Submitted by MURILO RAPHAEL DE MELO null (engenhariasp@piraflora.com.br) on 2017-03-29T19:30:16Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Modelo novo Final.pdf: 1070767 bytes, checksum: 9448e5eb4a8f905c67d161d2933a9827 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-03-30T18:20:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 melo_mr_me_bot.pdf: 1070767 bytes, checksum: 9448e5eb4a8f905c67d161d2933a9827 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-30T18:20:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 melo_mr_me_bot.pdf: 1070767 bytes, checksum: 9448e5eb4a8f905c67d161d2933a9827 (MD5) Previous issue date: 2017-02-03 / Um dos fatores que mais contribuem para queda da produtividade em mudas de Eucalyptus spp. são as doenças. Nos últimos anos tem se observado o aumento gradativo de doenças de origem bacteriana, principalmente de ocorrência foliar. A mancha foliar bacteriana ocorrem em mudas de eucalipto em todas as fases de produção do viveiro, podendo facilmente ser levada a campo, prejudicando o desenvolvimento inicial da muda. No presente estudo foi avaliado o efeito da severidade de bacteriose e da desfolha no crescimento pós-plantio de mudas de Eucalipto. As plantas avaliadas apresentaram um retardo no desenvolvimento devido a doença e a desfolha, no entanto, mantendo a adubação, após a recuperação, as mudas tiveram seu crescimento normalizado. / Diseases are one of the factors that most contribute to decrease the Eucalyptus spp. productivity. Now a day observe the gradual increase of bacterial origin diseases, mainly of foliar occurrence. The bacterial leaf spot occurs in eucalyptus seedlings at all stages of nursery production, and it can easily take to the field, damaging the initial development of the seedlings. In this study was evaluated the effect of bacterial leaf spot severity and defoliation on post-planting growth of Eucalyptus seedlings. The evaluated plants presented a delay in the development due to disease and defoliation; however, maintaining the fertilization, after the recovery, the seedlings had their growth normalized.

La gale bactérienne des Solanées à graines est une maladie répandue dans la plupart des aires de production de tomate et des Capsicum spp. (piment, poivron) du monde. Elle est très sévère dans les régions tropicales et subtropicales et sa présence est récurrente dans la région Sud-Ouest de l’océan Indien. Cette maladie est complexe car cinq taxons sont actuellement reconnus comme agents causaux, X. vesicatoria , X. perforans , X. gardneri , X. euvesicatoria et X. campestris pv. raphani . Néanmoins certaines études récentes suggèrent des synonymies de certaines de ces espèces entre elles et également avec d’autres Xanthomonas. Les objectifs principaux de la thèse étaient (1) l’analyse de la diversité sur une collection mondiale à l’aide des deux techniques moléculaires à haut débit, AFLP et MLSA, avec un accent particulier sur la diversité génétique et pathologique régionale (2) la description des relations phylogénétiques entre ces taxons et les autres Xanthomonas (3) la mise au point d’un outil d’identification rapide qui tienne compte de la diversité de l’agent pathogène et basé sur des marqueurs SCAR identifiés par AFLP. Une absence de congruence entre les topologies d’arbres dérivées des séquences de 4 gènes de ménage étudiés a été mise en évidence, de même que plusieurs évènements de recombinaison sur trois d’entre eux. Un inventaire des espèces trouvées dans les îles SWIO a pu être dressé, mettant à jour une grande diversité dans cette région. Nos données ont confirmé de fortes similarités génétiques entre X. alfalfae , X. euvesicatoria et X. perforans d’une part et de X. cynarae et X. gardneri d’autre part, qui ont probablement le statut d’espèces-synonyme. / Bacterial spot of Solanaceae is present in most areas of the world where tomato and pepper are cultivated. Its incidence is especially high in tropical and subtropical regions, such as the islands of South West Indian Ocean. This desease can be caused by five taxa: X. vesicatoria , X. perforans , X. gardneri , X. euvesicatoria et X. campestris pv. raphani, but recent studies suggest that some of those species are synonymous or actually correspond to other species of Xanthomonas. The objectives of this work were (1) to assess the genetic diversity of a word collection of strains using two high throughput molecular techniques: AFLP and MLSA; (2) to describe the phylogenetic relationships between the different taxa caising bacterial spot and other Xanthomonas; (3) to develop a rapid identification method based on SCAR markers identified by AFLP, which would take into account the global diversity of the pathogen. Tree topologies derived from the sequences of four housekeeping genes were not congruent and recombination events could be detected in three of them. A survey of bacterial spot of tomato and pepper in the South West Indian Ocean showed a broad diversity of the species causing this disease in the region. Our data confirmed the strong genetic similarity between, X. alfalfae , X. euvesicatoria et X. perforans, as well as between X. cynarae and X. gardneri, which are probably synonymous species.

La gale bactérienne des Solanées à graines est une maladie répandue dans la plupart des aires de production de tomate et des Capsicum spp. (piment, poivron) du monde. Elle est très sévère dans les régions tropicales et subtropicales et sa présence est récurrente dans la région Sud-Ouest de l'océan Indien. Cette maladie est complexe car cinq taxons sont actuellement reconnus comme agents causaux, X. vesicatoria , X. perforans , X. gardneri , X. euvesicatoria et X. campestris pv. raphani . Néanmoins certaines études récentes suggèrent des synonymies de certaines de ces espèces entre elles et également avec d'autres Xanthomonas. Les objectifs principaux de la thèse étaient (1) l'analyse de la diversité sur une collection mondiale à l'aide des deux techniques moléculaires à haut débit, AFLP et MLSA, avec un accent particulier sur la diversité génétique et pathologique régionale (2) la description des relations phylogénétiques entre ces taxons et les autres Xanthomonas (3) la mise au point d'un outil d'identification rapide qui tienne compte de la diversité de l'agent pathogène et basé sur des marqueurs SCAR identifiés par AFLP. Une absence de congruence entre les topologies d'arbres dérivées des séquences de 4 gènes de ménage étudiés a été mise en évidence, de même que plusieurs évènements de recombinaison sur trois d'entre eux. Un inventaire des espèces trouvées dans les îles SWIO a pu être dressé, mettant à jour une grande diversité dans cette région. Nos données ont confirmé de fortes similarités génétiques entre X. alfalfae , X. euvesicatoria et X. perforans d'une part et de X. cynarae et X. gardneri d'autre part, qui ont probablement le statut d'espèces-synonyme.