Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-30T18:01:34Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Maria A. P. Agostini.pdf: 6019063 bytes, checksum: 87a17f7164c995addc5b46e34e5d51ec (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-30T18:04:00Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Maria A. P. Agostini.pdf: 6019063 bytes, checksum: 87a17f7164c995addc5b46e34e5d51ec (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-03-30T18:06:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Maria A. P. Agostini.pdf: 6019063 bytes, checksum: 87a17f7164c995addc5b46e34e5d51ec (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-30T18:06:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Maria A. P. Agostini.pdf: 6019063 bytes, checksum: 87a17f7164c995addc5b46e34e5d51ec (MD5) Previous issue date: 2016-08-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The yellow-spotted river turtle Podocnemis unifilis is the most widely distributed freshwater river turtle and is found in a diversity of habitats. Associated with natural characteristics of turtles, human action causes a sharp population declines, causing species like P. unifilis to be on the list of animals to be protected by IBAMA. Many aspects of the biology of the species can be determined using molecular genetic analyses. In some rivers of the Amazon basin, rapids and waterfalls limit gene flow of various aquatic and semiaquatic groups, so it is necessary to study the patterns of species especially in places that are targeted for hydroelectric projects. Thus, we analyzed the D-loop region of mitochondrial DNA of 300 adult turtles of different rivers in the Brazilian Amazon basin, determining organizational patterns of genetic variability and evaluating the interference of natural barriers. We measured the number of haplotypes, the number of segregating sites, haplotype diversity, nucleotide diversity, neutrality tests, AMOVA and we constructed a haplotype network. To measure levels of structuring among populations, we inferred the Ф ST fixation index, the number of biological groups in the sample, level of gene flow, Mantel's test, and finally, we estimated natural barriers to gene flow using Barrier program. We found high genetic diversity and restricted gene flow with high levels of structuring between locations. The differences within the Madeira, Tapajós, Trombetas, Xingu and Tocantins-Araguaia rivers are possibly caused by waterfalls and rapids. We define 8 different Management Units: Barreirinha, middle Trombetas River, Tapajós River, upstream of the waterfall of Volta Grande do Xingu River, downstream of the waterfall of Volta Grande do Xingu River, Guaporé River, Tocantins-Araguaia basin and a group of the Amazon floodplain area with other populations. We indicate the use of our data in making decisions to release young in participatory management of project sites of Amazon turtles, in decisions on implementation of construction projects and inspection and seizure of illegal trade in turtles, and underline the importance of studying the species through other molecular markers to assist in the conservation of turtles. / O tracajá (Podocnemis unifilis) é a tartaruga de água doce com maior distribuição, podendo ser encontrada nos mais diversos habitats. Associada a características naturais dos quelônios, a ação humana provoca um declínio acentuado das populações, fazendo com que espécies como P.unifilis esteja na lista de animais a serem protegidos pelo IBAMA. Muitos aspectos da biologia das espécies podem ser determinados usando análises genéticas. Em alguns rios da bacia Amazônica, corredeiras e cachoeiras limitam o fluxo gênico de vários grupos aquáticos e semiaquáticos, portanto, é necessário estudar os padrões genéticos das espécies principalmente em locais que são visados para empreendimentos hidrelétricos. Com isso, analisamos a região D-Loop do DNA mitocondrial de 300 tracajás adultos de diferentes rios da drenagem da Amazônia brasileira, determinando padrões de organização da variabilidade genética e avaliando a interferência de barreiras naturais aos indivíduos. Foram medidos o número de haplótipos, número de sítios segregantes, a diversidade haplotípica, diversidade nucleotídicas, testes de neutralidade, AMOVA e foi construída uma rede de haplótipos. Para medir os níveis de estruturação entre as localidades inferimos o índice de fixação ФST, a quantidade de grupos biológicos na amostra, nível de fluxo genético, teste de Mantel, e por fim, foram estimadas as barreiras naturais ao fluxo gênico usando o programa Barrier. Encontramos altos valores de diversidade genética e um fluxo genético restrito com altos níveis de estruturação entre as localidades. As diferenças dentro dos rios Madeira, Tapajós, Trombetas, Xingu e Tocantins-Araguaia possivelmente são causadas pelas cachoeiras e corredeiras. Sugerimos 8 Unidades de Manejo distintas: Barreirinha, Médio rio Trombetas, rio Tapajós, montante da cachoeira da Volta Grande do Xingu, jusante da cachoeira da Volta Grande do Xingu, rio Guaporé, bacia Tocantins-Araguaia e um grupo da região da várzea amazônica com as demais localidades. Indicamos a utilização de nossos dados na tomada de decisão de locais de soltura de filhotes em projetos de manejo participativo de quelônios amazônicos, nas decisões sobre implantação de empreendimentos e na fiscalização e apreensão do comércio ilegal de tracajás, além de ressaltar a importância do estudo da espécie através de outros marcadores moleculares, a fim de auxiliar na conservação dos tracajás

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-10-15T14:14:00Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Mestrado Hugo Ricardo - PPG CIPET.pdf: 1267336 bytes, checksum: 8c2b743c36b3377566b931286d8bead5 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-10-15T14:14:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Mestrado Hugo Ricardo - PPG CIPET.pdf: 1267336 bytes, checksum: 8c2b743c36b3377566b931286d8bead5 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-15T14:14:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Mestrado Hugo Ricardo - PPG CIPET.pdf: 1267336 bytes, checksum: 8c2b743c36b3377566b931286d8bead5 (MD5) Previous issue date: 2015-08-06 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The creation of chelonians is an important tool for the strategies of conservation of chelonians in the Amazon, with that the reproductive success in the captive breeding is essential. As the turtle (Podocnemis expansa) and tracajá (Podocnemis unifilis) are the most important species in trade and local subsistence (SMITH, 1979). The present work aims to obtain information on the influence of P. expansa matrices, weight and size, on the characteristics of nests and pups, and the influence of temperature and incubation period on the sexual ratio of P. expansa nests . Data collection was carried out in two commercial turtle breeders located in the municipality of Iranduba and Manacapuru / AM, where the spawning period was monitored. Data were collected on nest dates, nest depths and width, nest distance (trawl size and paw width), characteristic of hatching (rate and hatching, biometry and sexing of the pups) and the collected data of climatic data by means of Data Logger placed within the selected nests. Pearson correlation analyzes were performed to verify if the characteristics of the matrices influence the nests (number of eggs, egg weight and size, egg mass, width and depth of nests) and pups (initial pups size and weight, pups, hatching rate, incubation period). Among the variables that had the highest correlation index (Pearson correlation> 0.50 and p value <0.05), linear regressions were applied to evaluate the significance index of the correlations found. The size of females influences the performance of pups production, so it is important to select large matrices since they are as observed in nature. Large-sized eggs produce larger and heavier pups, and the number of eggs directly influenced the total mass of the nest. The average temperature of incubation influences with a positive relation the size and weight of the pups. / A criação de quelônios é uma importante ferramenta para as estratégias de conservação de quelônios na Amazônia, com isso o sucesso reprodutivo nas criações em cativeiro é imprescindível. Sendo a tartaruga (Podocnemis expansa) e o tracajá (Podocnemis unifilis) as espécies de maior importância no comércio e na subsistência local (SMITH, 1979). O presente trabalho visa obter informações visa obter informações sobre a influência das matrizes de P. expansa, peso e tamanho, sobre as características dos ninhos e filhotes, e a influência da temperatura e do período de incubação na razão sexual dos ninhos de P. expansa. A coleta de dados foi realizada em 2 criadores comerciais de quelônios localizados no município de Iranduba e Manacapuru/AM, onde foi monitorado o período de desova, coletou-se informações sobre as datas das posturas, profundidades e largura do ninho, distância do ninho em relação ao nível da água, quantidade e biometria dos ovos, características das matrizes (tamanho do rastro e largura da pata), característica da eclosão (taxa e eclosão, biometria e sexagem dos filhotes) e a coletada de dados climáticos através de Data Logger colocados dentro dos ninhos selecionados. Foram realizadas análises de correlação de Pearson para verificar se características das matrizes influenciam os ninhos (número de ovos, peso e tamanho dos ovos, massa de ovos, largura e profundidade dos ninhos) e os filhotes (tamanho e peso inicial dos filhotes, sexo dos filhotes, taxa de eclosão, período de incubação). Entre as variáveis que possuíram o maior índice de correlação (correlação de Pearson > 0,50 e valor p < 0,05), foram aplicadas regressões lineares para avaliar o índice de significância das correlações encontradas. O tamanho das fêmeas influencia no desempenho da produção de filhotes, por isso é importante selecionar matrizes de grande porte, uma vez que assim como observado na natureza. Ovos de tamanhos maiores produzem filhotes maiores e mais pesados, e o número de ovos influenciou diretamente na massa total do ninho. A temperatura média de incubação influência com uma relação positiva o tamanho e peso dos filhotes.