Cette thèse part du constat de la nécessité d'améliorer la performance temporelle des flux de patients souffrant de pathologies urgentes. Elle propose pour ce faire un rôle original des outils de gestion. Particulièrement dans le secteur public, les outils de gestion sont principalement utilisés pour conformer les organisations à la représentation d'un décideur éloigné du terrain, laissant un degré de liberté faible aux acteurs locaux. Nous utilisons des outils provenant des lean et supply-chain managements dans le cadre d'une chaîne de prise en charge des accidents vasculaires cérébraux et des urgences hospitalières pour montrer que les outils de gestion peuvent permettre de "générer" des organisations originales plus performantes que celles existantes. L'apport de cette thèse est donc double. Premièrement sur l'ouverture des fonctions des outils de gestion. Deuxièmement sur les chaînes logistiques de prise en charge de l'urgence, que nous appelons emergency healthcare supply-chains, pour lesquelles les modalités de fonctionnement sont décrites et distinguées par rapport aux notions classiques de healthcare supply chains. / In this thesis, we acknoledge that the performance of emergency patients flow could be highered. We propose to explore an original function of management tools. Indeed particularly in the public sector, management tools are mainly used to conform the organizations to the representation of a central deciding actor, disconnected from the field, which leads to a low degree of freedom of local workers. We use tools from lean and supply-chain managements respectively in a stroke care chain and a local emergency care chain to prove that management tools can "generate" more performing alternative organizations. This thesis proposes two kinds of findings. Firstly on the opening of the functions of management tools. Secondly on emergency healtcare supply chains, for which specificities compared to classical healthcare supply chains imply original management rules and functions.