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Méthodologies de synthèses pour la préparation de ‘puces à SAS’ : vers de nouveaux outils pour l’étude des interactions héparane sulfate /protéines / Synthetic methodologies for the preparations of SAS chips : generation of new tools to decipher Heparan Sulfate-Protein interactionsLiu, Wenqing 23 January 2015 (has links)
L’Héparane sulfate (HS) est un polysaccharide linéaire et sulfaté présent à la surface des cellules ou dans le milieu extracellulaire des tissus animaux. Le long des chaines d'HS, des régions présentant une densité de charge négative élevée (domaines S) alternent avec des régions plus faiblement chargées (domaines A). Différents motifs SAS sont ainsi exposés à la surface des cellules et permettent des interactions spécifiques avec de nombreuses protéines comme l’interféron gamma (INF-γ). Cette cytokine interagit avec haute affinité avec les chaines d'HS, ce qui module son activité in vivo (accumulation et localisation tissulaire, clairance sanguine). Pour moduler l’activité de l’INF-γ en inhibant ses interactions avec les chaines d'HS de la surface des cellules, nous avons entrepris la synthèse de mimes de motifs SAS, dans lesquels des fragments synthétiques de domaines S sont liés par un espaceur de longueur modulable. Pour effectuer cette conjugation, nous avons choisi d'utiliser deux types de chimie click la "CuAAC" et la "ligation oxime". Cette stratégie a nécessité de mettre au point des fonctionnalisations orthogonales des extrémités réductrices et non réductrices d'oligosaccharides synthétiques. Nous avons mis au point les réactions sur un disaccharide modèle dérivé du cellobiose, puis les avons transférées à la modification d'un tetrasaccharide synthétique d'HS. Dans ce travail, nous avons optimisé deux réactions clef : une alkylation anomérique dans l’eau et une allylation de fonction alcool dans des conditions neutres / Heparan sulfate (HS) is a linear polysaccharide found in animal tissues at the cell surface or in the extracellular matrix. HS chains display alternating highly negatively charged regions (S) and less charged ones (A). SAS domains with different topologies can thus be exposed at the cell surface with the aim of interacting specifically with different proteins. Gamma interferon (INF-γ) is a cytokine that binds tightly to HS chains. This interaction allows controlling numerous bioactivities of the cytokine (accumulation and location in tissues as well as blood clearance). The discovery of HS fragment able to modulate the activity of IFN-γ could open the way to new innovative therapeutics. To this aim we launched a program aiming at synthesizing mimetic of the SAS motifs found in HS. We devised a strategy allowing linking two synthetic S fragments of HS through a spacer. To this aim we selected two click chemistry reactions: the "CuAAC" triazole formation and "oxime ligation". To implement this strategy, we optimized, on a disaccharide model derived from cellobiose, a methodology allowing the functionalization of the reducing and non-reducing end of synthetic oligosaccharides by to orthogonal reactive functions. Then we extended the methodology to a HS tetrasaccharide fragment. In this work, we optimized two key reactions: an anomeric alkylation in water and a hydroxyl allylation in neutral condition
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Synthèse d'une librairie d'analogues monomériques et dimériques du sLe XCalosso, Mickael 09 1900 (has links)
Dans cet ouvrage sera décrite la synthèse de nouveaux analogues du sialyl
Lewis X (sLex). A cet effet, nous avons préparé une librairie d’analogues synthétisée
à partir d’une approche mettant en jeu un «espaceur» acyclique permettant d’avoir un
biais conformationnel que nous avons défini comme la stratégie ATC-B.
Nous avions déjà démontré que certains analogues portant un groupe benzoate
en C-2 et en C-4 du galactose présentent une activité 50 fois supérieure à celle du
sLex. Nous avions par ailleurs démontré qu’en l’absence du benzoate en C-2,
l’activité devient alors trois fois plus faible. A présent, il paraissait interessant de
synthétiser des analogues ayant seulement un groupe benzoate en C-4 pour evaluer
l’impact de ce groupement sur la puissance de nos analogues.
Par le passé, nous avions également mis en évidence le rôle des esters sur
l’activité des analogues portant un «espaceur» acyclique dans le cadre de la stratégie
ATC-B. Nous effectuerons donc des variations à ce niveau pour en évaluer l’impact.
Enfin, nous avons préparé une nouvelle famille d’analogues de type dimère.
Ceux-ci seront constitués de 2 unités des composés monomériques synthétisés
précédemment. La synthèse de ces dimères fera l’emploi de la «Click Chemistry».
Cette étude nous mènera a vous présenter la synthèse de ces composés et la
méthodologie employée. / This work describes the synthesis of novel sialyl Lewis X (sLex) analogues.
To this end, we have prepared a library of analogues by implementing a strategy that
makes use of an Acyclic Tether which allows for defined Conformational Bias (ATCB
strategy).
We have previously shown that analogues bearing a benzoate group at both
positions C-2 and C-4 of the galactose exert an activity 50-fold greater than that of
sLex. Indeed, removing the benzoate at position C-4 while keeping the one at C-2 led
to a three fold decrease in potency. We are currently preparing the corresponding
analogues that have the benzoate only at position C-4 in order to fully evaluate its
impact on the potency of the analogue.
We have also previously elucidated the role of esters on the activity of
analogues that have acyclic tether as part of the ATC-B strategy. Variations have
been made at the level of the ester and their impact has been evaluated.
Lastly, we have prepared a novel family of analogues consisting of two
identical monomeric subunits linked together. Synthesis of these dimers was
performed via «Click Chemistry». This study describes the synthesis of the
compounds and the methodology employed.
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Addition stéréosélective de nucléophiles sur un centre acétal : synthèse de nucléosides 1’,2’-cisSt-Jean, Olivier 04 1900 (has links)
Plusieurs analogues de nucléosides thérapeutiques (Ara-C, Clofarabine), utilisés
pour le traitement de leucémies, présentent un arrangement 1’,2’-cis entre la nucléobase
reliée au centre anomère et le substituant (électroattracteur) en C-2’. Récemment, notre
laboratoire a développé une approche synthétique pour former sélectivement des
analogues de nucléosides et de thionucléosides 1’,2’-trans et 1’,2’-cis à partir de
précurseurs acycliques.
Ce mémoire présente une nouvelle méthodologie pour accéder efficacement aux
analogues de nucléosides 1’,2’-cis à partir de furanosides. Différents groupements en
position anomérique ont été examinés, sous conditions cinétiques en utilisant le bromure
de diméthylbore pour générer sélectivement des produits acycliques ou cycliques. Les
intermédiaires cinétiques de différents furanosides de méthyle formés en présence de
Me2BBr ont été piégés in situ par un thiol pour générer des thioacétals acycliques avec
de bonnes voire d’excellentes diastéréosélectivités. Les produits générés sont en accord
avec une rétention globale de l’information stéréochimique du centre acétal et deux
déplacements SN2 consécutifs ont été suggérés pour rationaliser ces résultats. Toutefois,
l’objectif de synthétiser des analogues de nucléosides à partir de furanosides de méthyle
a échoué.
Tel que démontré par le Dr Michel Prévost, l’activation par Me2BBr des lactols
des quatres différents furanosides suivie d’une addition in situ d’une base silylée a
permis de former diastéréosélectivement les analogues de nucléosides 1’,2’-cis
correspondants avec d’excellents rendements. Nous avons démontré que d’autres
substrats peuvent être employés et que l’induction stéréochimique est sous contrôle du
substituant électroattracteur en C-2. D’autres acides de Lewis, tel que TMSBr, peuvent
également être utilisés.
Cette méthodologie a également été étendue à d’autres nucléophiles tels que des
Grignards ou des éthers d’énols silylés, conduisant à de bonnes sélectivités. / Many therapeutically relevant nucleoside analogs (Ara-C, Clofarabine) for the
treatment of leukemia have a 1’,2’-cis arrangement between the nucleobase attached at
the anomeric center and the non-hydrogen substituent at C-2’. Recently, our laboratory
has developed a versatile approach to the synthesis of 1’,2’-trans and 1’,2’-cis
nucleoside and thionucleoside analogues from acyclic scaffolds.
This work will present a new methodology to access efficiently 1’,2’-cis
nucleoside analogues from cyclic furanoside. Activation of various anomeric groups by
Me2BBr was investigated, and under kinetic control acyclic substrates or cyclic ones
could be generated selectively. Trapping the kinetic product of methyl furanoside
formed in presence of Me2BBr by thiol in the presence of base led to the formation of
acyclic thioacetal in good to excellent diastereoselectivity. The results obtained are in
accordance with total retention of the stereochemical information of the acetal moiety
and thus suggested that the mechanism of these two reactions is two successive SN2
displacements. The objective of synthesizing nucleoside analogs from methyl
furanoside was unsuccessful.
As shown recently by Dr Michel Prévost, activation of all four furanoside lactol
scaffolds by Me2BBr with an in situ addition of silylated nucleobase afforded 1’,2’-cis
pyrimidine nucleoside analogues in very good yields and with diastereoselectivities
greater or equal to 20:1. Expending this methodology to other scaffolds provided
evidence of stereoelectronic control of the C-2 electron-withdrawing substituent. Other
Lewis acids such as TMSBr can be used.
This methodology was also applied to other nucleophiles such as allyl Grignard
and silylated enols ethers, which were successfully alkylated in good yield and 1,2-cis
diastereoselectivity.
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Synthèse d'une librairie d'analogues monomériques et dimériques du sLe XCalosso, Mickael 09 1900 (has links)
Dans cet ouvrage sera décrite la synthèse de nouveaux analogues du sialyl
Lewis X (sLex). A cet effet, nous avons préparé une librairie d’analogues synthétisée
à partir d’une approche mettant en jeu un «espaceur» acyclique permettant d’avoir un
biais conformationnel que nous avons défini comme la stratégie ATC-B.
Nous avions déjà démontré que certains analogues portant un groupe benzoate
en C-2 et en C-4 du galactose présentent une activité 50 fois supérieure à celle du
sLex. Nous avions par ailleurs démontré qu’en l’absence du benzoate en C-2,
l’activité devient alors trois fois plus faible. A présent, il paraissait interessant de
synthétiser des analogues ayant seulement un groupe benzoate en C-4 pour evaluer
l’impact de ce groupement sur la puissance de nos analogues.
Par le passé, nous avions également mis en évidence le rôle des esters sur
l’activité des analogues portant un «espaceur» acyclique dans le cadre de la stratégie
ATC-B. Nous effectuerons donc des variations à ce niveau pour en évaluer l’impact.
Enfin, nous avons préparé une nouvelle famille d’analogues de type dimère.
Ceux-ci seront constitués de 2 unités des composés monomériques synthétisés
précédemment. La synthèse de ces dimères fera l’emploi de la «Click Chemistry».
Cette étude nous mènera a vous présenter la synthèse de ces composés et la
méthodologie employée. / This work describes the synthesis of novel sialyl Lewis X (sLex) analogues.
To this end, we have prepared a library of analogues by implementing a strategy that
makes use of an Acyclic Tether which allows for defined Conformational Bias (ATCB
strategy).
We have previously shown that analogues bearing a benzoate group at both
positions C-2 and C-4 of the galactose exert an activity 50-fold greater than that of
sLex. Indeed, removing the benzoate at position C-4 while keeping the one at C-2 led
to a three fold decrease in potency. We are currently preparing the corresponding
analogues that have the benzoate only at position C-4 in order to fully evaluate its
impact on the potency of the analogue.
We have also previously elucidated the role of esters on the activity of
analogues that have acyclic tether as part of the ATC-B strategy. Variations have
been made at the level of the ester and their impact has been evaluated.
Lastly, we have prepared a novel family of analogues consisting of two
identical monomeric subunits linked together. Synthesis of these dimers was
performed via «Click Chemistry». This study describes the synthesis of the
compounds and the methodology employed.
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Addition stéréosélective de nucléophiles sur un centre acétal : synthèse de nucléosides 1’,2’-cisSt-Jean, Olivier 04 1900 (has links)
Plusieurs analogues de nucléosides thérapeutiques (Ara-C, Clofarabine), utilisés
pour le traitement de leucémies, présentent un arrangement 1’,2’-cis entre la nucléobase
reliée au centre anomère et le substituant (électroattracteur) en C-2’. Récemment, notre
laboratoire a développé une approche synthétique pour former sélectivement des
analogues de nucléosides et de thionucléosides 1’,2’-trans et 1’,2’-cis à partir de
précurseurs acycliques.
Ce mémoire présente une nouvelle méthodologie pour accéder efficacement aux
analogues de nucléosides 1’,2’-cis à partir de furanosides. Différents groupements en
position anomérique ont été examinés, sous conditions cinétiques en utilisant le bromure
de diméthylbore pour générer sélectivement des produits acycliques ou cycliques. Les
intermédiaires cinétiques de différents furanosides de méthyle formés en présence de
Me2BBr ont été piégés in situ par un thiol pour générer des thioacétals acycliques avec
de bonnes voire d’excellentes diastéréosélectivités. Les produits générés sont en accord
avec une rétention globale de l’information stéréochimique du centre acétal et deux
déplacements SN2 consécutifs ont été suggérés pour rationaliser ces résultats. Toutefois,
l’objectif de synthétiser des analogues de nucléosides à partir de furanosides de méthyle
a échoué.
Tel que démontré par le Dr Michel Prévost, l’activation par Me2BBr des lactols
des quatres différents furanosides suivie d’une addition in situ d’une base silylée a
permis de former diastéréosélectivement les analogues de nucléosides 1’,2’-cis
correspondants avec d’excellents rendements. Nous avons démontré que d’autres
substrats peuvent être employés et que l’induction stéréochimique est sous contrôle du
substituant électroattracteur en C-2. D’autres acides de Lewis, tel que TMSBr, peuvent
également être utilisés.
Cette méthodologie a également été étendue à d’autres nucléophiles tels que des
Grignards ou des éthers d’énols silylés, conduisant à de bonnes sélectivités. / Many therapeutically relevant nucleoside analogs (Ara-C, Clofarabine) for the
treatment of leukemia have a 1’,2’-cis arrangement between the nucleobase attached at
the anomeric center and the non-hydrogen substituent at C-2’. Recently, our laboratory
has developed a versatile approach to the synthesis of 1’,2’-trans and 1’,2’-cis
nucleoside and thionucleoside analogues from acyclic scaffolds.
This work will present a new methodology to access efficiently 1’,2’-cis
nucleoside analogues from cyclic furanoside. Activation of various anomeric groups by
Me2BBr was investigated, and under kinetic control acyclic substrates or cyclic ones
could be generated selectively. Trapping the kinetic product of methyl furanoside
formed in presence of Me2BBr by thiol in the presence of base led to the formation of
acyclic thioacetal in good to excellent diastereoselectivity. The results obtained are in
accordance with total retention of the stereochemical information of the acetal moiety
and thus suggested that the mechanism of these two reactions is two successive SN2
displacements. The objective of synthesizing nucleoside analogs from methyl
furanoside was unsuccessful.
As shown recently by Dr Michel Prévost, activation of all four furanoside lactol
scaffolds by Me2BBr with an in situ addition of silylated nucleobase afforded 1’,2’-cis
pyrimidine nucleoside analogues in very good yields and with diastereoselectivities
greater or equal to 20:1. Expending this methodology to other scaffolds provided
evidence of stereoelectronic control of the C-2 electron-withdrawing substituent. Other
Lewis acids such as TMSBr can be used.
This methodology was also applied to other nucleophiles such as allyl Grignard
and silylated enols ethers, which were successfully alkylated in good yield and 1,2-cis
diastereoselectivity.
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