Les modèles d'équations structurelles à variables latentes constituent des modèles statistiques complexes permettant de mettre en relation des concepts non observables. Les deux méthodes d'estimation de ces modèles, que sont, d'une part, l'analyse de la structure de covariance (méthode LISREL) et, d'autre part, l'approche PLS, offrent des solutions à la fois concurrentes et complémentaires. Dans ce travail, un certain nombre de questionnements liés à ce type de modèles et de méthodes sont abordés aussi bien d'un point de vue théorique qu'empirique. Nous étudions la construction du modèle initial par le biais d'algorithmes itératifs, au niveau des relations du modèle de mesure et du modèle structurel. Nous présentons des tests basés sur des permutations afin de comparer des échantillons non appariés sur un modèle donné. Des transformations dites optimales des variables sont utilisées afin de rechercher des relations non linéaires. Finalement, des méthodes permettant le traitement de données manquantes spécifiques induites par des filtres sont décrites. Pour chaque cas, la théorie existante est présentée et des approches novatrices sont introduites. Nous appliquons l'ensemble de ces méthodes dans le cadre de l'analyse de la satisfaction et de la fidélité des clients sur des données provenant d'Electricité de France.