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Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Resumo: A habilidade de permanência no rebanho (HPR) é medida tardiamente na vida do animal. Com isso, quando esta característica é usada como critério de seleção, o intervalo de geração, definido como a média de idade dos pais ao nascimento da progênie, tende a aumentar, provocando a diminuição do ganho genético. A mensuração das fêmeas em uma idade mais precoce seria uma forma de contornar este problema. Neste sentido, um melhor entendimento das regiões genômicas envolvidas na expressão desta característica em diferentes idades/partos é necessário. O objetivo com o presente estudo foi, então, identificar regiões genômicas associadas à HPR medida em diferentes partos de fêmeas da raça Nelore. Considerando apenas fêmeas com idade ao primeiro parto de até 40 meses, os fenótipos para HPR foram gerados observando se cada fêmea teve oportunidade de permanecer no rebanho do segundo ao oitavo parto, de maneira que cada vaca poderia ter até sete observações para HPR. Ao final, o banco de dados possuía 195.452, 161.261, 130.236, 103.043, 79.844, 62.663 e 47.045 fêmeas com fenótipos para o segundo, terceiro, quarto, quinto, sexto, sétimo e oitavo parto, respectivamente. Do total de animais no banco de dados, 3.849 (2.720 fêmeas e 1.129 touros) apresentavam informações genotípicas de 472.640 marcadores do tipo SNPs (Illumina BovineHD BeadChip). Ao todo, foram realizadas sete análises uni-características, considerando modelos thresholds com função de ligação probit. A metodologia do single-step... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Stayability (STAY) is a trait measured late in the animal's life. Thus, when this trait is used as selection criteria, the generation interval, defined as the parents average age at the progeny birth, tends to increase, causing a decrease in the genetic gain. Measuring females at an earlier age could be a way to circumvent this problem. In this sense, a better understanding of genomic regions involved in the expression of this trait at different ages/calving is necessary. The objective of the present study was to identify genomic regions associated with STAY measured in different calving of Nelore females. Considering only females that had their first calving up to 40 months of age, the phenotypes for STAY were generated by observing whether each female had the opportunity to remain in the herd from the second to the eighth calving, in such a way that each cow could have up to seven records. The final dataset had 195,452, 161,261, 130,236, 103,043, 79,844, 62,663 and 47,045 females with phenotypes for the second, third, fourth, fifth, sixth, seventh and eighth calving, respectively. In total, 3,849 (2,720 females and 1,129 bulls) animals from the whole dataset used in the analyses had genotypic information of 472,640 SNPs (Illumina BovineHD BeadChip) markers. In total, seven single-trait analyzes were performed considering threshold animal models with probit link function. The single-step GBLUP methodology was used to estimate variance components for STAY at each calving as w... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A degradação florestal tem aumentado significativamente nas últimas décadas e gerado impactos ambientais consideráveis, exigindo o estabelecimento de técnicas economicamente viáveis e eficazes de restauração florestal. Atualmente tem sido proposta a semeadura direta como uma alternativa ao plantio de mudas devido ao seu baixo custo. No entanto, ainda são poucos os trabalhos com semeadura direta que objetivem selecionar espécies que apresentam maiores porcentagens de emergência e sobrevivência. Diante disso, nós realizamos um estudo de semeadura direta com espécies arbóreas nativas da Floresta Estacional Semidecidual, no sul do Brasil, com o objetivo de: (1) determinar se atributos reprodutivos (massa, forma e conteúdo de água da semente) influenciam na germinação; (2) testar a efetividade da semeadura direta em tratamentos com e sem cobertura de palhada, sementes enterradas e não enterradas e (3) estabelecer critérios para a seleção de espécies para restauração ecológica. Foram coletadas sementes de 17 espécies, testadas a germinação em laboratório e, destas, 12 foram semeadas em campo. Foram medidos a forma, massa e conteúdo de água das sementes. Estes atributos foram relacionados com a taxa de germinação, tempo médio de germinação e índice de velocidade de germinação para as espécies testadas em laboratório. Na semeadura direta foram calculados a emergência, estabelecimento e sobrevivência e comparado as diferenças entre três tratamentos: enterrada com cobertura, enterrada sem cobertura e não enterrada com cobertura. Em laboratório o formato das sementes teve efeito sobre o índice de velocidade germinação, indicando que as sementes achatadas germinam mais rapidamente. Na semeadura direta, as sementes enterradas e com cobertura de palhada apresentaram maiores taxas de germinação (52% para Allophylus edulis), porém não houve efeito significativo para o estabelecimento e a sobrevivência. Nosso estudo sugere que espécies com sementes achatadas devem ser priorizadas em trabalhos de restauração ecológica florestal e que, na semeadura direta, as sementes quando enterradas aumentam o sucesso da semeadura. / Deforestation has increased significantly in the last decades and generated considerable environmental impacts, requiring the establishment of economically viable and effective forest restoration techniques. Direct sowing has now been proposed as an alternative to planting seedlings because of its low cost. However, there are still few works with direct seeding that aim to select species that show highest germination and establishment. Therefore, we carried out a direct sowing study with native tree species of the South Brazilian Semideciduous Seasonal Forest, aim to: (1) determine if reproductive attributes (mass, shape and water content of the seed) interfere with germination; (2) to test the effectiveness of direct seeding in treatments with and without seed cover, buried and non-buried seeds, and (3) establish criteria for selection of species for ecological restoration using direct seeding. Seeds of 17 species were collected and tested in the laboratory and 12 of them were sowed in the field. The traits seed mass, seed form and water content were related to germination rate, mean germination time and germination speed index for the species tested in the laboratory. In direct seeding, we compared the three treatments ‘buried with cover’, ‘buried without cover’, ‘not buried with cover’and analysed emergence, establishment and survival. In the laboratory, the flattened seeds presented greater germinability and a higher rate of germination, and the interaction of seed form and mass was significant for germination rate. In direct seeding, buried seedlings with mulch cover presented higher germination rates, but there was no significant effect for establishment and survival. Our study suggests that species with flattened seeds should be prioritized in forest ecological restoration and that, when buried, increase direct seeding success.

The thesis was focused on the reproductive traits of zwartbles breed level evaluation in Novosedly nad Nežárkou, evaluation data were compared with the average values of reproductive traits of zwartbles flocks, included in the performance monitoring of sheep in the Czech Republic, using statistical methods. Simultaneously, there was the effect of factors that might affect reproductive traits of the breed evaluated. 111 ewes were evaluated during the period 2012-2015. The average fertility in the sheeps during the monitoring period amounted to 175,7 % and an average rearing amounted to 88,5 %. There was a significant difference in fertility (p < 0,05) and even highly significant difference in rearing (p < 0,01) among the monitored flock and the flocks in the performance monitoring. The percentage of fertilization and intensity in breeding didn´t achieve satisfactory values, primarily due to the high percentage of futility in sheep in average of 25,5 %. All the reproduction indicators are below the breed average. Lambing number on litter size was evaluated as highly significant (p < 0,01). Ewe age at lambing was assessed as a highly significant influence exerted on fertility (p < 0,01). Influence paternal lines of ewes on their fertility was not statistically demonstrated (p 0,05).

A degradação florestal tem aumentado significativamente nas últimas décadas e gerado impactos ambientais consideráveis, exigindo o estabelecimento de técnicas economicamente viáveis e eficazes de restauração florestal. Atualmente tem sido proposta a semeadura direta como uma alternativa ao plantio de mudas devido ao seu baixo custo. No entanto, ainda são poucos os trabalhos com semeadura direta que objetivem selecionar espécies que apresentam maiores porcentagens de emergência e sobrevivência. Diante disso, nós realizamos um estudo de semeadura direta com espécies arbóreas nativas da Floresta Estacional Semidecidual, no sul do Brasil, com o objetivo de: (1) determinar se atributos reprodutivos (massa, forma e conteúdo de água da semente) influenciam na germinação; (2) testar a efetividade da semeadura direta em tratamentos com e sem cobertura de palhada, sementes enterradas e não enterradas e (3) estabelecer critérios para a seleção de espécies para restauração ecológica. Foram coletadas sementes de 17 espécies, testadas a germinação em laboratório e, destas, 12 foram semeadas em campo. Foram medidos a forma, massa e conteúdo de água das sementes. Estes atributos foram relacionados com a taxa de germinação, tempo médio de germinação e índice de velocidade de germinação para as espécies testadas em laboratório. Na semeadura direta foram calculados a emergência, estabelecimento e sobrevivência e comparado as diferenças entre três tratamentos: enterrada com cobertura, enterrada sem cobertura e não enterrada com cobertura. Em laboratório o formato das sementes teve efeito sobre o índice de velocidade germinação, indicando que as sementes achatadas germinam mais rapidamente. Na semeadura direta, as sementes enterradas e com cobertura de palhada apresentaram maiores taxas de germinação (52% para Allophylus edulis), porém não houve efeito significativo para o estabelecimento e a sobrevivência. Nosso estudo sugere que espécies com sementes achatadas devem ser priorizadas em trabalhos de restauração ecológica florestal e que, na semeadura direta, as sementes quando enterradas aumentam o sucesso da semeadura. / Deforestation has increased significantly in the last decades and generated considerable environmental impacts, requiring the establishment of economically viable and effective forest restoration techniques. Direct sowing has now been proposed as an alternative to planting seedlings because of its low cost. However, there are still few works with direct seeding that aim to select species that show highest germination and establishment. Therefore, we carried out a direct sowing study with native tree species of the South Brazilian Semideciduous Seasonal Forest, aim to: (1) determine if reproductive attributes (mass, shape and water content of the seed) interfere with germination; (2) to test the effectiveness of direct seeding in treatments with and without seed cover, buried and non-buried seeds, and (3) establish criteria for selection of species for ecological restoration using direct seeding. Seeds of 17 species were collected and tested in the laboratory and 12 of them were sowed in the field. The traits seed mass, seed form and water content were related to germination rate, mean germination time and germination speed index for the species tested in the laboratory. In direct seeding, we compared the three treatments ‘buried with cover’, ‘buried without cover’, ‘not buried with cover’and analysed emergence, establishment and survival. In the laboratory, the flattened seeds presented greater germinability and a higher rate of germination, and the interaction of seed form and mass was significant for germination rate. In direct seeding, buried seedlings with mulch cover presented higher germination rates, but there was no significant effect for establishment and survival. Our study suggests that species with flattened seeds should be prioritized in forest ecological restoration and that, when buried, increase direct seeding success.

A degradação florestal tem aumentado significativamente nas últimas décadas e gerado impactos ambientais consideráveis, exigindo o estabelecimento de técnicas economicamente viáveis e eficazes de restauração florestal. Atualmente tem sido proposta a semeadura direta como uma alternativa ao plantio de mudas devido ao seu baixo custo. No entanto, ainda são poucos os trabalhos com semeadura direta que objetivem selecionar espécies que apresentam maiores porcentagens de emergência e sobrevivência. Diante disso, nós realizamos um estudo de semeadura direta com espécies arbóreas nativas da Floresta Estacional Semidecidual, no sul do Brasil, com o objetivo de: (1) determinar se atributos reprodutivos (massa, forma e conteúdo de água da semente) influenciam na germinação; (2) testar a efetividade da semeadura direta em tratamentos com e sem cobertura de palhada, sementes enterradas e não enterradas e (3) estabelecer critérios para a seleção de espécies para restauração ecológica. Foram coletadas sementes de 17 espécies, testadas a germinação em laboratório e, destas, 12 foram semeadas em campo. Foram medidos a forma, massa e conteúdo de água das sementes. Estes atributos foram relacionados com a taxa de germinação, tempo médio de germinação e índice de velocidade de germinação para as espécies testadas em laboratório. Na semeadura direta foram calculados a emergência, estabelecimento e sobrevivência e comparado as diferenças entre três tratamentos: enterrada com cobertura, enterrada sem cobertura e não enterrada com cobertura. Em laboratório o formato das sementes teve efeito sobre o índice de velocidade germinação, indicando que as sementes achatadas germinam mais rapidamente. Na semeadura direta, as sementes enterradas e com cobertura de palhada apresentaram maiores taxas de germinação (52% para Allophylus edulis), porém não houve efeito significativo para o estabelecimento e a sobrevivência. Nosso estudo sugere que espécies com sementes achatadas devem ser priorizadas em trabalhos de restauração ecológica florestal e que, na semeadura direta, as sementes quando enterradas aumentam o sucesso da semeadura. / Deforestation has increased significantly in the last decades and generated considerable environmental impacts, requiring the establishment of economically viable and effective forest restoration techniques. Direct sowing has now been proposed as an alternative to planting seedlings because of its low cost. However, there are still few works with direct seeding that aim to select species that show highest germination and establishment. Therefore, we carried out a direct sowing study with native tree species of the South Brazilian Semideciduous Seasonal Forest, aim to: (1) determine if reproductive attributes (mass, shape and water content of the seed) interfere with germination; (2) to test the effectiveness of direct seeding in treatments with and without seed cover, buried and non-buried seeds, and (3) establish criteria for selection of species for ecological restoration using direct seeding. Seeds of 17 species were collected and tested in the laboratory and 12 of them were sowed in the field. The traits seed mass, seed form and water content were related to germination rate, mean germination time and germination speed index for the species tested in the laboratory. In direct seeding, we compared the three treatments ‘buried with cover’, ‘buried without cover’, ‘not buried with cover’and analysed emergence, establishment and survival. In the laboratory, the flattened seeds presented greater germinability and a higher rate of germination, and the interaction of seed form and mass was significant for germination rate. In direct seeding, buried seedlings with mulch cover presented higher germination rates, but there was no significant effect for establishment and survival. Our study suggests that species with flattened seeds should be prioritized in forest ecological restoration and that, when buried, increase direct seeding success.

This study was part of a program to develop new genotypes of sheep (Ovis spp.) and goats (Capra spp.) which are more useful for food and fiber production. The study examined the influence of domestication on behavioral and physiological traits of ewes and lambs, the influence of a single or twin offspring on ewe and lamb behaviors, and general relationships between ewes and lambs during the lambs' first month of life. Domestication has caused the intensities of observed traits to diverge greatly from the tendencies shown by wild populations. Domestication has produced increases in measurements associated with maternal care, discovery learning, tolerance or inclination for closeness with conspecifics, length of the breeding season, fertility, birth weight, and growth rate. Behaviors associated with imitative learning have decreased with domestication. Domestication has not altered the length of estrous cycle nor length of gestation. The partly domestic groups were intermediate to the most domestic and wild groups for three traits: maternal care, birth weight, and growth rate. However, other hybridization factors apparently altered the intermediate position of the partly domestic groups for the remaining traits: learning in the young, proximity of conspecifics, and fertility. The study's findings indicated that the development of new crossbreeds is an advantageous method of improving sheep and goat productivity. Some behavioral differences between ewes and their single lambs and ewes and their twin lambs resulted from the earlier physical development of singles as compared to twins: Singles played more and spent less time close to their mothers. Mothering capacities, sibling competition, and a sibling bond caused behavioral differences between ewes and their twin young and ewes and their single young: Twins suckled more, gained less weight, spent more time close to their mothers, stood more, received less sniffing from their mothers than did singles. The ewe-lamb bond did not vary between ewes and their single lambs and ewes and their twin lambs. The high occurrence of simultaneous behaviors and the maintenance of close contact between ewes and their offspring and between twins contributed to the cohesion and organization of the flock.

Orientador: Jeffrey Frederico Lui / Banca: Lucia Galvão de Albuquerque / Banca: Lenira El Faro Zadra / Resumo: Para estimar parâmetros genéticos para o número total de leitões nascidos (NLNT) e nascidos vivos (NLNV), empregaram-se modelos de repetibilidade, uni-características, bi-características, e de regressão aleatória (MRA). Os grupos de contemporâneos (GC) empregados nos três primeiros modelos foram: GC1 (granja-anoépoca) GC2 (granja-ano-mês) e GC3 (granja-ano-semana) relacionados com local e data em que ocorreu a parição. Para NLNT e NLNV, a herdabilidade (h2) estimada pelo modelo de repetibilidade foi de 0,09 ± 0,02. Nos modelos uni-características, a definição GC3 levou à estimativas mais elevadas nas ultimas parições. O modelo de repetibilidade com três classes de variâncias residuais foi o que apresentou melhor ajuste segundo o Teste da Razão de Verossimilhança (LRT) e o Critério de Informação de Akaike (AIC), para ambas as características. Dois MRA adicionais também foram ajustados para ambas as características. Para NLNT, um MRA linear e um quadrático de rank 2, ambos com três classes de variâncias residuais. Para NLNV, o primeiro foi um MRA linear, o segundo foi um MRA linear (genética) e quadrática com rank 2 (ambiente permanente). As estimativas de herdabilidade obtidas pelos MRA foram menores que as para o modelo multi-característica. As correlações genéticas obtidas pelos MRA tenderam a diminuir com o decorrer das parições, para ambas características. As correlações genéticas entre ordens de parição, de maneira geral foram altas, indicando que ao selecionar-se para primeira ganhos genéticos podem ser obtidos nas parições subseqüentes. / Abstract: Repeatability, single-trait, multiple-trait (MTM) and random regression models (RRM) were used with the objective to estimate genetic parameters for the number of piglets born in total (NOBT) and the number of piglets born alive (NOBA). Three different structures of cotemporary groups were applied: CG1 (herdyear- season), CG2 (herd-year-monthly) e CG3 (herd-year-weekly). For NOBT and NOBA, the estimates of heritability by repeatability model, were 0.09 ± 0.02. The estimates of heritability by single-trait model with CG3 definition were higher in 5th and 6th parities. The repeatability model with three classes of residual variances presented best fit. Two additional RRM were adjusted for both traits. For NOBT a linear and a quadratic RRM with rank 2, and three classes of residual variances, were utilized and for NOBA a linear RRM and Linear, for genetics effects, and quadratic with rank 2, for permanent environmental. The heritability estimates by RRM model were lower than MTM. The genetic correlations estimated by RRM tended to decrease over parities, for both traits. The genetics correlations were high among the most parities, indicating that the selection in the first parity will result in genetic gains in later parities. / Mestre

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Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-20Bitstream added on 2014-06-13T18:29:29Z : No. of bitstreams: 1 alves_dnm_me_jabo.pdf: 283323 bytes, checksum: ee31eb0fac2fd6cd06f249038ec9709e (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Para estimar parâmetros genéticos para o número total de leitões nascidos (NLNT) e nascidos vivos (NLNV), empregaram-se modelos de repetibilidade, uni-características, bi-características, e de regressão aleatória (MRA). Os grupos de contemporâneos (GC) empregados nos três primeiros modelos foram: GC1 (granja-anoépoca) GC2 (granja-ano-mês) e GC3 (granja-ano-semana) relacionados com local e data em que ocorreu a parição. Para NLNT e NLNV, a herdabilidade (h2) estimada pelo modelo de repetibilidade foi de 0,09 ± 0,02. Nos modelos uni-características, a definição GC3 levou à estimativas mais elevadas nas ultimas parições. O modelo de repetibilidade com três classes de variâncias residuais foi o que apresentou melhor ajuste segundo o Teste da Razão de Verossimilhança (LRT) e o Critério de Informação de Akaike (AIC), para ambas as características. Dois MRA adicionais também foram ajustados para ambas as características. Para NLNT, um MRA linear e um quadrático de rank 2, ambos com três classes de variâncias residuais. Para NLNV, o primeiro foi um MRA linear, o segundo foi um MRA linear (genética) e quadrática com rank 2 (ambiente permanente). As estimativas de herdabilidade obtidas pelos MRA foram menores que as para o modelo multi-característica. As correlações genéticas obtidas pelos MRA tenderam a diminuir com o decorrer das parições, para ambas características. As correlações genéticas entre ordens de parição, de maneira geral foram altas, indicando que ao selecionar-se para primeira ganhos genéticos podem ser obtidos nas parições subseqüentes. / Repeatability, single-trait, multiple-trait (MTM) and random regression models (RRM) were used with the objective to estimate genetic parameters for the number of piglets born in total (NOBT) and the number of piglets born alive (NOBA). Three different structures of cotemporary groups were applied: CG1 (herdyear- season), CG2 (herd-year-monthly) e CG3 (herd-year-weekly). For NOBT and NOBA, the estimates of heritability by repeatability model, were 0.09 ± 0.02. The estimates of heritability by single-trait model with CG3 definition were higher in 5th and 6th parities. The repeatability model with three classes of residual variances presented best fit. Two additional RRM were adjusted for both traits. For NOBT a linear and a quadratic RRM with rank 2, and three classes of residual variances, were utilized and for NOBA a linear RRM and Linear, for genetics effects, and quadratic with rank 2, for permanent environmental. The heritability estimates by RRM model were lower than MTM. The genetic correlations estimated by RRM tended to decrease over parities, for both traits. The genetics correlations were high among the most parities, indicating that the selection in the first parity will result in genetic gains in later parities.