Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-11-06T12:57:08Z No. of bitstreams: 1 Jose Carlos Pacheco dos Santos.pdf: 2283674 bytes, checksum: fe7f2ccab0bcd8a90de5787d67677227 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-06T12:57:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Carlos Pacheco dos Santos.pdf: 2283674 bytes, checksum: fe7f2ccab0bcd8a90de5787d67677227 (MD5) Previous issue date: 2015-10-28 / From March 2006 to December 2011, four copies of black marlin received marks monitored by satellite (Pop-up satellite tags-PSATs archival), near the continental slope, two in the Northeast (marlin-black I and II February and March respectively) and two in the southeast (black marlin-III and IV in December 2011 and February 2013 respectively). The results demonstrate a clear pattern of habitat use with most of the time spent predominantly near the sea surface, in water with a restricted temperature range. Despite the clear preference for surface water, the sauries often performed dives to deeper layers (> 50 m). Aiming to contribute to a better understanding of the current situation of white marlin and black stocks in the Atlantic Ocean, the catch per unit effort (CPUE) of these two species was analyzed based on 92,766 fishing bids by pelagic longline, carried out by the commercial fleet Brazil from 1978 to 2012, inflated by standard models of zero, negative binomial, delta log normal and generalized linear models (GLM) with distribution tweedie error. The frequency of zero catch was equal to 83% for black marlin and 74% for white marlin. The following factors were considered in the analysis: year, month, area and fleet strategy. The total fishing area ranging from 10 ° C to 35 ° S, was divided into two areas, 15 ° S latitude. Abundance of both species indices showed a strong interannual fluctuation. The CPUE of black marlin, after peaking in 2001, showed a declining trend since then, except for 2010, when it grew back. The CPUE of white marlin, in turn, after peaking in 1996, declined until 2006, remained stable between 2006 and 2009, and as the black marlin, increased again in 2010. Exclusively for white marlin were also used models Additives generalized, incorporating data from the fishery and the following environmental variables: sea surface temperature (SST), depth of the mixed layer (dml), chlorophyll concentration and moon lighting index. The final model explained the variability of CPUE, with dml and sst being the most important environmental factors to explain this variation. Higher CPE values occurred at a water mixture layer stretched up to 50 m deep, while the temperature range that concentrated the highest relative abundance was 26 ° to 29 ° C. There seems to be distinctions in CPUE also during the months of the year, with the highest values were observed during the first and fourth quarter. The analysis of annual spatial prediction for white marlin showed that there were a more representative area located in the central portion of the South Atlantic. However, this area does not remain fixed during all months of a year. These results contribute to a better understanding of spatial-temporal distribution of white marlin and thereby infer the possibilities for fisheries closures that have higher concentrations of this species as a possible fisheries management tool. / No período de março de 2006 a dezembro de 2011, quatro exemplares de agulhão negro receberam marcas monitoradas por satélite (Pop-up satellite archival tags-PSATs), nas proximidades do talude continental, sendo duas no nordeste (agulhão-negro I e II em fevereiro e março de respectivamente) e duas no sudeste (agulhão-negro III e IV em dezembro 2011 e fevereiro de 2013 respectivamente). Os resultados demonstram um padrão claro de utilização do habitat com a maior parte do tempo dispendido predominantemente próximo à superfície do mar, em águas com uma faixa de temperatura restrita. Apesar da clara preferência por águas superficiais, os agulhões frequentemente realizaram mergulhos para camadas mais profundas (> 50 m). Visando a contribuir para uma melhor compreensão da situação atual dos estoques de agulhão branco e negro no Oceano Atlântico, a captura por unidade de esforço (CPUE) dessas duas espécies foi analisada com base em 92.766 lances de pesca com espinhel pelágico, realizados pela frota comercial brasileira no período de 1978 a 2012, padronizada por modelos inflacionados de zero, binominal negativa, delta log normal e modelos lineares generalizados (GLM ) com distribuição de erro tweedie. A frequência de zeros das capturas foi igual a 83% para o agulhão negro e 74% para o agulhão branco. Os seguintes fatores foram considerados na análise: ano, mês, área e estratégia de frota. A área de pesca total, variando de 10°N a 35°S, foi dividida em duas áreas, em 15°S de latitude. Índices de abundância de ambas as espécies mostraram uma forte oscilação interanual. A CPUE do agulhão negro, após um pico em 2001, mostrou uma tendência decrescente desde então, com exceção de 2010, quando voltou a crescer. A CPUE do marlin branco, por sua vez, após um pico em 1996, declinou até 2006, permaneceu estável entre 2006 e 2009, e, como o agulhão negro, aumentou novamente em 2010. Exclusivamente para o agulhão branco, foram utilizados também Modelos Aditivos Generalizados, incorporando dados da pescaria e as seguintes variáveis ambientais: temperatura da superfície do mar (sst), profundidade da camada de mistura (dml), concentração de clorofila e índice de iluminação da lua. O modelo final explicou a variabilidade da CPUE, com a dml e a sst tendo sido as variáveis ambientais mais importantes para explicar esta variação. Os maiores valores de CPUE ocorreram em águas onde a camada de mistura se estendia até 50 m de profundidade, enquanto a faixa de temperatura que concentrou as maiores abundâncias relativas foi de 26° a 29°C. Parece haver distinções na CPUE também durante os meses do ano, com os maiores valores tendo sido observados durante o primeiro e o quarto trimestre. As análises de predição espacial anual para o agulhão branco demonstraram haver uma área mais representativa localizada na porção central do Atlântico Sul. No entanto esta área não permanece fixa durante todos os meses de um ano. Estes resultados contribuem para uma melhor compreensão da distribuição espaço-temporal do agulhão branco e com isto inferir as possibilidades de fechamentos de áreas de pesca que apresentem maiores concentrações de indivíduos desta espécie, como uma possível ferramenta de ordenamento pesqueiro.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2016-08-10T13:32:46Z No. of bitstreams: 1 Renata Maria Medeiros da Silva.pdf: 2007906 bytes, checksum: 93c6222428df747932010c3bb0212431 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-10T13:32:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Renata Maria Medeiros da Silva.pdf: 2007906 bytes, checksum: 93c6222428df747932010c3bb0212431 (MD5) Previous issue date: 2013-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The reliability of catch data of the pelagic logline fisheries is of concern especially for non-target species like sailfish (Istiophorus albicans) and spearfish (Tetrapturus pfluegeri). The catch of those two species is often reported aggregated hence it is difficult to calculate separated catch of each species. In this work the objective was to build a generalized linear model to estimate the proportion of sailfish (or spearfish) when the catch are aggregated. The response variable (number of sailfish in the aggregated catch) was assumed to follow a binomial distribution. Explanatory variables were year, quarter, fleet, distance from equator and distance from coast. Logit was used as link function. Models were selected for different scenarious as defined based on the inclusion or exclusion of factor year and fleet. Models fittings were ecceptable in the sense they are not biased. Sensitivity analyses were carried out because some influential data appeared. Variables fleet, quarter and distance from the equator and from coast are important to explain the variation of the sailfish proportion. China Taipei and USA fleet catches show high proportion of sailfish. The proportions in the north and south hemispheres are high in the boreal and austral summer respectively. The proportions are also high in the equatorial and regions. / A confiabilidade dos dados de captura das pescarias pelágicas de espinhel preocupa especialmente no caso das espécies não alvo como os agulhões vela (Istiophorus albicans) e verde (Tetrapturus pfluegeri). As capturas destas duas espécies são frequentemente registradas agregadas e portanto é difícil calcular as capturas separadas de cada uma delas. Neste trabalho o objetivo foi construir um modelo linear generalizado para estimar a proporção de agulhão vela e verde quando as capturas estão agregadas. A variável resposta (número de agulhões vela na captura agregada) é assumida como binomial. As variáveis explicativas foram ano, trimestre, frota, distâncias do equador e distância da costa. A logit foi usada como função de ligação. Foram selecionados modelos para diferentes cenários definidos em função da inclusão ou exclusão das variáveis ano e frota. Os ajustes dos modelos foram aceitáveis no sentido de que eles não são viesados. Análises de sensibilidade foram realizadas, pois alguns dados se mostraram influentes. As variáveis frota, trimestre e distâncias do equador e da costa são importantes para explicar as variações das proporções de agulhão vela. As frotas de China Taipei e dos EUA capturam proporções elevadas de agulhão vela. As proporções nos hemisférios norte e sul são elevadas nos verões boreal e austral, respectivamente. As proporções são também elevadas nas regiões equatoriais e costeiras.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, Florianópolis, 2011 / Made available in DSpace on 2012-10-26T07:14:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 290775.pdf: 11353099 bytes, checksum: 644386f7a4e9869059eb273284226edf (MD5) / As capturas incidentais (i.e. espécies capturadas sem intenção) geram, além do impacto ambiental, um problema econômico de larga escala em diversas pescarias comerciais. A pescaria com espinhel de superfície é uma das mais rentáveis do mundo, pois têm como alvo espécies de grande valor comercial como os atuns e o espadarte. No entanto, além destas espécies-alvo, também são capturadas espécies com populações frágeis e ameaçadas, como é o caso dos agulhões branco (Tetrapturus albidus) e negro (Makaira nigricans). A International Commission for the Conservation of Atlantic Tunas (ICCAT), instituição responsável pelo gerenciamento dos estoques de atuns e afins no oceano Atlântico, vêm solicitando para que seus países membros adotem medidas para a redução da captura destas espécies, devido à fragilidade dos estoques. Portanto, com a finalidade de dar apoio à medidas de manejo que possam auxiliar na redução da captura incidental, neste trabalho foram analisados dados da captura dos agulhões branco e negro no oceano Atlântico sul. Foram utilizados modelos com a intenção de se obter as probabilidades de captura (maior do que zero) destas espécies por área e época do ano. Com a identificação de áreas com probabilidades elevadas de captura, medidas de manejo baseadas em fechamento de áreas para a pesca em determinados períodos do ano podem ser utilizadas. Dados de espécies capturadas incidentalmente apresentam como característica um número de zeros excessivo, e frequentemente, também, superdispersão. Por esse motivo, modelos que consideram tanto o excesso de zeros quanto a superdispersão foram utilizados. Nesta abordagem, os modelos são chamados de "modelos de mistura" quando a variável resposta é modelada como uma mistura de uma distribuição de Bernoulli para a presença/ausência de zeros e uma outra distribuição para os valores positivos, e "modelos condicionais" quando a modelagem da variável resposta é feita em duas etapas, utilizando uma distribuição discreta truncada para os valores positivos e uma regressão logística tradicional para os valores nulos. Em ambas as abordagens, as distribuições de Poisson e binomial negativa (BN) foram utilizadas. A comparação entre os modelos foi feita através dos critérios de informação de Akaike (AIC) e bayesiano (BIC). O modelo com o menor valor destes critérios foi então selecionado para a continuidade das análises. Foram calculadas a Captura Por Unidade de Esforço (CPUE) padronizada pelo modelo, e as probabilidades de captura por ano, trimestre e área. Os resultados mostraram que para ambas as espécies, o padrão anual de CPUE está em queda, sugerindo também a redução dos estoques destas populações. As áreas com maiores probabilidades de captura são aquelas localizadas nas regiões tropicais do oceano Atlântico sul, especialmente nos meses do verão austral. Áreas mais centrais e à oeste, próximas à costa do Brasil, também mostraram valores elevados de probabilidade. Com estes resultados, pode-se concluir que os modelos utilizados foram apropriados, e devem ser considerados quando a intenção for modelar a captura de espécies capturadas incidentalmente, onde predominam o excesso de zeros e a superdispersão.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-09T11:51:57Z No. of bitstreams: 1 Carolina Martins Torres da Silva.pdf: 3685448 bytes, checksum: e48d65bdd413ecd20dae68b18bdb4266 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-09T11:51:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carolina Martins Torres da Silva.pdf: 3685448 bytes, checksum: e48d65bdd413ecd20dae68b18bdb4266 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / Today, the Blue marlin stock is highly overexploited due to the intense fishing effort targeting tunas in the Atlantic Ocean. The blue marlin is an oceanic pelagic and migratory species caught as a tuna bycatch. Although current studies are imprecise, some mitochondrial DNA analysis has shown that there is a single Atlantic blue marlin stock. The present study has the objective to investigate the blue marlin’s reproductive biology, detailing the ovogenesis and characterizing the microscopic maturity stages. The microscopic stages were analyzed through histological cuts stained with hematoxilin/eosin and evaluated under optical microscopy. The MIF length for females ranged from 104 to 345 cm, with a mean of 210 cm. For the males the MIF length ranged from 100 to 267 cm, mean 189 cm. The microscopic maturity scale made for the species is composed of 6 stages for the females and 4 stages for the males. The sexual proportion found is 1.6 males for each female. The mean first maturity size for females was 194.2 cm and for males was 168.6 cm. The spawn type observed was the partial one. The fecundity varied from 2,151,000 and 6,769,060 oocites for females between 272 and 290 cm MIF length. / Atualmente, o estoque de agulhão negro no Atlântico encontra-se sobre-explotado devido ao intenso esforço de pesca dirigido para as capturas de atuns neste oceano, com um crescente número de participantes nas diversas modalidades de pesca industrial, artesanal e esportiva. O agulhão negro é uma espécie oceânica pelágica, sendo capturada acidentalmente como fauna acompanhante na pesca de atuns com espinhel. As avaliações de estoque realizadas, embora apresentem um grau de incerteza por falta de informações mais detalhadas acerca da sua biologia, levam em consideração a existência de um único estoque de agulhão-negro no Atlântico, como apontam estudos genéticos baseados em análises de DNA mitocondrial. Com o intuito de diminuir tais carências, o presente trabalho tem como objetivo principal investigar a biologia reprodutiva da espécie, detalhando a ovogênese e caracterizando os estágios microscópicos de maturação. A coleta de amostras foi realizada no período de dezembro de 2004 a outubro de 2006, seguida da análise microscópica para a identificação dos estágios maturacionais. O comprimento (MIF) para as fêmeas teve uma amplitude de 104 cm até 345 cm, com uma média de 210 cm. Para os machos, variou de 100 cm a 267 cm, com média de 189 cm. Foram identificados 6 estágios para fêmeas e 4 para machos dentro da escala microscópica confeccionada para a espécie. A proporção sexual de machos e fêmeas foi de 1,6: 1,0. O tamanho médio de 1ª maturação sexual foi estimado em 194,2 cm para as fêmeas e 168,6 cm para os machos. O agulhão negro possui desova parcelada e alta fecundidade, com uma amplitude de 2.151.000 a 6.769.060 ovócitos hidratados.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-13T15:07:02Z No. of bitstreams: 1 Igor da Mata R P Oliveira.pdf: 2792534 bytes, checksum: 0e4e5664c5eb680f377e167f86443cbf (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-13T15:07:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Igor da Mata R P Oliveira.pdf: 2792534 bytes, checksum: 0e4e5664c5eb680f377e167f86443cbf (MD5) Previous issue date: 2006-03-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The white marlin Tetrapturus albidus is a ocean, pelagic and highly migratory specie, exploted by many countries and many commercial, sportive and artisanal fisheries. Like the other bilfishes, they are mainly caught by tunas and swordfish longline fishery, as by-catch, which subject a high fishing pressure. Then, the stock have been over-exploited, although the assessment show several uncertain, because need parameters. Before this, the present work promotes: a description by the fishing operations realized in the capture of white marlin by the leased longline fleet based in northeast Brazil; a distribution and relative abundance analyses and the influence of environmental factors in the capture of the specie; standardized catch and effort rates and reproductive biology information. The statistic tool utilized to standardization of abundance indices (CPUE) and for the analyses of the influence of factors (spatial, temporal and environmental) on the capture and gonad development of white marlin was generalized linear and additive models (GLM and GAM). Year, temperature of sea surface, latitude and depth of local fishing was the factors which more influenced on captures. The pattern of distribution and abundance observed confirms the northsouth migration through the brazilian off shore, of the third to the first trimester. Also was observed that the white marlin follows temperatures strips of about 24°-28°C, and is commonly concentrate in steep drop-offs and interface of different water masses, or in areas with marine richness. The model standardized with GAM showed better adjust than the GLM model, indicating that the inclusion of the factors was significantly in standardization procedure of CPUEs. The catches of white marlinshowed decline for about 15 or 20 years, and some stability since 1999-2000. Size at first sexual maturity (L50) was estimated as 139 cm (low jaw- fork length/ LJFL), for males, and 147 cm, for females. Month and temperature was the factors with more influence on gonad development. The gonad index of white marlin in the Atlantic Equatorial was highest in the end of second and the beginning of the third trimester. / O agulhão branco Tetrapturus albidus é uma espécie oceânica, pelágica e migradora sendo, por essa razão, explotada por vários países. Sua pesca se caracteriza pela grande diversidade de participantes, incluindo pescarias industriais, artesanais e esportivas. No entanto, assim como os demais agulhões, é mais freqüentemente capturado como fauna acompanhante da pesca com espinhel dirigida a atuns e espadarte, sendo sujeitos a uma intensa pressão pesqueira. Como conseqüência, o estoque se encontra sobreexplotado, embora as avaliações apresentem incertezas decorrentes da carência de dados de pesca e informações biológicas.No intuito de contribuir para a superação dessas deficiências, o presente trabalho apresenta: uma descrição das operações de pesca com espinhel pelágico realizadas pela frota arrendada brasileira sediada no Nordeste; uma análise da distribuição e da abundância relativa da espécie e da influência de variáveis ambientais na sua captura; índices padronizados de captura por unidade de esforço, e informações acerca da biologia reprodutiva. Como ferramentas de padronização de índices de abundância (CPUE), bem como das análises de influência de fatores de diversas ordens sobre a captura e o desenvolvimento gonadal do agulhão branco, foram utilizados modelos lineares e aditivos generalizados (GLM e GAM). Ano, temperatura da água do mar, latitude e profundidade do local de pesca foram os fatores que apresentaram maior influência nas capturas. Variações espaciais e sazonais da abundância relativa parecem confirmar a realização de uma migração no sentido norte-sul ao longo da costa brasileira do terceiro para o primeiro trimestre do ano. Osdados indicam, também, que o agulhão branco acompanha preferencialmente a faixa de temperatura de 24°C a 28°C, concentrando-se em áreas de descontinuidades topográficas ou na interface de massas d’água, os quais estão provavelmente associados a fenômenos de enriquecimento. O modelo padronizado por GAM se mostrou mais bem ajustado que por GLM, indicando que a inclusão das variáveis foi significante na padronização das CPUEs. As taxas de captura do agulhão branco apresentam um declínio contínuo ao longo de 15 ou 20 anos, até 1999-2000 passando a exibir, a partir de então, uma maior estabilidade. O comprimento de primeira maturação (L50) foi igual a 139cm de mandíbula inferiorfurca para machos e a 147cm para fêmeas. Mês e temperatura se mostraram os fatores com maior influência sobre o desenvolvimento gonadal. O índice gonadal do agulhão branco na região equatorial do Atlântico foi máximo em torno de maio.

Submitted by Eduarda Figueiredo (eduarda.ffigueiredo@ufpe.br) on 2015-03-12T13:41:49Z No. of bitstreams: 2 BRUNO LEITE certo.pdf: 3015278 bytes, checksum: e311c0270e5a7795107518e2006f9d59 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-12T13:41:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 BRUNO LEITE certo.pdf: 3015278 bytes, checksum: e311c0270e5a7795107518e2006f9d59 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012-06 / CNPq / No presente trabalho foram investigados vários aspectos relacionados à dinâmica populacional, ecologia e pesca do agulhão-vela no Atlântico equatorial e sudoeste. As análises incluíram: (1) biologia reprodutiva; (2) modelagem da distribuição de tamanho e captura por unidade de esforço (CPUE) em relação aos efeitos ambientais e espaciais; (3) movimentos e utilização do habitat determinado por telemetria via-satélite e; (4) análise da CPUE de agulhão-vela capturado pela pesca esportiva no Brasil. A proporção sexual de agulhão-vela varia espaço-temporalmente na área de estudo e o comprimento de primeira maturação sexual estimado foi 147,21 cm de mandíbula inferior até a forquilha (MIF). A fecundidade variou entre 0,44 x 106 ovócitos hidratados para uma fêmea de 156 cm MIF e 2,26 x 106 ovócitos hidratados para uma fêmea de 183 cm LJFL. O Atlântico equatorial oeste não é uma área de desova, enquanto que a costa sudeste brasileira, ao contrário, se constitui em uma área de desova importante para a espécie, principalmente de dezembro a fevereiro. Altas densidades de adultos também foram observadas a oeste de 40°W, em ambas as partes da área de estudo, norte e sul. Por outro lado, uma tendência oposta foi observada em relação aos juvenis, que parecem estar associados a águas com temperatura da superfície do mar (TSM) superiores a 28°C com uma profundidade da camada de mistura mais profunda (> 50m), no lado ocidental, particularmente entre 10° - 20°S e 25° - 35°W. A modelagem da CPUE revelou uma agregação sazonal elevada ao longo da costa sudeste brasileira durante o pico de desova, enquanto que o centro-oeste do Atlântico, ao sul de ~ 15°S, bem como a costa norte brasileira, podem representar importantes áreas de alimentação durante o inverno. Os modelos também revelaram que a TSM e a velocidade do vento foram as variáveis mais importantes na variação da CPUE. Os resultados da telemetria via-satélite indicaram um claro padrão de utilização do habitat vertical, predominantemente concentrado próximo da superfície do mar com uma preferência relativamente estreita de temperatura. A "rota mais provável" sugerem que os agulhões-vela marcados não se deslocaram significativamente do local de marcação. Por fim, na presente tese, novos insights sobre a estrutura populacional da espécie no Oceano Atlântico foram apresentados e discutidos. Embora a separação do estoque do noroeste parece ser clara, ainda há uma grande incerteza sobre o grau de mistura entre os estoques do sudoeste e leste.