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Uso do espaço pelo veado-catingueiro (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814): uma comparação entre colares GPS e DNA fecal / Space use by the brown brocket deer (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814): a comparison between GPS collars and fecal DNA

Peres, Pedro Henrique de Faria 08 September 2015 (has links)
Informações sobre o uso do espaço são importantes para o entendimento de processos ecológicos que envolvem uma espécie e a determinação de seu estado de conservação. Tais informações são escassas para o gênero Mazama, o mais diverso entre os cervídeos neotropicais, sendo que desenvolver metodologias para obtenção de dados ecológicos do gênero torna-se fundamental para qualquer ação de manejo envolvendo o grupo. O estudo do DNA fecal surge como uma ferramenta importante para viabilizar a coleta sistemática de informações sobre o gênero. Assim, o presente trabalho visou a estimar a área de vida e a seleção de hábitat do veado-catingueiro, comparando duas metodologias, com intuito de avaliar a aplicação do DNA fecal como alternativa para se estudar a espécie. O trabalho contou com 6 animais que tiveram suas localizações obtidas a cada 13 horas por colares GPS, no período de um ano. Nesse mesmo período e na mesma área, foram coletadas mensalmente amostras fecais, gerando um total de 830 amostras, cujo DNA foi extraído para identificação genética. A espécie das amostras foi determinada com o uso de um marcador mitocondrial (cit-b), e a identificação individual, com um painel de 11 microssatélites. Os valores de área de vida pelo método do MPC 95% variaram de 33 ha a 97 ha, e pelo método Kernel com 95% das localizações, variaram de 17 ha a 77 ha. Observou-se que as áreas de vida são alocadas nos diferentes habitats da região conforme o disponível (p = 0,072), porém são utilizadas internamente de forma selecionada (p=0,001). Neste nível, a espécie apresentou preferência pelos hábitats de cerrado e campo cerrado e evitou o campo (p < 0,005). Foram identificadas 670 amostras de veado-catingueiro e 15 genótipos únicos. A análise espacial das fezes também sugeriu uso desproporcional dos hábitats em relação à sua disponibilidade, sendo que a comparação direta entre os dois métodos revelou iguais distribuições no nível de espécie (p=0,178). As amostras individualizadas sugeriram um padrão de alta sobreposição de área de uso por diferentes indivíduos, mas avanços são necessários para melhor elucidar a questão. Perante os resultados observados, entende-se que há muito em se avançar na análise molecular das fezes que, realizada em larga escala, pode fornecer respostas importantes anteriormente inviáveis para espécies florestais. / Space use information is a key element to understand the ecological processes regarding a species and its conservation status. Such information is scarce for the genus Mazama, the most diverse group among Neotropical deer. The development of methods to obtain ecological data is fundamental to management actions concerning the group. The study of fecal DNA emerges as an important tool to enable systematic information collection about Mazama genus. Therefore, the present study aimed to estimate the home range and habitat selection of brown brocket deer comparing two methodologies in order to assess the application of fecal DNA as an alternative to study this species. Six animals were monitored with GPS collars and their location data was collected every 13 hours within one year time. Fecal samples were collected monthly in the same period and in the same area, generating a total of 830 samples whose DNA was extracted for genetic identification. The species identification was determined by a mitochondrial marker (cit-b) and individuals were identified applying a panel of 11 microsatellites. Home range was 33-97 h by MPC 95% and 17-77 h by Kernel 95%. Home rages are allocated in different habitats as available in the region (p = 0.072), but its use is internally selected (p = 0.001). At this level, the species showed preference for \"cerrado\" and \"campo cerrado\" habitats and avoidance to open field areas (p < 0.005). Genetics analysis identified 670 brown brocket deer samples and 15 unique genotypes. Feces spatial analysis suggested disproportionate use of habitats in relation to their availability in the field and the direct comparison between the two methods revealed equal distributions at the species level (p = 0.178). The genotyped samples suggested an overlapping home range pattern for different individuals, but advances are needed to further elucidate the issue. There is need for improvements in feces molecular analysis and, if held on large scale, it can provide important and previously unviable answers for forest species.
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Uso do espaço pelo veado-catingueiro (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814): uma comparação entre colares GPS e DNA fecal / Space use by the brown brocket deer (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814): a comparison between GPS collars and fecal DNA

Pedro Henrique de Faria Peres 08 September 2015 (has links)
Informações sobre o uso do espaço são importantes para o entendimento de processos ecológicos que envolvem uma espécie e a determinação de seu estado de conservação. Tais informações são escassas para o gênero Mazama, o mais diverso entre os cervídeos neotropicais, sendo que desenvolver metodologias para obtenção de dados ecológicos do gênero torna-se fundamental para qualquer ação de manejo envolvendo o grupo. O estudo do DNA fecal surge como uma ferramenta importante para viabilizar a coleta sistemática de informações sobre o gênero. Assim, o presente trabalho visou a estimar a área de vida e a seleção de hábitat do veado-catingueiro, comparando duas metodologias, com intuito de avaliar a aplicação do DNA fecal como alternativa para se estudar a espécie. O trabalho contou com 6 animais que tiveram suas localizações obtidas a cada 13 horas por colares GPS, no período de um ano. Nesse mesmo período e na mesma área, foram coletadas mensalmente amostras fecais, gerando um total de 830 amostras, cujo DNA foi extraído para identificação genética. A espécie das amostras foi determinada com o uso de um marcador mitocondrial (cit-b), e a identificação individual, com um painel de 11 microssatélites. Os valores de área de vida pelo método do MPC 95% variaram de 33 ha a 97 ha, e pelo método Kernel com 95% das localizações, variaram de 17 ha a 77 ha. Observou-se que as áreas de vida são alocadas nos diferentes habitats da região conforme o disponível (p = 0,072), porém são utilizadas internamente de forma selecionada (p=0,001). Neste nível, a espécie apresentou preferência pelos hábitats de cerrado e campo cerrado e evitou o campo (p < 0,005). Foram identificadas 670 amostras de veado-catingueiro e 15 genótipos únicos. A análise espacial das fezes também sugeriu uso desproporcional dos hábitats em relação à sua disponibilidade, sendo que a comparação direta entre os dois métodos revelou iguais distribuições no nível de espécie (p=0,178). As amostras individualizadas sugeriram um padrão de alta sobreposição de área de uso por diferentes indivíduos, mas avanços são necessários para melhor elucidar a questão. Perante os resultados observados, entende-se que há muito em se avançar na análise molecular das fezes que, realizada em larga escala, pode fornecer respostas importantes anteriormente inviáveis para espécies florestais. / Space use information is a key element to understand the ecological processes regarding a species and its conservation status. Such information is scarce for the genus Mazama, the most diverse group among Neotropical deer. The development of methods to obtain ecological data is fundamental to management actions concerning the group. The study of fecal DNA emerges as an important tool to enable systematic information collection about Mazama genus. Therefore, the present study aimed to estimate the home range and habitat selection of brown brocket deer comparing two methodologies in order to assess the application of fecal DNA as an alternative to study this species. Six animals were monitored with GPS collars and their location data was collected every 13 hours within one year time. Fecal samples were collected monthly in the same period and in the same area, generating a total of 830 samples whose DNA was extracted for genetic identification. The species identification was determined by a mitochondrial marker (cit-b) and individuals were identified applying a panel of 11 microsatellites. Home range was 33-97 h by MPC 95% and 17-77 h by Kernel 95%. Home rages are allocated in different habitats as available in the region (p = 0.072), but its use is internally selected (p = 0.001). At this level, the species showed preference for \"cerrado\" and \"campo cerrado\" habitats and avoidance to open field areas (p < 0.005). Genetics analysis identified 670 brown brocket deer samples and 15 unique genotypes. Feces spatial analysis suggested disproportionate use of habitats in relation to their availability in the field and the direct comparison between the two methods revealed equal distributions at the species level (p = 0.178). The genotyped samples suggested an overlapping home range pattern for different individuals, but advances are needed to further elucidate the issue. There is need for improvements in feces molecular analysis and, if held on large scale, it can provide important and previously unviable answers for forest species.
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Implicações da remoção de fezes de por Scarabaeinae (Coleoptera: Scarabaeidae) sobre a avaliação de aspectos ecológicos de Mazama (Artiodactyla: Cervidae), na Amazônia / Implications of feces removal by Scarabaeinae (Coleoptera: Scarabaeidae) on evaluation of ecological aspects of Mazama (Artiodactyla: Cervidae) in the Amazon

Cerveira, Josi Fernanda 01 September 2016 (has links)
Duas espécies de cervídeos florestais ocorrem em simpatria na Amazônia: Mazama americana e Mazama nemorivaga. Ambas apresentam hábitos solitários e comportamento elusivo e por isso são difíceis de serem capturados. Além disso, são extremamente sensíveis aos métodos de captura os quais quase sempre implicam em altos níveis de estresse e injúrias. A utilização de DNA fecal tem sido empregada como alternativa não invasiva à captura, uma vez que, a partir do DNA extraído das fezes, é possível a identificação da espécie, sexo e identificação dos indivíduos. Cães farejadores vem sendo utilizados para aumentar a detecção das amostras fecais em campo e tem sido importantes aliados em estudos populacionais de cervídeos no Cerrado, Pantanal e Mata Atlântica. Nestes biomas a permanência das fezes pode ser favorecida por questões climáticas e/ou por características locais da biota especializada na degradação e remoção de excrementos. Trabalhos que utilizam fezes como fonte de informação na Amazônia não estão disponíveis bem como também não são suficientemente conhecidos os parâmetros inerentes a degradação e remoção de fezes naquele bioma. Neste sentido, este trabalho foi desenvolvido em uma área protegida do sudeste da Amazônia (Floresta Nacional do Jamari, Rondônia) e faz uma síntese sobre as implicações ecológicas da remoção de fezes de cervídeos de Mazama por coleópteros Scarabaeinae. Discute-se aqui: 1. A composição, riqueza e abundância de escarabaeíneos onde verificou-se a predileção por fezes frescas independente da espécie de cervídeo; 2. A elevada taxa de remoção das fezes na região amazônica onde verificamos taxas: (i) máxima: 100 pellets removidos em uma hora (4,5% das amostras) e; (ii) mínima: 100 pellets removidos entre 12 a 24 horas (58% das amostras) e; 3. A diversidade de ácaros foréticos Macrochelidae coletados durante a triagem dos Scarabaeinae. Por fim, apresento um modelo conceitual sobre a inobservância de amostras fecais para Amazônia onde considero dados empíricos de remoção por coleópteros aliados à experiência de busca ativa de fezes com cão farejador e com dados de presença e abundância de cervídeos obtidas com armadilhas fotográficas. Os treinamentos mostraram que o cão fora eficiente em encontrar fezes e o armadilhamento mostraram boa frequência das espécies de Mazama, contudo, a efetiva ação dos escarabeídeos mostrou-se um importante obstáculo as intenções de se obter amostras moleculares através de fezes na Amazônia. / Two species of forest deer occur sympatric in the Amazon: Mazama americana and Mazama nemorivaga. Both have solitary habits and elusive behavior and so are difficult to capture. Moreover, they are extremely sensitive to catching methods which often involve high levels of stress and injuries. The use of fecal DNA has been employed as a noninvasive alternative to capturing, since is possible made species identification, identification of individuals and sexing by DNA extracted from stools. Sniffer dogs have been used to increase the detection of fecal samples in the field and it has been important allies in population studies of deer in the Cerrado, Pantanal and Atlantic Forest. In these biomes the persistence of feces can be favored by climatic reasons and / or by local characteristics of specialized biota in the degradation and removal of excreta. Studies that use feces as a source of information in the Amazon are not available and also are not sufficiently known the parameters inherent of degradation and removal of feces in that biome. Thus, this study was conducted in a protected area of southeastern Amazon (Jamari National Forest, Rondonia) and provides an overview of the ecological implications of the removal of deer stool\'s Mazama by dung beetles Scarabaeinae. It is discussed here: 1. The composition, richness and abundance of Scarabaeinae where there was a predilection for fresh feces independently of the deer species; 2. The high rate of stool removal in the Amazon where we see: (i) maximum rate: 100 pellets removed in an hour (4.5% of the samples) and; (Ii) minimum rate: 100 pellets removed between 12 and 24 hours (58% of samples) and; 3. The diversity of Macrochelidae phoretic mites collected during the screening of Scarabaeinae. Finally, I present a conceptual model about detection failure of fecal samples to Amazon where I consider removal data by Coleoptera combined the experience of active search of stool with sniffer dog and data of presence and abundance of deer taken with camera traps. The training showed that the dog was efficient in finding feces and trapping showed good frequency of Mazama species, however, the effective action of scarabs proved to be a major obstacle to the intentions to obtain molecular samples through feces in the Amazon.
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Implicações da remoção de fezes de por Scarabaeinae (Coleoptera: Scarabaeidae) sobre a avaliação de aspectos ecológicos de Mazama (Artiodactyla: Cervidae), na Amazônia / Implications of feces removal by Scarabaeinae (Coleoptera: Scarabaeidae) on evaluation of ecological aspects of Mazama (Artiodactyla: Cervidae) in the Amazon

Josi Fernanda Cerveira 01 September 2016 (has links)
Duas espécies de cervídeos florestais ocorrem em simpatria na Amazônia: Mazama americana e Mazama nemorivaga. Ambas apresentam hábitos solitários e comportamento elusivo e por isso são difíceis de serem capturados. Além disso, são extremamente sensíveis aos métodos de captura os quais quase sempre implicam em altos níveis de estresse e injúrias. A utilização de DNA fecal tem sido empregada como alternativa não invasiva à captura, uma vez que, a partir do DNA extraído das fezes, é possível a identificação da espécie, sexo e identificação dos indivíduos. Cães farejadores vem sendo utilizados para aumentar a detecção das amostras fecais em campo e tem sido importantes aliados em estudos populacionais de cervídeos no Cerrado, Pantanal e Mata Atlântica. Nestes biomas a permanência das fezes pode ser favorecida por questões climáticas e/ou por características locais da biota especializada na degradação e remoção de excrementos. Trabalhos que utilizam fezes como fonte de informação na Amazônia não estão disponíveis bem como também não são suficientemente conhecidos os parâmetros inerentes a degradação e remoção de fezes naquele bioma. Neste sentido, este trabalho foi desenvolvido em uma área protegida do sudeste da Amazônia (Floresta Nacional do Jamari, Rondônia) e faz uma síntese sobre as implicações ecológicas da remoção de fezes de cervídeos de Mazama por coleópteros Scarabaeinae. Discute-se aqui: 1. A composição, riqueza e abundância de escarabaeíneos onde verificou-se a predileção por fezes frescas independente da espécie de cervídeo; 2. A elevada taxa de remoção das fezes na região amazônica onde verificamos taxas: (i) máxima: 100 pellets removidos em uma hora (4,5% das amostras) e; (ii) mínima: 100 pellets removidos entre 12 a 24 horas (58% das amostras) e; 3. A diversidade de ácaros foréticos Macrochelidae coletados durante a triagem dos Scarabaeinae. Por fim, apresento um modelo conceitual sobre a inobservância de amostras fecais para Amazônia onde considero dados empíricos de remoção por coleópteros aliados à experiência de busca ativa de fezes com cão farejador e com dados de presença e abundância de cervídeos obtidas com armadilhas fotográficas. Os treinamentos mostraram que o cão fora eficiente em encontrar fezes e o armadilhamento mostraram boa frequência das espécies de Mazama, contudo, a efetiva ação dos escarabeídeos mostrou-se um importante obstáculo as intenções de se obter amostras moleculares através de fezes na Amazônia. / Two species of forest deer occur sympatric in the Amazon: Mazama americana and Mazama nemorivaga. Both have solitary habits and elusive behavior and so are difficult to capture. Moreover, they are extremely sensitive to catching methods which often involve high levels of stress and injuries. The use of fecal DNA has been employed as a noninvasive alternative to capturing, since is possible made species identification, identification of individuals and sexing by DNA extracted from stools. Sniffer dogs have been used to increase the detection of fecal samples in the field and it has been important allies in population studies of deer in the Cerrado, Pantanal and Atlantic Forest. In these biomes the persistence of feces can be favored by climatic reasons and / or by local characteristics of specialized biota in the degradation and removal of excreta. Studies that use feces as a source of information in the Amazon are not available and also are not sufficiently known the parameters inherent of degradation and removal of feces in that biome. Thus, this study was conducted in a protected area of southeastern Amazon (Jamari National Forest, Rondonia) and provides an overview of the ecological implications of the removal of deer stool\'s Mazama by dung beetles Scarabaeinae. It is discussed here: 1. The composition, richness and abundance of Scarabaeinae where there was a predilection for fresh feces independently of the deer species; 2. The high rate of stool removal in the Amazon where we see: (i) maximum rate: 100 pellets removed in an hour (4.5% of the samples) and; (Ii) minimum rate: 100 pellets removed between 12 and 24 hours (58% of samples) and; 3. The diversity of Macrochelidae phoretic mites collected during the screening of Scarabaeinae. Finally, I present a conceptual model about detection failure of fecal samples to Amazon where I consider removal data by Coleoptera combined the experience of active search of stool with sniffer dog and data of presence and abundance of deer taken with camera traps. The training showed that the dog was efficient in finding feces and trapping showed good frequency of Mazama species, however, the effective action of scarabs proved to be a major obstacle to the intentions to obtain molecular samples through feces in the Amazon.

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