Des données suggéraient que le facteur de transcription ZNF143 régule l’expression de milliers de gènes mais très peu d’informations étaient disponibles sur les gènes cibles, réseaux de gènes, processus biologiques et mécanismes impliquant ZNF143. Pour mon travail de thèse je me suis intéressé au potentiel régulateur de ce facteur en particulier chez l’homme. Mon projet de recherche a premièrement consisté à identifier toutes les cibles génomiques de ZFN143 puis à caractériser fonctionnellement cet interactome. Les résultats obtenus ont permis d’identifier plus de 3000 gènes cibles de ZNF143, principalement impliqués dans des processus liés à la croissance cellulaire. Mes travaux ont aussi permis de mettre à jour de nouveaux mécanismes de régulation impliquant ce facteur. En effet, nous avons démontré que les facteurs de transcription ZNF143, THAP11 et Notch1 modulent l’expression d’un répertoire commun de gènes via des sites de liaison à l’ADN chevauchant. Nous avons aussi montré que ZNF143 joue un rôle essentiel dans l’expression des gènes dirigés par des promoteurs bidirectionnels et qu’il est aussi impliqué dans une boucle d’autorégulation transcriptionnelle de son expression. / Numerous data were suggesting that the transcription factor ZNF143 regulates the expression of thousand of genes. However, nothing was known about the genome wide regulatory networks, biological processes and transcriptional mechanisms involving this factor.For my PhD thesis I was interested in exploring the regulatory potential of the ZNF143 transcription factor in human. The goal of my project was to identify all the genomic targets of this factor and functionally characterize this ZNF143-DNA interactome. The results I obtained allowed us to identify more than 3000 genes targeted by ZNF143, mainly involved in biological processes linked to cell proliferation. My work also led us to discover new transcriptional mechanisms involving ZNF143. We demonstrated that the transcription factors ZNF143, THAP11 and Notch1 modulate the expression of a common set f gene via overlapping DNA binding sites. Moreover, we also showed that ZNF143 in essential for the divergent expression of genes from bidirectional promoters and that its expression is regulated through auto-regulatory feedback loop.

Le facteur de transcription Staf et son orthologue humain ZNF143 sont impliqués dans l'activation de la transcription de gènes d'ARN non codants transcrits par l'ARN polymérase II et III et dans celle de 7 gènes de protéines. L'objectif de ma thèse était de caractériser de nouveaux gènes cibles de ce facteur chez l'homme. Par une approche bioinformatique couplée à des expériences de ChIP, nous avons montré qu'environ 10% des promoteurs de gènes de protéines humaines fixent hStaf/ZNF143. Ceci suggère que le site de liaison de hStaf/ZNF143 (SBS) est l'un des plus abondants dans les génomes de mammifères. En parallèle, nous avons étudié les promoteurs des gènes TFAM, BUB1B et SCARNA2 dans lesquels nous avons identifié des éléments conservés dont des sites SBS. Nous avons montré l'importance de ces éléments dans la transcription. Ces résultats mettent en évidence que Staf régule l'activité de gènes impliqués dans des processus cellulaires divers via des promoteurs à architectures variées.