La contribution des brise-vent à l'amélioration des revenus et du bien-être des ménages dans deux villages du Delta et de la Vallée du fleuve Sénégal a fait l'objet d'une étude au moyen d'enquêtes, de groupes de discussion et de profils historiques. Les notions de chef de ménage, de revenu et de bien-être ainsi que les concepts de capital social et de capital humain ont été utilisés pour aborder les aspects socio-économiques liés aux brise-vent. Le budget partiel et l'andyse du discours ont été utilisés pour l'analyse des données. Les résultats ont montré que les parcelles avec brise-vent étaient financièrement plus rentables que les parcelles sans brise-vent, et que les produits tirés des parcelles avec brise-vent permettaient aux chefs de ménage d'acquérir du capital humain et du capital social. Les résultats pourraient aider à mieux orienter les activités agroforestières par rapport aux attentes des producteurs agricoles de la zone d'étude.

Au Burkina Faso, 86% de la population active travaille dans l’agriculture. Toutefois, dans un contexte de démographie galopante et de manque d’investissements, cette agriculture a du mal à couvrir les besoins des populations. La diffusion et l’adoption de techniques améliorées de production sont à même d’inverser la tendance en permettant une intensification durable des productions. Malheureusement, les résultats obtenus par les initiatives de vulgarisation des technologies n’ont pas toujours été satisfaisants. Cette réalité est doublement vraie dans le cas des systèmes agroforestiers à base d’anacardiers ; systèmes nouveaux dont l’expansion s’est faite par les producteurs eux-mêmes sans aucune assistance technique. Il est donc indispensable d’identifier les déterminants de l’adoption des technologies diffusées. C’est dans ce but qu’une étude a été réalisée dans les régions des Cascades, des Hauts-Bassins et du Sud-Ouest du Burkina Faso auprès de 68 ménages producteurs d’anacarde afin de démontrer la pertinence de ces pratiques et d’identifier les déterminants de leur adoption en vue de formuler des recommandations pour réduire les contraintes majeures à celle-ci. L’étude a permis de montrer que l’application des bonnes pratiques de production permettait d’augmenter le rendement de l’anacardier. En outre, le facteur démographique « niveau d’éducation » du chef de ménage ainsi que les facteurs socioéconomiques notamment le prix obtenu à la vente et l’appartenance à une organisation paysanne ont une influence sur la probabilité d’adoption. / In Burkina Faso, 86% of the active population works in agriculture. However, in a context of rapid population growth and lack of investment, that agriculture is struggling to meet the needs of populations. Dissemination and adoption of improved production techniques are able to reverse the trend by enabling sustainable intensification of production. Unfortunately, the performances of the technology outreach initiatives have not always been up to expectations. This reality is doubly true in the case of cashew-based agroforestry systems; these new systems whose expansion was carried out by the producers themselves without any technical assistance. It is therefore essential to identify the determinants of adoption of disseminated technologies. It is for this purpose that a study was conducted in the Cascades, Hauts-Bassins and Southwest regions of Burkina Faso among 68 cashew producing households to demonstrate the relevance of these practices and identify the determinants of their adoption in order to make recommendations to reduce major constraints. The study showed that the application of good production practices made it possible to increase the yield of the cashew tree. Moreover, the demographic factor "level of education" of the head of household and socioeconomic factors including the price obtained on the sale and membership of a farmer’s organization influence the likelihood of adoption.

Au Mali, les ligneux fourragers représentent une part non négligeable des ressources alimentaires pour les animaux pendant la saison sèche où les herbacées se dessèchent. De plus, leur commercialisation constitue pour certains une importante source de revenus. Le but de cette recherche est de déterminer l'importance de l'utilisation du fourrage ligneux dans la vie socio-économique des acteurs de la filière. Des enquêtes socio-économiques ont permis de déterminer les espèces ligneuses fourragères utilisées et d'évaluer leur contribution à l'élevage pour les paysans de Kaniko et Try II, dans la commune rurale de Sincina. Dans ces villages, le fourrage de onze espèces ligneuses est utilisé. Cinq de ces espèces sont vendues sur le marché de la ville de Koutiala par les cueilleurs-commerçants. Il ressort de l'étude que le fourrage ligneux est un excellent complément alimentaire en saison sèche qui permet d'engraisser les ovins et caprins à moindre coût. Ces animaux constituent un capital monétaire et social indispensable pour la population rurale. Les retombées de l'activité permettent aux acteurs de subvenir aux besoins de leurs foyers.

Depuis 2001, le Sénégal a décliné des stratégies nationales de réduction de la pauvreté parmi lesquelles figure l’autopromotion paysanne, notamment via le développement de l’agroforesterie dont dépend près de la moitié de la population nationale pour sa survie. Notre étude, de type qualitatif, a été réalisée dans la communauté rurale de Mangagoulack, en Basse Casamance, auprès de 120 paysans. Elle comprenait des enquêtes à l’aide de questionnaires et de groupes de discussion, qui ont permis d’évaluer la contribution des produits forestiers ligneux et non ligneux du Parkia biglobosa (néré) utilisés par les ménages pour satisfaire leurs besoins vitaux. Ceux-ci utilisent le fruit pour combler leurs déficits vivriers et sa coque pour récupérer les terres salées et lutter contre les attaques des termites. Le néré, dont la gestion relève des propriétaires fonciers qui ont le monopole de la cueillette, contribue ainsi à réduire les risques de pauvreté des ménages.

La culture en couloir avec Inga edulis est en promotion en Amérique tropicale dont au district de Toledo, au Belize. Elle consiste à des couloirs de quatre mètres de culture bordés de haies d’Inga edulis en densité de 2500 arbres/ha. La production des plantules d’Inga se fait habituellement à partir de graines plantées en sacs en pépinière. Les coûts associés à cette production de plantules et la nature des graines d’Inga qui sont récalcitrantes sont des facteurs pouvant influencer l’adoption de ce système agroforestier. Le premier objectif est d’évaluer l’efficacité de la propagation végétative en polypropagateur sans brumisation. Le deuxième est l’évaluation du temps de production et d’implantation du système par la propagation végétative ainsi que par les méthodes de propagation par semences en pépinière et en champs. Le troisième objectif consiste à l’évaluation des facteurs jouant sur l’acquisition et la production de plantules d’arbres par les petits producteurs de la région. Celle-ci a été effectuée à l’aide de vingt entrevues semi-dirigées avec des petits producteurs de sept villages et trois ONG du district. Selon les résultats, la production de boutures en polypropagateur est intéressante et montre des taux d’enracinement au-delà de 75 % pour plusieurs traitements. Les différentes méthodes de propagation présentent des temps d’implantation du système agroforestier de 78j.h/ha pour les semis en sac, de 72j.h/ha pour les boutures et de 61j.h/ha pour les semences en champs. Le transport du matériel végétal vers les sites de plantation semble être un facteur clé émanant des entrevues et de l’évaluation des techniques d’implantation. Une distance plus élevée privilégie l’utilisation du semis direct. La consultation de la population locale combinée aux expérimentations sur le terrain ont permis de définir les meilleures méthodes pour l’implantation, selon diverses situations pour la culture en couloir avec Inga edulis / Inga alley cropping is in promotion in tropical America, including Belize in the district of Toledo. This approach consists of a 4 m-wide alley intermitted with row of Inga edulis with a density of 2500 trees/ha. Inga seedling production is normally done with seeds planted in bags at a nursery. The associate cost of this production and the unorthodox seeds of Inga edulis are factors influencing the adoption of this agroforestry system. The first objective is to estimate the efficiency of vegetative propagation of Inga edulis in a non-mist polypropagator. The second is to evaluate the time of production of seedlings and setting-up of the system by vegetative propagation as well as by the methods of propagation by seeds in a tree nursery and but also in direct seeding in the fields. The third objective consists of evaluation of factors playing on the acquisition and the production of seedlings of trees by the small producers of the region. This objective was met by carrying out twenty semi-structured interviews with small producers from seven villages and three NGOs of the Toledo district. According to the results, cuttings production with a non-mist polypropagator is interesting and shows rooting rates above 75 % for several treatments. The various methods of propagation demonstrate times for establishment of the agroforestry system of 78 Man-days/ha for the sowing in bag, of 72 md/ha for cuttings and of 61md/ ha for field direct sowing. The transport of vegetal material towards the plantation sites seems to be a key limiting factor for establishment of the system identified from interviews and from the evaluation of establishment methods. A greater distance from fields favors the use of direct sowing. Local consultations combined with field trials permitted definition of the best methods in diverse situations for Inga alley cropping establishment.

En Haïti, la pratique de l'agroforesterie se fait de façon traditionnelle. Cependant, la communauté rurale haïtienne tire l'essentiel de son revenu des produits provenant des systèmes agroforestiers. Ainsi, cette étude, dont l'objectif est d'évaluer, sur une base économique les systèmes agroforestiers, tout en tenant compte des différents facteurs qui influencent leur rentabilité, a été réalisée dans la commune de Petite Rivière de Nippes en Haïti. Un sondage mené auprès de 96 agriculteurs pour un total de 285 parcelles agroforestières, a permis d'identifier cinq types de systèmes dont les jardins de case s'avèrent le système le plus rentable et les plantations éparses en sont les moins bénéfiques pour l'agriculteur. Les facteurs sociaux et biophysiques qui influencent la rentabilité d'un système sont la taille de l'exploitation, le niveau d'éducation du chef de l'exploitation, la superficie des parcelles, la pente et l'interaction entre le mode de tenure et la distance par rapport à la résidence de l'exploitant.

La région du Nord Cameroun est au cœur de la conservation de la biodiversité en raison de l’important réseau d’aires protégées qui couvre 44% de sa superficie, comprenant trois parcs nationaux et 28 zones d’intérêt cynégétiques (ZIC). L’objectif global de notre étude était d’évaluer la contribution de l’agroforesterie à la conservation de la biodiversité de la ZIC 19 à travers l’amélioration des connaissances sur les pratiques agroforestières adaptées à la zone. Spécifiquement, nous avons identifié et caractérisé les systèmes agroforestiers existants dans la ZIC, identifié les conflits dans l’utilisation et l’occupation des terres et leur fréquence relative et analysé la perception des populations locales sur le rôle de l’agroforesterie dans la résolution de ces conflits. Dans la ZIC 19, nous avons mené de mai à septembre 2014 un sondage dans dix villages choisis au hasard sur les 40 villages accessibles. Dans chaque village, 30% des ménages a été échantillonné. Au total, 90 paysans choisis dans 300 ménages ont été interrogés sur les systèmes agroforestiers existants, les types de conflits, leur localisation et leur perception quant aux systèmes agroforestiers à réduire ces conflits. Des entretiens semi structurés menés avec les agents de l’administration et les autorités traditionnelles ont également été menés. Six systèmes agroforestiers ont été identifiés dont le plus pratiqué était le système de plantation éparse (39%) et le moins pratiqué le parc arboré (2%). La majorité (65%) des conflits était due aux attaques de la faune sauvage sur les cultures. La fréquence des attaques dans les parcelles agricoles n’était pas associée à leur proximité des zones de conservation. Selon la majorité (79%) des paysans, les haies vives, les jardins de case et les parcs arborés contribuaient à réduire les conflits. Aucun lien n’existait entre cette perception et le nombre de systèmes agroforestiers développés, lesquels ne sont par ailleurs pas répartis uniformément sur le territoire. Nous recommandons aux gestionnaires de la ZIC 19, la promotion de la pratique des systèmes agroforestiers basée sur une gestion participative communautaire. Les systèmes agroforestiers à promouvoir sont les haies vives à épineux, les jachères améliorées et les parcs arborés. Mots clés : zone d’intérêt cynégétique, faune, agroforesterie, conflits, perception humaine. / North Cameroon is the focal point of a vast network of protected areas including three national parks and 28 hunting interest zones (zones d’intérêt cynégétique, ZIC). The overall objective of my study was to assess the contribution of agroforestry in the conservation of the biodiversity of ZIC 19 through the improvement of knowledge on agroforestry practices adapted to the area. Specifically, we identified and characterized the existing agroforestry systems in the ZIC, identified conflicts in the use and occupation of land, as well as their relative frequency, and analyzed the perception of local people on the role of agroforestry in the resolution these conflicts. We conducted a survey in ten randomly selected villages of the 40 accessible villages in the ZIC. In each village, we sampled 30% of peasant households. I interviewed 90 peasants from 300 households, on existing agroforestry systems, the types of conflicts, conflict location and the peasants’ perception of agroforestry systems to reduce these conflicts. Semi-structured interviews with administration officials and traditional authorities were also conducted. Six agroforestry systems were identified, the most frequently practiced was the sparse planting system (39%) and least practiced park (2%). The majority of conflicts was due to attacks by wild animals on crops. Frequency of attacks on pastures and crops was independent of distance to the nearest conservation area. According to the majority of peasants, hedgerows, box gardens and parklands helped reduce conflicts. There was no link between peasants’ perception and the number of developed agroforestry systems, which were not evenly distributed over the territory. It is recommended to managers of ZIC19, promoting the practice of agroforestry systems (thorn hedges, improved fallows) based on a community participatory management. Keywords: hunting land management, agroforestry, conflict, wildlife, perception.

La caféiculture représente 7,5% des cultures permanentes mondiales et utilise généralement de grandes quantités de fertilisants azotés (jusqu'à 350 kg N ha-1 an-1). La caféiculture est souvent pratiquée sous couvert d'arbres dont certains sont fixateurs d'azote. La contribution des plantes fixatrices d'azote aux émissions de N2O est un sujet prégnant dans le cadre du développement durable, avec des résultats dans la littérature qui peuvent parfois apparaître contradictoires. Dans ce contexte, nous avons étudié le bilan des gaz à effet de serre (GES) dans deux cultures caféières fortement fertilisées (250 kg N ha-1 an-1), au Costa Rica : une monoculture et une culture ombragée par l'espèce légumineuse fixatrice de N2 Inga densiflora. Nous avons mesuré périodiquement les flux de N2O, CH4 et CO2 à l'interface solatmosphère, leurs déterminants édaphiques (humidité gravimétrique, espace poral occupé par l'eau, température et teneur en azote minéral) et les taux de minéralisation de l'azote dans le sol. Par ailleurs, nous avons caractérisé, au laboratoire, les paramètres biologiques de nitrification-dénitrification et leur production associée de N2O et N2 pour simuler en continu les émissions de N2O avec les modèles NGAS et NOE sur une durée d'un an. Enfin, nous avons évalué la dynamique du C du sol et l'accumulation de C dans les biomasses et la litière. Nos mesures ont montré une très forte contribution de la fertilisation azotée aux émissions de N2O, soit une proportion moyenne de 77% des bilans annuels (4,3 ± 0,3 et 5,8 ± 0,5 kg N-N2O ha-1 an-1, respectivement dans la monoculture et la culture ombragée). Les fertilisations ont également augmenté temporairement la respiration du sol. Les valeurs faibles des activités biologiques (notamment des potentiels de dénitrification < 1 kg N ha-1 j-1) ont expliqué les flux toujours inférieurs à 300 g N ha-1 j-1 observés dans des conditions environnementales pourtant favorables à la production de N2O (température, humidité et teneur en nitrate du sol élevées). La similarité entre les activités biologiques mesurées sur les deux cultures de café ainsi que celle entre les bilans annuels de N2O établis à partir de mesures et de modélisation permettent de conclure sur un effet de faible ampleur de l'espèce légumineuse fixatrice de N2 sur les émissions de N2O. Le bilan des flux de GES hors CO2 à l'interface sol-atmosphère et du stockage de C de la culture ombragée (11,93 ± 2,17 Mg CO2-equivalent ha-1 an-1) a été 4 fois supérieur au bilan de la monoculture (2,67 ± 1,94 Mg CO2-equivalent ha-1 an-1). Nos résultats tendent donc à confirmer que la culture de café conduite en agroforesterie, sur un Andosol, augmente le puits de GES et que, dans le contexte présent, l'utilisation d'une légumineuse fixatrice de N2 comme espèce ombragère ne contredit pas cette observation.

Le changement climatique et la variabilité ont des répercussions graves dans le secteur agricole des régions tropicales. Le secteur du café est sensible au changement climatique car il nécessite une température relativement froide et une plus grande durée des pluies. L'adaptation au changement climatique dans l'agroforesterie du café est donc importante pour traiter les impacts, mais il existe des obstacles et des limites. Le but de cette thèse était d'analyser les stratégies d'adaptation au changement climatique au centre du Kenya. Nous avons étudié différentes étapes de l'adaptation qui incluent (1) les connaissances sur le changement climatique et l'adaptation, la motivation à l'adaptation, (2) le choix actuel des stratégies d'adaptation et leurs déterminants, (3) les rôles du système d'innovation et du contexte institutionnel. Cette étude repose sur quatre sources d'information: - (1) groupes de discussion sur des questionnaires pré-définis, (2) enquêtes auprès des ménages, (3) entrevues auprès des intervenants et (4) données climatiques historiques sur le contexte de quatre types de systèmes de productions dans l’agriculture : les cultures vivrières, le café spécialisé, les systèmes diversifiés café-laiterie et les systèmes laitiers spécialisés, dans les zones caféières et vivrières. L'analyse des tendances de Mann-Kendal et l'estimateur de la pente de Sen ont été utilisées pour comparer les connaissances des agriculteurs sur les changements climatiques et l’historique des données climatiques, tandis que le modèle de Heckman a été utilisé pour analyser les stratégies d'adaptation et leurs déterminants. Les résultats soulignent des cohérences entre les connaissances des agriculteurs et l'analyse historique des données pour la température mais des incohérences avec le changement des précipitations. L'analyse de la perception par les agriculteurs révèle que les précipitations diminuent radicalement au fil du temps, alors qu'aucun élément de preuve concernant les précipitations ne permet d'appuyer la perception des agriculteurs. L'incohérence est donc corroborée par l'analyse des modèles. Les agriculteurs du secteur du café et des cultures vivrières se sont adaptés différemment aux changements climatiques. Les agriculteurs qui sont conscients des changements sont plus disposés à explorer les stratégies d'adaptation. Une partie des agriculteurs qui ne perçoivent pas le changement climatique adoptent des stratégies d’adaptation à des facteurs autres. L'adaptation au changement climatique est également déterminée par la performance institutionnelle et les différences de systèmes sectoriels d'innovation. La comparaison entre les secteurs du café et des produits laitiers révèle ainsi que les stratégies des acteurs du café sont limitées. En ce qui concerne l’élaboration des politiques, cette thèse contribue aux politiques d’accompagnement de l’adaptation au niveau des ménages, aux politiques de recherche agronomique et de négociation des accords internationaux. Les recommandations politiques au niveau des ménages se différentient selon trois scénarios. En premier lieu de l’intensification dans le café par l’innovation technologique. Les deux autres options politiques sont dans la diversification sectorielle dans la production laitière qui dépend de leur niveau de rentabilité. Les résultats de cette étude sont issus d’enquêtes sur l’analyse des systèmes d’innovation. D’autres options politiques sont proposées dans le développement de nouvelles infrastructures, des subventions pour accroitre les potentiels d’adaptation. Nous recommandons enfin de nouveaux sujets de recherche pour le futur. / Climate change and variability is the most widespread anthropogenic challenge affecting agricultural production and productivity particularly in the tropics. Coffee sector is sensitive to climate change as it requires relatively cold temperature and higher rainfall duration. Adaptation to climate change in the coffee agroforestry is, therefore, important to address the impacts, but there are barriers, and limits. The aim of this Thesis was to analyze the adaptation strategies to climate change in Central Kenya. We studied the steps in adaptation, which includes (1) the knowledge on climate change and adaptation, the motivation towards adaptation, (2) current choices of households’ adaptation strategies, and their determinants, (3) the roles of innovation system and institutional context to support adaptation. This study was based on four sources of information: - (1) Focus Group Discussions to predefine the questionnaires, (2) household surveys, (3) stakeholders interview, and, (4) historical climate data. The data collection considered four farming typologies; - food crops, specialized coffee, diversified coffee-dairy and specialized dairy farming systems in the coffee and food crops zones. Mann-Kendal trend analysis and Sen’s slope estimator were used to compare the farmers’ knowledge of climate change with the historical climate data, while Heckman model was used to analyze adaptation strategies and their determinants. The findings explore consistent results between farmers’ knowledge and historical data analysis for temperature, while inconsistency is observed in rainfall change. Analysis of farmers’ perception revealed rainfall is radically declining over time, while no evidence in rainfall record is found to support the farmers’ perception. The inconsistency is therefore, substantiated with analysis of patterns. Coffee and food crop farmers are found to adapt to climate change differently. Farmers who are aware of the changes are found more willing to explore adaptation strategies although some of the farmers who do not perceive the climate is changing are also adopting strategies for factors other than perception. The comparison between coffee and dairy sectors found that actors in the coffee are limited, the system is highly centralized with limited options for farmers to process and market their products, while the dairy sector is informally controlled by demand based business and comparatively, numerous actors. We conclude in this study that the patterns in rainfall affects the farming activities of the study area higher than the annual changes. Consequently, farmers adopt a series of adaptation strategies in response to their perception of changes in climate and economic pressure in the farm. This adaptation to climate change also depends on the nature of actors’ interaction and institutional context. In relation to policy development, this Thesis contributes to household level adaptation policies, research policies and international agreements and negotiations. The household level policy recommendations consists of three scenarios. Farmers’ intensification in coffee applying the right technological innovations. The second and third policy options are the diversification to dairy and complete sectoral transformation to dairy depending on the profitability and adaptation level of the sectors. The results in this study are derived from surveys and analysis of innovation systems. Other strategies such as new infrastructural development and institutional subsidies could be potential for adaptation. We therefore, recommend, these could be potential future research topics.

Les pertes de récolte dues aux ravageurs et aux maladies constituent une menace sérieuse pour les revenus et la sécurité alimentaire de milliers de familles rurales dans le monde entier. L'évaluation de ces pertes de récolte (baisse de rendement et préjudice économique) et de leurs causes est nécessaire pour améliorer la mise au point d'agroécosystèmes capables d'offrir de bons rendements de culture, une régulation des ravageurs et des maladies et d'autres services écosystémiques. Ce mémoire de doctorat vise à contribuer à la recherche dans le domaine des pertes de récolte en proposant des approches expérimentales et de modélisation susceptibles d'être utilisées pour estimer les pertes primaires et secondaires subies dans les cultures pérennes, et analyser leurs causes. La culture pérenne étudiée est celle du caféier à Turrialba au Costa Rica, où la culture du café se pratique dans des plantations qui vont de la monoculture à pleine exposition solaire à des systèmes agroforestiers hautement diversifiés, et qui sont soumises à une gamme de situations de production (topolimat, fertilité du sol, types d'ombrage) et de stratégies de gestion (pratiques culturales et intrants). Les trois questions de recherche principales ont été les suivantes : Quel est l'impact des stratégies de gestion et des situations de production sur les ravageurs et les maladies et les rendements en café ? Comment les pertes de rendement en café associées à des profils de dégâts donnés varient-elles en fonction des stratégies de gestion et des situations de production ? Quels types d'agro-écosystèmes à base de caféiers permettent de minimiser les pertes en café (baisse de rendement et préjudice économique) et de maximiser les avantages globaux retirés (services écosystémiques) ? / Crop losses due to pests and diseases are a major threat to incomes and food security of thousands of rural families worldwide. The assessment of crop losses (yield and economic losses) and their causes is needed to improve the development of agroecosystems capable to offer good crop yields, regulation of pests and diseases, and other ecosystem services. This doctoral research aimed to contribute to the research field of crop losses, by providing experimental and modeling approaches that could be used in perennial crops to estimate primary and secondary losses and analyze their causes. We worked in a perennial crop such as coffee, in Turrialba, Costa Rica, where coffee is grown in plantations from monocultures at full sun exposure to highly diversified agroforestry systems, and under a range of production situations (topoclimate, soil fertility, types of shade) and management strategies (agricultural practices and inputs). The three main research questions were: What is the impact of management strategies and production situations on pests and diseases and coffee yields? How do coffee yield losses caused by injury profiles vary in function of management strategies and production situations? Which types of coffee agroecosystems are capable to obtain the lowest coffee losses (yield and economic) and highest overall benefits (ecosystem services)? This research was developed through two experimental designs. The first was an experimental coffee parcel under controlled conditions (three-year experiment) to quantify primary and secondary yield losses by comparison of treatments, and to identify the main predictors of yield losses by structural equation modeling. The second experimental design was based on surveys in a coffee research plot network (coffee plots of smallholder farmers), where, during two years, we measured indicators of yields and indicators of four ecosystem services: regulation of pests and diseases, provisioning of agroforestry products, maintenance of soil fertility, and carbon sequestration. Yield losses in this network were estimated through modeling using the predictors identified in the experimental coffee parcel. Analyses of data included several statistical techniques, from analysis of variances, linear regressions to multivariate techniques. The results were organized in four manuscripts, and then discussed integrally. The main findings were: i) Both production situations and management strategies determine coffee yield and pest and disease injuries, effects of interactions altitude x management x types of shade must be considered; ii) Injury profiles depend on particular combinations of production situations and management strategies, with impacts on yield losses especially in a year of high coffee production (primary yield losses), but compromising also the yields of the next year (secondary yield losses); iii) Diversified agroforestry systems have better chances to regulate pests and diseases (reduce yield and economic losses), and simultaneously provide goods for family benefits, maintain soil fertility, and increase carbon sequestration, without implying trade-offs among these ecosystem services. The main prospects of this research are related to perform similar studies in coffee and other perennials at regional levels, develop an injury profile simulator for coffee, and prototyping of coffee agroforestry systems to optimize the provision of multiple ecosystem services.