Submitted by Inácio de Oliveira Lima Neto (inacio.neto@inpa.gov.br) on 2017-12-12T14:45:58Z No. of bitstreams: 2 Reata Cristina de Lima Gomes.pdf: 5263369 bytes, checksum: 9625e1de7592009a64a1ae947710bf9d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-12T14:45:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Reata Cristina de Lima Gomes.pdf: 5263369 bytes, checksum: 9625e1de7592009a64a1ae947710bf9d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-01 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Trichodactylidae are believed to have a separate phylogenetic origin from other freshwater crab families. Representatives of this family have morphological characteristics that diagnose them from other families of freshwater crabs: different body shape; absence of thorns in the dactylus and propodus; of the third narrow maxilliped merus. The family has 49 species distributed in two subfamilies and 15 genera. The suprageneric classification of the family was proposed based on the abdômenn characters, the first male pleopod (gonopod), and the axial skeleton. Due to its structural complexity, the gastric skeleton has been used as a source of morphological information for taxonomic and phylogenetic studies in different brachyuran groups. From the analysis of stomachs of 42 species (32 in the ingroup and 10 in the outgroup) the morphology of the ossicles of the gastric skeleton was described and illustrated. The cladistic analysis of Trichodactylidae was performed with the program Winclada and TNT. It was used 57 binary characters obtained from the gastric ossicle morphology. The cladistic analysis of this study resulted in two equally parsimonious trees with 343 steps each. The analyzes did not recover the monophyly of the family and did not result in the formation of clades, except in the cases of Avotrichodactylus and Moreirocarcinus. Even in this scenario, it is believed that gastric mill ossicle characters may be complementary elements in the analysis of family affinities. For this, it will be important to carry out new studies that include, besides characters the gastric skeleton, characters carapace, abdômenn, appendages, reproductive structures and the axial skeleton. A cladistic analysis that integrates these various morphological aspects will certainly have a much greater potential to better define clusters and elucidate their affinities both intra- and extrafamily. / Acredita-se que os Trichodactylidae tenham uma origem filogenética separada das demais famílias de caranguejos de água doce pois seus representantes apresentam características morfológicas que as separa, tais como: forma do corpo; ausência de espinhos nos dáctilos e própodos; mero do terceiro maxílipede estreito. A família possui 49 espécies distribuídas em duas subfamílias e 15 gêneros. A classificação supragenérica da família foi proposta com base em caracteres do abdômen, do primeiro pleópodo masculino (gonópodo) e do esqueleto axial. Por sua complexidade estrutural, o esqueleto gástrico tem sido utilizado como fonte de informações morfológicas para estudos taxonômicos e filogenéticos em diferentes grupos. A morfologia dos ossículos do esqueleto gástrico de estômagos de 42 espécies (32 do grupo-interno e 10 de grupo-externo) foi descrita e ilustrada. Baseado nessas informações, foi realizada uma análise cladística de Trichodactylidae no programa Winclada e TNT no qual, foram utilizados 57 caracteres binários obtidos da morfologia dos ossículos gástricos resultando em duas árvores igualmente parcimoniosas com 343 passos cada uma. As análises não resgataram o monofiletismo da família e nem resultou na formação de agrupamentos, exceto nos casos de Avotrichodactylus e Moreirocarcinus. Mesmo diante desse cenário, acredita-se que caracteres dos ossículos do moinho gástrico possam se constituir em elementos complementares na análise das afinidades da família. Para tanto, será importante realizar novos estudos que incluam, além de caracteres baseados no esqueleto gástrico, caracteres da carapaça, abdômen, apêndices, estruturas reprodutivas e do esqueleto axial. Uma análise cladística que integre esses vários aspectos morfológicos certamente terá um potencial muito maior para melhor definir os agrupamentos e elucidar as suas afinidades tanto intra- quanto extrafamiliares.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2018-02-19T12:54:59Z No. of bitstreams: 2 Renata Cristina Tese.pdf: 5263369 bytes, checksum: 9625e1de7592009a64a1ae947710bf9d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-19T12:55:00Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Renata Cristina Tese.pdf: 5263369 bytes, checksum: 9625e1de7592009a64a1ae947710bf9d (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-12-01 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Trichodactylidae are believed to have a separate phylogenetic origin from other freshwater crab families. Representatives of this family have morphological characteristics that diagnose them from other families of freshwater crabs: different body shape; absence of thorns in the dactylus and propodus; of the third narrow maxilliped merus. The family has 49 species distributed in two subfamilies and 15 genera. The suprageneric classification of the family was proposed based on the abdômenn characters, the first male pleopod (gonopod), and the axial skeleton. Due to its structural complexity, the gastric skeleton has been used as a source of morphological information for taxonomic and phylogenetic studies in different brachyuran groups. From the analysis of stomachs of 42 species (32 in the ingroup and 10 in the outgroup) the morphology of the ossicles of the gastric skeleton was described and illustrated. The cladistic analysis of Trichodactylidae was performed with the program Winclada and TNT. It was used 57 binary characters obtained from the gastric ossicle morphology. The cladistic analysis of this study resulted in two equally parsimonious trees with 343 steps each. The analyzes did not recover the monophyly of the family and did not result in the formation of clades, except in the cases of Avotrichodactylus and Moreirocarcinus. Even in this scenario, it is believed that gastric mill ossicle characters may be complementary elements in the analysis of family affinities. For this, it will be important to carry out new studies that include, besides characters the gastric skeleton, characters carapace, abdômenn, appendages, reproductive structures and the axial skeleton. A cladistic analysis that integrates these various morphological aspects will certainly have a much greater potential to better define clusters and elucidate their affinities both intra- and extrafamily. / Acredita-se que os Trichodactylidae tenham uma origem filogenética separada das demais famílias de caranguejos de água doce pois seus representantes apresentam características morfológicas que as separa, tais como: forma do corpo; ausência de espinhos nos dáctilos e própodos; mero do terceiro maxílipede estreito. A família possui 49 espécies distribuídas em duas subfamílias e 15 gêneros. A classificação supragenérica da família foi proposta com base em caracteres do abdômen, do primeiro pleópodo masculino (gonópodo) e do esqueleto axial. Por sua complexidade estrutural, o esqueleto gástrico tem sido utilizado como fonte de informações morfológicas para estudos taxonômicos e filogenéticos em diferentes grupos. A morfologia dos ossículos do esqueleto gástrico de estômagos de 42 espécies (32 do grupo-interno e 10 de grupo-externo) foi descrita e ilustrada. Baseado nessas informações, foi realizada uma análise cladística de Trichodactylidae no programa Winclada e TNT no qual, foram utilizados 57 caracteres binários obtidos da morfologia dos ossículos gástricos resultando em duas árvores igualmente parcimoniosas com 343 passos cada uma. As análises não resgataram o monofiletismo da família e nem resultou na formação de agrupamentos, exceto nos casos de Avotrichodactylus e Moreirocarcinus. Mesmo diante desse cenário, acredita-se que caracteres dos ossículos do moinho gástrico possam se constituir em elementos complementares na análise das afinidades da família. Para tanto, será importante realizar novos estudos que incluam, além de caracteres baseados no esqueleto gástrico, caracteres da carapaça, abdômen, apêndices, estruturas reprodutivas e do esqueleto axial. Uma análise cladística que integre esses vários aspectos morfológicos certamente terá um potencial muito maior para melhor definir os agrupamentos e elucidar as suas afinidades tanto intra- quanto extrafamiliares

Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-08T12:52:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Ana Gracy Oliveira Ribeiro.pdf: 2992880 bytes, checksum: 4e6d8270e0e303c6c4fbf6cedd9d38a6 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-03-08T12:52:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Ana Gracy Oliveira Ribeiro.pdf: 2992880 bytes, checksum: 4e6d8270e0e303c6c4fbf6cedd9d38a6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-08T12:52:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Ana Gracy Oliveira Ribeiro.pdf: 2992880 bytes, checksum: 4e6d8270e0e303c6c4fbf6cedd9d38a6 (MD5) Previous issue date: 2017-07-17 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The exoskeleton of crustaceous is one of the main sources of chitin, a biopolymer precursor of chitosan. This work aimed the extraction of chitin from the residues of the Dilocarcinus pagei crab collected in the city of Itacoatiara (AM), and eventually converted to chitosan and also the analysis of the physicochemical properties of the obtained materials. The demineralization step used acid solutions of different concentrations and under different reaction times, in which the condition using acid solution of 0.50 mol L-1 and reaction time of 30 minutes exhibited greater mass loss. Removal of the organic content occurred through the contact of the demineralised remnant with 1.0 mol L-1 NaOH solutions at 70 ° C for different time lengths, where a larger mass loss was observed for the 24-hour period. Chitin was obtained by exposing the deproteinized material to a 0.14 mol L-1 NaClO solution for 8 hours. From the analysis of the final yield of each stage, it was found that the residues of the Amazonian crab is constituted by 78.4 5% CaCO3 and 21.55 % organic matter. Of the organic fraction, 51.93 % (10.99 % of the initial mass of the residues) consists of proteins and lipids, whereas 48.07 % (10.56 % of the initial mass of the residues) consists of an association of chitin and pigments. From this association, 23.95 % (2.53 % of the initial mass of the residues) is formed by pigments and 76.05 % (8.03% of the initial mass of the residues) is formed by chitin. The content of chitin found is similar to that found in the literature for other species of crab. According to X-ray diffraction and thermogravimetric analysis, it was verified that the chitin obtained has diffraction patterns characteristic of the α-chitin crystallographic phase and the obtained chitosan has semi-crystalline structure. The thermal decomposition profile is characteristic of biopolymers, with the existence of non oxidative and oxidative events of mass loss. It was found through Infrared spectroscopy that the degree of deacetylation of the obtained chitosan samples after chitin treatment with 10.0 mol L-1 NaOH solution at 105 º for 60, 90 e 120 minute were between 68.45 % and 81.92 %. / Os exoesqueletos de crustáceos são uma das principais fontes de obtenção de quitina, um biopolímero precursor da quitosana. Este trabalho teve como principal objetivo a extração de quitina do resíduo dos caranguejos Dilocarcinus pagei coletados no município de Itacoatiara (AM) e posterior conversão em quitosana, além de analisar as propriedades físicas e químicas dos materiais obtidos. O tratamento de desmineralização foi realizado empregando soluções de HCl de diferentes concentrações e por diferentes períodos de tempo, no qual o tratamento utilizando a solução ácida de 0,50 mol L-1 e tempo de reação de 30 minutos exibiu maior perda de massa. A remoção do conteúdo orgânico ocorreu através do contato do remanescente desmineralizado com soluções de NaOH de 1,0 mol L-1 à 70 °C por diferentes períodos de tempo, onde foi observado maior perda de massa para o período de 24 horas. A obtenção da quitina ocorreu através da exposição do material desproteinizado com uma solução de NaClO 0,14 mol L-1 por um período de 8 horas. A partir da análise do rendimento final de cada etapa, encontrou-se que os resíduos do caranguejo amazônico são constituídos por 78,45 % de CaCO3 e 21,55 % de matéria orgânica. Da fração orgânica, 51,93 % (10,99 % da massa inicial dos resíduos) é constituída por proteínas e lipídeos, enquanto 48,07 % (10,56 % da massa inicial dos resíduos) é constituída por uma associação de quitina e pigmentos. Dessa associação, 23,95 % (2,53 % da massa inicial dos resíduos) é formada por pigmentos e 76,05 % (8,03 % da massa inicial dos resíduos) é formada por quitina. O conteúdo encontrado de quitina é similar ao encontrado na literatura para outras espécies de caranguejo. Através das técnicas de difração de raios X e análise termogravimétrica, constatou-se que a quitina obtida possui padrões de difração característicos da fase cristalográfica α-quitina e a quitosana obtida possui uma estrutura semicristalina. O perfil de decomposição térmica é característico de biopolímeros, com a existência de eventos não oxidativos e oxidativos de perda de massa. Constatou-se com auxílio da técnica de espectroscopia vibracional na região do infravermelho que o grau de desacetilação das quitosanas obtidas após processamento da quitina em solução 10,0 mol L-1 de NaOH a 105 ºC pelos tempos de 60, 90 e 120 minutos foi de 68,45 % a 81,92 %.

Os caranguejos de água doce estão alocados em cinco famílias e apenas duas tem ocorrência para o Brasil: Pseudothelphusidae e Trichodactylidae. Trichodactylus , gênero-tipo da família Trichodactylidae e alocado em Trichodactylinae, foi descrito por Latreille, 1828 para acomodar uma única espécie, T. fluviatilis. Baseado na hipótese de que Trichodactylus não é um grupo monofilético foi realizada uma extensiva amostragem morfológica e molecular. A Inferência filogenética com dois genes mitocondriais (16S rRNA e COI) e um nuclear (Histona 3) mostrou claramente que Trichodactylus não é monofilético. Foram encontradas três grandes linhagens em ambas as análises (Inferência Bayesiana e Máxima Verossimilhança), sendo T. quinquedentatus mais proximamente relacionado com espécies de Avotrichodactylus. O tempo de divergência entre essas linhagens foi estimado em 38 a 53 Ma. Nesse estudo, dez novas espécies pertencentes ao complexo Trichodactylus foram descritas. Adicionalmente, uma espécie e um gênero revalidado. Nesse estudo, portanto, a subfamília Trichodactylinae é composta pelos seguintes gêneros: Avotrichodactylus , Mikrotrichodactylus , Rodriguezia e Trichodactylus . Além disso, a designação de neótipo para T. fluviatilis é de fundamental importância, uma vez que, a série tipo foi perdida. O uso em conjunto e comparativo de diferentes ferramentas, tais como a molecular e morfológica, permitiu reconhecer que a biodiversidade de caranguejos de água doce no Brasil ainda está subestimada / The freshwater crabs are allocated in five families and only two of them have occurrence for Brazil: Pseudothelphusidae and Trichodactylidae. Trichodactylus , the genus-type of the family Trichodactylidae and allocated in Trichodactylinae, was described by Latreille, 1828 to accommodate a single species, T. fluviatilis. Based on the hypothesis that Trichodactylus is not a monophyletic group we realized an extensive morphological and molecular sampling. Phylogenetic inference based on two mitochondrial (16S rRNA e COI) and one nuclear (Histone 3) genes clearly indicated that Trichodactylus is not monophyletic. Were found three great lineages in both analysis (Bayesian Inference and Maximum Likelihood), being T. quinquedentatus more closely related to species of Avotrichodactylus . The time of divergence between these lineages was estimated at 38 to 53 Ma. In this study, nine new species belonging to the T. fluviatilis complex were described. Additionally, one species and one genus were revalidated. Therefore, in this study, the subfamily Trichodactylinae is composed by the following genus: Avotrichodactylus , Mikrotrichodactylus , Rodriguezia e Trichodactylus . Furthermore, we show that the designation of a neotype for T. fluviatilis is strongly needed, since that its type series has been lost. The joint and comparative use of different tools, such as molecular and morphological, allowed us to recognize that the biodiversity of freshwater crabs in Brazil is still very underestimated