O objetivo dessa pesquisa foi avaliar a influência do uso de sistemas de saneamento "in situ" na qualidade das águas extraídas de poços rasos e profundos localizados no bairro 22 de Abril, Jacareí São Paulo, Brasil. A metodologia empregada baseou-se em coletas periódicas de amostras de água dos poços monitorados e subseqüentes análises de nitratos, nitritos, coliformes fecais e totais. Os resultados das análises químicas foram validados por meio da utilização de modelos matemáticos (software Visual MODFLOW 4.2) empregados no estudo dos efeitos do fluxo e dispersão das plumas de contaminante ao redor das fossas sépticas distribuídas no local. As análises indicaram contaminação da água subterrânea extraída do poço raso, entretanto, apesar das precárias condições de instalação e manutenção das fossas rudimentares e da elevada densidade das fossas por unidade de área, a água do poço profundo não apresentou contaminação química e/ou biológica relacionadas ao sistema de saneamento "in situ".