Mathematical modeling of cancer is of significant interest due to its potential to aid in our understanding of the disease, including investigation into which factors are most important in the progression of cancer. With this knowledge and model different paths of treatment can be examined; (e.g. simulation of different treatment techniques followed by the more costly venture of testing on animal models). Significant work has been done in the field of cancer modeling with models ranging from the more broad systems, avascular tumor models, to smaller systems, models of angiogenic pathways. A preliminary model of a vascularized tumor has been developed; the model is based on fundamental principles of mechanics and will serve as the framework for a more detailed model in the future. The current model is a system of nonlinear partial differential equations (PDEs) separated into two basic sub-models, avascular and angiogenesis. The avascular sub-model is primarily based of Fickian diffusion of nutrients into the tumor. While the angiogenesis sub-model is based on the diffusion and chemotaxis of active sprout tips into the tumor. These two portions of the models allow the effects of microvessels on nutrient concentration within the tumor, as well as the effect of the tumor in driving angiogenesis, to be examined. The results of the model have been compared to experimental measurements of tumor growth over time in animal models, and have been found to be in good agreement with a correlation coefficient of (r2=0.98). / Master of Science

Orientador: Winston Bonetti Yoshida / Resumo: Introdução: O Angiossarcoma (AS) é um tumor vascular maligno raro. As vias moleculares associadas ao desenvolvimento e progressão do AS ainda são pouco entendidas. miRNAs são moléculas reguladoras da expressão gênica com papel importante na tumorigênese e constituem biomarcadores em potencial, podendo definir prognóstico e tratamento de pacientes com câncer. A identificação de perfis de expressão de miRNAs e das vias moleculares reguladas por miRNAs pode contribuir para a elucidação dos mecanismos de tumorigênese em AS. Objetivos: Identificação da expressão global de miRNAs e vias moleculares em AS. Identificar miRNAs alterados em AS; identificar genes-alvo regulados pelos miRNAs e mapear miRNAs e genes alvo relacionados ao desenvolvimento vascular. Material e Métodos: Realizamos uma meta-análise segundo a Declaração de Prisma e utilizando as principais bases de dados, PubMed e EMBASE. Após a aplicação de critérios de inclusão e exclusão específicos, um estudo (incluindo 5 amostras de AS) foi considerado elegível e selecionado para extração dos dados. Deste, foram identificados os miRNAs significativamente desregulados (FC>=1,5 e p<0,05). A seguir, os dados de expressão de miRNAs foram analisados utilizando as ferramentas de bioinformática miRWalk v.2.0 para predição de genes-alvo regulados pelos miRNAs e STRING e Cytoscape v.3.1.1/BINGO para identificação de redes de interação (miRNAs-mRNAs-alvo) e funções biológicas, respectivamente. Resultados: 59 miRNAs estavam com expres... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor