Submitted by Bruna Buch (bruna.buch@gmail.com) on 2019-01-31T14:18:48Z No. of bitstreams: 1 BrunaBuch_Tese.pdf: 6059154 bytes, checksum: ab596bb37969e3a6ac3aea0557b5363e (MD5) / Rejected by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: Problema 01) Solicitamos que corrija o ano descrita na capa para 2019, o ano de entrega da dissertação na Seção Técnica de Pós-Graduação Problema 02) Segundo a Portaria nº 206, de 4 de setembro de 2018, todos os trabalhos que tiveram financiamento CAPES deve constar nos agradecimentos a expressão: "O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 Agradecemos a compreensão. on 2019-01-31T16:28:27Z (GMT) / Submitted by Bruna Buch (bruna.buch@gmail.com) on 2019-01-31T16:59:59Z No. of bitstreams: 1 BrunaBuchTese.pdf: 6058711 bytes, checksum: 91a5b502646692883f387f5ae5a634f6 (MD5) / Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2019-01-31T17:24:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 buch_b_dr_sjrp.pdf: 6058711 bytes, checksum: 91a5b502646692883f387f5ae5a634f6 (MD5) / Made available in DSpace on 2019-01-31T17:24:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 buch_b_dr_sjrp.pdf: 6058711 bytes, checksum: 91a5b502646692883f387f5ae5a634f6 (MD5) Previous issue date: 2018-12-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As cianobactérias são importantes componentes das comunidades aquáticas em diversos ecossistemas, graças a longa história evolutiva do grupo que desenvolveu diversas adaptações fisiológicas e citológicas que permitiram a sua dominância ao redor do globo. As cianobactérias são também os bactérias fotossintetizantes com a morfologia mais diversificada e, embora essa qualidade tenha sido extensivamente utilizada pelos cientistas para a delimitação dos táxons e reconstrução da história evolutiva, vem perdendo cada vez mais espaço para o uso de marcadores moleculares, os quais são capazes de inferir relações filogenéticas mais robustas e que mais proximamente refletem o percurso evolutivo traçado por esses microrganismos. Desse modo, o objetivo da realização deste estudo foi caracterizar taxonomicamente populações de cianobactérias bentônicas de ambientes lênticos da região noroeste do estado de São Paulo, utilizando uma abordagem polifásica, por meio do uso do gene rRNA 16S e da estrutura secundária do ITS 16S-23S, além de considerar aspectos morfológicos e ecológicos. Como resultado deste trabalho, 41 populações de cianobactérias bentônicas foram avaliadas, sendo alocadas em 15 gêneros distribuídos em 11 famílias e cinco ordens. A ordem Oscillatoriales foi a mais representativa entre as populações estudadas (68,3%, 28 populações), seguida pela ordem Synechococcales (19,5%, 8 populações). A análise filogenética do gene RNAr 16S foi capaz de revelar a presença de táxons crípticos, que embora apresentem morfologia correspondente com táxons já descritos, formaram clados separados, indicando se tratarem de táxons ainda não conhecidos, e esse foi o caso de 13 populações aqui estudadas. Parte dos táxons crípticos foi trabalhada em maior profundidade, resultando em três manuscritos apresentados na forma de capítulos que correspondem à descrição dos novos gêneros e espécies Koinonema pervagatum (Capítulo III) e Blennothricopsis periphytica (Capítulo IV), além da descrição de três novas espécies para o gênero Phormidium (Capítulo V), com o registro da primeira espécie bentônica produtora de microcistina para o estado de São Paulo. Embora a prospecção dos genótipos tóxicos, utilizando marcadores específicos para os genes mcyE e sxtA responsáveis pela síntese de microcistinas e saxitoxinas, respectivamente, tenha revelado apenas uma linhagem tóxica, esse resultado é positivo do ponto de vista de impactos relacionados à presença de cianobactérias em corpos d’água para uso público. Entretanto, mostra a importância dos estudos de prospecção de toxinas em cianobactérias bentônicas no Brasil, ainda pouco explorados. / Cyanobacteria are important components of aquatic communities in different ecosystems, thanks to its long evolutionary history that provided several physiological and ecological adaptations, allowing them to spread around the globe. Cyanobacteria are also the most morpological diversified photossintetic bacterial group and, despite many taxonomists have extensively used this character to delimit taxa and to reconstruct their evolutionary history, it has been losing its prominence to molecular markers, which are most suited to infer robust phylogenetic relationships that properly reflect the evolutionary path followed by these organisms. Therefore, the aim of the study was to taxonomically characterize benthic cyanobacterial populations in lentic habitats from the Northwest region of São Paulo state, using a polyphasic approach, through the phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene and the 16S 23S ITS secondary structure, aside from morphological and ecological aspects. As result, 41 benthic cyanobacterial populations were evaluated and assigned to 15 genera distributed in 11 families and five orders. The Oscillatoriales order was the most representative among all (69.3%, 28 populations), followed by the Synechococcales (19.5%, eight populations). The 16S rRNA phylogenetic analysis revealed the presence of cryptotaxa, which, despite morphologically ressembling previously described taxa, formed separated clades, suggesting not yet acknowledged taxa. That was the case of 13 populations studied. Some of these cryptotaxa were deeper evaluated in three manuscripts presented here as chapters and described as the new genera and species Koinonema pervagatum (Chapter III) and Blennothricopsis periphytica (Chapter IV), the description of three new species from the Phormidium genus (Chapter V) and the first record of a benthic microcystin producing cyanobacteria in the São Paulo state. Although the toxic genotypes prospection using specific molecular markers for the mcyE and sxtA genes, responsible for microcystin and saxitoxin production, respectively, revealed only one toxic strain, it demonstrates a positive result regarding the impact caused by toxic cyanobacterial strains in waters for public use worldwide. However, it highlights the importance of studies on potentially toxic benthic cyanobacterial communities, still little explored in Brazil.

Orientador: Helio Langoni / Resumo: EBERHARDT, B.G. Avaliação de micro-organismos zoonóticos em filés de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus). Botucatu, 2018. 71p. Tese (Doutorado) – Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Campus de Botucatu, Universidade Estadual Paulista. RESUMO Cinquenta filés de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) obtidos em mercado de peixes no município de Ourinhos, Estado de São Paulo, foram analisados quanto à prevalência para Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda, Mycobacterium spp. e Cianobactérias. Amostras de músculo foram avaliadas por PCR para Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda e Mycobacterium spp., enquanto que as amostras para cianobactérias foram analisadas por PCR em Tempo Real (qPCR). Os resultados obtidos demonstraram ausência de Aeromonas hydrophila e Edwardsiella tarda nas amostras de filés. A prevalência para Mycobacterium spp. foi de 100% (50/50). Realização posterior de sequenciamento revelou Mycobacterium gordonae. Esta bactéria é considerada um colonizador comum, normalmente não patogênico, porém, há relatos de literatura que demonstram risco de infecção em indivíduos imunossuprimidos e até mesmo imunocompetentes. A taxa de prevalência para cianobactérias foi de 48% (24/50). As cianobactérias (algas azuis) produzem grande quantidade de metabólitos bioativos ou mesmo tóxicos, incluindo toxinas associadas a problemas ambientais e de saúde pública. Considerando a natureza e o papel das cianobactérias como patógenos emergentes, a elevada prevalência... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-03-30Bitstream added on 2014-06-13T18:50:13Z : No. of bitstreams: 1 hereman_tc_me_rcla.pdf: 346939 bytes, checksum: eea54caf1fb86eb9e0c1d403eabf0878 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Plantas cultivadas podem ser contaminadas com cianotoxinas através de irrigação com água contendo cianobactérias tóxicas. Uma espécie freqüentemente encontrada nos corpos d’agua é Microcystis aeruginosa, produtora da microcistina (MC), uma toxina hepatotóxica. Frente a esta possibilidade, nosso objetivo foi investigar os efeitos de extrato bruto de uma linhagem produtora de microcistina (BCCUSP232) e outra não produtora (BCCUSP03) em bioensaio de germinação de sementes e crescimento da hortaliça alface e a possibilidade de bioacumulação da cianotoxina nos tecidos foliares. Sementes germinadas em papel de filtro foram expostas a concentrações entre 0,5 a 100 μg.L-1 de MC-LR durante sete dias, enquanto as plantas cultivadas em vasos contendo substrato comercial para hortaliça foram irrigadas com 100ml de solução aquosa contendo 0,5 a 10 μg.L-1 de MC-LR durante 15 dias ao final do ciclo da cultura. Valores de massa seca correspondentes foram empregados para o tratamento com extrato bruto sem microcistina, além de controle com água. Os efeitos nocivos da MC-LR puderam ser observados no desenvolvimento das plântulas expostas a 75 e 100 μg.L-1, concentrações que induziram uma maior ocorrência de plântulas anormais devido ao aparecimento de necrose na radícula e encurtamento deste órgão nas plântulas normais, como também redução no teor de clorofila e aumento na atividade da enzima antioxidante peroxidase. Para as plantas adultas, a exposição às diferentes concentrações de MC-LR não interferiram no teor de clorofila e na atividade da peroxidase. Contudo, ambos os extratos (com e sem MC-LR) interferiram igualmente na permeabilidade seletiva da membrana plasmática das folhas da planta adulta, mesmo em baixa concentração, podendo assim deixá-la mais suscetível a estresses abióticos e bióticos. Embora as plantas se apresentassem saudáveis... / Crop plants may become contaminated with cyanotoxins during irrigation with water containing toxic cyanobacteria, such as Microcystis aeruginosa, which produces the hepatoxin microcystin (MC). The aim of the present study was to investigate the effects of a crude extract from a microcystin-producing strain (BCCUSP232) and non-microcystin-producing strain (BCCUSP03) on germination and growth bioassays of lettuce and assess the possibility of the bioaccumulation of this cyanotoxin in leaf tissue. Seeds germinated on filter paper were exposed to concentrations of 0.5 to 100 μg.L-1 of MC-LR for seven days, while plants grown in pots containing a commercial substrate were irrigated with 100mL of an aqueous solution containing 0.5 to 10 μg.L-1 of MC-LR for 15 days at the end of the culture cycle. The corresponding dry weight values were used for treatment with the crude extract without microcystin. Control plants received only water. The harmful effects of MC-LR were observed during the development of seedlings exposed to 75 and 100 μg.L-1, with a higher incidence of abnormal seedlings due to the onset of root necrosis as well as a shortening of roots in normal seedlings, a reduction in chlorophyll content and an increase in the activity of the antioxidant enzyme peroxidase. In adult plants, exposure to different concentrations of MC-LR did not affect the chlorophyll content or peroxidase activity. However, even at low concentrations, both extracts (with and without MC-LR) equally affected the selective permeability of the plasma membrane in leaves, which could make the plants more susceptible to biotic and abiotic stresses. Although the plants looked healthy and similar to the controls, there was an accumulation of microcystin in the leaves at concentrations of 7.2 μg.kg-1 and 167.1 μg.kg-1 when... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Bruno Giorno Eberhardt (bruno.giorno@agricultura.gov.br) on 2018-04-21T01:40:57Z No. of bitstreams: 1 TESE DOUTORADO - BRUNO GIORNO EBERHARDT.pdf: 3876871 bytes, checksum: 3c2c7eac21349ce401f54a1cb03fae4f (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Lucia Martins Frederico null (mlucia@fca.unesp.br) on 2018-04-23T12:55:33Z (GMT) No. of bitstreams: 1 eberhardt_bg_dr_botfca.pdf: 2911225 bytes, checksum: 9f9ad5ea743405838741796482e9ab66 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-23T12:55:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 eberhardt_bg_dr_botfca.pdf: 2911225 bytes, checksum: 9f9ad5ea743405838741796482e9ab66 (MD5) Previous issue date: 2018-03-01 / EBERHARDT, B.G. Avaliação de micro-organismos zoonóticos em filés de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus). Botucatu, 2018. 71p. Tese (Doutorado) – Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Campus de Botucatu, Universidade Estadual Paulista. RESUMO Cinquenta filés de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) obtidos em mercado de peixes no município de Ourinhos, Estado de São Paulo, foram analisados quanto à prevalência para Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda, Mycobacterium spp. e Cianobactérias. Amostras de músculo foram avaliadas por PCR para Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda e Mycobacterium spp., enquanto que as amostras para cianobactérias foram analisadas por PCR em Tempo Real (qPCR). Os resultados obtidos demonstraram ausência de Aeromonas hydrophila e Edwardsiella tarda nas amostras de filés. A prevalência para Mycobacterium spp. foi de 100% (50/50). Realização posterior de sequenciamento revelou Mycobacterium gordonae. Esta bactéria é considerada um colonizador comum, normalmente não patogênico, porém, há relatos de literatura que demonstram risco de infecção em indivíduos imunossuprimidos e até mesmo imunocompetentes. A taxa de prevalência para cianobactérias foi de 48% (24/50). As cianobactérias (algas azuis) produzem grande quantidade de metabólitos bioativos ou mesmo tóxicos, incluindo toxinas associadas a problemas ambientais e de saúde pública. Considerando a natureza e o papel das cianobactérias como patógenos emergentes, a elevada prevalência deste organismo em um alimento popular como o filé de tilápia do Nilo desperta preocupação, uma vez que os métodos tradicionais de inspeção são incapazes de detectar o patógeno, pelo fato de não provocar alterações macroscópicas nos produtos, bem como pelo potencial de toxicidade para humanos. Entretanto, estudos adicionais são necessários a fim de entender se estes compostos tóxicos estão presentes nos peixes e, caso estejam, se podem sofrer bioacumulação em níveis suficientes para afetar a saúde humana. Palavras-chave: Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda, Mycobacterium spp, Mycobacterium gordonae, cianobactéria, cianotoxina, tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus, diagnóstico. / Fifty fillets of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) from a Ourinhos fish market, Sao Paulo State (Southeast Brazil) were analyzed for the prevalence of Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda, Mycobacterium spp. and cyanobacteria. Muscle samples were evaluated by PCR for Aeromonas hydrophila, Edwardsiella tarda and Mycobacterium spp. Samples for cyanobacteria were analyzed by real time PCR. Both Aeromonas hydrophila and Edwardsiella tarda were not present in fish samples. The prevalence of Mycobacterium spp. was 100% (50/50). Sequencing revealed Mycobacterium gordonae. This agent is usually a ubiquitous and commonly nonpathogenic colonizing organism, although many research publications have reported disease in immunocompromised or even in immunocompetent patients. Prevalence for cyanobacteria was 48% (24/50). Cyanobacteria (blue-green algae) produce a diversity of toxic or otherwise bioactive metabolites, including a number of toxins that have been associated with human and environmental health concerns. Considering the nature and role of cyanobacteria as a pathogen of emerging importance, the high prevalence of this organism in a popular food item such as Nile tilapia raises concern, since no macroscopic alterations can be detected through regular food inspection methods. However, further studies are necessary in order to understand whether these compounds are present in fish and, if so, if they could accumulate sufficiently to affect human health.