El trabajo de la tesis consistió en el diseño y síntesis de polígonos moleculares vía autoensamblaje a partir de sus unidades constitutivas, que han sido unidades lineales (aristas fluoradas) del tipo organometálico o orgánico, y unidades angulares que han sido complejos plano cuadrados de Pt y Pd (esquinas) a base de ligandos difosfina y del ligando etilendiamina. Las reacciones de autoensamblaje han dado lugar a equilibrios entre triángulos y cuadrados moleculares y se ha estudiado la composición de los mismos en función de diferentes factores como la concentración, el disolvente utilizado o el ángulo bite del ligando fosfina de las esquinas.El estudio de los polígonos moleculares sintetizados se ha complementado en algunos casos con la realización de cálculos teóricos, un estudio cuantitativo de reconocimiento molecular o el análisis de la interacción con el DNA.También se han sintetizado compuestos fluoroarílicos de oro que poseen comportamiento de cristales líquidos. / The work carried out has consisted of the design and syntheses of molecular polygons via self-assembly. To do this, two kind of constituent units are necessary: linear units or edges (either organometallic or organic fluorinated compounds) and square-planar complexes or corners (either Pt or Pd compounds bearing two accessible coordination sites and quelating ligands such as diphosphine or ethylendiamine). The self-assembly reactions have led to a mixture of triangular and square entities in equilibrium, whose composition has been studied as a function of different factors like the concentration, the solvent or the bite angle of the phosphine of the corners. The study of the synthesized molecular polygons has been complemented, when appropriate, with theoretical calculations, a quantitative study of molecular recognition and the analysis of their interaction with DNA. In addition, a series of fluorinated organometallic gold compounds have been synthesized that have shown liquid crystal behaviour.