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Ciclodextrines gegants. Ciclodextrines modificades amb grups ancorats: dímers i efecte en sistemes d'interès biològic. Estudis computacionalsMaestre Asenjo, Itziar 13 December 2004 (has links)
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Complexos d'inclusió: enantiodiferenciació, reconeixement molecular i efecte quelat. Ciclodextrines gegants. Estudi computacionalBeà Bobet, Ivan 17 December 2001 (has links)
Els nostres estudis es basen en càlculs de mecànica clàssica realitzats mitjançant el programa Macromodel i el programa AMBER. Les tècniques emprades són mecànica molecular, dinàmica molecular, pertorbacions d'energia lliure, anàlisi MM/PBSA i altres anàlisis estadístics. Aquestes metodologies s'han aplicat a l'estudi de les associacions supramoleculars, més concretament en el camp dels complexos d'inclusió.- S'ha estudiat l'equilibri conformacional del clorociclohexà en el clúster tiourea/clorociclohexà. la preferència de la conformació axial del clorociclohexà dins els canals prové del major compactament que s'obté amb aquesta conformació.- S'ha estudiat l'equilibri conformacional axial-equatorial, i les barreres energètiques, del ciclohexanol i del ciclohexà i la seva possible modificació per la formació de complexos d'inclusió amb la b-ciclodextrina. En els complexos d'inclusió, el ciclohexanol altera completament el seu equilibri degut a la formació preferent d'enllaços d'hidrogen en la conformació axial.- S'ha estudiat la capacitat d'enantiodiferenciació de la b-ciclodextrina per la formació de complexos d'inclusió amb la cizolirtina i el seu carbinol precursor. L'enantiodiferenciació prové de l'estructura mitjana dels complexos diastereoisomèrics; la S-cizolirtina es troba més inclosa que la R-cizolirtina i presenta una orientació preferent, així, en promig, suporten diferents entorns químics. En els complexos amb carbinol la diferència entre estructures és menor i per tant presenta menys enantiodiferenciació.- S'ha estudiat la diferència en l'energia de complexació d'una molècula amb una funció ester front una amb una funció amida en la complexació amb un dímer de b-ciclodextrina unit per un pont disulfur. La major estabilitat de la complexació de l'ester prové de la major solubilitat de l'amida (l'ester és menys soluble i té més tendència formar el complex) i d'una energia interna desfavorable en el complex de l'amida que es troba tensionat.- S'ha estudiat la complexació del bisadamantil-fosfat amb una o dues b-ciclodextrines i amb un dímer d'aquestes unides per un pont disulfur, per tal d'estudiar l'efecte quelat. L'entalpia de formació del complex quelat és més favorable que la complexació amb dues ciclodextrines degut a la pèrdua de solvatació i l'energia interna desfavorable del complex amb les dues ciclodextrines.- S'ha realitzat un estudi teòric de l'estructura i comportament de les cicloamiloses comunes i de CA majors, tant en fase gas com en solució. Les CA comunes presenten estructures diferents del con truncat que se'ls acostuma a assignar, més replegades. Les de tamany major encara presenten més plegament i girs. Les estructures cristal·lines no corresponen a les estructures calculades en solució; en les CA comunes es pot contemplar l'estructura cristal·lina com un promig de les possibles estructures en solució, però en les CA més grans s'observa més variació estructural i la diferència és notable. Les CA grans ens obren una nova via d'investigació; presenten moltes possibilitats de plegaments i girs característics que es poden afavorir si es formen complexos d'inclusió amb les molècules adients, com ara àcids o alcohols de cadena llarga. / - Se ha estudiado el equilibrio conformacional del clorociclohexano en el clúster tiourea/clorociclohexano, mediante dinámica molecular. Los resultados apuntan a la hipótesis que la preferencia de la conformación axial del clorociclohexano en el clúster proviene de su mayor grado de empaquetamiento.- Se ha estudiado el equilibrio conformacional axial-equatorial, y las barreras energéticas, del ciclohexanol y del ciclohexano y su posible modificación por la formación de complejos de inclusión con la b-ciclodextrina. En los complejos de inclusión, el ciclohexanol altera completamente su equilibrio debido a la formación preferente de enlaces de hidrogeno en la conformación axial. No obstante, en los estudios experimentales no se observa ésta diferencia, cabe destacar que los cálculos se han realizados en fase gas y que los enlaces de hidrogeno están sobreestabilizados, pero la metodología usada es válida para evaluar barreras energéticas.- Se ha estudiado la capacidad de enantiodiferenciación de la b-ciclodextrina por la formación de complejos de inclusión con la cizolirtina y su carbinol precursor. La enantiodiferenciación proviene de la estructura promedio de los complejos diastereoisoméricos; la S-cizolirtina se encuentra más incluida que la R-cizolirtina y presenta una orientación preferente, así, en promedio, las dos moléculas soportan diferentes entornos químicos. En los complejos con carbinol la diferencia entre las estructuras es menor y por tanto presenta menor enantiodiferenciación, como también se observa experimentalmente.- Se ha estudiado la diferencia en la energía de complejación de una molécula con una función éster frente a una con una función amida al complejar con un dímero de b-ciclodextrina unido por un puente disulfuro. Mediante las técnicas de DM, FEP y MM/PBSA se ha llegado a las mismas conclusiones; la mayor estabilidad de la complejación del éster proviene de la mayor solubilidad de la y de una energía interna desfavorable en el complejo de la amida debido a que sus mejores interacciones guest-host obligan al complejo a tensionarse.- Se ha estudiado la complejación del bisadamantil-fosfato con una o dos b-ciclodextrinas y con un dímero de éstas unidas por un puente disulfuro, para así estudiar el efecto quelato. La entalpía de formación del complejo quelato (con el dímero unido por el puente disulfuro) es más favorable que la complejación con dos ciclodextrinas debido a la pérdida de solubilidad y a la energía interna desfavorable del último.- Se ha realizado un estudio teórico de la estructura y comportamiento de las cicloamilosas (CA), desde las más comunes (de 6-8 unidades de glucosa) hasta la de 28 unidades. Las CAs de 6-7 presentan estructuras diferentes, más plegadas, respecto a sus estructuras de rayos X. Las de tamaño mayor aún muestran más distorsiones y giros. Los enlaces de hidrógeno entre glucosas adyacentes no se mantienen y la cavidad típica de las ciclodextrinas tampoco se conserva. Las estructuras cristalinas no corresponden a las estructuras calculadas en solución; en las CAs comunes la estructura cristalina puede verse como un promedio de les posibles estructuras en solución, pero en las CAs mayores hay más variación estructural y la diferencia es notable. Las CAs grandes abren una nueva vía de investigación; presentan muchas posibilidades de pliegos y giros característicos y pueden formar complejos de inclusión con moléculas como ácidos o alcoholes de cadena larga. / Our work is centered in classical mechanics calculations, with the programs MacroModel and AMBER. The methodologies used are: molecular mechanics, molecular dynamics, free energy perturbations, MM/PBSA analysis and other statistical analysis. These methodologies have been applied to study supramolecular associations, specially in the field of inclusion complexes.- The conformational equilibrium of chloro-cyclohexane in the tiourea/chloro-cyclohexane cluster have been studied, proving that the axial conformation is preferred inside the tiourea tunnels by means of a higher package degree.- The conformational equilibrium and the free energy barriers of cyclohexanol and cyclohexane and their modification by formation of inclusion complexes with b-cyclodextrin have been studied. When complexed, the cyclohexanol behaves completely different because of the preferred formation of hydrogen bonds in the axial conformation.- The enantiodifferentiation capacity of the b-cyclodextrin by formation of inclusion complexes with chiral analgesic cizolirtine and its precursor carbinol has been studied. The causes of the enantiodifferentiation are subtle differences in the average structures of the diastereomeric complexes; the S-cizolirtine is more included than R-cizolirtine and has a preferred orientation, so, in average they have a different chemical environment. In the carbinol complexes the difference between the average structures is minor, so they have less enantiodifferentiation.- The molecular recognition process has been studied in the complexation of a b-cyclodextrin dimer linked by a S-S bond with two molecules different only by a ester group or an amide group. The better complexation of the ester has been explained by the mayor solubility of the amide (so the ester has more tendency to be included inside the cyclodextrin) and because the amide complex is tensioned and has a worse internal energy.- The chelatte effect has been studied in the complexation of a bisadamantyl-phosphate with one or two b-cyclodextrins and with a b-cyclodextrin dimer linked by a S-S bond. The enthalpy of formation of the chelatte complex is better than the complexation with two cyclodextrins because of the loss in solvatation and the unfavorable internal energy of the last one.- The structure and folding of several cycloamyloses (from 6 to 28 glucose units) have been studied, in the gas phase and in aqueous solution. The common cycloamyloses (6-8 glucose units) have distorted structures respect the x-ray data, and the major cycloamyloses have a large variety of folded structures. These larger cycloamyloses represent a new research field in our group, because of their possibilities to form inclusion complexes with long-chain alcohol's or acids.
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Inclusão de colesterol na membrana plasmática de espermatozoides caprinos / Inclusion of cholesterol to goat sperm membraneSilveira, Camila Oliveira 22 February 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The aim of this study was to evaluate the fertilizing capacity, acrosomal integrity, and qualify and quantify by chromatographic techniques the incorporation of cholesterol to the sperm membrane by cyclodextrin in different diluents on cryopreservation of goat sperm. Four males, Saanen (2) and Parda Alpine (2) breeds were used. It was performed
a completely randomized design, with each semen sample divided into the following treatments: TG - Tris-glycerol diluent; TGCCC - Cyclodextrin-cholesterol complex
(CCC) + Tris-glycerol diluent; TG15CCC - CCC diluted in isosmotic solution (saline) to semen with 15 minutes of incubation before addition of the Tris-glycerol diluent; EE
- egg yolk + ethylene glycol diluent; EECCC - CCC + egg yolk + ethylene glycol diluent; EE15CCC - CCC diluted in isosmotic solution (saline) to semen with 15 minutes of incubation before addition of the egg yolk + ethylene glycol diluent. Fresh semen, after its examination, was submitted to the cryopreservation process and stored
in a cryogenic cylinder for 10 days. After thawing, the following analysis were performed: acrosomal integrity, sperm fertilizing capacity through perivitelline
membrane of hen egg yolk binding test (MPEY) and analysis of sperm motility and vigor. Besides, techniques of gas and thin layer chromatography were conducted to evaluate the incorporation of cholesterol to the sperm membrane. Data were submitted to Lilliefors and Cochran and Bartlett tests to verify normality and homogeneity of variances, respectively. The characteristics that met the assumptions of these tests were submitted to ANOVA and means were compared by Duncan s test at 5% of probability. When data did not meet the assumptions of normality and homogeneity of variances, the means were compared by Kruskal-Wallis test. Pearson s correlation coefficient was calculated in all features.Addition of cyclodextrin-cholesterol complex did not increase binding of sperm to MPEY (P > 0.05). The EE15CCC treatment was superior to EECCC treatment in maintaining the acrosomal integrity but did not differ from control (EE; P > 0.05). In Tris-glycerol diluent, the values observed in the control treatment were higher (P < 0.05) than values of the other treatments (TGCCC and TG15CCC) in maintaining the acrosomal integrity. There was a negative correlation between the binding assay and acrosomal integrity (r = -0.25) and positive correlation between the binding assay and sperm motility (r = 0.20). The sperm motility and acrosomal integrity were negatively correlated (r = -0.26). In quantitative and qualitative evaluation of cholesterol by chromatographic techniques (gas and thin layer) there was no difference between the samples of semen in different treatments (P > 0.05). Both techniques showed no incorporation of cholesterol to spermatozoa. It was concluding that addition of cholesterol-cyclodextrin complex to the medium did not improve the physical aspects of goat semen, or the sperm binding capacity. Pre-incubation of semen with CCC for 15 minutes before addition of ethylene + egg yolk diluent (EE15CCC) did not enhance the integrity of the acrosome in relation to control (EE). The gas and thin layer chromatography showed, respectively, an efficient method for quantitatively and qualitatively determining the cholesterol present in the cryopreserved goat sperm. The
concentration of 1 mg of cholesterol-cyclodextrin complex added to the goat semen was not effective for increasing the concentration of cholesterol in sperm. / O objetivo do presente estudo foi avaliar a capacidade fecundante, integridade acrossomal, além de qualificar e quantificar por técnicas cromatográficas a incorporação
do colesterol à membrana plasmática do espermatozoide pela ciclodextrina em diferentes diluentes na criopreservação de espermatozoides caprinos. Foram utilizados quatro machos caprinos das raças Saanen (2) e Parda Alpina (2) seguindo um
delineamento inteiramente casualizado, dividido nos seguintes tratamentos: TGcontrole negativo para o diluente a base de Tris-glicerol; TGCCC- Complexo ciclodextrina-colesterol (CCC) + diluente Tris glicerol; TG15CCC- CCC diluído em solução isosmótica ao sêmen (soro fisiológico) com 15 minutos de incubação antes da adição do diluente Tris glicerol; EE- controle negativo para o diluente a base de Gema de ovo + etilenoglicol; EECCC- CCC + diluente Gema de ovo + etilenoglicol; EE15CCC- CCC diluído em solução isosmótica ao sêmen (soro fisiológico) com 15 minutos de incubação antes da adição do diluente Gema de ovo + etilenoglicol. O
sêmen fresco, após realização de sua análise física foi submetido ao processo de criopreservação e estocado em botijão de nitrogênio por 10 dias. Após o descongelamento realizou-se análise da integridade acrossomal, capacidade fecundante do espermatozoide por meio do teste de ligação à membrana perivitelina da gema do ovo de galinha (MPGV) e as análises de motilidade progressiva e vigor espermático. Além destes testes foi realizada a avaliação da incorporação do colesterol à membrana plasmática dos espermatozoides pelas técnicas de cromatografia gasosa e de camada delgada. Para verificação da normalidade e homogeneidade dos dados foi empregado, respectivamente, o teste de Lilliefors e Cochran e Bartlett. As características que atenderam as premissas destes testes foram submetidas à ANOVA e as médias foram
comparadas pelo teste de Duncan com 5% de probabilidade de erro. Quando as distribuições não atenderam as premissas de normalidade e homogeneidade, as médias foram comparadas pelo teste de Kruskal-Wallis. Realizou-se a correlação simples de
Pearson entre todas as características. A adição do complexo ciclodextrina-colesterol não aumentou a ligação dos espermatozoides a MPGV (P>0,05). O tratamento empregando o complexo ciclodextrina-colesterol (CCC) diluído em solução isosmótica ao sêmen com 15 minutos de incubação antes da adição do diluente a base gema de ovo + etilenoglicol (EE15CCC) foi superior aos valores médios do tratamento EECCC na manutenção da integridade acrossomal, porém não diferiu dos valores do tratamento controle para este diluente (EE; P >0,05). No diluente Tris-Glicerol, os valores observados no tratamento controle foi superior (P<0,05) aos valores médios dos demais tratamentos (TGCCC e TG15CCC) na manutenção da integridade acrossomal. Houve correlação negativa entre o teste de ligação e a integridade do acrossoma (r= -0,25) e
positiva entre o teste de ligação e a motilidade espermática progressiva (r= 0,20). A motilidade espermática progressiva e a integridade do acrossoma apresentaram correlação negativa (r= -0,26). Na avaliação quantitativa e qualitativa do colesterol
pelas técnicas cromatográficas (gasosa e camada delgada) não se verificou diferença entre as amostras do sêmen nos diferentes tratamentos (P>0,05). Ambas as técnicas demonstraram que não houve incorporação do colesterol aos espermatozoides. Conclui-se que o complexo ciclodextrina-colesterol no meio diluidor não melhorou os aspectos físicos do sêmen caprino pós-descongelamento e a capacidade de ligação à membrana perivitelina da gema do ovo de galinha. A pré-incubação do sêmen com o CCC por 15 minutos antes da adição do diluente a base de Etilenoglicol+ gema de ovo (EE15CCC) não proporcionou um aumento na integridade do acrossoma a ponto de diferir dos valores do tratamento controle (EE). A cromatografia gasosa e de camada delgada
demonstraram, respectivamente, um eficiente método quantitativo e qualitativo para determinar o colesterol presente no espermatozoide caprino criopreservados. A concentração de 1 mg do complexo ciclodextrina-colesterol adicionada ao sêmen
caprino não foi eficaz em aumentar a concentração de colesterol presente no espermatozoide.
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