Le Saguenay-Lac-St-Jean est une région isolée géographiquement située à 200 kilomètres au nord-est de la ville de Québec. La fibrose kystique, maladie héréditaire autosomale récessive, atteint une prévalence à la naissance de 1/902 naissances vivantes et un taux de porteurs de 1/15 habitants dans cette région. Les caractéristiques cliniques des 127 patients atteints de fibrose kystique semblent montrer un état général très satisfaisant ce qui pourrait être le résultat d'une la mutation ?F508 au profit de la présence d'autres mutations moins sévères. Une étude de la distribution par mois de naissance ne montre pas de distribution aberrante saisonnière ou mensuelle parmi ces patients. Par contre la distribution spatiale montre des foyers où la prévalence à la naissance est plus élevée. Alors que le coefficient moyen de consanguinité des patients atteints de fibrose kystique est marginalement plus élevé que celui des témoins appariés, le coefficient moyen de parenté est nettement plus élevé. Ces résultats combinés à des facteurs historiques, démographiques et sociaux expliquent cette prévalence à la naissance élevée pour la fibrose kystique dans cette région. De plus, elle est probablement le résultat d'un effet fondateur et d'une dérive génétique pour plusieurs mutations de fibrose kystique.

Différentes études ont mis en lumière des gènes de susceptibilité ou de protection au développement de traits complexes. Pour notre part, l'intérêt s'est concentré sur la lipase lipoprotéique (LPL), où l'impact que provoque une déficience dans ce gène a été clairement démontré sur le développement de maladies cardiovasculaires. Ce projet a pour but de faire l'étude d'association entre quatorze polymorphismes de la LPL et des facteurs de risque cardiovasculaires auprès de 252 travailleurs forestiers de la compagnie Abitibi-Consolidated de Saint-Félicien. Six des variants génotypes avaient une fréquence allélique > 2,5 % et servaient pour les régressions logistiques. Parmi les associations, S447X a été associé avec le risque de présenter de l'obésité abdominale, de l'hyperinsulinémie et de l'hyperglycémie et ce en dépit d'une diminution du risque d'hypertriglycéridémie. Ainsi, cette étude indique l'importance d'analyses supplémentaires afin de mieux comprendre l'implication de la LPL dans les mécanismes qui sous-tendent ces différents facteurs de risque.

L'analyse des données généalogiques est un outil important pour comprendre la répartition du pool génétique d'une population sur un territoire ou pour établir si un trait (maladie ou autre) comporte une composante héréditaire majeure. La mesure des liens de parenté, utilisée dans notre étude, est le coefficient moyen d'apparentement. Il existe peu d'études sur les propriétés statistiques du coefficient d'apparentement dû principalement à la dépendance inhérente et à la complexité de calcul de cette mesure ainsi qu'à l'indisponibilité de bases de données généalogiques fiables. Un test d'hypothèses faisant intervenir le coefficient moyen d'apparentement a été proposé par Hauck et Martin mais ce dernier est basé sur des résultats de normalité asymptotique et il n'est applicable que pour des tailles d'échantillons très grandes. Le premier objectif de la recherche a été d'établir les limites des résultats de normalité asymptotique dont la statistique est le coefficient moyen d'apparentement dans un contexte plus réaliste : une population et des échantillons de tailles relativement petites. Le second objectif a été de construire des algorithmes permettant de calculer un intervalle de confiance et un test d'hypothèses sur cette statistique en utilisant des techniques de simulations spécifiques. Plusieurs méthodes de construction d'intervalles et de tests ont été comparées afin de dégager le meilleur estimateur par intervalle et le meilleur test. Les meilleures méthodes de construction d'intervalles et de tests ont été obtenues à partir des techniques de rééchantillonnage. Elles ont permis d'obtenir d'excellents tests de comparaison. Cependant, les résultats concernant la détermination d'un intervalle de confiance sont mitigés. Il serait intéressant, lors de recherches ultérieures, de se pencher davantage sur ces techniques afin d'optimiser l'estimateur par intervalle. Il n'existait pas de résultats de simulation portant sur les intervalles de confiance et les tests d'hypothèses faisant intervenir le coefficient moyen d'apparentement. Ces résultats sont un premier pas vers une meilleure compréhension des propriétés statistiques du coefficient moyen d'apparentement.

Le gène de 1'apolipoprotéine E qui est polymorphique, est directement impliqué dans la régulation du métabolisme des lipides. La fréquence de ses trois allèles a été mesurée dans plusieurs populations et différentes études ont montré que le polymorphisme de l'apo E exerçait une influence sur les concentrations de lipides, de lipoprotéines et d'apolipoprotéines dans les populations, l'allèle £2 ayant pour effet d'abaisser les niveaux de cholestérol total (Chol) et de cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDLC), tandis que l'allèle £4 exerce un effet contraire. Vu l'importance de cet effet sur les niveaux lipidiques, l'hypothèse a été émise que la variation génétique au sein des apolipoprotéines pouvait être un déterminant majeur du risque de MCV. Dans le but de déterminer les effets du polymorphisme de l'apolipoprotéine E (apo E) sur le profil lipidique de la population du Lac St-Jean-Chibougamau, les phénotypes de l'apo E ainsi que les concentrations plasmatiques de cholestérol total (Chol), de cholestérol associé aux lipoprotéines de faible densité (LDL-C) et de haute densité (HDL-C) et de triglycérides (TG) ont été déterminés chez 435 personnes âgées de 18 à 74 ans. Les fréquences des allèles £2, £3 et £4 dans cette population, ont été estimées à 0.137, 0.749 et 0.1-14, respectivement. Pour les fins de l'analyse, l'échantillon a été subdivisé en trois sous-groupes: les hommes, les femmes pré-ménopausées et les femmes ménopausées. Après ajustement des données pour les effets de l'âge, du poids, de la taille, du ratio taille/hanche (WHR) et de l'indice de masse corporelle (BMI) dans chacun des sous-groupes, l'ANOVA a permis de mettre en évidence des différences significatives entre les groupes phénotypiques Apo E2 (E2/E2 et E3/E2), Apo E3 (E3/E3) et Apo E4 (E4/E3 et E4/E4) pour toutes les variables lipidiques chez les hommes et pour le CHOL et le LDL-C chez les femmes. À la fréquence plus élevée de l'allèle £2 était également associée des concentrations plus élevées de TG chez les hommes et les femmes ménopausées. La subdivision de l'échantillon en 4 districts (Alma, Dolbeau, Roberval et Chibougamau) a révélé des différences dans les fréquences de l'apo E entre les districts, particulièrement au niveau de la fréquence de l'allèle £2. Dans le district de Chibougamau, celle-ci était significativement plus élevée que celle des trois autres districts réunis (Aima, Dolbeau, Roberval). Malgré des différences importantes dans les fréquences des allèles de l'apo E entre les districts, l'analyse de la variance à deux facteurs (Apo E et districts) n'a pas permis de révéler de différence significative dans les concentrations des variables lipidiques entre les districts concernés. A l'exception d'une fréquence plus élevée de l'allèle £2 associée à une augmentation des niveaux de triglycérides, ces résultats sont similaires à ceux observés dans d'autres populations caucasiennes

Cette étude porte sur 177 individus décédés ayant un diagnostic confirmé de dystrophie myotonique (DM). Ces derniers -Lac-Saint-Jean (SLSJ) et/ou de la clinique des maladies neuromusculaires de cette région. L'âge moyen au décès est de 51,3 ans sans différence significative entre les hommes et les femmes. Une progression du nombre de décès en fonction de l'atteinte musculaire est démontrée dans cette étude. L'âge moyen d'apparition des symptômes de la DM a été estimé à 29,8 ans pour 30 individus et la durée moyenne de leur maladie a été de 13,7 ans. Quarante-quatre causes différentes de décès ont été compilées dans cette étude. Regroupées en 9 catégories de mortalité, elles portent principalement sur les causes inconnues de décès (60 cas), les causes pulmonaires (60 cas) et les causes cardiaques (26 cas). Trois municipalités du SLSJ enregistrent une surmortalité des personnes atteintes par rapport à leur population globale; il s'agit entre autres de Chicoutimi et de Jonquière.

Ce mémoire étudie les aspects cliniques, épidémiologiques et génétiques des enfants atteints de la mucolipidose de type II (ML-II) au Saguenay-Lac-Saint-Jean (SLSJ). Le phénotype caractéristique consiste en la présence d'une hypertrophie des gencives, un faciès grossier et/ou vieillot, une altération osseuse et un retard staturo-pondéral. Le décès survient la plupart du temps avant l'âge de 5 ans. Ces signes cliniques ont été retrouvés chez la majorité des enfants du SLSJ. L'incidence estimée de la ML-II au SLSJ s'élève à 1/2.613 naissances et le taux de porteurs à 1/51. La distribution spatiale des malades et des porteurs dans le nord-est du Québec montre une accumulation de cas au SLSJ; la majorité des cas étant nés à Chicoutimi. L'exogamie et l'endogamie ne présentent pas de différence significative entre le groupe malade et les groupes témoins. Le coefficient moyen de consanguinité pour les enfants atteints et dont les parents sont mariés au SLSJ est 2 fois plus élevé que la moyenne des groupes témoins. Il n'a pas de différence entre le coefficient moyen de parenté du groupe cible et la moyenne des coefficients moyens des groupes témoins. La recherche d'un effet fondateur de la ML-II dans le nord-est du Québec a permis d'identifier 34 ancêtres communs dont 33 originaires d'Europe au 17ème siècle, ce qui laisse supposer que le gène de la ML-II a été amené par immigration.

Le syndrome de Zellweger (syndrome cérébro-hépato-rénal) est une maladie autosomale récessive rare. Dans la région du Saguenay-Lac-St-Jean cette maladie a une incidence particulièrement élevée; en effet depuis 1971 huit cas furent répertoriés, ce qui est de quatre à cinq fois supérieur à l'incidence mondiale. Le phénotype rencontré dans cette région est très semblable à celui décrit dans la littérature. La distribution spatiale des lieux d'origine des parents et des enfants a montré qu'ils étaient presque tous originaires de la région. On a calculé le coefficient moyen de consanguinité qui s'est avéré nul pour les patients et les témoins. Le coefficient de parenté par contre est plus élevé pour les cas que pour les témoins ce qui suggère que le gène est fréquent dans cette population. La cystinose est une autre maladie autosomale récessive rare qui a au Saguenay-Lac-St-Jean une incidence dix fois supérieure à l'incidence mondiale. Les signes cliniques associés à la cystinose au Saguenay-Lac-St-Jean sont semblables à ceux décrits dans d'autres populations, à l'exception éventuellement d'une atteinte ophtalmique moins sévère. L'étude de la consanguinité et de la parenté a permis de montrer que le gène est fréquent dans cette population. L'étude de la parenté ainsi que les recherches généalogiques effectuées suggèrent que la présence de cette maladie au Saguenay-Lac-St-Jean est due à un effet fondateur.

Le Service spécialisé en déficience visuelle dessert 457 patients atteints de basse vision. Le centre est unique au Saguenay-Lac-St-Jean?Chibougamau-Chapais. La clientèle qui le fréquente est diversifiée et peut recevoir des services subventionnés à cet endroit. Une centaine de pathologies oculaires différentes et plusieurs pathologies systémiques y sont rencontrées. Plus de 50% des pathologies oculaires rencontrées chez la clientèle âgée de moins de 21 ans sont de causes héréditaires ou congénitales. Les coefficients moyens de consanguinité et d'apparentement calculés grâce à la reconstitution des généalogies donnent des résultats qui, pour certaines pathologies, se démarquent des valeurs moyennes retrouvées au Saguenay-Lac-Saint-Jean. Aucune pathologie oculaire parmi celles étudiées au centre de basse vision n'a une prévalence plus élevée dans la région du Saguenay-Lac-Saint-Jean qu'ailleurs dans la province. La répartition géographique des lieux de résidence des patients montre une certaine disparité pour quelques municipalités.

L'impact de la consanguinité sur la fécondité, la stérilité et la mortalité infantile a été étudié dans 5 mariages entre oncle et nièce (1:2), 251 mariages entre cousins (2:2) et 358 mariages entre cousins et petits-cousins (2:3) célébrés au Saguenay-Lac-Saint-Jean. Trois groupes contrôles appariés aux caractéristiques démographiques et socioéconomiques des couples consanguins ont été créés. Les données nécessaires à l'étude ont été extraites d'un registre informatisé de population. Le degré de stérilité primaire était semblable dans les groupes consanguins et non consanguins. Le nombre moyen d'enfants dans les trois groupes consanguins considérés n'était pas statistiquement différent de celui trouvé dans leurs groupes contrôles respectifs (p > 0,05). Le taux de mortinatalité n'était pas significativement plus élevé parmi les groupes 2:2 et 2:3 par rapport à leurs groupes contrôles respectifs (p>0,05). La mortalité durant la première année de vie était significativement plus élevée dans les deux groupes consanguins (p<0,01) alors que la mortalité entre 1 et 15 ans ne l'était pas (p>0,05). Moins de 1% de la mortalité avant l'âge de 15 ans excluant les avortements spontanés, pouvait être attribué aux mariages consanguins. Ces résultats sont comparables à ceux obtenus dans presque toutes les études publiées à ce jour dans diverses populations.

La polyneuropathie sensitivo-motrice avec ou sans agénésie du corps calleux est une maladie autosomale à transmission récessive. Dans la littérature scientifique, on trouve peu de référence à son sujet, la maladie étant rare dans le monde sauf au Saguenay-Lac-St-Jean. Les généalogies de 101 patients (82 familles) ont été reconstituées ce qui a permis de trouver 11 couples fondateurs pour la polyneuropathie. L'incidence de la maladie est de 1 malade pour 2117 naissances vivantes et le taux de porteurs est de 1/23. Les coefficients moyens de consanguinité et de parenté sont respectivement de 0,002279 et 0,000419. Les degrés de relation dans les mariages consanguins sont majoritairement au-delà du degré 3:3 (petits cousins). L'étude de la distribution spatiale des porteurs et des malades a permis de trouver une concentration de ceux-ci plus élevée que ne le veut le hasard à l'est du Lac St-Jean autour de la municipalité d'Alma. Une comparaison des résultats a été effectuée avec ceux obtenus dans l'étude de l'ataxie spastique de Charlevoix-Saguenay. Ces deux maladies ont été amenées de France par les premiers colons et un effet fondateurs leurs sont associées. La consanguinité proche ne permet pas d'expliquer les fréquences élevées de ces deux maladies au Saguenay-Lac-St-Jean.