Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-02-22T20:14:46Z No. of bitstreams: 1 2016 - Diego Mattos Penedo.pdf: 4081734 bytes, checksum: 3e13fd4d6f8b8c4d8d31a05fefa2ba14 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-22T20:14:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016 - Diego Mattos Penedo.pdf: 4081734 bytes, checksum: 3e13fd4d6f8b8c4d8d31a05fefa2ba14 (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / CAPES / Several studies have been conducted with capuchin monkeys (Sapajus and Cebus) in order to understand their evolutionary histories by South and Central America. Genetic analysis, in association with the coat coloration, assist in the identification of the relationships between species and show the diversity presented by both genera. In Brazil, Sapajus species are predominantly distributed, being S. nigritus endemic to the Atlantic Forest and characteristic of southeast. At Ilha da Marambaia, an important area with forest remaining in the state of Rio de Janeiro, there is a population of capuchin monkeys, but without previous study. The objective of this study was to characterize the population of capuchin monkeys at this region through phenotypic and genetic analyzes, including the coat coloration, the sequencing of the mitochondrial gene cytochrome oxidase II and the evaluation of karyotype with conventional staining and C-band. Interviews with residents and military personnel in the region, were also carried out, in order to identify the possible origin and isolation of the primates. Twelve specimens, eight males and four females, were analyzed. The coat features were consistent with that described for S. nigritus, with coloration varying from brown to blackish on the back, limbs, tail and top of the head, in addition to yellow chest and face with white or light yellow, contrasting. Tufts at the top of the head were seen in adults, being greater in females. The analysis of mitochondrial gene revealed closer proximity of this population with S. xanthosternos, which occurs at Bahia, and then with S. cay that occurs in parts of Brazil and Paraguay. The greatest divergence was in relation to the population of S. nigritus in Argentina. The karyotype was consistent with that described for Sapajus species, with 2n = 54 (XX or XY), although the morphology of the sex chromosome Y, submetacentric, was different from that commonly described in the literature (acrocentric). Presented intercalary C-band the chromosome pairs 4, 11, 12 and 17. The par 11 presented three polymorphisms, all interstitial to euchromatin and diversified from each other by deletion and inversion processes. The pattern of this pair is different from that described, as a small acrocentric, to S. nigritus in populations of Argentina, with banding similar to that considered specific for S. xanthosternos. According to the survey, the population of primates seems to be native of the island and is currently isolated. According to the genetic divergences found, the population of Ilha da Marambaia may have maintained ancestral characteristics. The C-band pattern of the pair 11 indicates that the polymorphism described for populations of Argentina does not correspond to the entire distribution of S. nigritus. These data may help to understand the diversity and evolution of Sapajus, since this would have radiated from southeastern Brazil. Further studies with populations from other regions of Rio de Janeiro are needed to verify the C-band pattern presented for the pair 11 as well as the genetic relationships demonstrated by the mitochondrial gene for the population of Ilha da Marambaia. / Diversos estudos v?m sendo realizados com macacos-prego e caiararas (Sapajus e Cebus) de modo a entender suas hist?rias evolutivas pelas Am?ricas do Sul e Central. An?lises gen?ticas, em associa??o ?s caracter?sticas de pelagem, auxiliam na identifica??o das rela??es entre as esp?cies e evidenciam a diversidade apresentada por ambos os g?neros. No Brasil, est?o distribu?das predominantemente as esp?cies de Sapajus, sendo S. nigritus end?mica de Mata Atl?ntica e caracter?stica do sudeste. Na Ilha da Marambaia, importante ?rea com remanescente florestal no estado do Rio de Janeiro, existe uma popula??o de macacos-prego, sem nenhum estudo anterior. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a popula??o de macacos-prego dessa regi?o atrav?s de an?lises fenot?picas e gen?ticas, incluindo o padr?o de pelagem, o sequenciamento do gene mitocondrial Citocromo Oxidase II e a avalia??o do cari?tipo com colora??o convencional e bandamento de heterocromatina constitutiva (banda C). Foram realizadas, tamb?m, entrevistas com moradores e militares da regi?o, de modo a identificar a poss?vel origem e isolamento dos primatas. Foram analisados doze esp?cimes, oito machos e quatro f?meas. As caracter?sticas de pelagem coincidiram, de modo geral, com descrito para S. nigritus, sendo observada colora??o variando de marrom a enegrecida no dorso, membros, cauda e topo da cabe?a, al?m de peito amarelo e face branca ou amarelo-clara, contrastante. Tufos de pelos no topo da cabe?a foram observados nos adultos, sendo maiores nas f?meas. A an?lise do gene mitocondrial revelou maior proximidade da popula??o da ilha com S. xanthosternos, que ocorre na Bahia, e em seguida com S. cay, que ocorre em parte do Brasil e no Paraguai. A maior diverg?ncia apresentada foi em rela??o a popula??es de S. nigritus da Argentina. A an?lise do cari?tipo revelou padr?o condizente com as esp?cies de Sapajus, com 2n = 54 (XX ou XY), embora a morfologia do cromossomo sexual Y, submetac?ntrica, fosse divergente do comumente descrito na literatura (acroc?ntrica). Apresentaram banda C intercalar os pares cromoss?micos 4, 11, 12 e 17. O par 11 mostrou-se com tr?s polimorfismos, todos intercalares e diversificados entre si por processos de dele??o e invers?o. O padr?o deste par foi divergente do descrito, como um pequeno acroc?ntrico, para S. nigritus em popula??es da Argentina, apresentando bandamento semelhante ao considerado espec?fico de S. xanthosternos. Segundo o levantamento realizado, a popula??o de primatas parece ser natural da ilha, estando provavelmente isolada. De acordo com as diverg?ncias gen?ticas encontradas, a popula??o da Ilha da Marambaia pode ter conservado caracter?sticas ancestrais. O padr?o de banda C do par 11 indica que o polimorfismo descrito para popula??es da Argentina pode n?o corresponder a toda a distribui??o de S. nigritus. Estes dados podem auxiliar no entendimento da diversidade e evolu??o das esp?cies de Sapajus, uma vez que este teria irradiado a partir do sudeste brasileiro. Novos estudos com popula??es de outras regi?es do Rio de Janeiro s?o necess?rios para se averiguar o padr?o de bandamento de heterocromatina apresentada para o par 11, bem como as rela??es gen?ticas demonstradas pelo sequenciamento do gene mitocondrial para a popula??o da Ilha da Marambaia.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-03-17T19:09:01Z No. of bitstreams: 1 EdwinLuizeFerreiraBarreto_TESE.pdf: 4396827 bytes, checksum: 67d20b4064513759f618b9148557fcdd (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-03-17T21:47:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 EdwinLuizeFerreiraBarreto_TESE.pdf: 4396827 bytes, checksum: 67d20b4064513759f618b9148557fcdd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T21:47:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 EdwinLuizeFerreiraBarreto_TESE.pdf: 4396827 bytes, checksum: 67d20b4064513759f618b9148557fcdd (MD5) Previous issue date: 2016-11-18 / Este trabalho tem como objetivo principal realizar o estudo e an?lise de diferentes antenas planares de microfita, atrav?s do emprego de geometrias fractais no patch ressoador e da remo??o parcial do plano de terra com acoplamento. Recentes estudos mostram que as varia??es nas formas geom?tricas do patch da antena e do plano de terra produzem mudan?as na distribui??o da densidade de corrente da estrutura e consequentemente nos modos ressonantes e na polariza??o da antena. No desenvolvimento desta tese, apresenta-se uma nova antena fractal que utiliza a t?cnica de inser??o de fendas e aberturas de forma fractal no plano de terra e tamb?m descontinuidades no transformador ? de onda na linha de transmiss?o a fim de aumentar a largura de banda e alcan?ar comportamentos espec?ficos em aplica??es de banda de frequ?ncia. Emprega-se o substrato FR-4 com dimens?es de 85,0 x 85,0 x 1,57 mm?. Al?m disso, usam-se diferentes modos de casamento de imped?ncia na linha de alimenta??o de antena como CPW (Coplanar Wave Guide) e altera??es da largura da linha de transmiss?o, a fim de obter varia??o na distribui??o de corrente e, consequentemente, na largura de banda de resposta por imped?ncia para S11 ? -10dB para banda C (3.9 GHz - 6,2 GHz) e banda S (2,0 GHz - 4,0 GHz). Uma an?lise comparativa de desempenho para a linha de microfita e CPW foi realizada, obtendo-se para alguns casos antenas circularmente polarizadas. Boa concord?ncia foi obtida entre os resultados medidos e simulados. / This work has as main objective to carry out the study and analysis of different planar microstrip antenna, by employing fractal geometry in the resonator patch and partial removal of the ground plane with coupling. Recent studies show that variations in geometric shapes of the antenna and the ground plane generate changes in current density distribution of the planar structure and consequently the resonant modes and antenna polarization. In developing this thesis presents a new fractal antenna using the technique of insertion slots and fractal shaped defects (gaps) in the ground plane and discontinuities with ? wavelength transformer in the transmission line in order to increase the bandwidth and inserting in the feed line to reach specific behaviors in three frequency bandwidth applications. We used the FR-4 substrate with dimensions of 85.0 x 85.0 x 1.57 mm?. In addition, we used different modes of impedance matching in line antenna feed as CPW (Coplanar Wave Guide), to change the width of the transmission line in order to obtain a variation in the current distribution and hence the response bandwidth impedance to S11 ? -10dB for C band (3.9 GHz - 6.2 GHz) and S band (2.0 GHz - 4.0 GHz). A comparative analysis of cases with microstrip line and CPW was made, applications in this frequency range require preferably circularly polarized antennas. Good agreement was obtained between measured and simulated results.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CHAPTER II: Pequi, Caryocar brasiliense, is one of the species of highlight at the biome of the Brazilian savannah due to its utilization in culinary, popular medicine, industry in general, and iron and steel industry. It presents an elevated index of exploration, being capable of entering the list of the endangered species. In the region of São José do Xingu (MT), a tree of pequi without thorn at the mesocarp was found and this enables to improve pequi not only for consumption, taking advantage of the high appreciation it already has. To detect the existing genomic differences between the pequi with and without the thorn at the endocarp, RADP markers were utilized. The generated polymorphisms were cloned and sequenced in order to identify the sequences responsible for the fenotypical alteration. It was observed that the pequi without thorn is genetically isolated from the other populations of pequi with thorn at the endocarp, proving that this characteristic is related to the genetic divergence of the species. Analysis in BLASTn evidenced the similarity of the Dof1 genes of Zea mays, in the population with thorn, and in the population without thorn, with the gene of phosphinotricin acetyl transferase of Z. mays. In the analysis of BLASTx, the similarity was verified with the proteins responsible for the deficiency in ferric reductase 4, in the pequi without thorn and catalase, in the pequi without thorn. CHAPTER III:The pequi, Cayocar brasiliense Cambess. Is a feature of Brazilian cerrado plant suffering extractive action, mainly for food. It is a plant very appreciated in the regions of Minas Gerais, especially in the north of this state. In the region of Sao Jose do Xingu, Mato Grosso, was found in a plant which had no thorns in the core and this allowed further research to discover the lack of thorns as it is an unwanted feature of the plant. Thus, the cytogenetic study, using conventional Giemsa staining, NOR, banda C, DAPI and CMA3 were used for comparison between the pequi with and without spines in the putamen. It was found that these differences are not attributed to chromosomal differences between the two types of pequi. Both have the same chromosome number, the marking of NOR, C banding was not verified due to the size of chromosomes and differences in staining with DAPI and CMA3 could not be verified although related to these characteristics. CHAPTER IV: The pequi is a species that is gathered and today is seen as a source for the production of biodiesel. The objective of this study was to identify sequences from a cDNA library that are involved in the metabolic pathways for production of pequi fruit, to gain a better understanding of the species and its biological and genetic properties. To do so, a cDNA library was created and the clones were cloned and sequenced. These identified sequences were deposited in GenBank. Most of the sequences found are associated with protection against oxidative stress in plants, some are transcription factors and others provide structural and pathogenic resistance. / CAPÍTULO II: O pequi, Caryocar brasiliense, é uma das espécies de destaque no bioma do Cerrado devido a sua utilização na culinária, medicina popular, indústria e siderurgia. Apresenta índice de exploração elevado, podendo entrar na lista das espécies ameaçadas de extinção. Na região de São José do Xingu (MT) foi encontrada uma árvore produzindo pequi sem espinho no endocarpo, o que levantou a possibilidade de melhorar o pequi para consumo aproveitando a alta apreciação que já possui. Com o objetivo de analisar as diferenças genômicas entre o pequi com e o sem espinho no endocarpo, utilizou-se marcadores RADP (Random Amplified Polymorphism DNA). As bandas polimórficas geradas foram isoladas, clonadas e seqüenciadas, buscando identificar sequências responsáveis pela alteração fenotípica. Observou-se que o pequi sem espinho fica isolado geneticamente das demais populações de pequi com espinho no caroço, comprovando que essa característica está relacionada à divergência genética da espécie. Análises em BLASTn mostraram a similaridade aos genes Dof1 de Zea mays, na população com espinho e com o gene da Acetiltransferase Fosfinotricina de Z. mays, na população sem espinho. As análises em BLASTx revelaram similaridade com as proteínas responsáveis pela Deficiência em Redutase Férrica 4, no pequi sem espinho e com catalase, no pequi com espinho. CAPÍTULO III: O pequizeiro, Cayocar brasiliense Cambess., é uma planta característica do cerrado brasileiro que sofre ação extrativista, principalmente, para a alimentação. É uma planta bastante apreciada em regiões de Minas Gerais, especialmente no Norte desse estado. Na região de São José do Xingu, Mato Grosso, foi encontrada uma planta produzindo pequi sem espinhos no caroço. O estudo citogenético, por meio de coloração convencional de Giemsa, NOR, banda C, DAPI e CMA3 foi utilizado para a comparação entre plantas produtoras de pequi com e sem espinhos no caroço. Verificou-se que essas diferenças não podem ser atribuídas à diferenças cromossômicas entre os dois tipos de pequi. Ambas as plantas têm o mesmo número cromossômico, mesma marcação de NOR. Não foi verificado bandeamento C devido ao tamanho dos cromossomos. Diferenças de coloração com DAPI e CMA3 foram detectadas, porém não é possível afirmar que estejam relacionadas com a presença ou ausência de espinhos no fruto. CAPÍTULO IV: O pequizeiro (Caryocar brasiliense Cambess.) é uma espécie nativa do cerrado brasilieiro e que possui importância alimentar e social para a população que dela depende. É uma espécie que sofre ação extrativista e que, atualmente, é considerada fonte para a produção de biodiesel. Nesse trabalho o objetivo foi identificar, a partir de uma bilbioteca de cDNA, seqüências que estejam envolvidas em vias metabólicas para produção do fruto do pequi, para conhecimento da espécie, suas propriedades biológicas e genéticas. Dessa forma foi construída biblioteca de cDNA e os clones foram clonados e seqüenciados. As sequências identificadas foram depositadas no GenBank. Algumas das sequências encontradas estão relacionadas à proteção contra o estresse oxidativo em plantas, outras são fatores de transcrição e algumas sequências expressas têm funções estruturais e de resistência a patógenos. / Doutor em Genética e Bioquímica