O conhecimento das causas de morbidade e mortalidade dos mamíferos aquáticos pertencentes à ordem Cetacea e subordem Pinnipedia no Brasil é escasso. Este trabalho teve por objetivo caracterizar as principais causas que contribuem para a morte destes animais, incluindo dentre outras as enfermidades infecciosas, parasitárias, traumáticas, metabólicas e nutricionais. Foram analisadas amostras provenientes de necropsias de 110 indivíduos oriundos de encalhes naturais e capturas acidentais em redes de pesca ocorridos na costa sul e sudeste do Brasil. Ocasionalmente, amostras de cetáceos e pinípedes provenientes de centros de reabilitação, zoológicos, aquários e oceanários também foram analisadas. As amostras consistiram de fragmentos de 1 a 2 cm3 dos órgãos principais acondicionados em formalina a 10%. As afecções foram diagnosticadas através de exames anatomopatológicos, associados, quando possível a resultados microbiológicos e parasitológicos. Dos diagnósticos finais elucidados para os cetáceos 88,6% (70/79) tiveram a morte relacionada com o sistema respiratório, 3,8% (3/79) de origem metabólica, 2,5% (2/79) de etiologia infecciosa, 1,3% (1/79) com origem traumática antropogênica e em 3,8% (3/79) foi indeterminada. Nos pinípedes as causas de morte também estiveram relacionadas principalmente com o trato respiratório (48,5% - 15/31). A morte decorrente de outras causas incluiu: 29,1% (9/31) de causas metabólicas; 3,2% (1/31) nutricional; 3,2% (1/31) digestivo; 3,2% (1/31) urinário; 3,2% (1/31) físico; 3,2% (1/31) síndrome, colapso; 3,2% (1/31) vandalismo; 3,2% (1/31) indeterminado. A análise parasitológica foi realizada em 15,4% (17/110) dos casos e a bacteriologia em 10,9% (12/110) dos casos. As interpretações anatomopatológicas foram associadas aos demais resultados, quando presentes, e então analisados conforme informações recentes de literatura relativas ao assunto. As amostras utilizadas na realização deste projeto complementam o banco de tecidos de animais selvagens mantido pelo Laboratório de Patologia Comparada de Animais Selvagens da FMVZ, formando dessa forma o primeiro acervo de tecidos de mamíferos marinhos disponível no Brasil. Os resultados alcançados neste estudo reforçam a necessidade da abordagem multidisciplinar dos animais encalhados e também dos capturados acidentalmente em redes de pesca, buscando informações que possam colaborar para uma maior compreensão dos processos patológicos que os acometem e os predispõe à morte. / The known causes of morbidity and mortality of aquatic mammals belonging to the Order Cetacea and Suborder Pinnipedia in Brazil is limited. The aim of this work was to characterize the main processes that contribute to or cause the death of these animals, and included investigating infectious, parasitic, traumatic, metabolic and nutritional diseases. Samples coming from 110 fresh animals were analyzed, including individuals from strandings and incidentally caught in fishing nets along the south and southeastern coasts of Brazil. Circumstantially, carcasses coming from zoological collections, aquariums and rehabilitation centers were also included. The samples consisted of fragments of 1-2 cm3 taken of the main organs and fixed in 10% formalin. All the tissues have been processed according to routine histological procedures and analyzed under light microscopy. Diseases were diagnosed through anatomopathologic examinations, associated, whenever possible, with microbiologic and parasitologic results and then compared to related bibliography. Final results, mentioning the cause of the death, included: cetaceans: 88,6% (70/79) had lesions associated with the respiratory tract; 3,8% (3/79) of metabolic origin, 2,5% (2/79) of infectious etiology, 1,3% (1/79) were human related injuries, and 3,8% (3/79) of the cases were undetermined. For the pinnipeds the main cause of death was also related to the respiratory tract (48,5% - 15/31). The causes of death implicated in the other cases included: 29,1% (9/31) metabolical causes; 3,2% (1/31) nutritional origin; 3,2% (1/31) digestive causes; 3,2% (1/31) urinary tract; 3,2% (1/31) physical causes; 3,2% (1/31) syndrome; 3,2% (1/31) human related injuries; 3,2% (1/31) were undetermined. Parasitological analyses were performed in 15,4% (17/110) of the cases and bacteriology in 10,9% (12/110). The samples utilized in this project were stored to create a tissue bank for further studies. The results achieved in this work reinforce the need for a multidisciplinary view of stranded and by-caught animals, searching for information that can collaborate to better understand the pathologic processes affecting marine mammals and predisposing their death.

Sotalia guianensis é um pequeno cetáceo costeiro encontrado ao longo do Oceano Atlântico Sul-Ocidental. Está exposta a inúmeras ameaças, tais como captura acidental em redes de pesca, tráfego de embarcações e turismo. A análise de viabilidade populacional (AVP) é uma forma de prever as flutuações e a probabilidade de persistência ou extinção de uma espécie ou população ao longo do tempo, incorporando dados demográficos, ecológicos e ambientais de populações reais em simulações computacionais de modelos estocásticos e determinísticos. O presente estudo teve como objetivos estimar densidade, abundância e realizar uma AVP para S. guianensis no Complexo Estuarino-Lagunar de Cananéia, São Paulo. Estimativas de abundância e densidade foram obtidas entre 2011 e 2012, utilizando o método de transecção linear com amostragem de distâncias, com 1.339,91 km percorridos e 83h05min em esforço. Avistou-se 241 grupos, compostos por 1 a 20 indivíduos. O programa Distance, com modelo half-normal e ajuste coseno e menor valor de AIC, estimou uma abundância de 193 indivíduos (95%IC: 158 - 237) e densidade de 2,5538 ind/km2 (95%IC: 2,0812 - 3,1337). A média de tamanho de grupo é 4,1504 indivíduos (95%IC: 3,7666 - 4,5734). De forma geral, a espécie apresenta grandes variações ao longo de sua distribuição com relação ao tamanho populacional, densidade, tamanho de grupos, distribuição nos habitats e residência. Tais diferenças estão associadas possivelmente às características físicas e ambientais de cada habitat, que interferem direta ou indiretamente na distribuição e dinâmica populacional da espécie e suas presas. Para a AVP a população foi tratada como não suplementada, sem dispersão, sem remoção, sem depressão endogâmica e a extinção foi definida como a permanência de apenas um sexo. O valor inicial da população é 193 indivíduos e demais parâmetros demográficos e reprodutivos foram estimados com base na literatura disponível. Variações de parâmetros específicos (mortalidade, capacidade de suporte do ambiente (K), variação ambiental na reprodução e catástrofe) foram inseridas nos cenários para avaliar as tendências populacionais sob diferentes ameças. Utilizou-se o programa VORTEX 9.99b. A AVP apontou para o declínio e extinção (P(E) = 1,000) da população em menos de 300 anos em todos os cenários, com taxas de crescimento de -0,082 (SD = 0,120), - 0,049 (SD = 0,107) e -0,086 (SD = 0,062), para os cenários 1, 2 e 3 respectivamente. O tempo médio para extinção foi estimado em 39,6 anos para o cenário 1, 57,3 anos para o cenário 2 e 3,3 anos para o cenário 3. As projeções geradas pela AVP apontaram cenários pessimistas, o que pode estar relacionado ao pequeno tamanho da população. As análises mostram que variações no tamanho populacional, mortalidade, K e catástrofes podem influenciar fortemente a persistência de pequenas populações. O estuário de Cananéia é um ambiente favorável e bem preservado que oferece recursos suficientes para S. guianensis, entretanto, o aumento das atividades antrópicas na área pode levar a mudanças na dinâmica populacional e alterações no habitat, comprometendo sua persistência ao longo do tempo. / Sotalia guianensis is a small coastal cetacean found along the south-western Atlantic Ocean. Through its range, is exposed to numerous threats, such as bycatch in fishing nets, vessel traffic and tourism. Population viability analysis (PVA) is a way to predict the trends and the probability of persistence or extinction of a species or population over time, incorporating demographic, ecological and environmental data of real populations in computer simulations of stochastic and deterministic models. The present study aimed to estimate density, abundance and population viability of S. guianensis in the estuarine-lagoon complex. Estimates of abundance and density were obtained between 2011 and 2012, using the distance sampling method and linear transects, with 1,339 .91 km and 83h05min in effort. It were recorded 241 groups (n) with group size between 1 to 20 individuals. The Distance program, with half-normal model and adjust cosine with the lowest AIC, estimated an abundance of 193 individuals (95% CI: 158-237) and density of 2.5538 ind/km2 (95% CI: 2.0812 - 3.1337). The average group size is 4.1504 individuals (95% IC: 3.7666-4.5734). In general, the species presents large variations throughout its distribution regarding population size, density, groups size, distribution in habitat and residence. Such differences are possibly associated with the physical characteristics of each habitat and environmental conditions that interfere directly or indirectly in the distribution and population dynamics of the species and its prey. For the PVA population was treated as not supplemented, without dispersion, without removal, without inbreeding depression, and extinction was defined as the presence of only one sex. The initial population size was 193 individuals and other demographic and reproductive parameters were estimated based on available literature for the species. Variations of specific parameters (mortality, carrying capacity of the environment, environmental variation on reproduction and catastrophe) were used to evaluate population trends under different threats and scenarios. It was used the VORTEX program v. 9.99 b. AVP pointed to the decline and extinction (P(E) = 1,000) of the population in less than 300 years in all scenarios, with growth rates of -0.082 (SD = 0.120), -0.049 (SD = 0.107) and - 0.086 (SD = 0.062), for scenarios 1, 2 and 3 respectively. The average time to extinction was estimated at 39.6 years for scenario 1, 57.3 years for scenario 2 and 3.3 years for scenario 3. The projections generated by the AVP showed pessimistic scenarios, which may be related to the small size of the population. The analyses show that variations in population size, mortality, carrying capacity and disasters can strongly influence the persistence of small populations. Cananéia estuary is a well preserved environment that offers sufficient resources to S. guianensis, however, the increase in anthropogenic activities in the estuary may lead to changes in population dynamics and habitat quality, compromising their persistence over time.

O conhecimento das causas de morbidade e mortalidade dos mamíferos aquáticos pertencentes à ordem Cetacea e subordem Pinnipedia no Brasil é escasso. Este trabalho teve por objetivo caracterizar as principais causas que contribuem para a morte destes animais, incluindo dentre outras as enfermidades infecciosas, parasitárias, traumáticas, metabólicas e nutricionais. Foram analisadas amostras provenientes de necropsias de 110 indivíduos oriundos de encalhes naturais e capturas acidentais em redes de pesca ocorridos na costa sul e sudeste do Brasil. Ocasionalmente, amostras de cetáceos e pinípedes provenientes de centros de reabilitação, zoológicos, aquários e oceanários também foram analisadas. As amostras consistiram de fragmentos de 1 a 2 cm3 dos órgãos principais acondicionados em formalina a 10%. As afecções foram diagnosticadas através de exames anatomopatológicos, associados, quando possível a resultados microbiológicos e parasitológicos. Dos diagnósticos finais elucidados para os cetáceos 88,6% (70/79) tiveram a morte relacionada com o sistema respiratório, 3,8% (3/79) de origem metabólica, 2,5% (2/79) de etiologia infecciosa, 1,3% (1/79) com origem traumática antropogênica e em 3,8% (3/79) foi indeterminada. Nos pinípedes as causas de morte também estiveram relacionadas principalmente com o trato respiratório (48,5% - 15/31). A morte decorrente de outras causas incluiu: 29,1% (9/31) de causas metabólicas; 3,2% (1/31) nutricional; 3,2% (1/31) digestivo; 3,2% (1/31) urinário; 3,2% (1/31) físico; 3,2% (1/31) síndrome, colapso; 3,2% (1/31) vandalismo; 3,2% (1/31) indeterminado. A análise parasitológica foi realizada em 15,4% (17/110) dos casos e a bacteriologia em 10,9% (12/110) dos casos. As interpretações anatomopatológicas foram associadas aos demais resultados, quando presentes, e então analisados conforme informações recentes de literatura relativas ao assunto. As amostras utilizadas na realização deste projeto complementam o banco de tecidos de animais selvagens mantido pelo Laboratório de Patologia Comparada de Animais Selvagens da FMVZ, formando dessa forma o primeiro acervo de tecidos de mamíferos marinhos disponível no Brasil. Os resultados alcançados neste estudo reforçam a necessidade da abordagem multidisciplinar dos animais encalhados e também dos capturados acidentalmente em redes de pesca, buscando informações que possam colaborar para uma maior compreensão dos processos patológicos que os acometem e os predispõe à morte. / The known causes of morbidity and mortality of aquatic mammals belonging to the Order Cetacea and Suborder Pinnipedia in Brazil is limited. The aim of this work was to characterize the main processes that contribute to or cause the death of these animals, and included investigating infectious, parasitic, traumatic, metabolic and nutritional diseases. Samples coming from 110 fresh animals were analyzed, including individuals from strandings and incidentally caught in fishing nets along the south and southeastern coasts of Brazil. Circumstantially, carcasses coming from zoological collections, aquariums and rehabilitation centers were also included. The samples consisted of fragments of 1-2 cm3 taken of the main organs and fixed in 10% formalin. All the tissues have been processed according to routine histological procedures and analyzed under light microscopy. Diseases were diagnosed through anatomopathologic examinations, associated, whenever possible, with microbiologic and parasitologic results and then compared to related bibliography. Final results, mentioning the cause of the death, included: cetaceans: 88,6% (70/79) had lesions associated with the respiratory tract; 3,8% (3/79) of metabolic origin, 2,5% (2/79) of infectious etiology, 1,3% (1/79) were human related injuries, and 3,8% (3/79) of the cases were undetermined. For the pinnipeds the main cause of death was also related to the respiratory tract (48,5% - 15/31). The causes of death implicated in the other cases included: 29,1% (9/31) metabolical causes; 3,2% (1/31) nutritional origin; 3,2% (1/31) digestive causes; 3,2% (1/31) urinary tract; 3,2% (1/31) physical causes; 3,2% (1/31) syndrome; 3,2% (1/31) human related injuries; 3,2% (1/31) were undetermined. Parasitological analyses were performed in 15,4% (17/110) of the cases and bacteriology in 10,9% (12/110). The samples utilized in this project were stored to create a tissue bank for further studies. The results achieved in this work reinforce the need for a multidisciplinary view of stranded and by-caught animals, searching for information that can collaborate to better understand the pathologic processes affecting marine mammals and predisposing their death.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O boto-cinza (Sotalia guianensis Van Benédén, 1864) é um pequeno cetáceo da família Delphinidae. Ocorre em águas costeiras da América do Sul e Central, associado à ambientes estuarinos, às baías e áreas protegidas. Estudos sobre hábitos alimentares são importantes para avaliar os padrões de relação entre presa e predador. Desta forma, o conhecimento da composição da dieta do predador pode fornecer informações a respeito de sua distribuição, padrões de migração e de seu comportamento, além de contribuir com informações sobre a biologia e comportamento de suas presas. Neste trabalho, são abordados aspectos da ecologia alimentar do boto-cinza da Baía de Sepetiba, com o objetivo de caracterizar a dieta e compará-la em relação ao sexo, classe etária e estações do ano, a partir da análise do conteúdo estomacal de 76 botos-cinza encalhados entre 2005 e 2011. Os itens alimentares recuperados dos estômagos como otólitos e ossos de peixes, bicos de cefalópodes, carapaças de crustáceos, foram identificados baseando-se em trabalhos de identificação e em uma coleção de referência. O comprimento e biomassa das presas foram estimados com o uso de equações de regressão encontradas na literatura para estas espécies. As amostras foram separadas em machos adultos, fêmeas adultas e juvenis, e em estações quente/chuvosa (out-abr) e fria/seca (mai-set), em que os estômagos foram recuperados. Um total de 1800 presas foi identificado, relativo a 23 espécies de teleósteo, quatro espécies de cefalópode e três de crustáceo. O boto-cinza da Baía de Sepetiba apresentou uma dieta tipicamente piscívora, com um hábito alimentar no qual, poucas espécies foram consumidas em alta frequencia. Todas as presas identificadas têm distribuição costeira sendo a maioria estuarina de pequeno porte ou juvenil. As presas mais importantes na dieta do boto-cinza, segundo o índice de importância relativa (IIR), foram Cetengraulis edentulus; Micropogonias furnieri; Mugil spp.; Chloroscombrus chrysurus; Cynoscion jamaicensis; Stellifer sp.; e Sciadeichthys luniscutis. Dentre os cefalópodes, a lula Doryteuthis plei foi à presa mais importante. Este estudo indica que o boto-cinza apresenta variações intra-específicas no seu hábito alimentar entre fêmeas adultas, machos adultos e juvenis, além de variações sazonais na composição de sua dieta. A partir do conhecimento do comportamento e hábito de suas presas, pode-se concluir que, Sotalia guianensis da Baía de Sepetiba se alimenta ao longo de toda a Baía, além de utilizar áreas costeiras próximas para atividades de alimentação e forrageio. / The Guiana dolphin (Sotalia guianensis, Van Benédén, 1864) is a small cetacean of the Delphinidae family. The species occurs on coastal waters from South and Central America, in estuarine environments, bays and protected areas. This study aims to characterize Guiana dolphin feeding habits and to investigate variation in diet related to sex age class and season, in Sepetiba Bay (RJ). Stomach contents of 76 S. guianensis, stranded between 2005 and 2011, were analysed. Food items found in the stomachs (otoliths, fish bones, cephalopod beaks, crustacean structures) were identified based on identification guides and one reference collection. Some measurements of the prey remains were used to estimate the length and weight of preys using regression equations specific for each prey species. Dolphin sample was gathered into adult males, adult females and juveniles. Season was defined as hot/wet season (Oct-Apr) and cold/dry (May-Sep). A total of 1800 prey were found, including 23 species of teleosts, four species of cephalopods and three species of crustaceans. Guiana dolphin in Sepetiba Bay had a typically piscivorous diet. The index of relative importance (IRI) showed that Cetengraulis edentulus; Micropogonias furnieri; Mugil spp.; Chloroscombrus chrysurus; Cynoscion jamaicensis; Stellifer sp.; e Sciadeichthys luniscutis were the seven most important species. Among cephalopods, the squid Dorytheutis plei was the most important. This study indicates that the Guiana dolphin has intra-specific variations in the diet between adult females, adult males, and young and seasonal variations in the composition of its diet. Diet composition suggests that S. guianensis feeds into Sepetiba Bay and along coastal adjacent waters.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O boto-cinza (Sotalia guianensis Van Benédén, 1864) é um pequeno cetáceo da família Delphinidae. Ocorre em águas costeiras da América do Sul e Central, associado à ambientes estuarinos, às baías e áreas protegidas. Estudos sobre hábitos alimentares são importantes para avaliar os padrões de relação entre presa e predador. Desta forma, o conhecimento da composição da dieta do predador pode fornecer informações a respeito de sua distribuição, padrões de migração e de seu comportamento, além de contribuir com informações sobre a biologia e comportamento de suas presas. Neste trabalho, são abordados aspectos da ecologia alimentar do boto-cinza da Baía de Sepetiba, com o objetivo de caracterizar a dieta e compará-la em relação ao sexo, classe etária e estações do ano, a partir da análise do conteúdo estomacal de 76 botos-cinza encalhados entre 2005 e 2011. Os itens alimentares recuperados dos estômagos como otólitos e ossos de peixes, bicos de cefalópodes, carapaças de crustáceos, foram identificados baseando-se em trabalhos de identificação e em uma coleção de referência. O comprimento e biomassa das presas foram estimados com o uso de equações de regressão encontradas na literatura para estas espécies. As amostras foram separadas em machos adultos, fêmeas adultas e juvenis, e em estações quente/chuvosa (out-abr) e fria/seca (mai-set), em que os estômagos foram recuperados. Um total de 1800 presas foi identificado, relativo a 23 espécies de teleósteo, quatro espécies de cefalópode e três de crustáceo. O boto-cinza da Baía de Sepetiba apresentou uma dieta tipicamente piscívora, com um hábito alimentar no qual, poucas espécies foram consumidas em alta frequencia. Todas as presas identificadas têm distribuição costeira sendo a maioria estuarina de pequeno porte ou juvenil. As presas mais importantes na dieta do boto-cinza, segundo o índice de importância relativa (IIR), foram Cetengraulis edentulus; Micropogonias furnieri; Mugil spp.; Chloroscombrus chrysurus; Cynoscion jamaicensis; Stellifer sp.; e Sciadeichthys luniscutis. Dentre os cefalópodes, a lula Doryteuthis plei foi à presa mais importante. Este estudo indica que o boto-cinza apresenta variações intra-específicas no seu hábito alimentar entre fêmeas adultas, machos adultos e juvenis, além de variações sazonais na composição de sua dieta. A partir do conhecimento do comportamento e hábito de suas presas, pode-se concluir que, Sotalia guianensis da Baía de Sepetiba se alimenta ao longo de toda a Baía, além de utilizar áreas costeiras próximas para atividades de alimentação e forrageio. / The Guiana dolphin (Sotalia guianensis, Van Benédén, 1864) is a small cetacean of the Delphinidae family. The species occurs on coastal waters from South and Central America, in estuarine environments, bays and protected areas. This study aims to characterize Guiana dolphin feeding habits and to investigate variation in diet related to sex age class and season, in Sepetiba Bay (RJ). Stomach contents of 76 S. guianensis, stranded between 2005 and 2011, were analysed. Food items found in the stomachs (otoliths, fish bones, cephalopod beaks, crustacean structures) were identified based on identification guides and one reference collection. Some measurements of the prey remains were used to estimate the length and weight of preys using regression equations specific for each prey species. Dolphin sample was gathered into adult males, adult females and juveniles. Season was defined as hot/wet season (Oct-Apr) and cold/dry (May-Sep). A total of 1800 prey were found, including 23 species of teleosts, four species of cephalopods and three species of crustaceans. Guiana dolphin in Sepetiba Bay had a typically piscivorous diet. The index of relative importance (IRI) showed that Cetengraulis edentulus; Micropogonias furnieri; Mugil spp.; Chloroscombrus chrysurus; Cynoscion jamaicensis; Stellifer sp.; e Sciadeichthys luniscutis were the seven most important species. Among cephalopods, the squid Dorytheutis plei was the most important. This study indicates that the Guiana dolphin has intra-specific variations in the diet between adult females, adult males, and young and seasonal variations in the composition of its diet. Diet composition suggests that S. guianensis feeds into Sepetiba Bay and along coastal adjacent waters.

Sotalia guianensis é um pequeno cetáceo costeiro encontrado ao longo do Oceano Atlântico Sul-Ocidental. Está exposta a inúmeras ameaças, tais como captura acidental em redes de pesca, tráfego de embarcações e turismo. A análise de viabilidade populacional (AVP) é uma forma de prever as flutuações e a probabilidade de persistência ou extinção de uma espécie ou população ao longo do tempo, incorporando dados demográficos, ecológicos e ambientais de populações reais em simulações computacionais de modelos estocásticos e determinísticos. O presente estudo teve como objetivos estimar densidade, abundância e realizar uma AVP para S. guianensis no Complexo Estuarino-Lagunar de Cananéia, São Paulo. Estimativas de abundância e densidade foram obtidas entre 2011 e 2012, utilizando o método de transecção linear com amostragem de distâncias, com 1.339,91 km percorridos e 83h05min em esforço. Avistou-se 241 grupos, compostos por 1 a 20 indivíduos. O programa Distance, com modelo half-normal e ajuste coseno e menor valor de AIC, estimou uma abundância de 193 indivíduos (95%IC: 158 - 237) e densidade de 2,5538 ind/km2 (95%IC: 2,0812 - 3,1337). A média de tamanho de grupo é 4,1504 indivíduos (95%IC: 3,7666 - 4,5734). De forma geral, a espécie apresenta grandes variações ao longo de sua distribuição com relação ao tamanho populacional, densidade, tamanho de grupos, distribuição nos habitats e residência. Tais diferenças estão associadas possivelmente às características físicas e ambientais de cada habitat, que interferem direta ou indiretamente na distribuição e dinâmica populacional da espécie e suas presas. Para a AVP a população foi tratada como não suplementada, sem dispersão, sem remoção, sem depressão endogâmica e a extinção foi definida como a permanência de apenas um sexo. O valor inicial da população é 193 indivíduos e demais parâmetros demográficos e reprodutivos foram estimados com base na literatura disponível. Variações de parâmetros específicos (mortalidade, capacidade de suporte do ambiente (K), variação ambiental na reprodução e catástrofe) foram inseridas nos cenários para avaliar as tendências populacionais sob diferentes ameças. Utilizou-se o programa VORTEX 9.99b. A AVP apontou para o declínio e extinção (P(E) = 1,000) da população em menos de 300 anos em todos os cenários, com taxas de crescimento de -0,082 (SD = 0,120), - 0,049 (SD = 0,107) e -0,086 (SD = 0,062), para os cenários 1, 2 e 3 respectivamente. O tempo médio para extinção foi estimado em 39,6 anos para o cenário 1, 57,3 anos para o cenário 2 e 3,3 anos para o cenário 3. As projeções geradas pela AVP apontaram cenários pessimistas, o que pode estar relacionado ao pequeno tamanho da população. As análises mostram que variações no tamanho populacional, mortalidade, K e catástrofes podem influenciar fortemente a persistência de pequenas populações. O estuário de Cananéia é um ambiente favorável e bem preservado que oferece recursos suficientes para S. guianensis, entretanto, o aumento das atividades antrópicas na área pode levar a mudanças na dinâmica populacional e alterações no habitat, comprometendo sua persistência ao longo do tempo. / Sotalia guianensis is a small coastal cetacean found along the south-western Atlantic Ocean. Through its range, is exposed to numerous threats, such as bycatch in fishing nets, vessel traffic and tourism. Population viability analysis (PVA) is a way to predict the trends and the probability of persistence or extinction of a species or population over time, incorporating demographic, ecological and environmental data of real populations in computer simulations of stochastic and deterministic models. The present study aimed to estimate density, abundance and population viability of S. guianensis in the estuarine-lagoon complex. Estimates of abundance and density were obtained between 2011 and 2012, using the distance sampling method and linear transects, with 1,339 .91 km and 83h05min in effort. It were recorded 241 groups (n) with group size between 1 to 20 individuals. The Distance program, with half-normal model and adjust cosine with the lowest AIC, estimated an abundance of 193 individuals (95% CI: 158-237) and density of 2.5538 ind/km2 (95% CI: 2.0812 - 3.1337). The average group size is 4.1504 individuals (95% IC: 3.7666-4.5734). In general, the species presents large variations throughout its distribution regarding population size, density, groups size, distribution in habitat and residence. Such differences are possibly associated with the physical characteristics of each habitat and environmental conditions that interfere directly or indirectly in the distribution and population dynamics of the species and its prey. For the PVA population was treated as not supplemented, without dispersion, without removal, without inbreeding depression, and extinction was defined as the presence of only one sex. The initial population size was 193 individuals and other demographic and reproductive parameters were estimated based on available literature for the species. Variations of specific parameters (mortality, carrying capacity of the environment, environmental variation on reproduction and catastrophe) were used to evaluate population trends under different threats and scenarios. It was used the VORTEX program v. 9.99 b. AVP pointed to the decline and extinction (P(E) = 1,000) of the population in less than 300 years in all scenarios, with growth rates of -0.082 (SD = 0.120), -0.049 (SD = 0.107) and - 0.086 (SD = 0.062), for scenarios 1, 2 and 3 respectively. The average time to extinction was estimated at 39.6 years for scenario 1, 57.3 years for scenario 2 and 3.3 years for scenario 3. The projections generated by the AVP showed pessimistic scenarios, which may be related to the small size of the population. The analyses show that variations in population size, mortality, carrying capacity and disasters can strongly influence the persistence of small populations. Cananéia estuary is a well preserved environment that offers sufficient resources to S. guianensis, however, the increase in anthropogenic activities in the estuary may lead to changes in population dynamics and habitat quality, compromising their persistence over time.

In conservation ecology, abundance estimates are an important factor from which management decisions are based. Methods to estimate abundance of cetaceans from visual detections are largely developed, whereas parallel methods based on passive acoustic detections are still in their infancy. To estimate the abundance of cetacean species using acoustic detection data, it is first necessary to correctly identify the species that are detected. The current automatic PAMGUARD Whistle Classifier used to automatically identify whistle detection of cetacean species is modified with the objective to facilitate the use of these detections to estimate cetacean abundance. Given the variability of cetacean sounds within and between species, developing an automated species classifier with a 100% correct classification probability for any species is unfeasible. However, through the examples of two case studies it is shown that large and high quality datasets with which to develop these automatic classifiers increase the probability of creating reliable classifiers with low and precise misclassification probability. Given that misclassification is unavoidable, it is necessary to consider the effect of misclassified detections on the number of observed acoustic calls detected and thus on abundance estimates, and to develop robust methods to cope with these misclassifications. Through both heuristic and Bayesian approaches it is demonstrated that if misclassification probabilities are known or estimated precisely, it is possible to estimate the true number of detected calls accurately and precisely. However, misclassification and uncertainty increase the variance of the estimates. If the true numbers of detections from different species are similar, then a small amount of misclassification between species and a small amount of uncertainty in the probabilities of misclassification does not have a detrimental effect on the overall variance and bias of the estimate. However, if there is a difference in the encounter rate between species calls associated with a large amount of uncertainty in the probabilities of misclassification, then the variance of the estimates becomes larger and the bias increases; this in return increases the variance and the bias of the final abundance estimate. This study despite not bringing perfect results highlights for the first time the importance of dealing with the problem of species misclassification for cetacean if acoustic detections are to be used to estimate abundance of cetaceans.

published_or_final_version / abstract / Environmental Management / Master / Master of Science in Environmental Management

Anthropogenic contaminants in the marine environment often biodegrade slowly, bioaccumulate in organisms, and can cause reproductive, immune, and developmental effects on wildlife; however, their effects on cetacean health and behavior have not been extensively studied. This study aims to expand knowledge concerning concentrations and biological effects of endocrine disrupting contaminants and essential and non-essential inorganic elements in stranded cetaceans. We evaluated tissue samples and pathology data from 66 odontocetes that stranded in the southeastern United States during 2012– 2017. Using mass spectrometry blubber samples were analyzed for five endocrine disrupting contaminants (atrazine, bisphenol-A, diethyl phthalate, nonylphenol ethoxylate, triclosan), and liver samples were analyzed for 12 inorganic elements (As, Cd, Co, Cu, Mg, Mn, Fe, Pb, Hg, Se, Tl, Zn). Results from this study demonstrate that exposure to certain contaminants may be associated with subtle or sublethal cellular changes in free-ranging marine mammals that could contribute to health declines or stranding. / Includes bibliography. / Thesis (M.S.)--Florida Atlantic University, 2019. / FAU Electronic Theses and Dissertations Collection

Thesis (Ph. D.)--University of St Andrews, January 2007. / Includes bibliographical references. Available in PDF format via the World Wide Web.