. The aim of this study was evaluate the nutritional value of dephytinizated defatted rice bran (DDRB) in growing pigs diets and compare it to the defatted rice bran (DRB) with or without phytase supplemented. Thirty-six barrow pigs, from a commercial lineage, were distributed in metabolic cages, into two periods of 10 days, with 5 days for adaptation and 5 days of total feces and urine collection. Pigs initial weights in the two periods were 29 ± 0,73 e 37 ± 0,55 kg, respectively. The experimental design was made by incomplete blocks, and the block was the period. The reference diet was replaced by 30% by the ingredients test from the same origin. Two reference diets, with and without phytase, formulated based on corn and soybean meal, were used to evaluate the influence of the reference diet on energy digestibility. Among the three combinations studied, the DDRB was the ingredient with the highest digestible energy (2545 kcal/kg), metabolizable energy (2519 kcal/kg) and digestible protein (12,18%). The inclusion of 1310 FTU bacterial phytase increased utilization of calcium, phosphorus and improved the digestibility of dry matter and crude protein of FAD, with no differences from DDRB however. The DRB without phytase had the lowest digestibility coefficients for all the responses. The use of 439 FTU phytase in the reference diet did not influence the DRB energy calculation. Dephytinization process may be an alternative for the use of FAD + phytase, since this improves nutritional quality of this ingredient. Phytase improved not only Ca e P, but also energy and protein digestibility.

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