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Dinâmica de marcadores genéticos na região do complexo de histocompatibilidade principal humano em populações do Centro-Oeste do Brasil

Silva, Ana Carolina Arcanjo 28 February 2012 (has links)
Dissertação (Mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2012. / Submitted by Sabrina Silva de Macedo (sabrinamacedo@bce.unb.br) on 2012-06-12T15:30:34Z No. of bitstreams: 1 2012_AnaCarolinaArcanjoSilva.pdf: 25358632 bytes, checksum: 230ef8eeebdc5f8ecac4c74b6c329a72 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-06-12T15:31:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_AnaCarolinaArcanjoSilva.pdf: 25358632 bytes, checksum: 230ef8eeebdc5f8ecac4c74b6c329a72 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-12T15:31:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_AnaCarolinaArcanjoSilva.pdf: 25358632 bytes, checksum: 230ef8eeebdc5f8ecac4c74b6c329a72 (MD5) / Teoricamente, regiões genômicas com grande importância funcional, como genes e regiões regulatórias, são as mais afetadas pela seleção natural. O MHC humano (6p23.1) é uma dessas regiões pois contém a maioria dos genes relacionados à regulação e ação do sistema imune em humanos. Neste trabalho foram escolhidos marcadores genéticos localizados no MHC humano de dois tipos – STRs, que apresentam alta taxa de mutação, e inserções Alu, com baixa taxa de mutação. Foram analisados165 indivíduos de duas populações, uma urbana com alto grau de miscigenação (Brasília, 105 indivíduos) e uma comunidade afroderivada remanescente de quilombo (Kalunga, 60 indivíduos). Estes foram genotipados em relação aos marcadores AluMICB, AluTF, AluHJ AluHG e AluHF (no MHC de Classe I), bem como para os microssatélites TNFa, TNFb, TNFc, TNFd, TNFe (no MHC de Classe III). Os fragmentos foram amplificados por meio de PCR e genotipados em gel de poliacrilamida a 6% (todos os Alu), gel de poliacrilamida desnaturante a 12% (TNFc) e eletroforese capilar em sequenciador automático ABI3130 (TNFa-e). Os dados obtidos foram analisados em três grupos: haplótipos Alu, haplótipos microssatélites e haplótipos contendo todos os 10 marcadores estudados, cujas inferências foram feitas com o algoritmo PHASE. Os marcadores TNFa e TNFd se mostraram fora do Equilíbrio de Hardy-Weinberg em ambas populações estudadas, mesmo após Correção de Bonferroni. Brasília e Kalunga apresentaram déficit global de heterozigotos. Em Kalunga o marcador AluHG apresentou excesso de heterozigotos mesmo sem estar fora do EHW, o que pode indicar ação de mecanismo evolutivo devido à sua proximidade com o gene HLA-G. Mesmo fora do EHW em Kalunga, o marcador TNFd não mostrou déficit ou excesso de heterozigotos, o que também pode indicar atuação de mecanismo evolutivo. Os haplótipos analisados mostraram diferenças de comportamento entre os tipos de marcadores moleculares. Conforme as análises feitas com base nos haplótipos Alu, as populações são similares e apresentam pouca diferenciação populacional, além de compartilharem os haplótipos mais frequentes. Para os haplótipos TNF, entretanto, as populações se mostram moderadamente diferentes e compartilham apenas 21 dos 190 haplótipos possíveis. O Teste de Neutralidade de Ewens-Watterson indicou desvio do esperado em condições de neutralidade para os loci TNFa, TNFb e TNFd isoladamente, mas não indicou desvio da neutralidade para nenhum dos conjuntos haplotípicos estudados. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Genetic markers are used in population genetics to address different questions, like genetic counseling or the understanding of evolutionary mechanisms. Especially, genetic markers located in important genomic regions, such as genes or regulatory sequences, are most commonly affected by natural selection. The human MHC (6p23.1) is a region of great importance due to the presence of genes related to action and regulation of the human immune system, thus, several studies have reported that natural selection might be acting in such region. In this work, two types of genetic markers were selected in the MHC region, one of them being Alu insertions, which have low rates of mutation; and the other being STRs, which have rather high mutation rates. 165 samples from two distinct populations, an urban admixed population (Brasília, 105 samples) and an afro-derived rural population (Kalunga, 60 individuals) were studied for the loci AluMICB, AluTF, AluHJ AluHG e AluHF (Class I MHC) and TNFa, TNFb, TNFc, TNFd, TNFe (Class III MHC). The fragments were amplified by PCR and genotyped in 6% polyacrylamide gel (Alu insertions), 12% denaturing polyacrylamide gel (TNFc) and capillary electrophoresis in an ABI3130 automatic sequencer (TNFa-e). Data were analyzed in three groups: Alu haplotypes, microsatellite haplotypes and haplotypes containing all loci here studied. The haplotypes were inferred with the PHASE algorithm. Both TNFa and TNFd loci departed from Hardy-Weinberg Equilibrium (HWE) in both populations, even after Bonferroni's Correction. Brasília and Kalunga showed global heterozigote deficit. AluHG showed heterozigote excess even in accordance with HWE, which may indicate influence of evolutionary mechanisms due to its proximity to HLA-G gene. Aside being apart of HWE in Kalunga, TNFd locus did not show excess or deficit of heterozigotes. The analyzed haplotypes showed behavioral differences among the two sets of markers. In the analysis based on the Alu haplotypes, both populations are similar and show little populational divergence. For the TNF haplotypes, however, both populations showed moderate differences and share only 21 of the 190 possible haplotypes. The Ewens-Watterson Neutrality test indicated that the TNFa, TNFb and TNFd loci do not behave neutrally when analyzed separately, but did not show departure of neutrality for any of the haplotypes analyzed.
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Padrões ecológicos globais de dois clados de serpentes, Viperidae e Elapidae (Serpentes, Squamata)

Terribile, Levi Carina 02 1900 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2009. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2010-03-30T16:18:31Z No. of bitstreams: 1 2009_LeviCarinaTerribile.pdf: 6485192 bytes, checksum: d3b81bdb8bcb6b131928445f33568b80 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-05-12T17:41:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_LeviCarinaTerribile.pdf: 6485192 bytes, checksum: d3b81bdb8bcb6b131928445f33568b80 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-12T17:41:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_LeviCarinaTerribile.pdf: 6485192 bytes, checksum: d3b81bdb8bcb6b131928445f33568b80 (MD5) Previous issue date: 2009-02 / O estudo dos padrões ecológicos em grandes escalas geográficas é de grande interesse atual para ecólogos e biogeógrafos. Em especial, o gradiente latitudinal de riqueza de espécies e a variação geográfica no tamanho do corpo dos organismos são os dois padrões emergentes que tem recebido bastante ênfase nos últimos anos dentro do programa de pesquisa de macroecologia. O conhecimento efetivo dos padrões de diversidade em grandes escalas e dos processos envolvidos em sua origem e manutenção é vital para estabelecer programas mais eficientes de conservação da biodiversidade. O presente trabalho propõe estudar o padrão global de riqueza e de tamanho corpóreo das espécies de serpentes das famílias Viperidae e Elapidae, além de propor estratégias globais para a conservação da diversidade de espécies de ambas as famílias. Para tanto, foram obtidos dados macroecológicos de extensão de ocorrência e de comprimento total máximo de 228 espécies de Viperidae e 224 espécies de Elapidae. As análises dos fatores ecológicos e evolutivos envolvidos nesses padrões mostraram que as variações geográficas na riqueza e tamanho do corpo de Viperidae são determinadas primeiramente por fatores climáticos contemporâneos, enquanto que para as espécies de Elapidae esses padrões estão mais associados a fatores histórico/evolutivos do grupo. Esses resultados também mostram a importância de se utilizar abordagens desconstrutivas, como é o caso do princípio de desconstrução extrema proposto no presente trabalho, para as análises dos padrões de diversidade. Finalmente, as análises mostraram a existência de estratégias viáveis para a conservação da diversidade de Viperidae e Elapidae em escala global. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The study of ecological patterns in large geographical scales is currently of great interest in ecology and biogeography. Particularly, the latitudinal gradient of species richness and the geographical variation in body size of organisms are the two emerging patterns that have received special attention in recent years within the research program of macroecology. It is clear that an effective knowledge of the processes involved in the origin and maintenance of biodiversity patterns in large scale is important to design efficient strategies for biodiversity conservation. The aim of this study is to evaluate the global pattern of richness and body size of the species of two snake families, Viperidae and Elapidae, and propose conservation strategies for both families. For this, macroecological data of occurrence and maximum total body length were obtained for 228 species of Viperidae and 224 species of Elapidae. The evaluation of the ecological and evolutionary factors involved in these patterns showed that geographical variations in richness and body size of Viperidae are mainly determined by contemporary climate, while for Elapidae these patterns are more related to the evolutionary history of this group. These results also showed the importance of using deconstructive approaches, such as the "principle of extreme deconstruction" proposed in this study for the analysis of diversity patterns. Finally, the analyses of conservation priorities indicated the existence of viable conservation opportunities to preserve Viperidae and Elapidae diversity in global scale.
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Biologia termal das tartarugas Trachemys dorbigni (Duméril & Bibron, 1835) e Trachemys scripta elegans (Wied, 1839) dos lagos de Porto Alegre, RS, Brasil (Testudines, Emydidae)

Rocha, Daniel Franco Netto de Borba January 2005 (has links)
Nos lagos artificiais dos parques de Porto Alegre, pode-se observar um número muito grande de tartarugas, tanto a nativa Trachemys dorbigni quanto a norte-americana Trachemys scripta elegans estando abundantemente presentes nos mesmos. Este trabalho realizou-se nos lagos do Parque Moinhos de Vento e Jardim Botânico com o objetivo de se obter dados a respeito do comportamento de assoalhamento, interações agressivas realizadas durante esta atividade e biologia termal desses quelônios. Nessas coletas, os exemplares foram marcados, suas temperaturas cloacais registradas e dados morfométricos foram medidos. Realizou-se amostragens no período de setembro de 2003 a outubro de 2004, com coletas de dados para comportamento de assoalhamento e biologia termal ocorrendo quinzenalmente em ambos lagos. As amostragens a respeito das interações agressivas ocorreram durante quatro dias por estação do ano somente no Parque Moinhos de Vento. O padrão de comportamento de assoalhamento encontrado para ambas as espécies foi basicamente do tipo unimodal simétrico para os dois locais de coleta, sendo T. scripta elegans a espécie que ocupou previamente os locais disponíveis para esta atividade. As temperaturas corpóreas de ambas espécies coletadas dentro d’água, foram altamente relacionadas com a temperatura da água, enquanto indivíduos coletados em assoalhamento, apresentaram temperaturas cloacais mais relacionadas com as temperaturas do substrato que estava sendo utilizado, do que com as temperaturas do ar. Foi obtida uma taxa de 2,3 interações agressivas por hora observada, considerando-se esta atividade como bastante freqüente entre as espécies observadas. T. scripta elegans demonstrou-se mais agressiva que T. dorbigni causando, assim, uma interferência no comportamento de assoalhamento da mesma, e apresentando um perfil muito semelhante às características termorregulatórias que possui em seu hábitat natural.
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Biologia e conservação de quelônios no Delta do Rio Jacuí - RS : aspectos da história natural de espécies em ambientes alterados pelo homem

Bujes, Clovis de Souza January 2008 (has links)
O conhecimento que temos sobre a história natural de quelônios ocorrentes no Brasil, e principalmente no estado do Rio Grande do Sul, é ainda rudimentar. As principais causas dessa carência de informações na literatura são atribuídas à dificuldade de obtenção de dados de animais na natureza. As ações humanas colocaram em risco várias populações de quelônios e sua biodiversidade tem declinado por todo o mundo. Desta forma, este estudo busca informações básicas acerca da historia natural de populações sinantrópicas, investigando alguns aspectos da história natural de uma comunidade de quelônios que ocorre no Parque Estadual Delta do Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. O trabalho foi executado entre abril de 2003 e dezembro de 2006 em três pontos amostrais distintos no interior do Parque: Ilha da Pintada, Fazenda Kramm e Ilha das Flores. Os animais foram capturados manualmente e com armadilhas iscadas. Todo o animal capturado foi identificado como espécie, teve o sexo determinado a partir dos caracteres sexuais secundários e recebeu um número individual de identificação. Os espécimes foram pesados e medidos em comprimento (CC) e largura (LC) da carapaça, em comprimento (CP) e largura (LP) do plastrão, em altura do casco (AC), em comprimento da sutura médio ventral (CSMV), em largura cefálica (LCF) e o comprimento da cauda foi registrado em duas porções: distância da cloaca em relação à margem do plastrão (CD1) e comprimento total (CD2). A dieta dos animais foi analisada através do exame do conteúdo fecal, o qual foi obtido após manter os espécimes capturados confinados em baldes com água por cerca de 24 horas. A temperatura a que foram expostos os ovos durante a incubação, em condições naturais, foi monitorada a intervalos de três horas por um período de vinte e quatro horas mensalmente, durante os cinco primeiros meses de incubação. Cerca de 40% dos ovos retirados destes ninhos foram incubados em condições artificiais. Assim, foram comparados os gradientes de temperatura em ambas condições, bem como o período de incubação e o comportamento de eclosão e emergência dos filhotes. Durante este estudo, no Delta do Jacuí, foram registrados a tartarugatigre- d’água Trachemys dorbigni (66% das capturas), o cágado-preto Acanthochelys spixii (8%), o cágado-de-pescoço-de-cobra Hydromedusa tectifera (5%) e o cágado-cinza Phrynops hilarii (21%). Estas espécies ocuparam diferentes tipos de hábitats, tais como, banhados, canais, sacos, rios, canais de irrigação, quadras de arroz, poças e cavas. A destruição e a fragmentação do hábitat, a poluição e a desinformação humana foram as principais ameaças aos quelônios no Parque. As primeiras observações sobre a variação no padrão de escutelação em T. dorbigni, descritas nesta tese, revelaram que 7,7 % dos machos, 10,52% das fêmeas, 14,28% dos imaturos e 6,52% dos filhotes eram portadores de algum tipo de anomalia no casco, bem como apresentaram escudos epidérmicos supernumerários. A associação de diferentes fatores ambientais, interagindo sobre o desenvolvimento embrionário dos indivíduos, parece ser a responsável pela alteração do padrão de escutelação nesta espécie. O exame do conteúdo fecal demonstrou que parte da dieta de T. dorbigni foi composta de gastrópodes nativos (familia Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) e material vegetal (Poaceae, Angiospermae), além da presença de areia e material sintético. Estes resultados culminaram com uma informação inédita na literatura, qual seja, a predação de T. dorbigni sobre o mexilhão-dourado (Limnoperma fortunei). Este fato demonstra a importância do estudo deste quelônio como potencial controlador biológico do mexilhãodourado, uma espécie introduzida no delta. Outra informação importante e, também, original foi o primeiro registro de ocorrência da tartaruga-americana Trachemys scripta elegans, em ambientes ocupados pela espécie nativa T. dorbigni, no Parque Estadual Delta do Jacuí. Durante o estudo de alguns parâmetros populacionais de Trachemys dorbigni foram capturados 137 exemplares (30 machos, 93 fêmeas e 14 jovens), com taxa de recaptura relativamente baixa (5,1%). O período de atividade destes quelônios foi registrado entre os meses de agosto e abril. A densidade dos indivíduos residentes nas três áreas de coleta foi de 19.0, 7.3 e 4.0 tartarugas/ha e a biomassa, respectiva, foi de 62,2 Kg (20,73 Kg/ha), 49,94 Kg (8,32 Kg/ha) e 44,64 (4,96 Kg/ha). Não foram encontradas diferenças morfométricas significativas entre os espécimes coletados nas três áreas. A razão sexual foi igual a 1:1 e a distribuição de classes de tamanho revelou que a população era marcadamente composta por adultos (89,78%). Os ninhos construídos pelas fêmeas de Phrynops hilarii são constituídos de abertura, pescoço e câmara de incubação com dimensões médias de 143 por 126 mm. Os ovos (N = 78), oriundos de seis ninhos, foram caracterizados como esféricos, 34 x 32 mm (grau de esfericidade = 0,9561), brancos, de casca calcária e com peso médio de 21,47 g. Destes, 50 foram monitorados em condições naturais e 28, em condições artificiais. O período de incubação variou de 157 a 271 dias, em condições naturais, e de 130 a 191 dias, em condições artificiais e o sucesso de eclosão foi de 42,86 a 75% e 50 a 100% nas respectivas condições. A temperatura média no interior dos ninhos oscilou de 24,17 a 27,27°C, e foram similares às temperaturas médias do substrato, que variaram de 24,62 a 27,05°C e às médias do ar que oscilaram de 23,4 a 25,27 °C, enquanto que a temperatura média em condições artificiais foi de 22,18°C. Os filhotes eclodidos em condições artificiais foram significativamente maiores do que aqueles eclodidos em condições naturais. Os resultados obtidos neste estudo, além de revelar similaridades com outras espécies de quelônios, servirão como suporte para futuras estratégias de conservação dos hábitats e das espécies ocorrentes no Rio Grande do Sul. / The knowledge we have about the natural history of chelonians occurring in Brazil, especially in Rio Grande do Sul state, is very limited. This lack of information is probably due to the difficulty of data collection from nature. Human actions jeopardize several chelonian populations and their biodiversity has been decreasing over the world. Thus, the present study focuses on basic information about natural history of synantropic populations; investigating some aspects of natural history of a chelonian community that occurs in the Delta do Jacuí State Park, Rio Grande do Sul state, Brazil. The present work was carried out between April 2003 and December 2006 in three distinct sampling stations inside the Park: Pintada Island, Kramm Farm, and Flores Island. The animals were captured manually or by baited traps. All animals captured were identified to species level, were categorized in males or females according to secondary sexual characters, and received an individual identification number. All specimens were weighed and the following measurements were taken: length (CL) and width (CW) of carapace, length (PL) and width (PW) of plastron, height of the shell (HS), length of the medium ventral suture (MVSL), head width (HW), and length of the tail recorded as the distance from the cloacae relative to the border of the plastron (TL1) and as total length (TL2). The diet of the animals was analyzed by examining fecal contents which was collected from captured animals kept in a bucket filled with water for a period of 24 hours. The ambient temperature, in which the eggs were incubated, in natural conditions, was monitored monthly every three hours for a period of 24 hours, in the first five months of incubation. About 40% of the eggs removed from these nests were incubated in artificial conditions. Thus, temperature gradients were compared in both conditions, as well as incubation period, hatching behavior and emergence of the juveniles. During the present study, the following chelonian species were found in the Delta do Jacuí State Park: Orbigni’s slider Trachemys dorbigni (66% of total captures), spiny necked turtle Acanthochelys spixii (8%), South American snake necked turtle Hydromedusa tectifera (5%) e o Hilaire’s side-necked turtle Phrynops hilarii (21%). These species occupied different types of habitats, such as marshes, canals, ponds, rivers, irrigation channels, rice fields, puddles, and cavas (artificial pool). Habitat destruction and fragmentation, pollution, and human action were the main threats to the chelonians in the Park. First observations about the variations in the pattern of scute formation in T. dorbigni, presented here, revealed that 7.7 % of males, 10.52% of females, 14.28% of immatures, and 6.52% of the juveniles carried a type of anomaly in the shell, as well as presented supernumerary epidermal shields. The combination of several environmental factors, acting on the embryonic development of the individuals might be responsible for the modification of the pattern of scute formation in this species. Analyses of fecal contents showed that part of the diet of T. dorbigni was composed by native gastropods (family Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) and plant material (Poaceae, Angiospermae). Also, sand and synthetic material was found in the feces. These results are novel since they indicate predation of T. dorbigni on golden mussel (Limnoperma fortunei), demonstrating the relevance of studying this chelonian as potential biological control for the golden mussel, an introduced species in the delta. Another new and important finding was the occurrence of the American turtle Trachemys scripta elegans, in environments occupied by the native species T. dorbigni, in the Delta do Jacuí State Park. During the study of some population parameters of Trachemys dorbigni a total of 137 specimens was captured (30 males, 93 females, and 14 juveniles), with a relatively low recapture rate (5.1%). The period of activity of these chelonians was recorded between August and April. The density of residents in the three sampling areas was 19.0, 7.3, and 4.0 turtles/ha and the respective biomass was 62.2 Kg (20.73 Kg/ha), 49.94 Kg (8.32 Kg/ha), and 44.64 (4.96 Kg/ha). No significant morphometric differences were found among specimens collected in the three sampling areas. Sexual ratio was 1:1 and the distribution of size classes revealed that the population was markedly composed by adults (89.78%). Nests constructed by females of Phrynops hilarii had an apperture, a neck, and an incubation chamber with mean dimensions of 143 by 126 mm. The eggs (N = 78), collected from six nests, were characterized as spherical, 34 x 32 mm (spherical degree = 0,9561), white, with a calcareous shell and a mean weight of 21.47 g. A total of 50 eggs were monitored in natural conditions, while 28 were kept in artificial conditions. The incubation period varied between 157 and 271 days, in natural conditions, and from 130 to 191 days, in artificial conditions. Hatching success ranged from 42,86 a 75% and from 50 to 100% in the respective conditions. Mean temperature inside the nests varied between 24.17 and 27.27°C, was similar to the substrate mean temperatures that ranged between 24.62 and 27.05°C, and to the air mean temperatures that oscillated between 23.4 and 25.27 °C. Mean temperature in artificial conditions was 22.18°C. Juveniles hatched in artificial conditions were significantly larger than those coming from natural conditions. In addition to reveal some similarities with other chelonian species, the results presented in this study may be used as a model for future conservation strategies for habitats and species occurring in Rio Grande do Sul state.
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Biologia e conservação de quelônios no Delta do Rio Jacuí - RS : aspectos da história natural de espécies em ambientes alterados pelo homem

Bujes, Clovis de Souza January 2008 (has links)
O conhecimento que temos sobre a história natural de quelônios ocorrentes no Brasil, e principalmente no estado do Rio Grande do Sul, é ainda rudimentar. As principais causas dessa carência de informações na literatura são atribuídas à dificuldade de obtenção de dados de animais na natureza. As ações humanas colocaram em risco várias populações de quelônios e sua biodiversidade tem declinado por todo o mundo. Desta forma, este estudo busca informações básicas acerca da historia natural de populações sinantrópicas, investigando alguns aspectos da história natural de uma comunidade de quelônios que ocorre no Parque Estadual Delta do Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. O trabalho foi executado entre abril de 2003 e dezembro de 2006 em três pontos amostrais distintos no interior do Parque: Ilha da Pintada, Fazenda Kramm e Ilha das Flores. Os animais foram capturados manualmente e com armadilhas iscadas. Todo o animal capturado foi identificado como espécie, teve o sexo determinado a partir dos caracteres sexuais secundários e recebeu um número individual de identificação. Os espécimes foram pesados e medidos em comprimento (CC) e largura (LC) da carapaça, em comprimento (CP) e largura (LP) do plastrão, em altura do casco (AC), em comprimento da sutura médio ventral (CSMV), em largura cefálica (LCF) e o comprimento da cauda foi registrado em duas porções: distância da cloaca em relação à margem do plastrão (CD1) e comprimento total (CD2). A dieta dos animais foi analisada através do exame do conteúdo fecal, o qual foi obtido após manter os espécimes capturados confinados em baldes com água por cerca de 24 horas. A temperatura a que foram expostos os ovos durante a incubação, em condições naturais, foi monitorada a intervalos de três horas por um período de vinte e quatro horas mensalmente, durante os cinco primeiros meses de incubação. Cerca de 40% dos ovos retirados destes ninhos foram incubados em condições artificiais. Assim, foram comparados os gradientes de temperatura em ambas condições, bem como o período de incubação e o comportamento de eclosão e emergência dos filhotes. Durante este estudo, no Delta do Jacuí, foram registrados a tartarugatigre- d’água Trachemys dorbigni (66% das capturas), o cágado-preto Acanthochelys spixii (8%), o cágado-de-pescoço-de-cobra Hydromedusa tectifera (5%) e o cágado-cinza Phrynops hilarii (21%). Estas espécies ocuparam diferentes tipos de hábitats, tais como, banhados, canais, sacos, rios, canais de irrigação, quadras de arroz, poças e cavas. A destruição e a fragmentação do hábitat, a poluição e a desinformação humana foram as principais ameaças aos quelônios no Parque. As primeiras observações sobre a variação no padrão de escutelação em T. dorbigni, descritas nesta tese, revelaram que 7,7 % dos machos, 10,52% das fêmeas, 14,28% dos imaturos e 6,52% dos filhotes eram portadores de algum tipo de anomalia no casco, bem como apresentaram escudos epidérmicos supernumerários. A associação de diferentes fatores ambientais, interagindo sobre o desenvolvimento embrionário dos indivíduos, parece ser a responsável pela alteração do padrão de escutelação nesta espécie. O exame do conteúdo fecal demonstrou que parte da dieta de T. dorbigni foi composta de gastrópodes nativos (familia Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) e material vegetal (Poaceae, Angiospermae), além da presença de areia e material sintético. Estes resultados culminaram com uma informação inédita na literatura, qual seja, a predação de T. dorbigni sobre o mexilhão-dourado (Limnoperma fortunei). Este fato demonstra a importância do estudo deste quelônio como potencial controlador biológico do mexilhãodourado, uma espécie introduzida no delta. Outra informação importante e, também, original foi o primeiro registro de ocorrência da tartaruga-americana Trachemys scripta elegans, em ambientes ocupados pela espécie nativa T. dorbigni, no Parque Estadual Delta do Jacuí. Durante o estudo de alguns parâmetros populacionais de Trachemys dorbigni foram capturados 137 exemplares (30 machos, 93 fêmeas e 14 jovens), com taxa de recaptura relativamente baixa (5,1%). O período de atividade destes quelônios foi registrado entre os meses de agosto e abril. A densidade dos indivíduos residentes nas três áreas de coleta foi de 19.0, 7.3 e 4.0 tartarugas/ha e a biomassa, respectiva, foi de 62,2 Kg (20,73 Kg/ha), 49,94 Kg (8,32 Kg/ha) e 44,64 (4,96 Kg/ha). Não foram encontradas diferenças morfométricas significativas entre os espécimes coletados nas três áreas. A razão sexual foi igual a 1:1 e a distribuição de classes de tamanho revelou que a população era marcadamente composta por adultos (89,78%). Os ninhos construídos pelas fêmeas de Phrynops hilarii são constituídos de abertura, pescoço e câmara de incubação com dimensões médias de 143 por 126 mm. Os ovos (N = 78), oriundos de seis ninhos, foram caracterizados como esféricos, 34 x 32 mm (grau de esfericidade = 0,9561), brancos, de casca calcária e com peso médio de 21,47 g. Destes, 50 foram monitorados em condições naturais e 28, em condições artificiais. O período de incubação variou de 157 a 271 dias, em condições naturais, e de 130 a 191 dias, em condições artificiais e o sucesso de eclosão foi de 42,86 a 75% e 50 a 100% nas respectivas condições. A temperatura média no interior dos ninhos oscilou de 24,17 a 27,27°C, e foram similares às temperaturas médias do substrato, que variaram de 24,62 a 27,05°C e às médias do ar que oscilaram de 23,4 a 25,27 °C, enquanto que a temperatura média em condições artificiais foi de 22,18°C. Os filhotes eclodidos em condições artificiais foram significativamente maiores do que aqueles eclodidos em condições naturais. Os resultados obtidos neste estudo, além de revelar similaridades com outras espécies de quelônios, servirão como suporte para futuras estratégias de conservação dos hábitats e das espécies ocorrentes no Rio Grande do Sul. / The knowledge we have about the natural history of chelonians occurring in Brazil, especially in Rio Grande do Sul state, is very limited. This lack of information is probably due to the difficulty of data collection from nature. Human actions jeopardize several chelonian populations and their biodiversity has been decreasing over the world. Thus, the present study focuses on basic information about natural history of synantropic populations; investigating some aspects of natural history of a chelonian community that occurs in the Delta do Jacuí State Park, Rio Grande do Sul state, Brazil. The present work was carried out between April 2003 and December 2006 in three distinct sampling stations inside the Park: Pintada Island, Kramm Farm, and Flores Island. The animals were captured manually or by baited traps. All animals captured were identified to species level, were categorized in males or females according to secondary sexual characters, and received an individual identification number. All specimens were weighed and the following measurements were taken: length (CL) and width (CW) of carapace, length (PL) and width (PW) of plastron, height of the shell (HS), length of the medium ventral suture (MVSL), head width (HW), and length of the tail recorded as the distance from the cloacae relative to the border of the plastron (TL1) and as total length (TL2). The diet of the animals was analyzed by examining fecal contents which was collected from captured animals kept in a bucket filled with water for a period of 24 hours. The ambient temperature, in which the eggs were incubated, in natural conditions, was monitored monthly every three hours for a period of 24 hours, in the first five months of incubation. About 40% of the eggs removed from these nests were incubated in artificial conditions. Thus, temperature gradients were compared in both conditions, as well as incubation period, hatching behavior and emergence of the juveniles. During the present study, the following chelonian species were found in the Delta do Jacuí State Park: Orbigni’s slider Trachemys dorbigni (66% of total captures), spiny necked turtle Acanthochelys spixii (8%), South American snake necked turtle Hydromedusa tectifera (5%) e o Hilaire’s side-necked turtle Phrynops hilarii (21%). These species occupied different types of habitats, such as marshes, canals, ponds, rivers, irrigation channels, rice fields, puddles, and cavas (artificial pool). Habitat destruction and fragmentation, pollution, and human action were the main threats to the chelonians in the Park. First observations about the variations in the pattern of scute formation in T. dorbigni, presented here, revealed that 7.7 % of males, 10.52% of females, 14.28% of immatures, and 6.52% of the juveniles carried a type of anomaly in the shell, as well as presented supernumerary epidermal shields. The combination of several environmental factors, acting on the embryonic development of the individuals might be responsible for the modification of the pattern of scute formation in this species. Analyses of fecal contents showed that part of the diet of T. dorbigni was composed by native gastropods (family Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) and plant material (Poaceae, Angiospermae). Also, sand and synthetic material was found in the feces. These results are novel since they indicate predation of T. dorbigni on golden mussel (Limnoperma fortunei), demonstrating the relevance of studying this chelonian as potential biological control for the golden mussel, an introduced species in the delta. Another new and important finding was the occurrence of the American turtle Trachemys scripta elegans, in environments occupied by the native species T. dorbigni, in the Delta do Jacuí State Park. During the study of some population parameters of Trachemys dorbigni a total of 137 specimens was captured (30 males, 93 females, and 14 juveniles), with a relatively low recapture rate (5.1%). The period of activity of these chelonians was recorded between August and April. The density of residents in the three sampling areas was 19.0, 7.3, and 4.0 turtles/ha and the respective biomass was 62.2 Kg (20.73 Kg/ha), 49.94 Kg (8.32 Kg/ha), and 44.64 (4.96 Kg/ha). No significant morphometric differences were found among specimens collected in the three sampling areas. Sexual ratio was 1:1 and the distribution of size classes revealed that the population was markedly composed by adults (89.78%). Nests constructed by females of Phrynops hilarii had an apperture, a neck, and an incubation chamber with mean dimensions of 143 by 126 mm. The eggs (N = 78), collected from six nests, were characterized as spherical, 34 x 32 mm (spherical degree = 0,9561), white, with a calcareous shell and a mean weight of 21.47 g. A total of 50 eggs were monitored in natural conditions, while 28 were kept in artificial conditions. The incubation period varied between 157 and 271 days, in natural conditions, and from 130 to 191 days, in artificial conditions. Hatching success ranged from 42,86 a 75% and from 50 to 100% in the respective conditions. Mean temperature inside the nests varied between 24.17 and 27.27°C, was similar to the substrate mean temperatures that ranged between 24.62 and 27.05°C, and to the air mean temperatures that oscillated between 23.4 and 25.27 °C. Mean temperature in artificial conditions was 22.18°C. Juveniles hatched in artificial conditions were significantly larger than those coming from natural conditions. In addition to reveal some similarities with other chelonian species, the results presented in this study may be used as a model for future conservation strategies for habitats and species occurring in Rio Grande do Sul state.
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Biologia termal das tartarugas Trachemys dorbigni (Duméril & Bibron, 1835) e Trachemys scripta elegans (Wied, 1839) dos lagos de Porto Alegre, RS, Brasil (Testudines, Emydidae)

Rocha, Daniel Franco Netto de Borba January 2005 (has links)
Nos lagos artificiais dos parques de Porto Alegre, pode-se observar um número muito grande de tartarugas, tanto a nativa Trachemys dorbigni quanto a norte-americana Trachemys scripta elegans estando abundantemente presentes nos mesmos. Este trabalho realizou-se nos lagos do Parque Moinhos de Vento e Jardim Botânico com o objetivo de se obter dados a respeito do comportamento de assoalhamento, interações agressivas realizadas durante esta atividade e biologia termal desses quelônios. Nessas coletas, os exemplares foram marcados, suas temperaturas cloacais registradas e dados morfométricos foram medidos. Realizou-se amostragens no período de setembro de 2003 a outubro de 2004, com coletas de dados para comportamento de assoalhamento e biologia termal ocorrendo quinzenalmente em ambos lagos. As amostragens a respeito das interações agressivas ocorreram durante quatro dias por estação do ano somente no Parque Moinhos de Vento. O padrão de comportamento de assoalhamento encontrado para ambas as espécies foi basicamente do tipo unimodal simétrico para os dois locais de coleta, sendo T. scripta elegans a espécie que ocupou previamente os locais disponíveis para esta atividade. As temperaturas corpóreas de ambas espécies coletadas dentro d’água, foram altamente relacionadas com a temperatura da água, enquanto indivíduos coletados em assoalhamento, apresentaram temperaturas cloacais mais relacionadas com as temperaturas do substrato que estava sendo utilizado, do que com as temperaturas do ar. Foi obtida uma taxa de 2,3 interações agressivas por hora observada, considerando-se esta atividade como bastante freqüente entre as espécies observadas. T. scripta elegans demonstrou-se mais agressiva que T. dorbigni causando, assim, uma interferência no comportamento de assoalhamento da mesma, e apresentando um perfil muito semelhante às características termorregulatórias que possui em seu hábitat natural.
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Demografia de Acanthochelys spixii (Duméril e Bibron, 1835) (Testudines, Chelidae) no cerrado do Distrito Federal

Fraxe Neto, Habib Jorge January 2009 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2009. / Submitted by Allan Wanick Motta (allan_wanick@hotmail.com) on 2010-05-21T18:05:57Z No. of bitstreams: 1 2009_HabibJorgeFraxeNeto.pdf: 206744 bytes, checksum: 43f492859387d7814bd4f48fd9b47f3e (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-05-24T19:38:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_HabibJorgeFraxeNeto.pdf: 206744 bytes, checksum: 43f492859387d7814bd4f48fd9b47f3e (MD5) / Made available in DSpace on 2010-05-24T19:38:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_HabibJorgeFraxeNeto.pdf: 206744 bytes, checksum: 43f492859387d7814bd4f48fd9b47f3e (MD5) Previous issue date: 2009 / Quelônios de água doce atualmente estão sujeitos a uma crise global de sobrevivência e, ainda que seja fundamental desenvolver estudos que subsidiem estratégias de manejo e conservação, as espécies que habitam o Cerrado não têm sido objeto de investigações sobre demografia. O presente estudo estima parâmetros demográficos para Acanthochelys spixii, em uma área de Cerrado do Distrito Federal, com base em modelos de captura e recaptura ao longo de quatro anos, avaliando-se os efeitos de sexo, variação temporal e fatores climáticos sobre a dinâmica populacional. A razão sexual não diferiu significativamente de 1:1. Com base no Critério de Informação de Akaike (AIC), a seleção de modelos candidatos com restrição a partir de variáveis climáticas evidenciou que a interação entre precipitação total e temperatura média do ar no mês anterior, assim como a associação da probabilidade de recaptura (p) a uma base mensal, explicam a quase totalidade da variação nas estimativas, obtendo-se para sobrevivência anual aparente (Φ) um valor constante de 0,814. Taxas de recaptura variaram ao longo do tempo entre 0,01 a 0,19 e, na estação seca, entre 0,01 a 0,04. A média mensal do tamanho populacional foi de 28 indivíduos, com valores entre 9 e 31 cágados adultos. Taxas anuais de crescimento populacional resultaram em 0,907 para 2006-2007 e 0,653 para 2007-2008. Considerando os parâmetros estimados e a pressão antrópica exercida sobre essa unidade de conservação, avalia-se a importância do Parque Nacional de Brasília para a conservação da herpetofauna na savana brasileira. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Freshwater turtles are under a global survival crisis and, although the development of studies to support conservation strategies is crucial, the species that inhabit the Cerrado biome have not been object of demography investigations. The present study estimates demographic parameters for Acanthochelys spixii, in the Cerrado of Distrito Federal,– using capture-recapture models along 4 years of data collection, and by analyzing the effects of sex, temporal variation and climatic factors on population dynamics. Sex ratio did not vary significantly from 1:1. Under Akaike´s Information Criteria (AIC), selection of candidate models constrained for climatic variables indicated that the interaction between total rainfall and average air temperature from the previous month, as well as the association of recapture probability (p) in a monthly basis, explain the estimates variation, with a constant annual apparent survival (Φ) value of 0.814. Recapture rates along the study period varied from 0.01 to 0.19 and, during the dry season, from 0.01 to 0.04. Monthly average population size was 28 adult turtles, with values between 9 and 31 adults along the 4 years. Annual population growth rates were 0.907 for the 2006-2007 time interval and 0.653 for 2007-2008. Considering the estimated parameters and the anthropic pressure on this protected area, the study evaluates the importance of Parque Nacional de Brasília for herpetofauna´s biodiversity conservation in the Brazilian savanna.
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Biologia termal das tartarugas Trachemys dorbigni (Duméril & Bibron, 1835) e Trachemys scripta elegans (Wied, 1839) dos lagos de Porto Alegre, RS, Brasil (Testudines, Emydidae)

Rocha, Daniel Franco Netto de Borba January 2005 (has links)
Nos lagos artificiais dos parques de Porto Alegre, pode-se observar um número muito grande de tartarugas, tanto a nativa Trachemys dorbigni quanto a norte-americana Trachemys scripta elegans estando abundantemente presentes nos mesmos. Este trabalho realizou-se nos lagos do Parque Moinhos de Vento e Jardim Botânico com o objetivo de se obter dados a respeito do comportamento de assoalhamento, interações agressivas realizadas durante esta atividade e biologia termal desses quelônios. Nessas coletas, os exemplares foram marcados, suas temperaturas cloacais registradas e dados morfométricos foram medidos. Realizou-se amostragens no período de setembro de 2003 a outubro de 2004, com coletas de dados para comportamento de assoalhamento e biologia termal ocorrendo quinzenalmente em ambos lagos. As amostragens a respeito das interações agressivas ocorreram durante quatro dias por estação do ano somente no Parque Moinhos de Vento. O padrão de comportamento de assoalhamento encontrado para ambas as espécies foi basicamente do tipo unimodal simétrico para os dois locais de coleta, sendo T. scripta elegans a espécie que ocupou previamente os locais disponíveis para esta atividade. As temperaturas corpóreas de ambas espécies coletadas dentro d’água, foram altamente relacionadas com a temperatura da água, enquanto indivíduos coletados em assoalhamento, apresentaram temperaturas cloacais mais relacionadas com as temperaturas do substrato que estava sendo utilizado, do que com as temperaturas do ar. Foi obtida uma taxa de 2,3 interações agressivas por hora observada, considerando-se esta atividade como bastante freqüente entre as espécies observadas. T. scripta elegans demonstrou-se mais agressiva que T. dorbigni causando, assim, uma interferência no comportamento de assoalhamento da mesma, e apresentando um perfil muito semelhante às características termorregulatórias que possui em seu hábitat natural.
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Biologia e conservação de quelônios no Delta do Rio Jacuí - RS : aspectos da história natural de espécies em ambientes alterados pelo homem

Bujes, Clovis de Souza January 2008 (has links)
O conhecimento que temos sobre a história natural de quelônios ocorrentes no Brasil, e principalmente no estado do Rio Grande do Sul, é ainda rudimentar. As principais causas dessa carência de informações na literatura são atribuídas à dificuldade de obtenção de dados de animais na natureza. As ações humanas colocaram em risco várias populações de quelônios e sua biodiversidade tem declinado por todo o mundo. Desta forma, este estudo busca informações básicas acerca da historia natural de populações sinantrópicas, investigando alguns aspectos da história natural de uma comunidade de quelônios que ocorre no Parque Estadual Delta do Jacuí, Rio Grande do Sul, Brasil. O trabalho foi executado entre abril de 2003 e dezembro de 2006 em três pontos amostrais distintos no interior do Parque: Ilha da Pintada, Fazenda Kramm e Ilha das Flores. Os animais foram capturados manualmente e com armadilhas iscadas. Todo o animal capturado foi identificado como espécie, teve o sexo determinado a partir dos caracteres sexuais secundários e recebeu um número individual de identificação. Os espécimes foram pesados e medidos em comprimento (CC) e largura (LC) da carapaça, em comprimento (CP) e largura (LP) do plastrão, em altura do casco (AC), em comprimento da sutura médio ventral (CSMV), em largura cefálica (LCF) e o comprimento da cauda foi registrado em duas porções: distância da cloaca em relação à margem do plastrão (CD1) e comprimento total (CD2). A dieta dos animais foi analisada através do exame do conteúdo fecal, o qual foi obtido após manter os espécimes capturados confinados em baldes com água por cerca de 24 horas. A temperatura a que foram expostos os ovos durante a incubação, em condições naturais, foi monitorada a intervalos de três horas por um período de vinte e quatro horas mensalmente, durante os cinco primeiros meses de incubação. Cerca de 40% dos ovos retirados destes ninhos foram incubados em condições artificiais. Assim, foram comparados os gradientes de temperatura em ambas condições, bem como o período de incubação e o comportamento de eclosão e emergência dos filhotes. Durante este estudo, no Delta do Jacuí, foram registrados a tartarugatigre- d’água Trachemys dorbigni (66% das capturas), o cágado-preto Acanthochelys spixii (8%), o cágado-de-pescoço-de-cobra Hydromedusa tectifera (5%) e o cágado-cinza Phrynops hilarii (21%). Estas espécies ocuparam diferentes tipos de hábitats, tais como, banhados, canais, sacos, rios, canais de irrigação, quadras de arroz, poças e cavas. A destruição e a fragmentação do hábitat, a poluição e a desinformação humana foram as principais ameaças aos quelônios no Parque. As primeiras observações sobre a variação no padrão de escutelação em T. dorbigni, descritas nesta tese, revelaram que 7,7 % dos machos, 10,52% das fêmeas, 14,28% dos imaturos e 6,52% dos filhotes eram portadores de algum tipo de anomalia no casco, bem como apresentaram escudos epidérmicos supernumerários. A associação de diferentes fatores ambientais, interagindo sobre o desenvolvimento embrionário dos indivíduos, parece ser a responsável pela alteração do padrão de escutelação nesta espécie. O exame do conteúdo fecal demonstrou que parte da dieta de T. dorbigni foi composta de gastrópodes nativos (familia Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) e material vegetal (Poaceae, Angiospermae), além da presença de areia e material sintético. Estes resultados culminaram com uma informação inédita na literatura, qual seja, a predação de T. dorbigni sobre o mexilhão-dourado (Limnoperma fortunei). Este fato demonstra a importância do estudo deste quelônio como potencial controlador biológico do mexilhãodourado, uma espécie introduzida no delta. Outra informação importante e, também, original foi o primeiro registro de ocorrência da tartaruga-americana Trachemys scripta elegans, em ambientes ocupados pela espécie nativa T. dorbigni, no Parque Estadual Delta do Jacuí. Durante o estudo de alguns parâmetros populacionais de Trachemys dorbigni foram capturados 137 exemplares (30 machos, 93 fêmeas e 14 jovens), com taxa de recaptura relativamente baixa (5,1%). O período de atividade destes quelônios foi registrado entre os meses de agosto e abril. A densidade dos indivíduos residentes nas três áreas de coleta foi de 19.0, 7.3 e 4.0 tartarugas/ha e a biomassa, respectiva, foi de 62,2 Kg (20,73 Kg/ha), 49,94 Kg (8,32 Kg/ha) e 44,64 (4,96 Kg/ha). Não foram encontradas diferenças morfométricas significativas entre os espécimes coletados nas três áreas. A razão sexual foi igual a 1:1 e a distribuição de classes de tamanho revelou que a população era marcadamente composta por adultos (89,78%). Os ninhos construídos pelas fêmeas de Phrynops hilarii são constituídos de abertura, pescoço e câmara de incubação com dimensões médias de 143 por 126 mm. Os ovos (N = 78), oriundos de seis ninhos, foram caracterizados como esféricos, 34 x 32 mm (grau de esfericidade = 0,9561), brancos, de casca calcária e com peso médio de 21,47 g. Destes, 50 foram monitorados em condições naturais e 28, em condições artificiais. O período de incubação variou de 157 a 271 dias, em condições naturais, e de 130 a 191 dias, em condições artificiais e o sucesso de eclosão foi de 42,86 a 75% e 50 a 100% nas respectivas condições. A temperatura média no interior dos ninhos oscilou de 24,17 a 27,27°C, e foram similares às temperaturas médias do substrato, que variaram de 24,62 a 27,05°C e às médias do ar que oscilaram de 23,4 a 25,27 °C, enquanto que a temperatura média em condições artificiais foi de 22,18°C. Os filhotes eclodidos em condições artificiais foram significativamente maiores do que aqueles eclodidos em condições naturais. Os resultados obtidos neste estudo, além de revelar similaridades com outras espécies de quelônios, servirão como suporte para futuras estratégias de conservação dos hábitats e das espécies ocorrentes no Rio Grande do Sul. / The knowledge we have about the natural history of chelonians occurring in Brazil, especially in Rio Grande do Sul state, is very limited. This lack of information is probably due to the difficulty of data collection from nature. Human actions jeopardize several chelonian populations and their biodiversity has been decreasing over the world. Thus, the present study focuses on basic information about natural history of synantropic populations; investigating some aspects of natural history of a chelonian community that occurs in the Delta do Jacuí State Park, Rio Grande do Sul state, Brazil. The present work was carried out between April 2003 and December 2006 in three distinct sampling stations inside the Park: Pintada Island, Kramm Farm, and Flores Island. The animals were captured manually or by baited traps. All animals captured were identified to species level, were categorized in males or females according to secondary sexual characters, and received an individual identification number. All specimens were weighed and the following measurements were taken: length (CL) and width (CW) of carapace, length (PL) and width (PW) of plastron, height of the shell (HS), length of the medium ventral suture (MVSL), head width (HW), and length of the tail recorded as the distance from the cloacae relative to the border of the plastron (TL1) and as total length (TL2). The diet of the animals was analyzed by examining fecal contents which was collected from captured animals kept in a bucket filled with water for a period of 24 hours. The ambient temperature, in which the eggs were incubated, in natural conditions, was monitored monthly every three hours for a period of 24 hours, in the first five months of incubation. About 40% of the eggs removed from these nests were incubated in artificial conditions. Thus, temperature gradients were compared in both conditions, as well as incubation period, hatching behavior and emergence of the juveniles. During the present study, the following chelonian species were found in the Delta do Jacuí State Park: Orbigni’s slider Trachemys dorbigni (66% of total captures), spiny necked turtle Acanthochelys spixii (8%), South American snake necked turtle Hydromedusa tectifera (5%) e o Hilaire’s side-necked turtle Phrynops hilarii (21%). These species occupied different types of habitats, such as marshes, canals, ponds, rivers, irrigation channels, rice fields, puddles, and cavas (artificial pool). Habitat destruction and fragmentation, pollution, and human action were the main threats to the chelonians in the Park. First observations about the variations in the pattern of scute formation in T. dorbigni, presented here, revealed that 7.7 % of males, 10.52% of females, 14.28% of immatures, and 6.52% of the juveniles carried a type of anomaly in the shell, as well as presented supernumerary epidermal shields. The combination of several environmental factors, acting on the embryonic development of the individuals might be responsible for the modification of the pattern of scute formation in this species. Analyses of fecal contents showed that part of the diet of T. dorbigni was composed by native gastropods (family Hydrobiidae), Trichodactylus sp. Latreille, 1825 (Crustacea) and plant material (Poaceae, Angiospermae). Also, sand and synthetic material was found in the feces. These results are novel since they indicate predation of T. dorbigni on golden mussel (Limnoperma fortunei), demonstrating the relevance of studying this chelonian as potential biological control for the golden mussel, an introduced species in the delta. Another new and important finding was the occurrence of the American turtle Trachemys scripta elegans, in environments occupied by the native species T. dorbigni, in the Delta do Jacuí State Park. During the study of some population parameters of Trachemys dorbigni a total of 137 specimens was captured (30 males, 93 females, and 14 juveniles), with a relatively low recapture rate (5.1%). The period of activity of these chelonians was recorded between August and April. The density of residents in the three sampling areas was 19.0, 7.3, and 4.0 turtles/ha and the respective biomass was 62.2 Kg (20.73 Kg/ha), 49.94 Kg (8.32 Kg/ha), and 44.64 (4.96 Kg/ha). No significant morphometric differences were found among specimens collected in the three sampling areas. Sexual ratio was 1:1 and the distribution of size classes revealed that the population was markedly composed by adults (89.78%). Nests constructed by females of Phrynops hilarii had an apperture, a neck, and an incubation chamber with mean dimensions of 143 by 126 mm. The eggs (N = 78), collected from six nests, were characterized as spherical, 34 x 32 mm (spherical degree = 0,9561), white, with a calcareous shell and a mean weight of 21.47 g. A total of 50 eggs were monitored in natural conditions, while 28 were kept in artificial conditions. The incubation period varied between 157 and 271 days, in natural conditions, and from 130 to 191 days, in artificial conditions. Hatching success ranged from 42,86 a 75% and from 50 to 100% in the respective conditions. Mean temperature inside the nests varied between 24.17 and 27.27°C, was similar to the substrate mean temperatures that ranged between 24.62 and 27.05°C, and to the air mean temperatures that oscillated between 23.4 and 25.27 °C. Mean temperature in artificial conditions was 22.18°C. Juveniles hatched in artificial conditions were significantly larger than those coming from natural conditions. In addition to reveal some similarities with other chelonian species, the results presented in this study may be used as a model for future conservation strategies for habitats and species occurring in Rio Grande do Sul state.
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Monitoring anaerobic digestion of animal slurry during inhibition and recovery phases

Moset Hernández, Verónica 07 December 2012 (has links)
Esta tesis doctoral se centra en la dinámica de la inhibición y la recuperación del proceso de digestión anaerobia de purines de cerdo para encontrar indicadores, predecir fallos del proceso, minimizar las pérdidas de metano (CH4) y evaluar las mejores prácticas de gestión a nivel de la planta de biogás. Para cumplir con este objetivo, cinco ensayos fueron diseñados y ejecutados. En primer lugar, se diseñó un experimento para controlar los cambios físico-químicos y de emisión de gas de dos tipos de purines envejecidos durante 15 semanas de almacenamiento en condiciones de verano. En segundo lugar, diferentes concentraciones de sulfato (SO42-) fueron evaluadas en digestión anaerobia termofílica de purines de cerdo y vacuno controlando la producción de CH4 y los cambios fisicoquímicos en un ensayo en discontinuo. Así mismo, la degradación anaeróbica de la materia orgánica (MO) y el límite de inhibición de SO42- fueron investigados. En tercer lugar, los efectos de incluir purines de cerdo acidificados con SO42- en un codigestión anaerobia con purines de cerdo convencionales se estudió a dos escalas (a escala laboratorio y a gran escala), donde se evaluó el rendimiento del proceso. Así mismo, los indicadores clave del proceso fueron identificados. En cuarto lugar, una combinación de dos métodos, reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa en tiempo real (qPCR) y microscopía electrónica de barrido cualitativa (SEM) fueron utilizados para evaluar los cambios en la población microbiana de los digestores anaerobios durante la adición de los purines. Finalmente, el rendimiento de CH4, la composición físico-química y la estructura y dinámica de la comunidad microbiológica fueron evaluadas durante la puesta en marcha de la digestión anaerobia de purines de cerdo a escala de laboratorio. Se evaluaron cuatro estrategias de puesta en marcha: inanición y no inanición, seguida de una adición gradual o brusca de los purines. Los resultados presentados en esta tesis doctoral per / Moset Hernández, V. (2012). Monitoring anaerobic digestion of animal slurry during inhibition and recovery phases [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/18069

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