Orientador: Domingos da Silva Leite / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T19:24:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Peroto_MariaClaudia_M.pdf: 1526611 bytes, checksum: 77aa753a6b4be729c0ff45854cf7bdcf (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: A toxina citoletal distensora, CDT, é uma citotoxina termolábil identificada em um grande número de enteropatógenos, entre eles Escherichia coli. Os genes de CDT são designados de cdtA, cdtB e cdtC e estão arranjados em um operon e, até o momento, já foram descritos cinco diferentes alelos: I, II, III, IV e V. Cepas de Escherichia coli podem ser classificadas em quatro grupos filogenéticos ECOR: A, B1, B2 e D, nos quais as cepas pertencentes aos grupos A e B1 são consideradas comensais e patógenos oportunistas e as cepas agrupadas como B2 e D, como cepas patogênicas. Os objetivos deste trabalho foram relacionar os alelos da CDT e alguns fatores de virulência associados aos grupos filogenéticos ECOR e estudar três conjuntos de cepas por eletroforese de campo pulsado (PFGE). Foram utilizadas 80 cepas de E. coli cdt-positivas isoladas de suínos, bovinos, ovinos, humanos, água e carne. Os alelos da CDT e os grupos filogenéticos foram identificados através da reação de polimerase em cadeia (PCR). Vinte e cinco cepas dos sorotipos O91:H21, O113:H21 e O116:H21 foram estudadas por PFGE para avaliação da diversidade genética. Os resultados demonstraram que o alelo V da CDT foi o mais freqüente, presente em 45% das cepas, mostrando forte associação com VT2 (97%); o alelo III foi observado em 36,2% das cepas, mostrando associação com VT1 em 79,0% das cepas. O alelo I da CDT foi detectado em 8,7% das cepas e o alelo IV em 5,0% das cepas. No estudo filogenético, 45 cepas (56,0%) foram agrupadas em B1, 15 cepas em B2 (18,7%), 13 cepa em D (16,2%) e sete cepas em A (8,7%). Nos ensaios de PFGE foi possível identificar, entre as cepas de um mesmo sorotipo, desde clones até cepas não relacionadas entre si. Os dados obtidos permitem concluir que no conjunto de cepas estudado o alelo CDT-V está associado ao grupo filogenético B1 enquanto o alelo CDT-III está associado aos grupos B2 e D / Abstract: Cytolethal distending toxin, CDT, is a termolabile cytotoxin found in a great number of enteropathogens, including Escherichia coli. The CDT genes are called cdtA, cdtB and cdtC and they are placed in an operon and five alleles (I, II, III, IV and V) were described until the moment. E. coli strains may be classified in four ECOR phylogenetic groups: A, B1, B2 and D; strains belonging to A and B1 groups are called commensal or opportunist pathogens and strains grouped as B2 and D, as pathogenic strains. The goals of this work were to relate the CDT alleles and some virulence factors associated to four ECOR phylogenetic groups and analyze three strain sets by pulsed field gel electrophoresis (PFGE). This study used 80 cdt-positive E. colistrains isolated from swines, bovines, ovines, humans, water and meat. CDT alleles and phylogenetic groups were identified using polymerase chain reaction (PCR). Twenty-five strains belonging to O91:H21, O113:H21 and O116:H21 serotypes were studied by PFGE for evaluation of genetic diversity. The results show that CDT-V was the most frequent allele, present in 45,0% of strains, and showing strong association with VT2 (97%); CDT-III was observed in 36,2% of strains, showing association with VT1 in 79,0% of strains. CDT-I was detected in 8,7% of strains and CDT-IV, in 5,0%. In the phylogenetic studies, 45 strains (56,0 %) was grouped in group B1, 15 strains (18,7%) was grouped in B2, D grouped 13 strains (16,2%) and the group A congregate 7 strains (8,7%). In PFGE studies it was possible to identify, in the same serotype, since clones until non-related strains. For the studied strains, data allows to conclude that CDT-V is associated to phylogenetic group B1 and CDT-III is associated to B2 and D groups / Mestrado / Microbiologia / Mestre em Genética e Biologia Molecular

CoordenaÃÃo de AperfeiÃoamento de Pessoal de NÃvel Superior / Campylobacter jejuni e Campylobacter coli sÃo importantes agentes etiolÃgicos de doenÃa diarrÃica na populaÃÃo mundial. A infecÃÃo por Campylobacter sp. à usualmente identificada por cultivo microbiolÃgico que leva aproximadamente 72 horas para identificaÃÃo do gÃnero. Nosso objetivo principal foi pesquisar a prevalÃncia de C. jejuni e C. coli em populaÃÃo infantil, com idade entre 2-36 meses, da Ãrea urbana de Fortaleza/CE, Brasil, em estudo do tipo epidemiolÃgico observacional caso-controle, utilizando, como ferramenta de detecÃÃo, a reaÃÃo em cadeia da polimerase (PCR). Outros objetivos consistiram em: investigar o impacto nutricional da infecÃÃo (casos) ou da colonizaÃÃo (controles) por Campylobacter sp.; determinar a presenÃa de trÃs genes de virulÃncia para a toxina citoletal distensora (CDT) de C. jejuni e avaliar a ocorrÃncia de inflamaÃÃo intestinal nas infecÃÃes causadas por Campylobacter sp. A populaÃÃo estudada consistiu de 83 casos e 83 controles, sendo os casos, crianÃas com histÃrico de diarrÃia nos 14 dias pregressos à seleÃÃo para o estudo. Foram avaliados parÃmetros sÃcio-econÃmicos atravÃs de questionÃrio epidemiolÃgico. Medidas antropomÃtricas foram coletadas para determinaÃÃo de escores-z no intuito de avaliar o perfil nutricional das crianÃas. A detecÃÃo de Campylobacter nas amostras congeladas foi realizada por ensaio imuno-enzimÃtico (ELISA) e PCR. Pela PCR tambÃm investigamos a presenÃa dos genes cdtA, cdtB e cdtC da CDT de C. jejuni. A avaliaÃÃo da inflamaÃÃo intestinal foi realizada pela pesquisa de lactoferrina fecal (LFF), atravÃs de ELISA semiquantitativa. Foi detectado, por PCR, C. jejuni em 9,6% dos casos (8/83) e 7,2% dos controles (6/83). C. coli foi detectado em 6,0% dos casos (5/83) e 1,2% dos controles (1/83). Os genes cdtA, cdtB e cdtC foram encontrados em 50% das amostras hipO+ (7/14). Houve diferenÃa significativa (p<0,05) dos escores WAZ e WHZ entre casos e controles portadores de C. jejuni, sendo que casos portadores apresentaram mÃdia inferior de WAZ e WHZ, quando comparados com os controles portadores. No grupo Casos, os portadores de C. jejuni apresentavam valor mÃdio de WHZ inferior ao valor mÃdio apresentado pelos casos nÃo-portadores. Mais de 80,0% das crianÃas estudadas apresentaram inflamaÃÃo intestinal caracterizada por elevados nÃveis de LFF, independente da presenÃa de diarrÃia e Campylobacter sp. Em conclusÃo, nossos achados corroboram dados da literatura cientÃfica relacionados à prevalÃncia de C. jejuni e C. coli na populaÃÃo infantil, existÃncia de portadores assintomÃticos e associaÃÃo entre a detecÃÃo do microorganismo e desnutriÃÃo. AlÃm disso, nossos dados apontam para ocorrÃncia de variabilidade genÃtica dentre as cepas de C. jejuni detectadas na populaÃÃo estudada em relaÃÃo à presenÃa ou ausÃncia dos genes de CDT. / Campylobacter jejuni and Campylobacter coli are important etiologic agents of worldwide diarrheal disease. Campylobacter sp. infection is usually identified by a 72 hour microbiological culture that identifies the genus of the responsible organism. Our main goal was to investigate the prevalence of C. jejuni and C. coli in children, aged 2-36 months, from urban Fortaleza, CE, Brazil, in an observational epidemiological case-control study using, as a tool of detection, the polymerase chain reaction (PCR). Our other goals were to investigate the nutritional impact of infection (cases) or colonization (controls) for Campylobacter sp., to determine the presence of three virulence genes of C. jejuni cytolethal distending toxin (CDT), and to evaluate the occurrence of inflammation in intestinal infections caused by Campylobacter sp. The study population consisted of 83 cases and 83 controls, where the cases consisted of children with a history of diarrhea in the 14 days prior to selection for the study. We assessed socioeconomic parameters through an epidemiological questionnaire. Anthropometric measurements were collected to determine z-score parameters for assessing the nutritional status of the children. Detection of Campylobacter from frozen samples was performed by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and PCR. Also, using PCR technology, we investigated the presence of C. jejuni genes cdtA, cdtB and cdtC. Intestinal inflammation was assessed by semi-quantitative ELISA detection of fecal lactoferrin (LFF). PCR technology detected C. jejuni in 9.6% of the cases (8/83) and 7.2% of the controls (6/83), while C. coli was detected in 6.0% of the cases (5/83) and 1.2% of the controls (1/83). CDT genes were found in 50% of hipO+ samples (7/14). There was a significant difference (p <0.05) in the weight for age z-scores (WAZ) and the weight for height z-scores (WHZ) between case and control carriers of C. jejuni, where case carriers showed lower average WAZ and WHZ than control carriers. Moreover, in the case group, carriers of C. jejuni showed a lower WHZ average than that of non-carrier cases of C. jejuni. More than 80.0% of the children studied had intestinal inflammation characterized by high levels of LFF regardless of the presence of diarrhea and Campylobacter sp. In conclusion, our findings corroborate data in the scientific literature related to the prevalence of C. jejuni and C. coli in pediatric populations, the existence of asymptomatic carriers and an association between the detection of the microorganism and malnutrition. In addition, our data suggest a genetic variability among the strains of C. jejuni detected in the study population, related to presence o absence of CDT genes.