Neste trabalho, são apresentados aspectos analíticos computacionais em funções matriciais , enfatizando-se os métodos de Aproximação de Runckel-Pittelkow , dos Aproximantes de Padé e de Decomposição Matricial. É estudada também, a sensibilidade das funções matriciais , isto é, o comportamento das funções matriciais frente perturbações da matriz . Como importante aplicação das fórmulas de Runckel & Pittelkow são obtidas expressões para a solução dinâmica de uma equação diferencial matricial . Além disso, com base nestas fórmulas, é apresentado um programa computacional para computar exponenciais matriciais .

Neste trabalho, são apresentados aspectos analíticos computacionais em funções matriciais , enfatizando-se os métodos de Aproximação de Runckel-Pittelkow , dos Aproximantes de Padé e de Decomposição Matricial. É estudada também, a sensibilidade das funções matriciais , isto é, o comportamento das funções matriciais frente perturbações da matriz . Como importante aplicação das fórmulas de Runckel & Pittelkow são obtidas expressões para a solução dinâmica de uma equação diferencial matricial . Além disso, com base nestas fórmulas, é apresentado um programa computacional para computar exponenciais matriciais .

Neste trabalho, são apresentados aspectos analíticos computacionais em funções matriciais , enfatizando-se os métodos de Aproximação de Runckel-Pittelkow , dos Aproximantes de Padé e de Decomposição Matricial. É estudada também, a sensibilidade das funções matriciais , isto é, o comportamento das funções matriciais frente perturbações da matriz . Como importante aplicação das fórmulas de Runckel & Pittelkow são obtidas expressões para a solução dinâmica de uma equação diferencial matricial . Além disso, com base nestas fórmulas, é apresentado um programa computacional para computar exponenciais matriciais .

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-12-13T16:05:44Z No. of bitstreams: 1 Thiago Tavares Magalhães - Estudo de configurações de modelos.pdf: 5946560 bytes, checksum: 7262f9bab0cb6698f3f33dc1183bf938 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-12-13T16:05:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Thiago Tavares Magalhães - Estudo de configurações de modelos.pdf: 5946560 bytes, checksum: 7262f9bab0cb6698f3f33dc1183bf938 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-13T16:06:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thiago Tavares Magalhães - Estudo de configurações de modelos.pdf: 5946560 bytes, checksum: 7262f9bab0cb6698f3f33dc1183bf938 (MD5) Previous issue date: 2016-03-02 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Optimization is a permanent subject for research, aiming to provide solutions that improve the utilization of resources and activities of various kinds. Due to the advances in distributed computational processing architectures, analysis and suggestion of parallelizable techniques for treatment of problems has been increasingly highlighted. Among them, the model known as ``island model'', which proposes the achievement of better optimized results in shorter execution time,and brings in a new set of parameters and possibilities, deserves special attention. Thus, this work presents interconnected sets of experiments and proposals that complement the literature concerning 1) the possibilities of model hybridization and the best strategies for hybridization, 2) the study of the parameter known as ``migration policy'' and its influence on diversification and exploitation, and 3) the applicability of the model and of the different implemented migration policies in the context of optimization aiming at several optima. In this way, this work joins the knowledge from the literature and experiments and suggestions that are not founded in previous researches. From these results it is expected that new implementations or applications of island hybrid models for optimization via metaheuristics, aiming at one or more optima, can be more efficiently developed. / A otimização é tema constante de estudo, visando prover soluções que melhorem o aproveitamento de recursos ou atividades de inúmeras naturezas. Com o avanço das arquiteturas distribuídas de processamento computacional, a análise e a sugestão de técnicas paralelizáveis para a resolução de problemas tem recebido cada vez mais destaque. Dentre estas, destaca-se o modelo conhecido como "modelo de ilhas", que propõe a obtenção de resultados mais otimizados em menor tempo de execução, trazendo consigo um novo conjunto de parâmetros e de possibilidades. Assim, este trabalho traz conjuntos interligados de experimentos e propostas que complementam a literatura sobre 1) possibilidades de hibridização do modelo e melhores estratégias de hibridização, 2) o estudo do parâmetro conhecido como ``política de migração'' e as suas influências com respeito à diversificação e especificação e 3) a aplicabilidade do modelo e das diferentes políticas de migração testadas no contexto da otimização visando vários ótimos. Dessa forma, este trabalho alia o conhecimento da literatura a experimentos e sugestões não encontrados em trabalhos anteriores. A partir destes resultados espera-se que novas implementações ou aplicações de modelos de ilha híbridos para otimização via meta-heurísticas, visando um ou vários ótimos, possam ser desenvolvidos de maneira mais eficiente.

Bauhinia forficata, Leguminosae, é conhecida popularmente como pata-devaca e seus principais constituintes químicos são flavonóides. Ë comumente usada como antidiabética, mas existem relatos a respeito de suas atividades antioxidante e antiedematogênica. A fim de avaliar-se o comportamento de seus constituintes químicos frente a variações de temperatura e umidade, realizou-se estudo de estabilidade acelerada (50 ºC ± 2 oC e 90% ± 5% U.R.), onde a substância química majoritária (SQM) serviu como marcador para os devidos cálculos e, portanto, o seu isolamento prévio tornou-se imprescindível. Um método devidamente validado por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE) foi utilizado para as análises e através das mesmas pode-se predizer uma reação de segunda ordem e, por conseguinte, um tempo de vida útil de 2,63 dias e um tempo de meia-vida de 23,65 dias. Avaliou-se, ainda, as atividades antioxidante (DPPH), antiedematogênica (edema em pata de ratos induzido pela carragenina) e anticolinesterásica (autobiografia). Para a atividade antioxidante, dos extratos testados, o butanólico foi o que demonstrou maior ação (54,73 µl/ml) sendo, no entanto, inferior ao padrão Ginkgo biloba (42,51 µl/ml). Na avaliação da atividade antiedematogênica, o extrato aquoso testado demonstrou um máximo de inibição de 76,5%. Ao testar-se a atividade anticolinesterásica de produtos isolados obtidos a partir de B. forficata, nenhuma ação significativa foi observada exigindo estudos complementares.

Bauhinia forficata, Leguminosae, é conhecida popularmente como pata-devaca e seus principais constituintes químicos são flavonóides. Ë comumente usada como antidiabética, mas existem relatos a respeito de suas atividades antioxidante e antiedematogênica. A fim de avaliar-se o comportamento de seus constituintes químicos frente a variações de temperatura e umidade, realizou-se estudo de estabilidade acelerada (50 ºC ± 2 oC e 90% ± 5% U.R.), onde a substância química majoritária (SQM) serviu como marcador para os devidos cálculos e, portanto, o seu isolamento prévio tornou-se imprescindível. Um método devidamente validado por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE) foi utilizado para as análises e através das mesmas pode-se predizer uma reação de segunda ordem e, por conseguinte, um tempo de vida útil de 2,63 dias e um tempo de meia-vida de 23,65 dias. Avaliou-se, ainda, as atividades antioxidante (DPPH), antiedematogênica (edema em pata de ratos induzido pela carragenina) e anticolinesterásica (autobiografia). Para a atividade antioxidante, dos extratos testados, o butanólico foi o que demonstrou maior ação (54,73 µl/ml) sendo, no entanto, inferior ao padrão Ginkgo biloba (42,51 µl/ml). Na avaliação da atividade antiedematogênica, o extrato aquoso testado demonstrou um máximo de inibição de 76,5%. Ao testar-se a atividade anticolinesterásica de produtos isolados obtidos a partir de B. forficata, nenhuma ação significativa foi observada exigindo estudos complementares.

Bauhinia forficata, Leguminosae, é conhecida popularmente como pata-devaca e seus principais constituintes químicos são flavonóides. Ë comumente usada como antidiabética, mas existem relatos a respeito de suas atividades antioxidante e antiedematogênica. A fim de avaliar-se o comportamento de seus constituintes químicos frente a variações de temperatura e umidade, realizou-se estudo de estabilidade acelerada (50 ºC ± 2 oC e 90% ± 5% U.R.), onde a substância química majoritária (SQM) serviu como marcador para os devidos cálculos e, portanto, o seu isolamento prévio tornou-se imprescindível. Um método devidamente validado por Cromatografia Líquida de Alta Eficiência (CLAE) foi utilizado para as análises e através das mesmas pode-se predizer uma reação de segunda ordem e, por conseguinte, um tempo de vida útil de 2,63 dias e um tempo de meia-vida de 23,65 dias. Avaliou-se, ainda, as atividades antioxidante (DPPH), antiedematogênica (edema em pata de ratos induzido pela carragenina) e anticolinesterásica (autobiografia). Para a atividade antioxidante, dos extratos testados, o butanólico foi o que demonstrou maior ação (54,73 µl/ml) sendo, no entanto, inferior ao padrão Ginkgo biloba (42,51 µl/ml). Na avaliação da atividade antiedematogênica, o extrato aquoso testado demonstrou um máximo de inibição de 76,5%. Ao testar-se a atividade anticolinesterásica de produtos isolados obtidos a partir de B. forficata, nenhuma ação significativa foi observada exigindo estudos complementares.

[pt] A metodologia estatística escolhida para validação de métodos analíticos aplicável à metrologia em química é fundamental para assegurar a qualidade, comprovar a eficiência e demonstrar a exatidão dos resultados das medições nas análises químicas. Essa metodologia, desenvolvida em conformidade com o rigor metrológico, resulta num sistema de medições validado, confiável e com incertezas quantificadas. Este trabalho propõe uma metodologia geral para validação de métodos analíticos. A metodologia desenvolvida resultou de uma síntese de métodos parciais descritos na literatura, e inclui uma escolha crítica de técnicas mais adequadas dentro das alternativas existentes. A abordagem proposta combina quatro diferentes aspectos da validação: a modelagem da curva de calibração; o controle da especificidade do método; a comparação da tendência e precisão (repetitividade e precisão intermediária) do método com um método de referência; e a estimação das componentes de incerteza inerentes a todos esses aspectos. Como resultado, além de uma proposta para validação de métodos para uso em análises químicas, obtêm- se a função de calibração inversa e as incertezas expandidas, que permitem obter os resultados analíticos associados aos valores da resposta, com suas respectivas incertezas associadas. Na modelagem geral para obtenção da curva de calibração, empregam-se técnicas estatísticas para avaliação da linearidade e para o cálculo do mínimo valor detectável e do mínimo valor quantificável. A especificidade do método analítico é avaliada pela adição de padrões a um conjunto de amostras representativas e posterior recuperação dos mesmos, com ajuste por mínimos quadrados e testes de hipóteses. Para estudar a tendência e a precisão do método quando comparado a um método de referência, utiliza-se um modelo hierárquico de quatro níveis e a aproximação de Satterthwaite para determinação do número de graus de liberdade associados aos componentes de variância. As técnicas estatísticas utilizadas são ilustradas passo a passo por exemplos numéricos. / [en] The use of statistical methodology for analytical methods validation is vital to assure that measurements have the quality level required by the goal to be attained. This thesis describes a statistical modelling approach for combining four different aspects of validation: checking the linearity of the calibration curve and compute the detection and the quantification limits; controlling the specificity of the analytical method; estimating the accuracy (trueness and precision) of the alternative method, for comparison with a reference method. The general approach is a synthesis of several partial techniques found in the literature, according to a choice of the most appropriate techniques in each case. For determination of the response function, statistical techniques are used for assessing the fitness of the regression model and for determination of the detection limit and the quantification limit. Method specificity is evaluated by adjusting a straight line between added and recovered concentrations via least squares regression and hypotheses tests on the slope and intercept. To compare a method B with a reference method A, the precision and accuracy of method B are estimated. A 4-factor nested design is employed for this purpose. The calculation of different variance estimates from the experimental data is carried out by ANOVA. The Satterthwaite approximation is used to determine the number of degrees of freedom associated with the variance components. The application of the methodology is thoroughly illustrated with step-by-step examples.

O uso hormônios como promotores de crescimento em animais de criação foi proibido em vários países, inclusive no Brasil, desde os anos setenta. Para o controle destes anabolizantes, foi desenvolvida uma enorme variedade de métodos, tanto com propósitos de triagem como de confirmação. Os métodos mais usados são os físico-quimicos, entre eles os cromatográficos, tais como cromatografia em camada delgada, cromatografia a gás acoplada a espectrômetro de massa, cromatografia líquida de alta eficiência com detector UV, e os ensaios imunoquímicos tais como radioimunoensaio ou enzimaimunoensaio. Este trabalho revisa os métodos analíticos mais usados internacionalmente no controle de substâncias anabolizantes em tecidos e urina de animais de criação para consumo humano. Atenção especial é dada ao anabolizante potencialmente cancinogênico, Dietilstilbeltrol (DES) em relação ao seu uso no Brasil e às dificuldades envolvidas em sua determinação. São propostos neste trabalho métodos para detecção do DES em sítios de aplicação, na urina, no tecido muscular e nas vísceras, bem como são apresentados os resultados da aplicação desta metodologia em amostras de animais implantado e de controle e amostras autênticas. / Since the seventies, the use of hormonal anabolics as growth promotors in lifestock fattening has been banned in many countries, including Brazil. For control purposes a wide range of methods have been developed for both large-scale screnning and confirmation. The most used methods are the physical-chemical ones, such as thin-layer chromatography (TLC), gas chromatography-mas spectrometry (CG-MS), high performance liquid cromatography (HF\'LC) with UV detector and immunochemical assay (RIA) or enzime imuno assay (ELISA). This thesis reviews the most used methods for the control of anabolics in tissue as well as in the urine of cattle raised for human consumption. Special attention is given to the potencially calcinogen Diethylstilbestrol, its possible use in Brazil and the difficulties envolved in its determination. Suitable methods for the detection of DES in samples from injection sites, urine, tissue and organs of implanted and control animals, are presented, as well as results obtained from authentic samples.

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-08-02T16:44:43Z No. of bitstreams: 1 tese Marlon.pdf: 3479616 bytes, checksum: f60059a6220c6ab4e97a28df4efe523a (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-08-02T16:44:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 tese Marlon.pdf: 3479616 bytes, checksum: f60059a6220c6ab4e97a28df4efe523a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-02T16:45:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese Marlon.pdf: 3479616 bytes, checksum: f60059a6220c6ab4e97a28df4efe523a (MD5) Previous issue date: 2015-04-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / The indiscriminate use of antibiotics or their incorrect administration has made over the years, these drugs are losing their effectiveness due to evolutionary mechanisms, which naturally confer resistance characteristics to bacterias. As example of this evolutionary mechanism, we can mention the recent reports polymyxins resistant bacteria, drugs used as a last resort in infection control by super resistant bacteria, such as bacteria of the species Klebsiella pneumoniae microarray. The ease of this bacterium in performing transfers of genetic material, together with other mechanisms of their own group, is also making it resistant to polymyxins. This bacterial resistance points to a serious epidemiological problem, causing deaths including in Brazil. This study, aimed to infer the possible metabolic pathways and genes active in gene regulation mechanism related to resistance to polymyxin B in the genome of the bacteria K. pneumoniae KP13 strain, which had its entire genome unraveled in 2013. This opportunistic pathogenic microorganism He was responsible for hospital infection outbreak in 2009 in the south of the country. The findings of this study were made from the RNA-Seq technique, which is a transcriptome analysis technique based on the next generation sequencing (NGS), which allows a review of gene expression on a large scale. The transcriptome study, among others gives us an overview of the set of messengers transcripts (mRNAs) in a cell, and this allows us to directly evaluate the expression of its genes in specific situations. The transcriptome of the study was examined body 6 under conditions with two biological replicates for each condition. For sequencing were used two sequencing platforms: Illumina HiSeq and Roche 454 which enabled a comparative analysis of the data. From the obtained result of gene expression, the first stage of the study was the pre-processing of RNA-Seq data, where it was developed a methodology that was the basis for this analysis prokaryotic organism, given that the vast majority of materials available aims to study eukaryotic organisms. In the second stage of labor, the alignments were generated and the following was made to quantify the expression for each gene of the bacteria under study. The next step was to examine differential expression of genes important step towards the elucidation of resistance targets of regulation. All the differential expression of genes procedure was done using the R platform and the EDGE R package, the most suitable for the size of data that would be analyzed. The inference of genes active in gene regulation mechanism related to resistance to polymyxin B in the genome of the bacteria K. pneumoniae KP13 was made based on the clustering technique k-means, which showed to be effective within the universe of data to be mined. For the data generated, we were obtained $ 150 $ groups from the set 70 % genes most differentially expressed in all study conditions and, of these, the most significant associated with drug resistance and their metabolic pathways were chosen were investigated. Groupings proved concise and technical shows stable for application tests with other bodies. / O uso indiscriminado de antibióticos ou sua incorreta administração fez com que no passar dos anos, essas drogas fossem perdendo sua eficiência, devido aos mecanismos evolutivos, que naturalmente conferem caracteristicas de resistência às bacterias.Como exemplo desse mecanismo evolutivo, podemos citar os recentes relatos de bactérias resistentes às polimixinas, medicamentos utilizados como última alternativa no controle de infecções por bactérias super resistentes, como é o caso das bactérias da espécie Klebsiella pneumoniae. A facilidade dessa bactéria em realizar transferências de material genético, aliada a outros mecanismos próprios de seu grupo, vem tornando-a resistente também às polimixinas. Essa resistência bacteriana aponta para um problema epidemiológico grave, causador de óbitos inclusive no Brasil. O presente trabalho, teve por objetivo inferir os possíveis genes e vias metabólicas atuantes no mecanismo de regulação gênica relacionados à resistência à polimixina B no genoma da bactéria K. pneumoniae estirpe KP13, a qual teve seu genoma completo desvendado em 2013. Este microorganismo patogênico oportunista foi o responsável pelo surto de infecção hospitalar em 2009, no sul do pais. As análises do presente estudo foram feitas a partir da técnica de RNA-Seq, que é uma técnica de análise de transcriptomas baseada no sequenciamento de nova geração (NGS), que permite uma avaliação de expressão genica em grande escala. O estudo do transcriptoma, dentre outros nos dá uma visão geral do conjunto de transcritos mensageiros (mRNAs) em uma célula, e isso nos permite avaliar diretamente a expressão de seus genes sob situações específicas. O transcriptoma do organismo de estudo foi analisado sob 6 condições, com duas réplicas biológicas para cada condição. Para o sequenciamento foram usadas duas plataformas de sequenciamento: Illumina HiSeq e Roche 454 o que possibilitou uma análise comparativa dos dados. A partir do resultado obtido da expressão gênica, a primeira etapa do trabalho foi realizar o pré-processamento dos dados do RNA-Seq, onde foi desenvolvido uma metodologia que serviu como base para análise desse organismo procarioto, haja vista que a grande maioria dos materiais disponíveis visa estudo de organismos eucariotos. Na segunda etapa do trabalho, foram gerados os alinhamentos e a seguir foi feita a quantificação da expressão para cada gene da bactéria em estudo. O passo seguinte foi analisar a expressão diferencial dos genes, passo importante para a elucidação dos alvos de regulação da resistência. Todo o procedimento de expressão diferencial de genes foi feito utilizando a plataforma R, e o pacote EDGE R, o mais indicado para a dimensão de dados que viria a ser analisada. A inferência dos genes atuante no mecanismo de regulação gênica relacionados à resistência à polimixina B no genoma da bactéria K. pneumoniae KP13 foi feita baseando-se na técnica de agrupamento k-means, a qual apresentou-se efetiva dentro do universo de dados a ser minerado. Para os dados gerados, foram obtidos 150 agrupamentos a partir do conjunto de $70\%$ dos genes mais diferencialmente expressos em todas as condições do estudo, e, desses, foram escolhidos os mais significantes associados com a resistência bacteriana e suas vias metabólicas foram investigadas. Os agrupamentos mostraram-se concisos e a técnica mostra-se estável para aplicação de testes com outros organismos.