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Automated Identification of Noun Clauses in Clinical Language Samples

Manning, Britney Richey 09 August 2009 (has links) (PDF)
The identification of complex grammatical structures including noun clauses is of clinical importance because differences in the use of these structures have been found between individuals with and without language impairment. In recent years, computer software has been used to assist in analyzing clinical language samples. However, this software has been unable to accurately identify complex syntactic structures such as noun clauses. The present study investigated the accuracy of new software, called Cx, in identifying finite wh- and that-noun clauses. Two sets of language samples were used. One set included 10 children with language impairment, 10 age-matched peers, and 10 language-matched peers. The second set included 40 adults with mental retardation. Levels of agreement between computerized and manual analysis were similar for both sets of language samples; Kappa levels were high for wh-noun clauses and very low for that-noun clauses.
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Utilização de técnicas de análise de imagens para avaliação da morfologia interna e do vigor de sementes de sorgo / Using image analysis techniques for evaluation of internal morphology and vigor of sorghum seeds

Javorski, Maicon 10 August 2016 (has links)
A análise de imagens com a utilização de raios X em sementes e análise computadorizada de plântulas são técnicas eficientes na avaliação da qualidade de sementes de diversas espécies, constituindo-se em métodos de rápida resposta, com metodologias de simples execução e reprodução. Assim, foi proposto com a presente pesquisa avaliar metodologias que visam relacionar a morfologia interna de sementes de sorgo com seu potencial fisiológico por meio da análise de imagens radiografadas de sementes e computadorizadas de plântulas. Para tanto, foram utilizadas sementes do híbrido 50A70, representado por dez lotes. O estudo foi realizado em duas etapas, em que a primeira consistiu no uso de imagens radiografadas para relacionar a morfologia interna das sementes e sua germinação e a segunda consistiu na avaliação do vigor das sementes por meio dos testes de primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, de frio, de emergência e velocidade de emergência de plântulas em areia, emergência de plântulas em campo e o uso do sistema computadorizado de imagens de plântulas (\"Seed Vigor Image System\" - SVIS®) aos dois e três dias após a semeadura do teste de germinação, para detectar diferenças de vigor das sementes armazenadas durante quatro meses. Concluiu-se que o teste de raios X é eficiente na identificação de danos por deterioração de tecidos, danos mecânicos, danos por malformação e danos por insetos, possibilitando estabelecer a relação entre o dano observado e o prejuízo causado para a germinação. A análise computadorizada de plântulas aos três dias de idade é uma alternativa segura para detectar diferenças de vigor entre os lotes. / Image analysis techniques using X-rayed seeds and computerized analysis of seedlings are considered efficient to evaluate the seed quality of various species, with a fast response and methodologies that are easy to implement and reproduce. Thus, this research aimed to evaluated methodologies that associate the internal morphology of sorghum seeds with their physiological potential via radiographed images of seeds and image processing of seedlings. Ten seed lots of the sorghum hybrid 50A70 were used in the study. The study was conducted in two phases; the first involved the utilization of radiographed images of seeds to associate their internal morphology with germination. The second consisted evaluation of vigor using first count germination, accelerated aging, cold test, emergence and speed of emergence in sand, seedling emergence in field and computerized seedling image analysis (\"Seed Vigor Image System - SVIS®\"), the seedlings were evaluated two and three days after sowing for the germination test, in order to detect variations in the seed vigor among the lots, during four months of storage. The results allowed to conclude that the X-ray test is effective in identifying damage tissue deterioration, mechanical damage, malformation damage and insect damage, enabling to establish a relationship between the observed damage and the negative effect on germination. Computerized analysis of three-day-old seedlings consists in a feasible method to detect differences in the seed vigor among the lots.
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Avaliação da morfologia interna e do vigor de sementes de algodão utilizando técnicas de análise de imagens / Evaluation of the internal morphology and vigor of cotton seeds using techniques of image analysis

Corrêa, Plínio Duarte 15 August 2017 (has links)
A avaliação da qualidade de sementes por meio de análise de imagens vem ganhando espaço no mercado sementeiro, devido a sua praticidade, objetividade e rapidez. Assim, o presente trabalho teve como objetivos estudar a utilização do teste de raios X em sementes de algodão do cultivar FM975WS, para avaliação da morfologia interna e a utilização da análise computadorizada de imagens de plântulas (SVIS®) e a sua relação com os testes tradicionais, para avaliação do vigor de sementes. O trabalho foi divido em duas etapas. Na primeira etapa, foram utilizadas imagens radiográficas para avaliar possíveis danos mecânicos, danos por deterioração de tecidos e danos por malformação das sementes e sua relação com a germinação. Na outra etapa, foram utilizados os testes tradicionais para avaliação do vigor de sementes por meio dos testes de primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, germinação a baixa temperatura, emergência e índice de velocidade de emergência de plântulas em areia, emergência de plântulas em campo e a análise computadorizada de plântulas. Concluiu- se que a análise de imagens, utilizando o teste de raios X, é eficiente na avaliação da morfologia interna de sementes de algodão, com identificação de suas partes internas e na avaliação de danos causados nas sementes, entre eles, danos por deterioração de tecidos, danos por malformação da semente e danos mecânicos, os quais permitem relacionar a ocorrência dos mesmos com a germinação das sementes e que a utilização do SVIS®, como uma técnica de análise computadorizada de imagens de plântulas, é uma alternativa para avaliação do vigor de sementes de algodão. / The evaluation of the physiological quality of seeds by means of image analysis has been gaining space in the seed market due to its practicality, objectivity and speed. The objective of this study was to study the use of the X-ray test in cotton seeds of the cultivar FM975WS, to evaluate the internal morphology and the use of the computerized analysis of seedlings images (SVIS®) and its relation with the traditional tests to evaluate seed vigor. The work was divided into two stages. In the first stage, radiographic images were used to evaluate possible mechanical damages, damages due to deterioration of tissues and damages due to seed malformation and its relation with germination. In the other step, the traditional tests were used to evaluate the vigor of seeds by means of tests of first count of germination, accelerated aging, germination at low temperature, emergence and speed index of emergence of seedlings in sand, emergence of field seedlings and computerized analysis of seedlings. It is concluded that the image analysis, using the X-ray test, is efficient in the evaluation of the internal morphology of cotton seeds, with identification of its internal parts and in the evaluation of damages caused to the seeds, among them damages due to tissues deterioration, damage due to seed malformation and mechanical damages, which allow to relate their occurrence to the germination of the seeds and the use of SVIS®, as a technique of computerized analysis of seedlings images, is an alternative for evaluating the vigor of cotton seeds .
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Densidade mamográfica antes e após o uso de tibolona: auxílio da informática / Mamographic Density Before and After the Use of Tibolone: Computer Help

Carloni, Marcelo Ballaben 26 January 2007 (has links)
A terapia hormonal na menopausa tem sido objeto de muita contradição nos últimos anos, pois trabalhos mostram resultados contraditórios quanto a benefícios e riscos para as usuárias. Ficou demonstrada, em alguns trabalhos, a maior incidência de carcinoma de mama em usuárias de terapia hormonal clássica e, portanto, existe uma constante busca no que diz respeito ao refinamento de métodos diagnósticos e avaliação dos efeitos das novas drogas na mama. Dentre as drogas mais modernas, a tibolona vem se destacando por apresentar poucos efeitos colaterais, principalmente relacionados à mama. Esta droga apresenta três metabólitos com ação tecidual específica. Assim, efeitos androgênicos, estrogênicos ou progesterônicos podem ser observados na dependência do órgão alvo estudado. Os objetivos de nosso estudo foram avaliar um método de análise computadorizada da densidade mamográfica e, ao mesmo tempo, avaliar os efeitos da tibolona na densidade dessas mamografias. Em nosso estudo, foram avaliadas 26 pacientes na pós menopausa e que tinham indicação do uso de terapia hormonal oral, de acordo com o protocolo vigente no Setor de Endocrinologia Ginecológica do Centro de Saúde Escola da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP. Essas pacientes receberam tibolona na dose de 2,5 mg/dia por 24 semanas. Todas foram submetidas à mamografia antes a após o uso da droga sendo, durante a realização do exame, colocado sobre a plataforma de compressão da mama (Buck) um objeto de referência (escala em acrílico confeccionada para essa finalidade) na intenção de normalizar os exames pré e pós-tratamento. Além disto, as mamografias foram submetidas à avaliação de dois examinadores com o intuito de verificar variações da densidade mamográfica. Essas mesmas mamografias, após normalização pelo objeto de referência, também foram submetidas à análise computadorizada da densidade. Foram realizadas comparações entre os resultados da avaliação da densidade da mama antes e após o uso da tibolona tanto nos laudos dos examinadores, quanto nas imagens digitalizadas. Foi feito também comparação inter-examinadores. As análises comparativas das densidades das grafias antes a após o uso da tibolona não mostraram variações significativas tanto na análise dos examinadores quanto na análise computadorizada. A análise comparativa inter-examinadores mostrou uma tendência à variação entre as classificações da densidade mamográfica, apesar de não ser estatisticamente significante. Podemos concluir que a tibolona, se administrada a pacientes na pós menopausa, na dose de 2,5 mg/dia por 24 semanas não causa variação da densidade mamográfica. Desta forma, a avaliação computadorizada da densidade mamográfica pode ser usada como método auxiliar aos radiologistas, em casos de mamas mais densas permitindo uma melhor avaliação desses casos. / Over the last few years, hormonal therapy has been subject of much controversy since various studies have shown contradictory results regarding the risks and benefits for users. A higher incidence of breast carcinoma among users of classical hormonal therapy has been demonstrated in some studies and therefore there is a constant search regarding the refinement of diagnostic methods and the evaluation of the effects of new drugs on the breast. Among the more modern drugs, tibolone is particularly outstanding because it has few side effects, especially related to the breast. This drug has three metabolites with specific tissue action. Therefore, androgenic, estrogenic or progestogenic effects can be achieved, depending on the organ evaluated. The objectives of the present study were to assess a computerized method for the analysis of mammographic density. The author evaluated 26 menopausal women with an indication for oral hormonal therapy according to the protocol of the sector of gynecologic endocrinology of the Faculty of Medicine of Ribeirão Preto, USP. Tibolone at the dose of 2.5 mg/day was administered to these patients for 24 weeks. The patients were submitted to mammography before and after the use of the drug. During the exam, a reference object (an acrylic scale prepared for this purpose) was placed on the platform for breast compression (Buck) in order to normalize the pre- and post-treatment exams. In addition, two examiners evaluated the mammographies in order to determine variations in mammographic density. After normalization according to the reference object, these same mammographies were submitted to computerized density analysis. The mamographic density results obtained before and after the use of tibolone are compared in the digitalized images and in the examiners evaluation. In the same way, an inter-examiners analysis was done. The comparative analyses of the mammographic densities before and after the use of tibolone did not show significant variations in the analyses of the examiners or in the computerized analysis. Inter-examiner analysis showed a tendency to variation in the classification of mammographic density, although the difference was not statistically significant. The author concluded that tibolone, when administered to menopausal women at the dose of 2.5 mg/day for 24 weeks, did not cause a variation in mammographic density. Computerized evaluation of mammographic density can be used as an auxiliary method to radiologists, in cases of high density breast mammography, allowing a more confident evaluation of these cases.
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Utilização de técnicas de análise de imagens para avaliação da morfologia interna e do vigor de sementes de sorgo / Using image analysis techniques for evaluation of internal morphology and vigor of sorghum seeds

Maicon Javorski 10 August 2016 (has links)
A análise de imagens com a utilização de raios X em sementes e análise computadorizada de plântulas são técnicas eficientes na avaliação da qualidade de sementes de diversas espécies, constituindo-se em métodos de rápida resposta, com metodologias de simples execução e reprodução. Assim, foi proposto com a presente pesquisa avaliar metodologias que visam relacionar a morfologia interna de sementes de sorgo com seu potencial fisiológico por meio da análise de imagens radiografadas de sementes e computadorizadas de plântulas. Para tanto, foram utilizadas sementes do híbrido 50A70, representado por dez lotes. O estudo foi realizado em duas etapas, em que a primeira consistiu no uso de imagens radiografadas para relacionar a morfologia interna das sementes e sua germinação e a segunda consistiu na avaliação do vigor das sementes por meio dos testes de primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, de frio, de emergência e velocidade de emergência de plântulas em areia, emergência de plântulas em campo e o uso do sistema computadorizado de imagens de plântulas (\"Seed Vigor Image System\" - SVIS®) aos dois e três dias após a semeadura do teste de germinação, para detectar diferenças de vigor das sementes armazenadas durante quatro meses. Concluiu-se que o teste de raios X é eficiente na identificação de danos por deterioração de tecidos, danos mecânicos, danos por malformação e danos por insetos, possibilitando estabelecer a relação entre o dano observado e o prejuízo causado para a germinação. A análise computadorizada de plântulas aos três dias de idade é uma alternativa segura para detectar diferenças de vigor entre os lotes. / Image analysis techniques using X-rayed seeds and computerized analysis of seedlings are considered efficient to evaluate the seed quality of various species, with a fast response and methodologies that are easy to implement and reproduce. Thus, this research aimed to evaluated methodologies that associate the internal morphology of sorghum seeds with their physiological potential via radiographed images of seeds and image processing of seedlings. Ten seed lots of the sorghum hybrid 50A70 were used in the study. The study was conducted in two phases; the first involved the utilization of radiographed images of seeds to associate their internal morphology with germination. The second consisted evaluation of vigor using first count germination, accelerated aging, cold test, emergence and speed of emergence in sand, seedling emergence in field and computerized seedling image analysis (\"Seed Vigor Image System - SVIS®\"), the seedlings were evaluated two and three days after sowing for the germination test, in order to detect variations in the seed vigor among the lots, during four months of storage. The results allowed to conclude that the X-ray test is effective in identifying damage tissue deterioration, mechanical damage, malformation damage and insect damage, enabling to establish a relationship between the observed damage and the negative effect on germination. Computerized analysis of three-day-old seedlings consists in a feasible method to detect differences in the seed vigor among the lots.
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Avaliação da morfologia interna e do vigor de sementes de algodão utilizando técnicas de análise de imagens / Evaluation of the internal morphology and vigor of cotton seeds using techniques of image analysis

Plínio Duarte Corrêa 15 August 2017 (has links)
A avaliação da qualidade de sementes por meio de análise de imagens vem ganhando espaço no mercado sementeiro, devido a sua praticidade, objetividade e rapidez. Assim, o presente trabalho teve como objetivos estudar a utilização do teste de raios X em sementes de algodão do cultivar FM975WS, para avaliação da morfologia interna e a utilização da análise computadorizada de imagens de plântulas (SVIS®) e a sua relação com os testes tradicionais, para avaliação do vigor de sementes. O trabalho foi divido em duas etapas. Na primeira etapa, foram utilizadas imagens radiográficas para avaliar possíveis danos mecânicos, danos por deterioração de tecidos e danos por malformação das sementes e sua relação com a germinação. Na outra etapa, foram utilizados os testes tradicionais para avaliação do vigor de sementes por meio dos testes de primeira contagem de germinação, envelhecimento acelerado, germinação a baixa temperatura, emergência e índice de velocidade de emergência de plântulas em areia, emergência de plântulas em campo e a análise computadorizada de plântulas. Concluiu- se que a análise de imagens, utilizando o teste de raios X, é eficiente na avaliação da morfologia interna de sementes de algodão, com identificação de suas partes internas e na avaliação de danos causados nas sementes, entre eles, danos por deterioração de tecidos, danos por malformação da semente e danos mecânicos, os quais permitem relacionar a ocorrência dos mesmos com a germinação das sementes e que a utilização do SVIS®, como uma técnica de análise computadorizada de imagens de plântulas, é uma alternativa para avaliação do vigor de sementes de algodão. / The evaluation of the physiological quality of seeds by means of image analysis has been gaining space in the seed market due to its practicality, objectivity and speed. The objective of this study was to study the use of the X-ray test in cotton seeds of the cultivar FM975WS, to evaluate the internal morphology and the use of the computerized analysis of seedlings images (SVIS®) and its relation with the traditional tests to evaluate seed vigor. The work was divided into two stages. In the first stage, radiographic images were used to evaluate possible mechanical damages, damages due to deterioration of tissues and damages due to seed malformation and its relation with germination. In the other step, the traditional tests were used to evaluate the vigor of seeds by means of tests of first count of germination, accelerated aging, germination at low temperature, emergence and speed index of emergence of seedlings in sand, emergence of field seedlings and computerized analysis of seedlings. It is concluded that the image analysis, using the X-ray test, is efficient in the evaluation of the internal morphology of cotton seeds, with identification of its internal parts and in the evaluation of damages caused to the seeds, among them damages due to tissues deterioration, damage due to seed malformation and mechanical damages, which allow to relate their occurrence to the germination of the seeds and the use of SVIS®, as a technique of computerized analysis of seedlings images, is an alternative for evaluating the vigor of cotton seeds .
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Densidade mamográfica antes e após o uso de tibolona: auxílio da informática / Mamographic Density Before and After the Use of Tibolone: Computer Help

Marcelo Ballaben Carloni 26 January 2007 (has links)
A terapia hormonal na menopausa tem sido objeto de muita contradição nos últimos anos, pois trabalhos mostram resultados contraditórios quanto a benefícios e riscos para as usuárias. Ficou demonstrada, em alguns trabalhos, a maior incidência de carcinoma de mama em usuárias de terapia hormonal clássica e, portanto, existe uma constante busca no que diz respeito ao refinamento de métodos diagnósticos e avaliação dos efeitos das novas drogas na mama. Dentre as drogas mais modernas, a tibolona vem se destacando por apresentar poucos efeitos colaterais, principalmente relacionados à mama. Esta droga apresenta três metabólitos com ação tecidual específica. Assim, efeitos androgênicos, estrogênicos ou progesterônicos podem ser observados na dependência do órgão alvo estudado. Os objetivos de nosso estudo foram avaliar um método de análise computadorizada da densidade mamográfica e, ao mesmo tempo, avaliar os efeitos da tibolona na densidade dessas mamografias. Em nosso estudo, foram avaliadas 26 pacientes na pós menopausa e que tinham indicação do uso de terapia hormonal oral, de acordo com o protocolo vigente no Setor de Endocrinologia Ginecológica do Centro de Saúde Escola da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto-USP. Essas pacientes receberam tibolona na dose de 2,5 mg/dia por 24 semanas. Todas foram submetidas à mamografia antes a após o uso da droga sendo, durante a realização do exame, colocado sobre a plataforma de compressão da mama (Buck) um objeto de referência (escala em acrílico confeccionada para essa finalidade) na intenção de normalizar os exames pré e pós-tratamento. Além disto, as mamografias foram submetidas à avaliação de dois examinadores com o intuito de verificar variações da densidade mamográfica. Essas mesmas mamografias, após normalização pelo objeto de referência, também foram submetidas à análise computadorizada da densidade. Foram realizadas comparações entre os resultados da avaliação da densidade da mama antes e após o uso da tibolona tanto nos laudos dos examinadores, quanto nas imagens digitalizadas. Foi feito também comparação inter-examinadores. As análises comparativas das densidades das grafias antes a após o uso da tibolona não mostraram variações significativas tanto na análise dos examinadores quanto na análise computadorizada. A análise comparativa inter-examinadores mostrou uma tendência à variação entre as classificações da densidade mamográfica, apesar de não ser estatisticamente significante. Podemos concluir que a tibolona, se administrada a pacientes na pós menopausa, na dose de 2,5 mg/dia por 24 semanas não causa variação da densidade mamográfica. Desta forma, a avaliação computadorizada da densidade mamográfica pode ser usada como método auxiliar aos radiologistas, em casos de mamas mais densas permitindo uma melhor avaliação desses casos. / Over the last few years, hormonal therapy has been subject of much controversy since various studies have shown contradictory results regarding the risks and benefits for users. A higher incidence of breast carcinoma among users of classical hormonal therapy has been demonstrated in some studies and therefore there is a constant search regarding the refinement of diagnostic methods and the evaluation of the effects of new drugs on the breast. Among the more modern drugs, tibolone is particularly outstanding because it has few side effects, especially related to the breast. This drug has three metabolites with specific tissue action. Therefore, androgenic, estrogenic or progestogenic effects can be achieved, depending on the organ evaluated. The objectives of the present study were to assess a computerized method for the analysis of mammographic density. The author evaluated 26 menopausal women with an indication for oral hormonal therapy according to the protocol of the sector of gynecologic endocrinology of the Faculty of Medicine of Ribeirão Preto, USP. Tibolone at the dose of 2.5 mg/day was administered to these patients for 24 weeks. The patients were submitted to mammography before and after the use of the drug. During the exam, a reference object (an acrylic scale prepared for this purpose) was placed on the platform for breast compression (Buck) in order to normalize the pre- and post-treatment exams. In addition, two examiners evaluated the mammographies in order to determine variations in mammographic density. After normalization according to the reference object, these same mammographies were submitted to computerized density analysis. The mamographic density results obtained before and after the use of tibolone are compared in the digitalized images and in the examiners evaluation. In the same way, an inter-examiners analysis was done. The comparative analyses of the mammographic densities before and after the use of tibolone did not show significant variations in the analyses of the examiners or in the computerized analysis. Inter-examiner analysis showed a tendency to variation in the classification of mammographic density, although the difference was not statistically significant. The author concluded that tibolone, when administered to menopausal women at the dose of 2.5 mg/day for 24 weeks, did not cause a variation in mammographic density. Computerized evaluation of mammographic density can be used as an auxiliary method to radiologists, in cases of high density breast mammography, allowing a more confident evaluation of these cases.
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Quantitative Treatment Response Characterization In Vivo: UseCases in Renal and Rectal Cancers

Antunes, Jacob T., Antunes 13 September 2016 (has links)
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