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Padronização e avaliação da técnica de eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE) para tipagem molecular das celpas de Yersinia pestis isoladas no nordeste brasileiro / Standardization and evaluation of the technique of electrophoresis in pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) for molecular typing of Yersinia pestis Celpa isolated in northeastern Brazil

Barros, Maria Paloma Silva de January 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2012-05-07T14:43:59Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 000063.pdf: 1337362 bytes, checksum: fdc0d841069eb0184e4ae777bec25b84 (MD5) Previous issue date: 2007 / A Yersinia pestis é o agente causador da peste, doença infecciosa transmitida através da picada de pulgas infectadas. O homem se contamina acidentalmente ao entrar em contato com roedores ou outros animais infectados (raposas, cães e gatos) e suas pulgas. A Y. pestis é uma espécie muito homogênea, fenotipicamente, apresentando um sorotipo, um fagotipo e três biotipos. Diferentes métodos moleculares foram utilizados em estudos epidemiológicos para discriminar cepas bacterianas. No entanto, para Y. pestis isoladas em focos do Nordeste do Brasil, a maioria dos marcadores estudados não conseguiram discriminar as cepas originadas de diferentes hospedeiros, períodos e locais de isolamento. A eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE) é caracterizada pela separação de fragmentos de DNA obtidos por digestão dos cromossomos com endonucleases de restrição. Essa técnica é considerada o padrão ouro dos métodos de tipagem molecular, sendo altamente discriminatória e válida para muitos patógenos bacterianos, inclusive Y. pestis de outros focos do mundo. O objetivo deste trabalho foi realizar tipagem molecular de cepas brasileiras de Y. pestis através do PFGE. Das 43 cepas de Y. pestis, 36 foram usadas para padronização da técnica e 22 cepas, obtidas antes e durante um surto de peste ocorrido no Estado da Paraíba, para avaliação do PFGE. De acordo com padrões encontrados com a endonuclease de restrição AscI, 19 perfis foram gerados. Esses genótipos foram enquadrados em oito grupos (A-H) geneticamente relacionados. A técnica do PFGE mostrou se capaz de diferenciar as cepas de Y. pestis obtidas em diferentes municípios, antes e durante o surto de peste. De acordo com a variabilidade dos padrões de restrição e o alto poder discriminatório, a técnica PFGE pode ser utilizada para diferenciação e análise de novos isolados. A padronização do protocolo do PFGE para genotipagem das cepas brasileiras de Y. pestis pode ser útil na compreensão e controle da expansão da peste
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Análise molecular da microbiota fecal de recém-nascidos saudáveis / Molecular analysis of fecal microbiota from healthy newborns

Brandt, Kátia Galeão 18 December 2008 (has links)
Objetivo: Analisar através de metodologia molecular a microbiota fecal de recém-nascidos (RN) saudáveis, em aleitamento materno exclusivo. Materiais e métodos: Amostras fecais de dez RN foram avaliadas no 2º, 7º e 30º dias de vida (DV), através de sequenciamento do 16S rDNA bacteriano. Real-time PCR para bifidobacterias foi empregado nas amostras de 30 dias. Resultados: A diversidade bacteriana fecal aumentou do 2º para o 30º DV. E. coli predominou no 2º e 7º DV, e Clostridium no 30º DV. Usando real-time PCR, bifidobacterias foram identificadas em todas as amostras de 30 dias. Conclusão: Enterobacterias predominaram na primeira semana de vida. Aos 30 DV observou-se uma maior diversidade bacteriana, com predomínio de Clostridium.. A técnica inicial não permitiu identificar bifidobacterias. / Purpose: To evaluate by molecular methodology the fecal microbiota of healthy newborns, exclusively breastfed. Materials and methods: Fecal samples from ten neonates were analyzed on 2nd, 7th and 30th day of life, using 16S rDNA sequencing and real-time PCR for bifidobacteria. Results: The fecal bacteria diversity increased from the second to the 30th day of life. E. coli was predominant in the fecal samples from the 2nd and 7th day of life, and Clostridium.in the samples of the 30th day. Using real-time PCR bifidobacteria were identified in all 30th day samples. Conclusion: Enterobacteria were predominant in the first week of life. On 30th day of life a greater bacterial diversity was observed with predominance of Clostridium. The initial technique didnt allow the identification of bifidobacteria.
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Análise molecular da microbiota fecal de recém-nascidos saudáveis / Molecular analysis of fecal microbiota from healthy newborns

Kátia Galeão Brandt 18 December 2008 (has links)
Objetivo: Analisar através de metodologia molecular a microbiota fecal de recém-nascidos (RN) saudáveis, em aleitamento materno exclusivo. Materiais e métodos: Amostras fecais de dez RN foram avaliadas no 2º, 7º e 30º dias de vida (DV), através de sequenciamento do 16S rDNA bacteriano. Real-time PCR para bifidobacterias foi empregado nas amostras de 30 dias. Resultados: A diversidade bacteriana fecal aumentou do 2º para o 30º DV. E. coli predominou no 2º e 7º DV, e Clostridium no 30º DV. Usando real-time PCR, bifidobacterias foram identificadas em todas as amostras de 30 dias. Conclusão: Enterobacterias predominaram na primeira semana de vida. Aos 30 DV observou-se uma maior diversidade bacteriana, com predomínio de Clostridium.. A técnica inicial não permitiu identificar bifidobacterias. / Purpose: To evaluate by molecular methodology the fecal microbiota of healthy newborns, exclusively breastfed. Materials and methods: Fecal samples from ten neonates were analyzed on 2nd, 7th and 30th day of life, using 16S rDNA sequencing and real-time PCR for bifidobacteria. Results: The fecal bacteria diversity increased from the second to the 30th day of life. E. coli was predominant in the fecal samples from the 2nd and 7th day of life, and Clostridium.in the samples of the 30th day. Using real-time PCR bifidobacteria were identified in all 30th day samples. Conclusion: Enterobacteria were predominant in the first week of life. On 30th day of life a greater bacterial diversity was observed with predominance of Clostridium. The initial technique didnt allow the identification of bifidobacteria.

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