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Extraction, purification et caractérisation d’isoformes d’hexokinase du tubercule de pomme de terre (Solanum tuberosum)Moisan, Marie-Claude 12 1900 (has links)
L’hexokinase (HK) est la première enzyme du métabolisme des hexoses et catalyse la
réaction qui permet aux hexoses d’entrer dans le pool des hexoses phosphates et donc par le
fait même la glycolyse. Bien que le glucose soit son principal substrat, cette enzyme peut
aussi phosphoryler le mannose et le fructose. Malgré son importance dans le métabolisme
primaire, l’HK n’a jamais été purifiée à homogénéité sous forme native. Le but de ce travail
était donc de purifier une isoforme d’HK à partir de tubercule de Solanum tuberosum et par
la suite de caractériser ses propriétés cinétiques.
Bien avant que je commence mon travail, un groupe de recherche avait déjà séparé et
partiellement purifié trois isoformes d’HK de S. tuberosum. Un protocole d’extraction était
donc disponible, mais l’HK ainsi extraite était peu stable d’où le besoin d’y apporter
certaines modifications. En y ajoutant certains inhibiteurs de protéases ainsi qu’en
modifiant les concentrations de certains éléments, le tampon d’extraction ainsi modifié a
permis d’obtenir un extrait dont l’activité HK était stable pendant au moins 72h après
l’extraction, en empêchant la dégradation.
À l’aide du tampon d’extraction optimisé et d’une chromatographie sur colonne de butyl
sépharose, il a été possible de séparer 4 isoformes d’HKs. Par la suite, une isoforme d’HK
(HK1) a été purifiée à l’homogénéité à l’aide de 5 étapes de chromatographie
supplémentaires. En plus de caractériser les propriétés cinétiques de cette enzyme, l’analyse
de séquençage par MS/MS a permis de l’associer au produit du gène StHK1 de Solanum
tuberosum. Avec une activité spécifique de 10.2 U/mg de protéine, il s’agit de l’HK
purifiée avec l’activité spécifique la plus élevée jamais rapportée d’un tissu végétal.L’ensemble des informations recueillies lors de la purification de HK1 a ensuite été utilisée
pour commencer la purification d’une deuxième isoforme (HK3). Ce travail a permis de
donner des lignes directrices pour la purification de cette isoforme et certains résultats
préliminaires sur sa caractérisation enzymatique. / Hexokinase (HK) catalyzes the first step of hexose metabolism by phosphorylating hexose
to generate the corresponding hexose phosphate thereby allowing hexose entrance in
glycolysis. Even though glucose is the main substrate, HK can also phosphorylate a broad
spectrum of hexoses. Despite its importance this enzyme has never been purified to
homogeneity in a native form. The aim of this work was therefore to purify this enzyme
from Solanum tuberosum tubers and subsequently characterize its kinetic properties.
Before I started this work, another group had already separated and partially purified 3 HK
isoform from S. tuberosum. An extraction protocol was available but improvement was
necessary since the extracted HK had little stability. By adding some protease inhibitors
and by modifying the concentration of certain components in the extraction buffer we were
able to obtain an extract with a HK activity stable for at least 72 h after extraction by
preventing degradation.
With this buffer and chromatography on butyl sepharose it was possible to separate 4 HK
isoforms from S. tuberosum. After 5 more chromatographic steps, one HK isoform was
purified to homogeneity (HK1). This enzyme was characterized and sequenced by MS/MS.
We were able to associate this protein sequence with the gene product of StHK1 from S.
tuberosum. With a specific activity of 10.2 U/mg of protein, this is the HK with the highest
specific activity ever reported from a plant tissue.
All the information gathered while purifying HK1 was used to undertake the purification of
a second isoform (HK3). We were able to obtain preliminary results on its kinetic
properties.
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Extraction, purification et caractérisation d’isoformes d’hexokinase du tubercule de pomme de terre (Solanum tuberosum)Moisan, Marie-Claude 12 1900 (has links)
L’hexokinase (HK) est la première enzyme du métabolisme des hexoses et catalyse la
réaction qui permet aux hexoses d’entrer dans le pool des hexoses phosphates et donc par le
fait même la glycolyse. Bien que le glucose soit son principal substrat, cette enzyme peut
aussi phosphoryler le mannose et le fructose. Malgré son importance dans le métabolisme
primaire, l’HK n’a jamais été purifiée à homogénéité sous forme native. Le but de ce travail
était donc de purifier une isoforme d’HK à partir de tubercule de Solanum tuberosum et par
la suite de caractériser ses propriétés cinétiques.
Bien avant que je commence mon travail, un groupe de recherche avait déjà séparé et
partiellement purifié trois isoformes d’HK de S. tuberosum. Un protocole d’extraction était
donc disponible, mais l’HK ainsi extraite était peu stable d’où le besoin d’y apporter
certaines modifications. En y ajoutant certains inhibiteurs de protéases ainsi qu’en
modifiant les concentrations de certains éléments, le tampon d’extraction ainsi modifié a
permis d’obtenir un extrait dont l’activité HK était stable pendant au moins 72h après
l’extraction, en empêchant la dégradation.
À l’aide du tampon d’extraction optimisé et d’une chromatographie sur colonne de butyl
sépharose, il a été possible de séparer 4 isoformes d’HKs. Par la suite, une isoforme d’HK
(HK1) a été purifiée à l’homogénéité à l’aide de 5 étapes de chromatographie
supplémentaires. En plus de caractériser les propriétés cinétiques de cette enzyme, l’analyse
de séquençage par MS/MS a permis de l’associer au produit du gène StHK1 de Solanum
tuberosum. Avec une activité spécifique de 10.2 U/mg de protéine, il s’agit de l’HK
purifiée avec l’activité spécifique la plus élevée jamais rapportée d’un tissu végétal.L’ensemble des informations recueillies lors de la purification de HK1 a ensuite été utilisée
pour commencer la purification d’une deuxième isoforme (HK3). Ce travail a permis de
donner des lignes directrices pour la purification de cette isoforme et certains résultats
préliminaires sur sa caractérisation enzymatique. / Hexokinase (HK) catalyzes the first step of hexose metabolism by phosphorylating hexose
to generate the corresponding hexose phosphate thereby allowing hexose entrance in
glycolysis. Even though glucose is the main substrate, HK can also phosphorylate a broad
spectrum of hexoses. Despite its importance this enzyme has never been purified to
homogeneity in a native form. The aim of this work was therefore to purify this enzyme
from Solanum tuberosum tubers and subsequently characterize its kinetic properties.
Before I started this work, another group had already separated and partially purified 3 HK
isoform from S. tuberosum. An extraction protocol was available but improvement was
necessary since the extracted HK had little stability. By adding some protease inhibitors
and by modifying the concentration of certain components in the extraction buffer we were
able to obtain an extract with a HK activity stable for at least 72 h after extraction by
preventing degradation.
With this buffer and chromatography on butyl sepharose it was possible to separate 4 HK
isoforms from S. tuberosum. After 5 more chromatographic steps, one HK isoform was
purified to homogeneity (HK1). This enzyme was characterized and sequenced by MS/MS.
We were able to associate this protein sequence with the gene product of StHK1 from S.
tuberosum. With a specific activity of 10.2 U/mg of protein, this is the HK with the highest
specific activity ever reported from a plant tissue.
All the information gathered while purifying HK1 was used to undertake the purification of
a second isoform (HK3). We were able to obtain preliminary results on its kinetic
properties.
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