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Análise molecular de vírus da raiva circulante no Estado do Rio de Janeiro entre 1999 e 2004 / The genetic analysis of circulating rabies virus in Rio de Janeiro state between 1994 and 2004

Dantas Junior, Joeler Vargas January 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-26T17:15:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 136.pdf: 882256 bytes, checksum: 9ae92b0a5f442228c4bb16e69b70145b (MD5) Previous issue date: 2006 / Neste estudo foram utilizadas 70 amostras de tecido encefálico congelado de animais,com o diagnóstico positivo para vírus da raiva pela imunofluorescência direta (IFD) e pelo teste biológico (TB), enviados ao Banco de Germoplasma do Laboratório de Biologia Animal (LBA)da Empresa de Pesquisa Agropecuária do Estado do Rio de Janeiro (PESAGRO RIO). Estas amostras foram provenientes de diversos municípios do estado do Rio de Janeiro. Das 70 amostras analisadas 50 foram utilizadas para testar um protocolo de RT-PCR e 33 utilizadas naanálise genética do vírus da raiva circulantes no estado do Rio de Janeiro.O protocolo testado de amplificação genômica, precedida de transcrição reversa (RTPCR)para o gene da nucleoproteína de vírus da raiva e vírus relacionados ao vírus da raiva, teve como objetivo a utilização desta metodologia em laboratórios onde são realizadas investigações para a detecção de vírus da raiva. Foram utilizadas 50 amostras de tecido encefálico de animais (44 bovinos, 5 eqüinos e 1 quiróptero). Nas 50 amostras analisadas pela RT-PCR se observou os amplicons de 606 pb, correspondendo a região da nucleoproteína (N) investigada e demonstraram a especificidade do protocolo. Houve concordância nas três provas de diagnósticas utilizadas. Uma amostra negativa na prova de imunofluorescência direta, apresentou positividade tanto na prova biológica e quanto na RT-PCR. Trinta e três amostras isoladas de 27 bovinos, 05 eqüinos e 01 quiróptero, foram analisadas com base no seqüenciamento direto de amplicons de 514 pb da região codificadora danucleoproteína (N). As seqüências foram verificadas quanto ao seu parentesco genético e evolucionário. Os dados indicam que não existem diferenças genéticas significativas entre as amostras isoladas de diferentes hospedeiros e regiões geográficas do estado do Rio de Janeiro, durante os últimos seis anos. Os resultados indicam, provavelmente, que a variabilidade observada ocorre em virtude de modificações sinônimas. Apesar da estabilidade genética do gene da nucleoproteína (N) é importante um continuo esforço de monitoração da diversidade dos genes das amostras de campo de vírus da raiva, pois modificações genéticas podem acarretar eventuais falhas vacinais. / In this study were used 70 samples of animal frozen encephalic tissue, with positive diagnosis for Rabies Virus by Direct Immunofluorescence (DIF) and by biological test, sent to Germoplasm Bank of Animal Biology Laboratory (ABL) belonged to the Empresa de Pesquisa Agropecuária do Estado do Rio de Janeiro (PESAGRO – RIO). These samples were provenient of many countys of Rio de Janeiro State. From 70 analyzed samples, 50 were used to test an RT-PCR protocol and 33 were used in the genetic analysis of circulating Rabies Virus in Rio de Janeiro State. The genomic amplification preceded of Reverse Transcription (RT-PCR) protocol tested for the Rabies Virus and Rabies related viruses nucleoprotein gene had as purpose the use of this methodology in laboratories where are made investigations for the detection of Rabies Virus. A total of 50 samples of animal encephalic tissue were used (44 cattle, 05 horses and 01 bat). In the 50 samples analysed by RT-PCR was observed amplicons of 606 bp, corresponding to the investigated nucleoprotein region and showing the protocol specificity. There was an agreement in the three diagnostic probes used. One sample, negative for the direct immunofluorescence, presented positivity for both biological probe and RT-PCR. A total of 33 samples isolated of 27 cattle, 05 horses and 01 bat were analyzed based on the direct sequencing of the 514 bp amplicons, provenient of the nucleoprotein (N) coding region. The sequences had their genetic and evolutionary relationship studied. Data indicate that there are no significant genetic differences among the samples isolated from different hosts and geographic regions of Rio de Janeiro State, during the last six years. The results indicate, probably, that the observed variability occur due to synonymous modifications. Although the genetic stability of the nucleoprotein (N) gene is important, a continuous effort in monitoring of the countryside Rabies Virus samples genes, because genetic modifications may cause eventual vaccine-failure.
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Caracterização química e atividade biológica de senna alata l. Roxb e senna siamea

SILVA, Grace Kelly Cordeiro Da 23 August 2013 (has links)
Submitted by Irene Nascimento (irene.kessia@ufpe.br) on 2017-07-14T19:14:08Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO - GRACE KELLY C. DA SILVA Final.pdf: 3244075 bytes, checksum: 27d5c4bb143cedbc4228d134925e8b5a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-14T19:14:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO - GRACE KELLY C. DA SILVA Final.pdf: 3244075 bytes, checksum: 27d5c4bb143cedbc4228d134925e8b5a (MD5) Previous issue date: 2013-08-23 / O uso de produtos naturais na medicina popular como agente terapêutico é conhecido por praticamente todas as civilizações antigas. O gênero Senna Mill, é uma importante fonte de substâncias com grande diversidade estrutural, sendo atualmente utilizada como laxantes e purgativas. Diante disso, este trabalho teve como objetivo caracterização química e atividades biológicas do extrato bruto metanólico das folhas de Senna alata L. Roxb e Senna siamea (Lam.). O perfil fitoquímico foi realizado em cromatografia de camada delgada, com diferentes fases móveis e reveladores. A extração do óleo essencial foi utilizada por hidrodestilação e analizado em cromatografia gasosa acoplada ao espectro de massa (CG/MS). A atividade larvicida do óleo essencial foi avaliada segundo o método recomendado pela Organização Mundial de Saúde, adaptado. A atividade antimicrobiana foi realizada pelo método de difusão em Agar, e identificação da concetração inibitória mínima. Os métodos de Mosman (1983) e Costa-Lotufo et al. (2002) foram utilizados para analisar a atividade hemolítica e citotóxica, respectivamente. O potencial de toxicidade aguda foi avaliado segundo a OECD 423. A metodologia de Rao et al., 1997, modificada, foi utilizado para análise da atividade laxante. A caracterização fitoquímica evidenciou os seguintes metabólitos: açucares redutores; flavonóides; antraquinonas, triterpenos, cumarinas, monoterpenos e sesquiterpenos, proantocianidinas e leucoantocianidina. Após análise em CG/MS, 03 (três) compostos foram identificados: ácido n-hexadecanóico, fitol e 9,12,15- ácido octadecatrienóico (Z,Z,Z). O óleo essencial da S. siamea não apresentou atividade larvicida. Não foi evidenciada atividade antimicrobiana do extrato bruto metanólico das folhas (EBMF) de S. siamea. Entretanto o EBMF de S. alata apresentou atividade moderada contra B. subitilis (AM04), e baixa atividade contra S. aureus (AM103) e S. aureus (AM1210). Ambos os extratos se mostraram inativos frente à atividade hemolítica e citotóxica. Na toxicidade aguda não houve óbito dos animais após administração da dose 2000mg/kg, com isso, ambos os extratos são considerados atóxicos ou baixa toxicidade. O Extrato metanólico bruto das folhas (EMBF) de S. siamea e S. alata, nas doses de 62,5mg/kg, 125mg/kg e 250mg/kg, não apresentaram atividade laxante. Estudos mais aprofundados dos extratos são necessários para garantir a segurança e eficácia terapêutica dos mesmos. / The use of natural products in folk medicine as a therapeutic agent is known by virtually all ancient civilizations. The genus Senna Mill, is an important source of substances with great structural diversity, being currently used as laxatives and purgatives. The objective of this work was to characterize the chemical and biological activities of the crude methanolic extract of the leaves of Senna alata L. Roxb and Senna siamea (Lam.). The phytochemical profile was performed in thin layer chromatography, with different mobile phases and developers. The extraction of the essential oil was used by hydrodistillation and analyzed by gas chromatography coupled to the mass spectrum (CG / MS). The larvicidal activity of the essential oil was evaluated according to the method recommended by the World Health Organization, adapted. The antimicrobial activity was performed by the agar diffusion method, and identification of minimal inhibitory concentration. The methods of Mosman (1983) and Costa-Lotufo et al. (2002) were used to analyze the hemolytic and cytotoxic activity, respectively. The acute toxicity potential was evaluated according to OECD 423. The methodology of Rao et al., 1997, modified, was used to analyze the laxative activity. The phytochemical characterization showed the following metabolites: reducing sugars; Flavonoids; Anthraquinones, triterpenes, coumarins, monoterpenes and sesquiterpenes, proanthocyanidins and leucoanthocyanidin. After analysis in CG / MS, 03 (three) compounds were identified: n-hexadecanoic acid, phytol and 9,12,15-octadecatrienoic acid (Z, Z, Z). The essential oil of S. siamea showed no larvicidal activity. There was no evidence of antimicrobial activity of the crude methanolic leaf extract (EBMF) of S. siamea. However, S. alata EBMF showed moderate activity against B. subitilis (AM04), and low activity against S. aureus (AM103) and S. aureus (AM1210). Both extracts were inactive against hemolytic and cytotoxic activity. In acute toxicity, the animals did not die after administration of the 2000mg / kg dose, with both extracts being considered nontoxic or low toxicity. The crude methanolic extract of the leaves (EMBF) of S. siamea and S. alata, at doses of 62.5mg / kg, 125mg / kg and 250mg / kg, presented no laxative activity. Further studies of extracts are necessary to ensure the therapeutic safety and efficacy of the extracts.
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Caracterização morfológica, bioquimica e molecular de Vickermania Itaguaiensis N. Gen, SP (Protozoa, Kinetoplastida)

Silva Junior, Renato da January 2011 (has links)
Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-09-19T13:39:08Z No. of bitstreams: 1 renato_s_junior_ioc_bp_0048_2011.pdf: 2131023 bytes, checksum: c67826382b4b8b6c00b329a3f8c712d2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-09-19T13:39:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 renato_s_junior_ioc_bp_0048_2011.pdf: 2131023 bytes, checksum: c67826382b4b8b6c00b329a3f8c712d2 (MD5) Previous issue date: 2011 / Universidade Federal Fluminense. Centro de Estudos Gerais. Instituto de Biologia. Niteroi, RJ, Brasil / A família Trypanosomatidae inclui parasitas de uma grande variedade de vertebrados, invertebrados (principalmente insetos), plantas e algumas espécies de protozoários, sendo, depois do nematóides, os de maior distribuição de hospedeiros na natureza. No presente trabalho, um novo isolado foi obtido por coprocultivo de trato intestinal de Leptoglossus stigma Herb, 1784 (Hemiptera, Coreidae), capturado no município de Itaguaí/RJ. O isolado original e três clones (obtidos por citometria de fluxo) foram depositados na "Coleção de Flagelados do Laboratório de Transmissores de Leishmanioses." Um clone foi caracterizado por diversas abordagens em comparação com espécies de referência de diferentes gêneros. Foi analisado o crescimento em meio de cultivo em intervalos de 24 h, entre 48-144 h, a diferenciação celular e a morfometria dos principais estágios evolutivos encontrados. A análise de isoenzimas foi realizada utilizando-se os seguintes sistemas: GPI, PGM, 6PGDH, HK, ACON, MPI, FUM, IDH, MDH e ACON. RAPD-PCR foi realizado utilizando-se 6 iniciadores, conjuntamente com outros tripanosomatídeos. Os dados destas análises foram processados numericamente e submetidos à análise computacional utilizando-se o coeficiente de associação Jaccard e o algoritmo de agrupamento UPGMA. Realizou-se seqüenciamento do amplicon do gene de SSU rRNA e o fragmento analisado foi alinhado com vinte e uma seqüencias depositadas no GenBank, gerando uma árvore filogenética resultante do pareamento. O conjunto de resultados deste trabalho sugere que a amostra obtida constitui nova espécie, pertencendo a um novo gênero, nomeada Vickermania itaguaiensis. / The Trypanosomatidae family includes parasites of a wide variety of vertebrates, invertebrates (mainly insects), plants and some species of protozoa, and after the nematodes, the highest distribution of hosts in nature. In this study, an isolate was obtained by coproculture from Leptoglossus stigma Herb, 1784 (Hemiptera, Coreidae) intestinal tract, captured in the city of Itaguaí/RJ. The original isolate and clones (obtained by flow cytometry) were deposited in the "Coleção de Flagelados do Laboratório de Transmissores de Leishmaniose". One clone was characterized by several approaches in comparison with the reference species of different genus. Growth was analyzed in culture medium at 24 h intervals between 48-144 h, cell differentiation and morphometric parameters of the main evolutionary stages matches. The isoenzyme analysis was performed using the following systems: GPI, PGM, 6PGDH, HK, ACON, MPI, FUM, IDH, MDH and ACON. RAPD-PCR was performed using 6 primers, together with other trypanosomatids. The analysis of these data were numerically processed and submitted to computer analysis using the Jaccard association coefficient and UPGMA clustering algorithm. We carried out sequencing of the amplicon from SSU rRNA gene and the fragment analyzed was aligned with twenty-one sequences deposited in GenBank, generating a phylogenetic tree resulting from the pairing. The result set of this work suggests that the sample obtained represents a new species belonging to a new genus, named Vickermania itaguaiensis.

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