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Estudo de associação genômica para habilidade de permanência no rebanho na raça Nelore, considerando diferentes idades /Silva, Diogo Osmar January 2018 (has links)
Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Resumo: A habilidade de permanência no rebanho (HPR) é medida tardiamente na vida do animal. Com isso, quando esta característica é usada como critério de seleção, o intervalo de geração, definido como a média de idade dos pais ao nascimento da progênie, tende a aumentar, provocando a diminuição do ganho genético. A mensuração das fêmeas em uma idade mais precoce seria uma forma de contornar este problema. Neste sentido, um melhor entendimento das regiões genômicas envolvidas na expressão desta característica em diferentes idades/partos é necessário. O objetivo com o presente estudo foi, então, identificar regiões genômicas associadas à HPR medida em diferentes partos de fêmeas da raça Nelore. Considerando apenas fêmeas com idade ao primeiro parto de até 40 meses, os fenótipos para HPR foram gerados observando se cada fêmea teve oportunidade de permanecer no rebanho do segundo ao oitavo parto, de maneira que cada vaca poderia ter até sete observações para HPR. Ao final, o banco de dados possuía 195.452, 161.261, 130.236, 103.043, 79.844, 62.663 e 47.045 fêmeas com fenótipos para o segundo, terceiro, quarto, quinto, sexto, sétimo e oitavo parto, respectivamente. Do total de animais no banco de dados, 3.849 (2.720 fêmeas e 1.129 touros) apresentavam informações genotípicas de 472.640 marcadores do tipo SNPs (Illumina BovineHD BeadChip). Ao todo, foram realizadas sete análises uni-características, considerando modelos thresholds com função de ligação probit. A metodologia do single-step... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Stayability (STAY) is a trait measured late in the animal's life. Thus, when this trait is used as selection criteria, the generation interval, defined as the parents average age at the progeny birth, tends to increase, causing a decrease in the genetic gain. Measuring females at an earlier age could be a way to circumvent this problem. In this sense, a better understanding of genomic regions involved in the expression of this trait at different ages/calving is necessary. The objective of the present study was to identify genomic regions associated with STAY measured in different calving of Nelore females. Considering only females that had their first calving up to 40 months of age, the phenotypes for STAY were generated by observing whether each female had the opportunity to remain in the herd from the second to the eighth calving, in such a way that each cow could have up to seven records. The final dataset had 195,452, 161,261, 130,236, 103,043, 79,844, 62,663 and 47,045 females with phenotypes for the second, third, fourth, fifth, sixth, seventh and eighth calving, respectively. In total, 3,849 (2,720 females and 1,129 bulls) animals from the whole dataset used in the analyses had genotypic information of 472,640 SNPs (Illumina BovineHD BeadChip) markers. In total, seven single-trait analyzes were performed considering threshold animal models with probit link function. The single-step GBLUP methodology was used to estimate variance components for STAY at each calving as w... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Digestibilidade aparente da dieta de touros da raça nelore selecionados pelo consumo alimentar residual / Diet apparent digestibility of nellore bulls selected by residual feed intakeMobiglia, Andrea de Mello 27 February 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Owing to the potential of utilization of residual feed intake as tool for genetic selection becomes indispensable the studies that looking for understand the variables influence RFI, principally data from cattle of Nellore breed, consist with Brazilian reality. The aim of this study was to evaluate the apparent digestibility of diet of Nellore bulls classified by residual feed intake (RFI). One hundred and twenty Nellore bulls were used , with body weight (BW) of 392.5 ± 47.15 kg. The animals were maintained in a feedlot with individual pens and fed with the same diet for 83 days. The animals were fed ad libitum and the diet was composed of sorghum silage, sugarcane bagasse and concentrate, in relation 33:67 (V: C) in dry matter. The animals were weight at the beginning of the trial and every 28 days after the solid feed restriction. The refused and offered fed were weight to measure the daily feed intake. RFI was calculate by difference between the observed intake and estimated intake what was obtained through a multiple regression equation of feed intake, average daily gain (ADG) and metabolic body weight (MBW) of the animals. On eighth week was realized a digestibility assay. To estimate the fecal production was used indigestible neutral detergent fiber (NDFi) as internal marker. The randomized design was used for statistical analysis. The ADG and BC were the same for different RFI groups (P>0.05), despite of low RFI animals showed lower feed intake (P<0.05) than medium and high RFI. However, the digestibility coefficient did not differ between the RFI groups (P>0.05). In contrast, the apparent digestibility of NFC was negative correlated (– 0,23) with the RFI. / Tendo em vista o potencial de utilização do consumo alimentar residual como ferramenta para seleção genética torna-se imprescindível estudos que procuram entender as variáveis que influenciam o CAR, principalmente dados com bovinos da raça Nelore condizentes com a realidade brasileira. O objetivo deste estudo foi avaliar a digestibilidade aparente da dieta de touros da raça Nelore classificados pelo consumo alimentar residual (CAR). Foram utilizados 120 touros da raça Nelore, com peso corporal (PC) de 392,5 ± 47,15 kg. Os animais foram mantidos em confinamento com baias individuais e alimentados com a mesma dieta por 83 dias. Todos os animais foram alimentados à vontade e a dieta era composta de silagem de sorgo, bagaço de cana e concentrado, na relação 33: 67 (V: C) na matéria seca. Os animais foram pesados no inicio do experimento e a cada 28 dias após jejum de sólido. Diariamente foram pesadas as sobras e o fornecido para determinar o consumo diário. O CAR foi calculado pela diferença do consumo observado e estimado, o qual foi obtido por uma equação de regressão entre consumo, o ganho de peso diário e peso corporal médio metabólico dos animais. Na 8ª semana do experimento foi realizado ensaio de digestibilidade. O marcador interno utilizado para estimar a produção fecal foi a fibra em detergente neutro indigestível (FDNi). Para as análises estatísticas, foi utilizado delineamento inteiramente casualizado. O ganho médio de peso diário (GMD) e PC foram os mesmos para as classes de CAR (P>0,05), apesar dos animais de baixo CAR apresentar menor ingestão de nutrientes (P<0,05) que os animais de médio e alto CAR. Entretanto, os coeficientes de digestibilidade não diferiram entre os grupos (P>0,05). Em contraste, a digestibilidade aparente dos CNF apresentou correlação negativa de -0,23 com o CAR.
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