Les avancées en Biologie Moléculaire ont accéléré le développement de techniques de génotypage haut-débit et ainsi permis le lancement des premières études génétiques d'association à grande échelle. La dimension et la complexité des données issues de ce nouveau type d'étude posent aujourd'hui de nouvelles perspectives statistiques et informatiques nécessaires à leur analyse, constituant le principal axe de recherche de cette thèse.<br />Après une description introductive des principales problématiques liées aux études d'association à grande échelle, nous abordons plus particulièrement les approches simple-marqueur avec une étude de puissance des principaux tests d'association, ainsi que de leur combinaisons. Nous considérons ensuite l'utilisation d'approches multi-marqueurs avec le développement d'une méthode d'analyse fondée à partir de la statistique du Score Local. Celle-ci permet d'identifier des associations statistiques à partir de régions génomiques complètes, et non plus des marqueurs pris individuellement. Il s'agit d'une méthode simple, rapide et flexible pour laquelle nous évaluons les performances sur des données d'association à grande échelle simulées et réelles. Enfin ce travail traite également du problème du test-multiple, lié aux nombre de tests à réaliser lors de l'analyse de données génétiques ou génomiques haut-débit. La méthode que nous proposons à partir du Score Local prend en compte ce problème. Nous évoquons par ailleurs l'estimation du Local False Discovery Rate à travers un simple modèle de mélange gaussien.<br />L'ensemble des méthodes décrites dans ce manuscrit ont été implémentées à travers trois logiciels disponibles sur le site du laboratoire Statistique et Génome : fueatest, LHiSA et kerfdr.

<p>The test context is of paramount importance in language testing as it provides an understanding of the kind of tasks to be included in the test, how these tasks are executed by the test takers and how they can be efficiently administered. The objective of this study was to investigate the extent to which the context of the DR Congo English state examination (ESE) is valid and to come out with some useful suggestions that are likely to improve its validity. Two basic theories, the modern validity theory and the schema theory, informed this study. Weir‟s (2005) socio-cognitive framework was used to build the validity argument for the evaluation of the English state examination.</p> <p>A mixed method was used where the research design consisted of the combination of both qualitative and quantitative data during the collection and analysis stages. The content document analysis method was used to examine the content of the different state examination papers so as to identify the main features of the test, and the statistic (descriptive) method was used to quantify observations identified in the state examination papers and to evaluate the context validity of the ESE. Three techniques were used to collect the research data: the questionnaire, the<br /> test, and the interview.</p> <p>Three main findings of this study were reported: (1) the conditions under which the ESE tasks are performed and the relevance of these tasks to the test domain and characteristics are still far to contribute to the quality of evaluation of high school finalist students / (2) the extent to which the ESE includes tasks that take into consideration the nature of information in the text as well as the knowledge required for completing the task is globally good / (3) the conditions under which the test takes place are poor and these conditions affect the validity of test scores. The study recommends the test developers to approximate test tasks to those students have been exposed to in classroom situations and those they are likely to encounter in real life. It also recommends all the people involved in the administration of the test to adhere to high ethical standards.</p>

<p>The test context is of paramount importance in language testing as it provides an understanding of the kind of tasks to be included in the test, how these tasks are executed by the test takers and how they can be efficiently administered. The objective of this study was to investigate the extent to which the context of the DR Congo English state examination (ESE) is valid and to come out with some useful suggestions that are likely to improve its validity. Two basic theories, the modern validity theory and the schema theory, informed this study. Weir‟s (2005) socio-cognitive framework was used to build the validity argument for the evaluation of the English state examination.</p> <p>A mixed method was used where the research design consisted of the combination of both qualitative and quantitative data during the collection and analysis stages. The content document analysis method was used to examine the content of the different state examination papers so as to identify the main features of the test, and the statistic (descriptive) method was used to quantify observations identified in the state examination papers and to evaluate the context validity of the ESE. Three techniques were used to collect the research data: the questionnaire, the<br /> test, and the interview.</p> <p>Three main findings of this study were reported: (1) the conditions under which the ESE tasks are performed and the relevance of these tasks to the test domain and characteristics are still far to contribute to the quality of evaluation of high school finalist students / (2) the extent to which the ESE includes tasks that take into consideration the nature of information in the text as well as the knowledge required for completing the task is globally good / (3) the conditions under which the test takes place are poor and these conditions affect the validity of test scores. The study recommends the test developers to approximate test tasks to those students have been exposed to in classroom situations and those they are likely to encounter in real life. It also recommends all the people involved in the administration of the test to adhere to high ethical standards.</p>

Cette thèse est motivée par l’analyse des données issues de l’imagerie par résonance magnétique fonctionnelle (IRMf). La nécessité de développer des méthodes capables d’extraire la structure sous-jacente des données d’IRMf constitue un challenge mathématique attractif. A cet égard, nous modélisons les réseaux de connectivité cérébrale par un graphe et nous étudions des procédures permettant d’inférer ce graphe.Plus précisément, nous nous intéressons à l’inférence de la structure d’un modèle graphique non orienté par une procédure de test multiple. Nous considérons deux types de structure, à savoir celle induite par la corrélation et celle induite par la corrélation partielle entre les variables aléatoires. Les statistiques de tests basées sur ces deux dernières mesures sont connues pour présenter une forte dépendance et nous les supposerons être asymptotiquement gaussiennes. Dans ce contexte, nous analysons plusieurs procédures de test multiple permettant un contrôle des arêtes incluses à tort dans le graphe inféré.Dans un premier temps, nous questionnons théoriquement le contrôle du False Discovery Rate (FDR) de la procédure de Benjamini et Hochberg dans un cadre gaussien pour des statistiques de test non nécessairement positivement dépendantes. Nous interrogeons par suite le contrôle du FDR et du Family Wise Error Rate (FWER) dans un cadre gaussien asymptotique. Nous présentons plusieurs procédures de test multiple, adaptées aux tests de corrélations (resp. corrélations partielles), qui contrôlent asymptotiquement le FWER. Nous proposons de plus quelques pistes théoriques relatives au contrôle asymptotique du FDR.Dans un second temps, nous illustrons les propriétés des procédures contrôlant asymptotiquement le FWER à travers une étude sur simulation pour des tests basés sur la corrélation. Nous concluons finalement par l’extraction de réseaux de connectivité cérébrale sur données réelles. / This thesis is motivated by the analysis of the functional magnetic resonance imaging (fMRI). The need for methods to build such structures from fMRI data gives rise to exciting new challenges for mathematics. In this regards, the brain connectivity networks are modelized by a graph and we study some procedures that allow us to infer this graph.More precisely, we investigate the problem of the inference of the structure of an undirected graphical model by a multiple testing procedure. The structure induced by both the correlation and the partial correlation are considered. The statistical tests based on the latter are known to be highly dependent and we assume that they have an asymptotic Gaussian distribution. Within this framework, we study some multiple testing procedures that allow a control of false edges included in the inferred graph.First, we theoretically examine the False Discovery Rate (FDR) control of Benjamini and Hochberg’s procedure in Gaussian setting for non necessary positive dependent statistical tests. Then, we explore both the FDR and the Family Wise Error Rate (FWER) control in asymptotic Gaussian setting. We present some multiple testing procedures, well-suited for correlation (resp. partial correlation) tests, which provide an asymptotic control of the FWER. Furthermore, some first theoretical results regarding asymptotic FDR control are established.Second, the properties of the multiple testing procedures that asymptotically control the FWER are illustrated on a simulation study, for statistical tests based on correlation. We finally conclude with the extraction of cerebral connectivity networks on real data set.

Dreiaxiale Druckprüfungen können als Einstufenversuche, als Mehrstufenversuche oder als Versuche mit kontinuierlichen Bruchzuständen ausgeführt werden. Bei der Anwendung der Mehrstufentechnik ergeben sich insbesondere Fragestellungen hinsichtlich der richtigen Wahl des Umschaltpunktes und des optimalen Verlaufs des Spannungspfades zwischen den einzelnen Versuchsstufen. Fraglich beim Versuch mit kontinuierlichen Bruchzuständen bleibt, ob im Versuchsverlauf tatsächlich Spannungszustände erfasst werden, welche die Höchstfestigkeit des untersuchten Materials repräsentieren. Die Dissertation greift diese Fragestellungen auf, ermöglicht den Einstieg in die beschriebene Thematik und schafft die Voraussetzungen, die zur Lösung der aufgeführten Problemstellungen notwendig sind. Auf der Grundlage einer umfangreichen Datenbasis gesteinsmechanischer und petrophysikalischer Kennwerte wurde ein numerisches Modell entwickelt, welches das Spannungs-Verformungs-, Festigkeits- und Bruchverhalten eines Sandsteins im direkten Zug- und im einaxialen Druckversuch sowie in dreiaxialen Druckprüfungen zufriedenstellend wiedergibt. Das Festigkeitsverhalten des entwickelten Modells wurde in Mehrstufentests mit unterschiedlichen Spannungspfaden analysiert und mit den entsprechenden Laborbefunden verglichen.