Made available in DSpace on 2018-08-01T23:27:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10881_81 - Mylla Carla Cescon Freire.pdf: 1313608 bytes, checksum: 57fa1668897624f985a8b3440fe12072 (MD5) Previous issue date: 2017-04-07 / O Stenella coeruleoalba é um pequeno cetáceo pelágico da família Delphininae que apresenta uma ampla distribuição e pode ser encontrado em águas tropicais e temperadas dos oceanos Atlântico, Pacífico e Índico, bem como em mares adjacentes, como o Mar Mediterrâneo. O presente estudo teve por objetivo analisar a região do citocromo b (Cit-b) e a região controle (D-loop) do DNA mitocondrial de indivíduos do Nordeste e do Sul do Brasil (Oceano Atlântico Sul), além de compará-las com sequências de golfinhos-listrados provenientes do Oceano Atlântico Norte, e com isso avaliar os índices de diversidade e a presença ou a ausência de estruturação genética entre as diferentes localidades. Os S. coeruleoalba do Brasil apresentaram uma alta diversidade genética para ambos os marcadores mitocondriais analisados (D-loop: h= 0,984; π= 0,294; Cit-b: h= 0,848; π= 0,249) e considerando o marcador Cit-b constituem duas populações (FST= 0,180; P= 0,045). Uma diferenciação significativa entre as unidades amostrais de S. coeruleoalba do Atlântico Norte e do Atlântico Sul foi verificada a partir dos dois marcadores mitocondriais avaliados (D-loop: FST= 0,034/ P= 0,009; Cit-b: FST= 0,130/ P= 0,026). Ademais, com a região D-loop, foi possível evidenciar estruturação genética entre dois grupos de golfinhos-listrados do Mar Mediterrâneo (FST= 0,0913/ P= 0,000). Não foi possível identificar estruturação entre os indivíduos do oeste do Oceano Atlântico Norte com as unidades amostrais do Brasil, mesmo estes não apresentando compartilhamento de haplótipos. Tal fato sugere que estas unidades possam ter surgido de linhagens próximas geneticamente e ainda fazem parte de uma mesma população. Até então, nenhum estudo genético populacional com a espécie S. coeruleoalba havia sido realizado no Oceano Atlântico Sul. Entender como os golfinhos-listrados encontram-se estruturados é de suma importância para compreender a genética destes indivíduos e assim definir estratégias de conservação adequadas para cada população identificada.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:09:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_5352_Juliander Agrizzi.pdf: 606180 bytes, checksum: f3bc95528fb2b8aba7449f2329c84f7c (MD5) Previous issue date: 2012-02-27 / Os roedores de espinho Echimyidae são a família mais diversa em termos taxonômicos e fenotípicos dentre os roedores histricognatos. Nessa família, as espécies de Trinomys são restritas à região leste do Brasil, com distribuição associada à Mata Atlântica. Dados da literatura sugerem que a grande a variação intraespecífica nesse gênero dificulta a tarefa de se alocar espécimes de museu às 13 espécies atualmente descritas. Dos poucos trabalhos realizados com esse gênero, a maioria se baseou em dados fenotípicos e aqueles que abordaram análises moleculares consideraram poucos genes ou número de exemplares reduzido. O objetivo do presente trabalho foi identificar e comparar a estrutura geográfica da diversidade genética das populações de três espécies de Trinomys, T. paratus, T. panema e T. setosus, que ocorrem na região central da Mata Atlântica. Para tal, foram sequenciados e analisados o gene mitocondrial do citocromo b (citb) e um gene nuclear do fator von Willebrand (vWF) de 103 espécimes. A filogenia concatenada dos genes confirmou a monofilia e o alto grau de divergência genética entre essas três espécies. Foram identificados dois filogrupos divergentes tanto em T. setosus e quanto em T. panema, sendo sustentados nas diferentes análises, indicando que sejam unidades taxonômicas distintas. Segundo a datação molecular, a diversificação das linhagens que levam à essas três espécies de Trinomys ocorreu no Mioceno Superior, enquanto a diversificação intraespecífica aconteceu principalmente no Plioceno e Pleistoceno. As redes haplotípicas indicaram que populações dessas três espécies de Trinomys apresentam certa estruturação geográfica na região central da Mata Atlântica. As redes de citb mostraram-se geograficamente mais estruturadas do que as de vWF, o que sugere que as fêmeas dessas espécies de Trinomys devem ter áreas de uso menores e provavelmente dispersam menos do que os machos, pois o gene mitocondrial é transmitido de forma maternal. As populações de T. setosus e T. panema não possuem haplótipos compartilhados de citb, apresentam isolamento por distância e não demonstram sinais de expansão populacional recente. Já o contrário foi observado em T. paratus, onde a maioria dos espécimes analisados foram de baixada e de regiões próximas, facilitando o fluxo gênico e consequentemente o compartilhamento de haplótipos.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / Trypanosoma cruzi, como agente etiológico de la enfermedad de Chagas, es uno de los principales problemas de salud pública en diversos países latinoamericanos. De acuerdo con la Organización Panamericana de la Salud (OPS), existirían alrededor de 18 millones de personas infectadas en el continente. A su vez, la Organización Mundial de la Salud (OMS) indica que en el cono sur alrededor de 50 millones de personas están expuestas al riesgo de infectarse. El conocimiento de la magnitud de la infección chagásica, su repercusión sobre la salud y la economía de los países latinoamericanos, varía grandemente, en especial, sus formas clínicas. La caracterización genética de las variedades de T. cruzi es de suma importancia, debido a la considerable heterogeneidad genética y biológica en las poblaciones de este parásito. Se han descritos previamente dos linajes filogenéticos importantes, ambos muy heterogéneos; T.cruzi I y T.cruzi II. En la presente memoria se han caracterizado nueve cepas a través de la secuenciación del gen para citocromo b y su posterior análisis filogenético, el cual se realizó junto al total de cepas descritas en GenBank para citocromo b de T. cruzi. Los resultados obtenidos muestran una topología que divide las diferentes cepas en tres Clados principales (Clado A, B y C), lo cual reafirma resultados obtenidos en diversos estudios previos. Las muestras chilenas se distribuyen en los tres clados, pero principalmente en el Clado A, cuyas cepas están clasificadas como T. cruzi I según la nomenclatura internacional

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:38:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8702_Luana Nara.pdf: 2645043 bytes, checksum: 6e96dd66d7ea2aa0c11054ce8d366ce5 (MD5) Previous issue date: 2015-03-20 / As informações existentes sobre Stenella clymene são escassas, principalmente relacionadas à genética da espécie, por conta disso encontra-se classificada como dados deficientes pela lista vermelha de espécies ameaçadas da IUCN. Em muitos casos, o que dificulta estudos com a espécie, é que esta por ter uma distribuição restrita à áreas profundas das regiões tropicais e temperadas do Oceano Atlântico, seus avistamentos e encalhes não são frequentes. Dos poucos estudos genéticos já realizados, questionamentos surgiram quanto à posição da espécie no gênero, bem como a hipótese de S. clymene ter uma origem hibrida. O presente estudo analisou as regiões citocromo oxidase I (CoI), citocromo b (Cyt b) e região controle (D-loop) do DNA mitocondrial de indivíduos do nordeste do Brasil, comparando-os com sequências da subfamília Delphininae obtidas de estudos prévios. Os indivíduos do Brasil apresentaram uma alta diversidade genética e provavelmente constituem uma mesma unidade populacional. Também foi encontrada uma diferenciação significativa e altos valores no nível de FST entre as unidades populacionais de S. clymene do Atlântico Norte e Atlântico Sul. Entre as unidades populacionais do Atlântico Sul e Golfo do México a diferenciação foi significativa, mas o valor no nível de FST foi baixo, além disso, a rede haplotípica e a recuperação filogenética indicam que provavelmente existe uma conectividade entre as duas populações. Quanto à reconstrução filogenética por região mitocondrial, para D-loop S. clymene é parafilética e grupo irmão do clado composto por Stenella coeruleoalba, Delphinus delphis e Stenella frontalis, enquanto para a região CoI e Cyt b S. clymene é polifilética e grupo irmão de S. coeruleoalba. / The existing information concerning Stenella clymene are scarce specially when considering genetic approaches, which leads to the IUCN red list of threatened species classification as “data deficient”. In many circumstances, molecular studies are difficult as sightings and stranding events are infrequent due the restricted distribution of S. clymene in tropical and temperate deep waters of the Atlantic Ocean. The former studies raised up questions regarding the species position in the genera and a hypothesis that S. clymene has a hybrid origin. The present study analyzed the cytocromo oxidase I (CoI), cytocromo b (Cyt b) and control region (D-loop) of the mitochondrial DNA of northeastern Brazil individuals comparing them with Delphininae sequences obtained from Genbank. Brazilian individuals showed a high genetic diversity and they probably constitute the same population unit. A significant differentiation and high values in the level of FST was found between population units of North Atlantic and South Atlantic Ocean. Between the population units of South Atlantic and Mexican Gulf the differentiation was significant, but FST value was low, in addition the haplotype network and the phylogenetic recovery suggest a connectivity between the two populations. Moreover, in the phylogenetic reconstruction for D-loop region S. clymene is paraphyletic and sister group of Stenella coeruleoalba, Delphinus delphis e Stenella frontalis clade, while for CoI and Cyt b regions S. clymene is polyphyletic and sister group of S. coeruleoalba

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:13:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8_1.pdf: 1293352 bytes, checksum: 746673d69958e017a467483837256871 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Fundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / A caça predatória ilegal é o segundo maior fator de impacto em populações de animais silvestres no Brasil, ficando atrás apenas da perda de habitat por desmatamento. Apesar de ser proibida no Brasil (Leis n° 5.197/1967 e n° 9.605/1998), o poder público ainda não dispõe de recursos eficientes e cientificamente testados que possam ser utilizados em análises forenses visando comprovar o ato da caça, seja ela desportiva ou com finalidade comercial. A análise baseada no DNA tem sido utilizada em várias situações, com a finalidade de detectar fraudes comerciais e outras ilegalidades. Diante do exposto, o objetivo do presente trabalho foi à identificação e a utilização de perfis de PCR/RFLP espécieespecíficos para diagnóstico forense de 15 espécies da fauna brasileira e sua diferenciação de quatro espécies domésticas (bovino, suíno, caprino, ovino), totalizando 19 espécies. Para tanto foram realizadas análises de seqüências de nucleotídeos com os programas Sequencher 4.9, BioEdit 6.0.7, CLEAVER, pDRAW e Gene Runner 3.0.5, tendo sido identificados vários SNPs associados à criação de sítios de enzimas de restrição discriminantes. Com apenas 9 enzimas foram obtidos os perfis de PCR/RFLP discriminantes para as 19 espécies. A validação do protocolo in vitro foi realizada com amostras biológicas de 6 espécies silvestres (Agouti paca, Cebus apella, Dasyprocta leporina, Dasypus novemcinctus, Euphractus sexcinctus, Tayassu tajacu) juntamente com 4 espécies domésticas (Bos taurus, Capra hircus, Ovis aries and Sus scrofa), e os perfis detectados na analise in silico foram confirmados em gel de agarose 2%. O presente estudo reforçou o potencial de polimorfismos do gene Citocromo b como poderosos marcadores para identificação de espécies. Os dados produzidos aqui podem ser úteis como ferramentas em conservação no combate a caça predatória e monitoramento do comércio ilegal de carne de caça e de seus produtos

Los Testudinidae sudamericanos actuales están representados por cuatro especies agrupadas en el género Chelonoidis: C. carbonaria, C. chilensis, C. denticulata y C. nigra (Fritz & Havaš 2007). En nuestro país encontramos a C. carbonaria en unas pocas localidades de las provincias de Chaco, Formosa y Salta, mientras que C. chilensis posee casi el 95% de su distribución en la Argentina. La sistemática de esta última especie ha sido muy debatida desde la publicación del trabajo de Freiberg en 1973 donde se describen las especies C. donosobarrosi y C. petersi, además de la clásica C. chilensis previamente descripta por Gray en 1870. La primera de ellas caracterizada por alcanzar un mayor tamaño y una distribución más austral (localidad tipo: San Antonio Oeste, Río Negro), mientras que la segunda presenta tamaño pequeño y su distribución ocupa el centro norte de nuestro país (localidad tipo: Paraje Kishka, Santiago del Estero). Para fundamentar su trabajo, Freiberg (1973) reconoce dos nuevas especies de Chelonoidis proveyendo una serie de rasgos de forma y coloración del caparazón que resultarían útiles para reconocer ambas especies entre sí y respecto de Chelonoidis chilensis. Esta propuesta taxonómica tuvo dispar aceptación, con lo cual se inició un debate que continúa prácticamente hasta el día de hoy. En cuanto a su situación de conservación, las poblaciones de C. chilensis están incluidas en al Apéndice II de la Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora (CITES), y son consideradas vulnerables por las Comisiones de Conservación de la UICN (Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza, Red List 2011). Los factores más relevantes que ponen en riesgo la integridad de sus poblaciones son la caza extractiva multipropósito (predominantemente mascotismo) y la reducción, modificación y destrucción del hábitat por la expansión de la frontera agrícola. A nivel local, hasta el año 2010 se la categorizó como Amenazada (Richard & Waller 2000) y a partir del año 2012 se la asignó a la categoría vulnerable (Prado et al. 2012) sin que mediara alguna mejora evidente de la situación. A este panorama, debe agregarse el desconocimiento de la biología y ecología de las poblaciones presentes en Argentina. En base a estos antecedentes, el objetivo principal de este trabajo de Tesis fue realizar un análisis de la variabilidad genética de Chelonoidis chilensis a nivel cromosómico y molecular (ADN mitocondrial), en relación a la distribución geográfica y el estado de conservación de las poblaciones naturales de la especie, tanto protegidas como no protegidas, presentes en Argentina. La metodología empleada consistió en primer término, en extraer, amplificar y secuenciar el ADNmt (gen del citocromo b y región Control) proveniente de diversas muestras recolectadas a lo largo de toda la distribución geográfica de la especie en nuestro país y en la obtención de cromosomas a partir de muestras de sangre periférica para elaborar los cariotipos correspondientes. Posteriormente, a partir de los datos moleculares se realizó un análisis filogenético y filogeográfico de las muestras y finalmente la información obtenida se relacionó con los datos citogenéticos y datos de distribución y ecología de la especie, estos últimos obtenidos mediante muestreos poblacionales realizados a campo. A partir del análisis de los datos obtenidos, nuestros resultados permiten concluir que: 1. La variabilidad genética observada corresponde a una única especie: Chelonoidis chilensis (Gray 1870), que presenta una gran variabilidad fenotípica. De esta manera, los datos aquí presentados corroboran, con mayor evidencia, lo recientemente postulado por Fritz et al. (2012) sobre la base del estudio de un menor número de ejemplares y poblaciones. 2. El análisis del ADNmt permitió establecer 2 haplogrupos de C. chilensis, uno correspondiente a las tortugas de la Ecorregión del Monte de Llanuras y Mesetas, y el otro a las tortugas de la Ecorregión Chaco Seco. 3. En cuanto a la constitución cromosómica de la especie, nuestros resultados indicaron que la totalidad de C. chilensis presentó un complemento cromosómico constante (2n=52). Asimismo, los haplogrupos mencionados anteriormente evidenciaron un cariomorfo específico, determinado por la existencia de 12 pares de macrocromosomas y 14 pares de microcromosomas (cariomorfo A) en el caso de las tortugas de la Ecorregión Chaco Seco, y 11 pares de macrocromosomas y 15 de microcromosomas (cariomorfo B) en el caso de las tortugas de la Ecorregión del Monte de Llanuras y Mesetas. La existencia de una tortuga con características genéticas mixtas (haplogrupo del Monte y cariomorfo del Chaco) en el grupo bajo estudio evidenciaría la ocurrencia de cruzamientos entre individuos de las 2 regiones antes mencionadas y, lo más importante, que su descendencia sería viable. 4. La variabilidad genética observada en las poblaciones naturales de C. chilensis podría explicarse por la existencia de un evento vicariante a causa de los cambios climáticos del Plio-Pleistoceno. Se propone que estos cambios generaron dos grupos poblacionales, uno con distribución en la actual Ecorregión del Monte de Llanuras y Mesetas y en parte de la zona más austral de la actual Ecorregión Chaco seco, mientras que el otro grupo es exclusivo de la Ecorregión Chaco Seco. 5. Proponemos que la especie estudiada sea considerada como Amenazada, en vez de Vulnerable, tal cual ha sido recientemente categorizada (Prado et al. 2012). Las razones para ello son: (a) valores bajos de abundancia encontrados en la mayoría de las localidades, (b) la aparente ausencia de poblaciones en gran parte de las localidades estudiadas mediante el método de búsqueda al azar, (c) la existencia de una clara regresión, disminución espacial y pérdida de calidad de hábitat sugerida por diversos autores, fundamentalmente para la Ecorregión Chaco Seco, y (d) la existencia de un mercado ilegal aún prevalente, no cuantificado ni controlado efectivamente.

Made available in DSpace on 2016-12-23T13:47:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jucara Albina da Silva Gomes.pdf: 1575369 bytes, checksum: 1445d86b74105309d6fa7115013412e5 (MD5) Previous issue date: 2008-02-20 / Thaptomys is a monotypic genus. Thaptomys nigrita is only species recognized to the genus to the moment, although the taxonomic history of genus reveals more than one species has been described in the literature. Currently, there are four scenarios presented in taxonomic literature for the genus: 1) A single species, without subspecies, with wide geographical distribution, 2) One species with two subspecies, being Thaptomys nigrita nigrita distributed between southern of Bahia to northern of Santa Catarina and Thaptomys nigrita subterraneus distributed south of São Paulo to the north of Rio Grande do Sul, including eastern of Paraguay and northeastern of Argentina; 3) Two species with karyotype distinction, being Thaptomys sp. restricted to the south of Bahia with 2n = 50 and Thaptomys nigrita occurring in the rest of the genus distribution with 2n = 52, 4) Two species with morphological differentiation and one variant form, being Thaptomys sp. found in southern of Bahia and Thaptomys nigrita represented by the individuals found in the rest of the distribution of the genus, and a variant form found in Paraná. Thus, the objective of this study was to evaluate the four scenarios to the genus Thaptomys using molecular markers, and to test the existence of more than one taxonomic unit for the genus, from the study of 833 bp of nuclear gene cytochrome b (cit b). For this, we used population genetics analyzes, phylogenetic analyzes and analyzes of molecular variation (AMOVA). Our results revealed that the populations of the ends of the distribution are balanced demographic and population center of the distribution are expanding population. The time since the expansion reveal that the northern populations expanded to southward and southern populations expanded to northward. Phylogenetic analyzes and AMOVA reveal the existence of four evolutionarily significant units. Thus, we propose the existence of four taxonomic units for the genus Thaptomys: Thaptomys sp1, with 2n = 50 to the south of Bahia, Thaptomys nigrita to Espírito Santo, Minas Gerais, Rio de Janeiro and north of São Paulo, with 2n = 52; Thaptomys sp 2 to the center and east of São Paulo and Thaptomys subterraneus to south of São Paulo to Rio Grande do Sul, including northeastern to Argentina / Thaptomys é um gênero monotípico, sendo Thaptomys nigrita sua única espécie reconhecida, embora a história taxonômica do gênero revele que mais de uma espécie já foi descrita na literatura. Atualmente, existem quatro cenários taxonômicos apresentados na literatura para o gênero: 1) Uma única espécie, sem divisão subespecífica, com grande distribuição geográfica; 2) Uma espécie com duas subespécies, sendo Thaptomys nigrita nigrita distribuída entre o sul da Bahia até o norte de Santa Catarina e Thaptomys nigrita subterraneus distribuída do sul de São Paulo até o norte do Rio Grande do Sul, incluindo o leste do Paraguai e o nordeste da Argentina; 3) Duas espécies com distinção cariotípica, sendo Thaptomys sp. restrita ao sul da Bahia com 2n=50 e Thaptomys nigrita ocorrendo no restante da distribuição do gênero com 2n=52; 4) Duas espécies, com uma forma variante, com diferenciação morfológica, sendo Thaptomys sp. encontrado no sul da Bahia e Thaptomys nigrita representado pelo indivíduos encontrados no resto da distribuição do gênero, e uma forma variante encontrada no Paraná. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar os quatro cenários de divisão do gênero Thaptomys utilizando marcadores moleculares, e testar a existência de mais de uma unidade taxonômica para o gênero, a partir do estudo de 833 pb do gene nuclear citocromo b (citb). Para isso foram feitas análises de variabilidade genética intrapopulacionais, análises de demográficas das populações, análises filogenéticas e análises de variação molecular interpopulacional (AMOVA). Nossos resultados revelaram que as populações das extremidades da distribuição de Thaptomys se encontram em equilíbrio demográfico e as populações do centro da distribuição estão em expansão populacional. Os tempos desde a expansão revelam que as populações do norte se expandiram em direção ao sul e as populações do sul em direção ao norte. As análises filogenéticas e as análises de AMOVA revelam a existência de quatro unidades evolutivamente significantes. Dessa forma, propomos a existência de quatro unidades taxonômicas para o gênero Thaptomys: Thaptomys sp1, com 2n=50 para o sul da Bahia, Thaptomys nigrita para Espírito Santo, Minas Gerais, Rio de Janeiro e norte de São Paulo, com 2n=52; Thaptomys sp 2 para o centro e leste de São Paulo e Thaptomys subterraneus para sul de São Paulo até o Rio Grande do Sul, incluindo o nordeste da Argentina

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissPPZ.pdf: 10164746 bytes, checksum: 6cb727b1bda5e6495013b55cc249b925 (MD5) Previous issue date: 2006-05-19 / Financiadora de Estudos e Projetos / The lambaris, which include small Astyanax scabripinnis fish, inhabit the headwaters of small streams, forming well known populational isolates. These populations are possibly inbred, presenting little or no gene flow and reduced size. It is believed that these characteristics have aided the fixation of a pronounced karyotypic variability, contributing to the elevated phenotypic plasticity observed between the populations. Due to these factors, this fish group has received special treatment, since they represent a species complex. However, despite abundant cytogenetic studies and all the attention granted to this group, such a polymorphism has not yet been verified on a molecular level and its phylogeny remains unresolved. The verification of whether the karyotypic variations found between the A. scabripinnis populations of the Campos do Jordão region also exist on a molecular level, the estimate of part of the current phylogenetic relationships between them and, also, the verification of whether there is any relationship between the presence or absence of B chromosomes in this species with the observed haplotypic diversity was possible through the analysis of the intraspecific genetic variation of a part of the mitochondrial cytochrome b. The results corroborate the hypothesis that these populations were in contact prior to the elevation of the Serra da Mantiqueira and that they are currently geographically separated. The phylogenetic relationships between the studied populations are discussed. The absence of evolutionary relationship between the cytochrome b gene and the supernumerary chromosomes of these populations was observed. / A espécie Astyanax scabripinnis, constituída por pequenos peixes, popularmente conhecidos como lambari, são habitantes das cabeceiras de pequenos córregos, formando isolados populacionais já bem conhecidos. Estas populações podem ser endogâmicas, apresentando baixo ou nenhum fluxo gênico e tamanho reduzido. Acredita-se que tais características tenham auxiliado na fixação de acentuada variabilidade cariotípica e morfológica, contribuindo para a elevada plasticidade fenotípica observada entre as diferentes populações. Devido a esses fatores, tem-se dado um tratamento especial para esse grupo de peixes, uma vez que eles representam um complexo de espécies. Porém, apesar dos estudos citogenéticos serem abundantes e de toda atenção voltada para este grupo, tal polimorfismo ainda não foi verificado em nível molecular, sendo sua filogenia ainda uma questão aberta. A partir da análise da variação genética intraespecífica de parte do gene mitocondrial citocromo b, foi possível verificar se as variações cariotípicas encontradas entre as populações de A. scabripinnis da região de Campos do Jordão também existem em nível molecular, bem como estimar parte das relações filogenéticas atuais entre as mesmas. A análise da rede de haplótipos corrobora a hipótese de que estas populações estiveram em contato anteriormente ao soerguimento da Serra da Mantiqueira, e hoje se encontram geograficamente separada. Além disso, foi possível inferir que a população do Lago do Pedalinho, provavelmente esteja sofrendo influencia de ações antrópicas e/ou do efeito fundador. Estudos futuros utilizando um número maior de indivíduos por população permitirão a realização de análise cladística aninhada, e a utilização de marcadores moleculares com taxa evolutiva mais rápida, poderá inferir sobre uma história evolutiva mais recente deste grupo de peixes.

Submitted by Natalia de Souza Gonçalves (natalia.goncalves@ufpe.br) on 2016-09-23T12:27:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Bárbara - Dissertação (1).pdf: 1256778 bytes, checksum: f7860c2ccf9b24ebb97f4ef0f9969fa5 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-23T12:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Bárbara - Dissertação (1).pdf: 1256778 bytes, checksum: f7860c2ccf9b24ebb97f4ef0f9969fa5 (MD5) Previous issue date: 2016-03-11 / CNPq / A Entomologia Forense é a aplicação de insetos, ácaros e outros artrópodes em investigações criminais. Na Medicina Legal, sua principal aplicação é na elucidação de crimes violentos. Para tanto, faz-se necessária a correta identificação das espécies, o que, por muitas vezes é uma tarefa difícil, principalmente na fase larval por apresentarem poucas diferenças morfológicas. Tendo em vista esta dificuldade para identificação, o presente trabalho objetivou identificar através de técnicas de biologia molecular espécimes imaturos de dípteros com interesse forense. Foram coletados dípteros imaturos em dez cadáveres decompostos recém-admitidos aos Serviços de Medicina Legal dos estados da Paraíba e Pernambuco. O DNA foi isolado a partir da técnica de extração orgânica. Em seguida, foram realizadas reações de amplificação e sequenciamento de um segmento do gene citocromo B. As sequências foram identificadas através da busca por homologia contra sequências depositadas no GenBank a partir do BLASTn; os grupos monofiléticos foram agrupados através do modelo K2P, conduzidos no programa MEGA e a diversidade genética estimada no DNAsp. Por meio das análises foi possível identificar seis espécies pertencentes a três famílias, estando a espécie Chrysomya albiceps presente em seis cadáveres decompostos; as análises de diversidade genética para C. albiceps revelaram baixo polimorfismo, propondo ausência de barreiras genéticas entre as populações. Conclui-se que o marcador é eficiente para a identificação de espécies, no entanto para diversidade genética faz-se necessária a utilização de marcadores alternativos. / Forensic Entomology is the application of insects, mites and other arthropods in criminal investigations. In Legal Medicine, its main application is in the elucidation of violent crimes. Therefore, the correct identification of the species is needed, which in is often a difficult task, especially in the larval stage when they have little morphological differences. In view of this difficulty in identification, this study aimed to identify, by molecular biology techniques, immature specimens of Diptera with forensic interest. Were collected immature Diptera in ten decomposing corpses newly admitted to the Legal Medicine Services of the states of Paraiba and Pernambuco. DNA was isolated from the organic extraction method with phenol-chloroform. Then, were performed amplification and sequencing reactions in a segment of the cytochrome B gene. The sequences were identified by homology search against sequences deposited in GenBank throught BLASTn; the monophyletic groups were grouped by the K2P model, conducted in the MEGA program and the genetic diversity estimated in DNAsp. Through the analysis was possible to identify six species belonging to three families, being the kind Chrysomya albiceps present in six decomposing corpses; the analysis of genetic diversity for C. albiceps showed low polymorphism, suggesting the absence of genetic barriers between populations. It concludes that the marker is effective for identifying species, however for genetic diversity is necessary the use of alternative markers.

Submitted by Natalia de Souza Gonçalves (natalia.goncalves@ufpe.br) on 2016-09-23T13:58:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Emilly.pdf: 3694284 bytes, checksum: b1e6e78f9d75225d406cb1ffd3c9bc2b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-23T13:58:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Tese Emilly.pdf: 3694284 bytes, checksum: b1e6e78f9d75225d406cb1ffd3c9bc2b (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / FACEPE / CAPES / CNPq / O beijupirá Rachycentron canadum, é um peixe pelágico marinho, migrador, cosmopolita que possui grande interesse comercial no mundo. O presente trabalho objetivou avaliar a existência de estruturação populacional interoceânica, analisar a diversidade genética e a conectividade entre as populações no Atlântico Sul, além de estimar a variabilidade e endogamia da espécie nas pisciculturas e na costa brasileira. Para isso foram utilizados exemplares do beijupirá ao longo de sua distribuição global (Atlântico, Índico e Pacífico), na costa brasileira e em quatro pisciculturas no Brasil analisados por meio de marcadores microssatélites e do DNAmt (citocromo b e D-loop). Os resultados obtidos na análise interoceânica indicam alta diversidade genética e moderada estruturação genético-populacional para o D-loop, rejeitando a hipótese de panmixia global da espécie. Na costa brasileira foi observada ausência de estruturação populacional, evidenciando conectividade e inexistência de barreiras que impeçam o fluxo gênico e a migração da espécie, revelando uma população panmítica intra-oceânica. Já nas pisciculturas do beijupirá no Brasil foi observada perda de diversidade genética e diferenciação genética entre as pisciculturas e os selvagens, apesar do cultivo recente da espécie. Diante disso, o gerenciamento da pesca tanto a nível mundial, quanto local, e o manejo da espécie nas estações de piscicultura devem considerar estas informações para a exploração sustentável e o comércio de indivíduos em termos regionais e globais, trazendo implicações para o manejo da espécie e sua conservação. / Cobia Rachycentron canadum, is a marine pelagic, migratory, cosmopolitan fish that has great commercial interest in the world. This study aimed to evaluate the existence of inter-oceanic population structure, analyze the genetic diversity and connectivity among populations in the South Atlantic, as well as to estimate the variability and inbreeding in cobia farms and the Brazilian coast. Specimens were collected throughout its global distribution (Atlantic, Indian and Pacific), the Brazilian coast and four aquaculture installations in Brazil using microsatellite markers and mtDNA (cytochrome b and D-loop). The results of the inter-oceanic analysis indicate high genetic diversity and moderate genetic population structure for the D-loop, rejecting the hypothesis of global panmixia. In the Brazilian coast the absence of population structure was observed, showing connectivity and lack of barriers that prevent gene flow and migration of species, revealing an intra-oceanic panmitic population. However, in the farmed cobia, a loss of genetic diversity was detected , besides genetic differentiation between farm and wild, despite the recent farming of the species. Thus, the fisheries management both globally and locally, and the maintenance of species in aquaculture installations should consider this information for the sustainable exploitation and trade of individuals in regional and global terms, bringing implications for the management of the species and its conservation.