Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-25Bitstream added on 2014-06-13T19:17:41Z : No. of bitstreams: 1 cursino_ms_me_jabo.pdf: 1013380 bytes, checksum: e2baa17d3b529f6efabece49dc7a6901 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O veado mateiro, Mazama americana, apresenta populações cariotipicamente diferentes (citótipos) em diferentes regiões brasileiras. Estes citótipos apresentam uma diferenciação cariotípica que originou duas linhagens evolutivas A e B. Estas linhagens apresentam uma distância genética entre elas, maior que em relação a outras espécies de Mazama. A existência de mecanismo de isolamento reprodutivo pós-zigótico, devido a distância cariotípica das linhagens, comprovaria a existência de pelo menos duas espécies dentro do que hoje denomina-se Mazama americana. Para tal foram realizados cruzamentos inter e intracitótipos obtendo prole F1 híbrida (n=6) e pura (n=3). As fêmeas F1 foram analisadas quanto aos seus parâmetros reprodutivos por meio da dosagem de metabólitos fecais de progesterona, histologia de ovário e produção de embriões in vitro. As fêmeas puras apresentaram parâmetros similares aos já descritos para fêmeas de M. americana, porém os parâmetros das fêmeas híbridas apresentaram-se distintos das puras. Duas híbridas apresentaram esterilidade com ausência de células germinativas, resposta negativa ao protocolo de superovulação e ausência de foliculos para aspiração e posterior produção de embriões in vitro. As outras híbridas apresentaram subfertilidade. Uma vez encontrado o isolamento reprodutivo entre as linhagens A e B, foi possível identificar ao menos duas espécies dentro de Mazama americana. Sugerimos que os citótipos podem ser divididos em subespécies das linhagens, porém outros estudos devem ser realizados para que esta hipótese seja comprovada / The red brocket deer, Mazama americana, shows populations that are karyotipically different (cytotypes) distinct regions in Brasil. These karyotype differentiation led to two evolutionary lineages A and B. These lineages have a genetic distance between them greater than for other species of Mazama. Once to these differences culminate in a division of the taxon, need to require a study of reproductive isolation among lineages. For these, crossings were performed within and between cytotypes obtaining F1 hybrid (n = 6) and pure (n = 3) offspring. The F1 females were analyzed as to their reproductive parameters. It was possible to infer the reproductive capacity of these through the measurement of fecal progesterone metabolites, histology of ovary and embryo production in vitro. The pure females showed parameters similar to those described for females of M. American, but the parameters of the hybrid females were lower than those of the pure. Two hybrid presented sterility with absence of germ cells, negative response to the superovulation protocol, and absence of follicles for aspiration and subsequent production of embryos. The other hybrids showed subfertility. Once found the reproductive isolation between strains A and B, it was possible to identify at least two species within Mazama americana. We suggest that these cytotypes can be divided into subspecies strains, but other studies must be conducted so that this hypothesis is verified

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:15Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-07-24Bitstream added on 2014-06-13T20:43:06Z : No. of bitstreams: 1 abril_vv_dr_jabo.pdf: 1648950 bytes, checksum: a989c1942e3dd9ac9da5d7078193a943 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Estudos com veado-mateiro (Mazama americana) mostram que há muitas controvérsias quanto ao número de subespécies ou até quanto ao desdobramento destas em espécies. Em estudo citotaxonômico foram encontradas variações cromossômicas intra e interpopulacionais em populações de M. americana geograficamente distantes, com número diplóide de 48 a 53 e número fundamental de 46 a 57. Com base nisto, o presente estudo visou compreender como ocorreu a reorganização cromossômica dentro das variantes encontradas durante a evolução do grupo. Para isto, estrutura e organização dos cromossomos de M. americana foram analisadas para identificar os rearranjos que originaram a variação intraespecífica através das técnicas de bandamento cromossômico (bandas G, C, Ag-NOR), hibridação in situ (FISH) com sondas teloméricas e pintura cromossômica com o uso de sondas cromossômicas da espécie Mazama gouazoubira. Foram identificados seis citótipos distribrídos em 12 cariótipos diferentes: Rondônia (2n=42 ou 43 e NF=46; 2n=42 e NF=49), Juína (2n= 43, 44 ou 45 e NF=48; 2n=44 e NF=46), Jarí (2n=49; NF=56, Carajás (2n=50 e NF=54), Santarém (2n=51 e NF=56) e Paraná (2n=51,52 ou 53 e NF=56). O cariótipo básico do citótipo Paraná foi utilizado como base comparativa para os demais. Os rearranjos que originaram essas diferenças foram fusões cêntricas, em tandem e inversões pericêntricas. A análise de complexo sinaptonêmico confirmou a existência de um sistema sexual múltiplo do tipo XX/XY1Y2 através da detecção de uma trivalente sexual. Sítios teloméricos intersticiais evidenciam que a ocorrência de eventos de fusões em tandem foi essencial para a evolução cariotípica desta espécie e a homologia de sondas cromossomo-específicas de M. gouazoubira corroboram que o caminho da reorganização cromossômica entre estas espécies foi principalmente através de fusões. / Studies with the red brocket deer (Mazama americana) shown that there are a lot of controversies about the number of subspecies or about the unfolding of these in new species. Citotaxonomic studies found intra and interpopulational chromosomal variations, with diploid number varing from 48 to 53 and fundamental number from 46 to 57. Based on these studies, the aim of the present study was understood how the chromosomal reorganization occurred between this variants during the evolution process. For that, we analyzed the chromosomal structure and organization of M. americana, identifying the rearrangements responsible for the intraspecific variation through chromosome banding (G and C-banding, Ag-NOR), in situ hybridization of telomeric probes and chromosome painting using probes of M. gouazoubira species. It were found six different variants: Rondônia (2n=42 or 43 and FN=46; 2n=42 and FN=49), Juína (2n= 43, 44 or 45 and FN=48; 2n=44 and FN=46), Jarí (2n=49 and FN=56), Carajás (2n=50 and FN=54), Santarém (2n=51 and FN=56) and Paraná (2n=51,52 or 53 and FN=56). The basic karyotype of Paraná variant was choosing for comparative analysis. The rearrangements responsible for these chromosomal differences were centric and tandem fusions and pericentric inversions. The synaptonemal analysis sustained the existence of a multiple sexual system (XX/XY1Y2) with detection of a sexual trivalent. Intersticial telomeric sites shown the occurrence of tandem fusions was essential for the karyotype evolution of this species and the homology with the probes of M. gouazoubira corroborated that the way of chromosomal reorganization between these species was mainly through chromosome fusions.

Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Fábio de Melo Sene / Banca: Joaquim Mansano Garcia / Resumo: O veado mateiro, Mazama americana, apresenta populações cariotipicamente diferentes (citótipos) em diferentes regiões brasileiras. Estes citótipos apresentam uma diferenciação cariotípica que originou duas linhagens evolutivas A e B. Estas linhagens apresentam uma distância genética entre elas, maior que em relação a outras espécies de Mazama. A existência de mecanismo de isolamento reprodutivo pós-zigótico, devido a distância cariotípica das linhagens, comprovaria a existência de pelo menos duas espécies dentro do que hoje denomina-se Mazama americana. Para tal foram realizados cruzamentos inter e intracitótipos obtendo prole F1 híbrida (n=6) e pura (n=3). As fêmeas F1 foram analisadas quanto aos seus parâmetros reprodutivos por meio da dosagem de metabólitos fecais de progesterona, histologia de ovário e produção de embriões in vitro. As fêmeas puras apresentaram parâmetros similares aos já descritos para fêmeas de M. americana, porém os parâmetros das fêmeas híbridas apresentaram-se distintos das puras. Duas híbridas apresentaram esterilidade com ausência de células germinativas, resposta negativa ao protocolo de superovulação e ausência de foliculos para aspiração e posterior produção de embriões in vitro. As outras híbridas apresentaram subfertilidade. Uma vez encontrado o isolamento reprodutivo entre as linhagens A e B, foi possível identificar ao menos duas espécies dentro de Mazama americana. Sugerimos que os citótipos podem ser divididos em subespécies das linhagens, porém outros estudos devem ser realizados para que esta hipótese seja comprovada / Abstract: The red brocket deer, Mazama americana, shows populations that are karyotipically different (cytotypes) distinct regions in Brasil. These karyotype differentiation led to two evolutionary lineages A and B. These lineages have a genetic distance between them greater than for other species of Mazama. Once to these differences culminate in a division of the taxon, need to require a study of reproductive isolation among lineages. For these, crossings were performed within and between cytotypes obtaining F1 hybrid (n = 6) and pure (n = 3) offspring. The F1 females were analyzed as to their reproductive parameters. It was possible to infer the reproductive capacity of these through the measurement of fecal progesterone metabolites, histology of ovary and embryo production in vitro. The pure females showed parameters similar to those described for females of M. American, but the parameters of the hybrid females were lower than those of the pure. Two hybrid presented sterility with absence of germ cells, negative response to the superovulation protocol, and absence of follicles for aspiration and subsequent production of embryos. The other hybrids showed subfertility. Once found the reproductive isolation between strains A and B, it was possible to identify at least two species within Mazama americana. We suggest that these cytotypes can be divided into subspecies strains, but other studies must be conducted so that this hypothesis is verified / Mestre

Orientador: José Maurício Barbanti Duarte / Banca: Fausto Foresti / Banca: Cláudio de Oliveira / Banca: Orlando Moreira Filho / Banca: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Resumo: Estudos com veado-mateiro (Mazama americana) mostram que há muitas controvérsias quanto ao número de subespécies ou até quanto ao desdobramento destas em espécies. Em estudo citotaxonômico foram encontradas variações cromossômicas intra e interpopulacionais em populações de M. americana geograficamente distantes, com número diplóide de 48 a 53 e número fundamental de 46 a 57. Com base nisto, o presente estudo visou compreender como ocorreu a reorganização cromossômica dentro das variantes encontradas durante a evolução do grupo. Para isto, estrutura e organização dos cromossomos de M. americana foram analisadas para identificar os rearranjos que originaram a variação intraespecífica através das técnicas de bandamento cromossômico (bandas G, C, Ag-NOR), hibridação in situ (FISH) com sondas teloméricas e pintura cromossômica com o uso de sondas cromossômicas da espécie Mazama gouazoubira. Foram identificados seis citótipos distribrídos em 12 cariótipos diferentes: Rondônia (2n=42 ou 43 e NF=46; 2n=42 e NF=49), Juína (2n= 43, 44 ou 45 e NF=48; 2n=44 e NF=46), Jarí (2n=49; NF=56, Carajás (2n=50 e NF=54), Santarém (2n=51 e NF=56) e Paraná (2n=51,52 ou 53 e NF=56). O cariótipo básico do citótipo Paraná foi utilizado como base comparativa para os demais. Os rearranjos que originaram essas diferenças foram fusões cêntricas, em tandem e inversões pericêntricas. A análise de complexo sinaptonêmico confirmou a existência de um sistema sexual múltiplo do tipo XX/XY1Y2 através da detecção de uma trivalente sexual. Sítios teloméricos intersticiais evidenciam que a ocorrência de eventos de fusões em tandem foi essencial para a evolução cariotípica desta espécie e a homologia de sondas cromossomo-específicas de M. gouazoubira corroboram que o caminho da reorganização cromossômica entre estas espécies foi principalmente através de fusões. / Abstract: Studies with the red brocket deer (Mazama americana) shown that there are a lot of controversies about the number of subspecies or about the unfolding of these in new species. Citotaxonomic studies found intra and interpopulational chromosomal variations, with diploid number varing from 48 to 53 and fundamental number from 46 to 57. Based on these studies, the aim of the present study was understood how the chromosomal reorganization occurred between this variants during the evolution process. For that, we analyzed the chromosomal structure and organization of M. americana, identifying the rearrangements responsible for the intraspecific variation through chromosome banding (G and C-banding, Ag-NOR), in situ hybridization of telomeric probes and chromosome painting using probes of M. gouazoubira species. It were found six different variants: Rondônia (2n=42 or 43 and FN=46; 2n=42 and FN=49), Juína (2n= 43, 44 or 45 and FN=48; 2n=44 and FN=46), Jarí (2n=49 and FN=56), Carajás (2n=50 and FN=54), Santarém (2n=51 and FN=56) and Paraná (2n=51,52 or 53 and FN=56). The basic karyotype of Paraná variant was choosing for comparative analysis. The rearrangements responsible for these chromosomal differences were centric and tandem fusions and pericentric inversions. The synaptonemal analysis sustained the existence of a multiple sexual system (XX/XY1Y2) with detection of a sexual trivalent. Intersticial telomeric sites shown the occurrence of tandem fusions was essential for the karyotype evolution of this species and the homology with the probes of M. gouazoubira corroborated that the way of chromosomal reorganization between these species was mainly through chromosome fusions. / Doutor

Duas espécies de cervídeos florestais ocorrem em simpatria na Amazônia: Mazama americana e Mazama nemorivaga. Ambas apresentam hábitos solitários e comportamento elusivo e por isso são difíceis de serem capturados. Além disso, são extremamente sensíveis aos métodos de captura os quais quase sempre implicam em altos níveis de estresse e injúrias. A utilização de DNA fecal tem sido empregada como alternativa não invasiva à captura, uma vez que, a partir do DNA extraído das fezes, é possível a identificação da espécie, sexo e identificação dos indivíduos. Cães farejadores vem sendo utilizados para aumentar a detecção das amostras fecais em campo e tem sido importantes aliados em estudos populacionais de cervídeos no Cerrado, Pantanal e Mata Atlântica. Nestes biomas a permanência das fezes pode ser favorecida por questões climáticas e/ou por características locais da biota especializada na degradação e remoção de excrementos. Trabalhos que utilizam fezes como fonte de informação na Amazônia não estão disponíveis bem como também não são suficientemente conhecidos os parâmetros inerentes a degradação e remoção de fezes naquele bioma. Neste sentido, este trabalho foi desenvolvido em uma área protegida do sudeste da Amazônia (Floresta Nacional do Jamari, Rondônia) e faz uma síntese sobre as implicações ecológicas da remoção de fezes de cervídeos de Mazama por coleópteros Scarabaeinae. Discute-se aqui: 1. A composição, riqueza e abundância de escarabaeíneos onde verificou-se a predileção por fezes frescas independente da espécie de cervídeo; 2. A elevada taxa de remoção das fezes na região amazônica onde verificamos taxas: (i) máxima: 100 pellets removidos em uma hora (4,5% das amostras) e; (ii) mínima: 100 pellets removidos entre 12 a 24 horas (58% das amostras) e; 3. A diversidade de ácaros foréticos Macrochelidae coletados durante a triagem dos Scarabaeinae. Por fim, apresento um modelo conceitual sobre a inobservância de amostras fecais para Amazônia onde considero dados empíricos de remoção por coleópteros aliados à experiência de busca ativa de fezes com cão farejador e com dados de presença e abundância de cervídeos obtidas com armadilhas fotográficas. Os treinamentos mostraram que o cão fora eficiente em encontrar fezes e o armadilhamento mostraram boa frequência das espécies de Mazama, contudo, a efetiva ação dos escarabeídeos mostrou-se um importante obstáculo as intenções de se obter amostras moleculares através de fezes na Amazônia. / Two species of forest deer occur sympatric in the Amazon: Mazama americana and Mazama nemorivaga. Both have solitary habits and elusive behavior and so are difficult to capture. Moreover, they are extremely sensitive to catching methods which often involve high levels of stress and injuries. The use of fecal DNA has been employed as a noninvasive alternative to capturing, since is possible made species identification, identification of individuals and sexing by DNA extracted from stools. Sniffer dogs have been used to increase the detection of fecal samples in the field and it has been important allies in population studies of deer in the Cerrado, Pantanal and Atlantic Forest. In these biomes the persistence of feces can be favored by climatic reasons and / or by local characteristics of specialized biota in the degradation and removal of excreta. Studies that use feces as a source of information in the Amazon are not available and also are not sufficiently known the parameters inherent of degradation and removal of feces in that biome. Thus, this study was conducted in a protected area of southeastern Amazon (Jamari National Forest, Rondonia) and provides an overview of the ecological implications of the removal of deer stool\'s Mazama by dung beetles Scarabaeinae. It is discussed here: 1. The composition, richness and abundance of Scarabaeinae where there was a predilection for fresh feces independently of the deer species; 2. The high rate of stool removal in the Amazon where we see: (i) maximum rate: 100 pellets removed in an hour (4.5% of the samples) and; (Ii) minimum rate: 100 pellets removed between 12 and 24 hours (58% of samples) and; 3. The diversity of Macrochelidae phoretic mites collected during the screening of Scarabaeinae. Finally, I present a conceptual model about detection failure of fecal samples to Amazon where I consider removal data by Coleoptera combined the experience of active search of stool with sniffer dog and data of presence and abundance of deer taken with camera traps. The training showed that the dog was efficient in finding feces and trapping showed good frequency of Mazama species, however, the effective action of scarabs proved to be a major obstacle to the intentions to obtain molecular samples through feces in the Amazon.

Duas espécies de cervídeos florestais ocorrem em simpatria na Amazônia: Mazama americana e Mazama nemorivaga. Ambas apresentam hábitos solitários e comportamento elusivo e por isso são difíceis de serem capturados. Além disso, são extremamente sensíveis aos métodos de captura os quais quase sempre implicam em altos níveis de estresse e injúrias. A utilização de DNA fecal tem sido empregada como alternativa não invasiva à captura, uma vez que, a partir do DNA extraído das fezes, é possível a identificação da espécie, sexo e identificação dos indivíduos. Cães farejadores vem sendo utilizados para aumentar a detecção das amostras fecais em campo e tem sido importantes aliados em estudos populacionais de cervídeos no Cerrado, Pantanal e Mata Atlântica. Nestes biomas a permanência das fezes pode ser favorecida por questões climáticas e/ou por características locais da biota especializada na degradação e remoção de excrementos. Trabalhos que utilizam fezes como fonte de informação na Amazônia não estão disponíveis bem como também não são suficientemente conhecidos os parâmetros inerentes a degradação e remoção de fezes naquele bioma. Neste sentido, este trabalho foi desenvolvido em uma área protegida do sudeste da Amazônia (Floresta Nacional do Jamari, Rondônia) e faz uma síntese sobre as implicações ecológicas da remoção de fezes de cervídeos de Mazama por coleópteros Scarabaeinae. Discute-se aqui: 1. A composição, riqueza e abundância de escarabaeíneos onde verificou-se a predileção por fezes frescas independente da espécie de cervídeo; 2. A elevada taxa de remoção das fezes na região amazônica onde verificamos taxas: (i) máxima: 100 pellets removidos em uma hora (4,5% das amostras) e; (ii) mínima: 100 pellets removidos entre 12 a 24 horas (58% das amostras) e; 3. A diversidade de ácaros foréticos Macrochelidae coletados durante a triagem dos Scarabaeinae. Por fim, apresento um modelo conceitual sobre a inobservância de amostras fecais para Amazônia onde considero dados empíricos de remoção por coleópteros aliados à experiência de busca ativa de fezes com cão farejador e com dados de presença e abundância de cervídeos obtidas com armadilhas fotográficas. Os treinamentos mostraram que o cão fora eficiente em encontrar fezes e o armadilhamento mostraram boa frequência das espécies de Mazama, contudo, a efetiva ação dos escarabeídeos mostrou-se um importante obstáculo as intenções de se obter amostras moleculares através de fezes na Amazônia. / Two species of forest deer occur sympatric in the Amazon: Mazama americana and Mazama nemorivaga. Both have solitary habits and elusive behavior and so are difficult to capture. Moreover, they are extremely sensitive to catching methods which often involve high levels of stress and injuries. The use of fecal DNA has been employed as a noninvasive alternative to capturing, since is possible made species identification, identification of individuals and sexing by DNA extracted from stools. Sniffer dogs have been used to increase the detection of fecal samples in the field and it has been important allies in population studies of deer in the Cerrado, Pantanal and Atlantic Forest. In these biomes the persistence of feces can be favored by climatic reasons and / or by local characteristics of specialized biota in the degradation and removal of excreta. Studies that use feces as a source of information in the Amazon are not available and also are not sufficiently known the parameters inherent of degradation and removal of feces in that biome. Thus, this study was conducted in a protected area of southeastern Amazon (Jamari National Forest, Rondonia) and provides an overview of the ecological implications of the removal of deer stool\'s Mazama by dung beetles Scarabaeinae. It is discussed here: 1. The composition, richness and abundance of Scarabaeinae where there was a predilection for fresh feces independently of the deer species; 2. The high rate of stool removal in the Amazon where we see: (i) maximum rate: 100 pellets removed in an hour (4.5% of the samples) and; (Ii) minimum rate: 100 pellets removed between 12 and 24 hours (58% of samples) and; 3. The diversity of Macrochelidae phoretic mites collected during the screening of Scarabaeinae. Finally, I present a conceptual model about detection failure of fecal samples to Amazon where I consider removal data by Coleoptera combined the experience of active search of stool with sniffer dog and data of presence and abundance of deer taken with camera traps. The training showed that the dog was efficient in finding feces and trapping showed good frequency of Mazama species, however, the effective action of scarabs proved to be a major obstacle to the intentions to obtain molecular samples through feces in the Amazon.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-10-07Bitstream added on 2014-06-13T19:53:59Z : No. of bitstreams: 1 gualberto_af_me_jabo.pdf: 464930 bytes, checksum: 799ea2a9f048c84fac80100f93c28e4f (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O veado-mateiro (Mazama americana) é a maior espécie do Gênero Mazama, e encontra distribuído geograficamente por quase toda a região neotropical. Animais originários do Estado de Rondônia têm apresentado importantes diferenças citogenéticas em relação ao padrão de outras populações, o que suscita necessidade de estudos mais aprofundados para definição da sua posição filogenética. O presente estudo objetivou identificar as diferentes populações de veado-mateiro desta região, verificando a existência de mais de uma espécie no local. Para tanto, foram obtidos 51 fragmentos de tecido de animais caçados por indígenas e pela população local em todas as regiões do Estado dos quais 33 tiveram seu DNA extraídos, amplificados (região de 480pb do citocromo b) e seqüenciados de forma satisfatória. Estas seqüências foram alinhadas e comparadas, gerando 21 haplótipos que se encontram distribuídos de forma aleatória pelas diversas regiões de coleta. Estes haplótipos serviram de base para a elaboração de redes de distância e árvores filogenéticas que quando analisadas sugeriram a existência de espécies crípticas dentro do que hoje se denomina Mazama americana no Estado de Rondônia. / The red brocket deer is the largest species of Mazama genus and it is distributed in almost all Neotropical regions. Individuals originated from Rondônia state in Brazil have been presented important cytogenetic differences when compared with populations of other regions of country; however more studies are necessary to define correct phylogenetic position of species. The objective of present study was performed the identification of different populations of red brocket deer from Rondônia state by verification of occurrence of more than one species on mentioned region. For this, 51 fragments of tissues from hunted animals were obtained with Indians and local people of all regions of Rondônia state. In 31 fragments of tissues the DNA was successful extract, amplified (480 bp region of cytochrome b) and sequenced. These sequences were aligned and compared creating 21 haplotypes, which are distributed in a randomly way thru the different regions of sampling. The haplotypes were used to elaborate distance nets and phylogenetic trees, which when analyzed suggested the existence of cryptic species on Mazama americana species that occurs in Rondônia state.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-05-27Bitstream added on 2014-06-13T19:33:20Z : No. of bitstreams: 1 carnelossi_eag_me_jabo.pdf: 5963862 bytes, checksum: c9072ade5521cd6b029cd77e62872e7a (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O veado-mateiro (Mazama americana) possui uma ampla distribuição geográfica na região neotropical. Estudos citogenéticos com a espécie revelam variações cromossômicas (citótipos) que apontam sua divisão em outras espécies. Neste trabalho, foram examinadas as relações filogenéticas desta espécie, analisando parte dos genes mitocondriais (citocromo-b e região controladora D-loop), dos genes nucleares (Beta e Kapa caseínas e do exon I do gene IRBP) e um fragmento do gene, presente no cromossomo Y, chamado SRY, para amostras de 19 indivíduos provenientes de diferentes regiões do Brasil. Os genes nucleares da kapa e beta caseína e do SRY, mostraram-se monomórficos, não sendo possível a obtenção de sequências para o gene IRBP. As inferências filogenéticas pelos genes mitocondriais revelam duas linhagens evolutivas, a dos indivíduos das populações da Bacia do Rio Paraná e a dos indivíduos do oeste da Bacia do Rio Amazonas. Também houve uma correlação entre os diferentes cariótipos e as distintas linhagens moleculares encontradas. Além disso, pode-se sugerir a ocorrência de convergência evolutiva entre estes grupos, bem como um possível caso de simpatria ou de retenção de polimorfismo ancestral nos indivíduos do leste da Amazônia. / The red brocket deer (Mazama americana) has a wide distribution in Neotropics. In this regard, cytogenetic studies in this species revealed chromosomic variations (cytotypes) which strongly suggest that red brockets can be divided into other species. In the present study, we examined phylogenetic relationships of 19 samples of individuals from different areas of Brazil through mitochondrial (cytochrome b and control region D-loop), nuclear (b-casein, k-casein, and first exon of the IRBP) and SRY gene analysis. The sequence analysis showed that b- and k-caseins as well as SRY nuclear genes were monomorphic, whereas IBRP gene sequencing was not possible. Phylogenetic inferences concerning mitochondrial gene analysis demonstrated two evolutionary lineages, one from Parana River Basin (southeast Brazil) and other from west of Amazon River Basin (northwest Brazil). Moreover, we found correlation between different karyotypes and distinct molecular lineages.

Submitted by ALINE MEIRA BONFIM MANTELLATTO null (alinemeira22@hotmail.com) on 2016-10-26T12:27:30Z No. of bitstreams: 1 Tese_Aline_Meira_Bonfim_Mantellatto.pdf: 3628073 bytes, checksum: fb09b14fa5d50ef174174cbe54e46f70 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-11-01T15:24:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 mantellato_amb_dr_jabo.pdf: 3628073 bytes, checksum: fb09b14fa5d50ef174174cbe54e46f70 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-01T15:24:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 mantellato_amb_dr_jabo.pdf: 3628073 bytes, checksum: fb09b14fa5d50ef174174cbe54e46f70 (MD5) Previous issue date: 2016-10-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Considerada a espécie de cervídeo brasileira mais ameaçada de extinção, Mazama bororo, foi recentemente descrita em 1996. Devido a isso, aspectos básicos de sua biologia ainda são desconhecidos. Dessa maneira, o presente trabalho teve como objetivo utilizar DNA extraído de espécimes recentes e de museus para descrever a sua distribuição histórica, investigar a existência de padrões filogeográficos, avaliar a taxonomia da espécie e os erros de identificação no material analisado pertencente aos acervos científicos de museus. Para tanto, foi realizada a extração de DNA de 200 amostras de ossos turbinais obtidos em museus de história natural e 78 destes espécimes foram identificados a partir de iniciadores do gene citocromo b (224bp). O total de 22 espécimes identificados como pertencentes à espécie Mazama bororo permitiu conhecer áreas inéditas da distribuição histórica e, possivelmente atuais, da espécie, como os estados de Rio Grande do Sul, Minas Gerais, Goiás, Espírito Santo e Bahia. Além disso, a comparação entre o DNA dos holótipos de Mazama bororo e de Mazama americana jucunda indica que a espécie M. bororo corresponde à subespécie M. americana jucunda, descrita em 1913, demonstrando a necessidade de elevar essa subespécie à categoria de espécie. Análises filogeográficas da espécie demonstram que M. bororo não apresenta uma estruturação populacional histórica e que diversidade genética é baixa quando comparada a outras espécies, um indicativo de que políticas de manutenção e conservação dessa espécie são essenciais a sua permanência. Comparando-se as identificações morfológicas presentes nos museus com as identificações obtidas a partir do marcador molecular utilizado observa-se que a taxa de erro decorrente da classificação baseada em caracteres morfológicos foi de 26%. Entretanto, espera-se que, com o auxílio do DNA de coleções científicas, a seleção de caracteres morfológicos não convergentes para este grupo seja possível, permitindo assim a realização de identificações morfológicas corretamente. / Mazama bororo was recently described in 1996 and is considered the most threatened species of Brazilian deer. Due to this, basic aspects of its biology are still unknown. Thus, this research project aims to use DNA extracted from recent specimens and from natural history collections to review the taxonomy, to describe historical distribution and to investigate the existence of phylogeographic patterns on M. bororo. For this purpose, we extracted DNA from 200 samples of turbinate bones obtained from natural history collections and 78 of these were identified from cytochrome b initiator (224bp). We obtained a total of 22 specimens identified as M. bororo. This result allowed identify unpublished areas on historical and perhaps current distribution of M. bororo in states such as Rio Grande do Sul, Minas Gerais, Goiás, Espírito Santo and Bahia. Moreover, the comparison among the DNA from holotype of M. bororo and Mazama americana jucunda indicates that M. bororo corresponds to the subspecies M. americana jucunda, described in 1913, highlighting the need to raise this subspecies to full species status. Our results also demonstrates that M. bororo did not show a genetic structuration of their populations and that their genetic diversity is lower than other species, highlighting the need to increase conservation and environment policy efforts to maintenance of this species. Finally, when we compare the morphological identification available on natural history collections with the identification obtained from molecular markers we found that the error rate resulting from the classification based on morphological characters was 26%. Nevertheless, we expect with the help of DNA from natural history collections will be possible to select non-convergent morphological characters for this group, allowing thus correct morphological identifications. / FAPESP: 2013/05944-7