Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2017-02-07T12:40:31Z No. of bitstreams: 1 Ana Lia Camposa Quaggio.pdf: 1430515 bytes, checksum: 68e33f51877fa5eba2d7e0997b3e6520 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-07T12:40:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ana Lia Camposa Quaggio.pdf: 1430515 bytes, checksum: 68e33f51877fa5eba2d7e0997b3e6520 (MD5) Previous issue date: 2010-02-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Since the 50’s, Xiphias gladius (Linnaeus, 1758) has been captured along the Brazilian coast by surface longliners. This is the second most important target species for the tuna fleet based in Itajaí, Santa Catarina State, after the blue-shark, Prionace glauca (Linnaeus, 1758). The study was based on data from sea observers, log books and carcass ladings of Xiphias gladius, Linnaeus, 1758) from the pelagic longline fleet based in Itajaí, which operated in the southwest Atlantic. Covariance models were fit to the catches (weight, kg) of swordfish and the effects used were: (1) the years 1997, 1998, 2001, 2002 e 2007 (2) lunar phases and (3) seasons. The covariate was fishing effort (hooks). The highest moon catches occurred on the first quarter moon and during wintertime. The Mantel-Haenszel procedure was used to test the hook selectivity and showed that the type “J” hook (J 9/0 10º offset), traditionally used by the fleet, have 1.2 more chances of catching Xiphias gladius than the “circle” hook (18/0 10º offset), used as an optinal device to reduce sea turtle bycatch. The M-H test showed that the J hook has 1,2 more chances of catching Xiphias gladius than the circle hook. The conversion of individual carcass weights (kg) to total length (cm) for the years 2000 to 2002 showed that 66% of the catches were sub-adults. / O espadarte, Xiphias gladius (Linnaeus, 1758), vem sendo capturado na costa brasileira desde os anos 50 pelo espinhel-de-superfície. Esta é a segunda mais importante espécie-alvo da frota atuneira sediada em Itajaí (SC), ficando atrás apenas do tubarão-azul, Prionace glauca (Linnaeus, 1758). No presente estudo foram analisados os dados obtidos para esta espécie através de observadores, mapas de bordo e fichas de desembarque de carcaças de X. gladius para a frota de espinhel-de-superfície sediada em Itajaí (SC) e atuante no Atlântico sudoeste. Foram elaborados modelos de análise de covariância (ANCOVA) e aplicados aos dados de captura (peso em kg) do espadarte, tendo como efeitos: (1) os anos de 1997, 1998, 2001, 2002 e 2007 (2) as fases lunares e (3) as épocas do ano. A covariável foi o esforço de pesca (n° de anzóis). As maiores médias de captura ocorreram durante as fases de lua crescente e no inverno. O procedimento estatístico de Mantel-Haenszel teste foi utilizado para comparar as capturas do espadarte no anzol tipo “Jota” (9/0 10º offset) comumente utilizado pela frota espinheleira com o anzol tipo “circular” (18/0 10ºoffset), este último oferecido como alternativa mitigadora à captura de tartarugas marinhas. O teste M-H indicou que o anzol “Jota” apresentou 1,2 mais chances de capturar Xiphias gladius que no “circular”. A conversão dos pesos individuais das carcaças (kg) em comprimentos totais (cm), referentes aos anos de 2000 a 2002, indicou que 66% das capturas foram de sub-adultos, ao longo de todo o ano.

RNAs não codificantes (ncRNAs) têm ganho crescente prestígio nos últimos anos devido a recentes e contínuas descobertas revelando sua diversidade e importância. Porém, a identificação dessas moléculas ainda é um problema em aberto. Em particular, Plasmodium falciparum é um desafio para a pesquisa de ncRNAs, onde poucos foram identificados até o momento. P. falciparum é o parasita que causa uma malária humana letal. A descoberta de novos ncRNAs neste organismo pode auxiliar no desenvolvimento de novos tratamentos. Este trabalho faz um estudo sobre técnicas computacionais para a predição de ncRNAs e, utilizando como objeto de estudo P. falciparum, propõe uma metodologia de predição que seja aplicável inclusive a genomas com viés composicional. A ênfase deste estudo foi a predição de ncRNAs família-específicos, utilizando o componente RNA da telomerase como objeto de estudo. Este é um importante RNA que, devido à sua alta taxa de mutação, é de difícil identificação. Este RNA ainda não foi identificado em P. falciparum. No entanto, evidências biológicas indicam que este RNA é presente, funcional e deve ser essencial ao parasita, caracterizando-se como um alvo de drogas. Além disso, foi realizado um trabalho preliminar sobre a predição de ncRNAs em geral em P. falciparum utilizando uma abordagem comparativa. / Noncoding RNAs (ncRNAs) have been receiving increasing prestige in the last years due to recent and continuous discoveries revealing their diversity and importance. However, the identification of these molecules is still an open problem. In particular, Plasmodium falciparum is a challenge for the ncRNA research, in which few ncRNAs have been identified. P. falciparum is the parasite that causes a lethal human malaria. The discovery of new ncRNAs in this organism may help in the development of new treatments. This work does a research of computational techniques for the ncRNA prediction and, by using P. falciparum as target, proposes a prediction methodology which is also applicable to compositionally biased genomes. The emphasis of this study was the prediction of family-specific ncRNAs, by using the telomerase RNA component as target. This is an important RNA that has a high mutation rate, being difficult to predict. This RNA has not been identified in P. falciparum, yet. However, biological evidences indicate this RNA is present, functional and might be essential for the parasite, being a drug target. In addition, this work presents preliminary results about the prediction of general ncRNAs in P. falciparum by using a comparative approach.

RNAs não codificantes (ncRNAs) têm ganho crescente prestígio nos últimos anos devido a recentes e contínuas descobertas revelando sua diversidade e importância. Porém, a identificação dessas moléculas ainda é um problema em aberto. Em particular, Plasmodium falciparum é um desafio para a pesquisa de ncRNAs, onde poucos foram identificados até o momento. P. falciparum é o parasita que causa uma malária humana letal. A descoberta de novos ncRNAs neste organismo pode auxiliar no desenvolvimento de novos tratamentos. Este trabalho faz um estudo sobre técnicas computacionais para a predição de ncRNAs e, utilizando como objeto de estudo P. falciparum, propõe uma metodologia de predição que seja aplicável inclusive a genomas com viés composicional. A ênfase deste estudo foi a predição de ncRNAs família-específicos, utilizando o componente RNA da telomerase como objeto de estudo. Este é um importante RNA que, devido à sua alta taxa de mutação, é de difícil identificação. Este RNA ainda não foi identificado em P. falciparum. No entanto, evidências biológicas indicam que este RNA é presente, funcional e deve ser essencial ao parasita, caracterizando-se como um alvo de drogas. Além disso, foi realizado um trabalho preliminar sobre a predição de ncRNAs em geral em P. falciparum utilizando uma abordagem comparativa. / Noncoding RNAs (ncRNAs) have been receiving increasing prestige in the last years due to recent and continuous discoveries revealing their diversity and importance. However, the identification of these molecules is still an open problem. In particular, Plasmodium falciparum is a challenge for the ncRNA research, in which few ncRNAs have been identified. P. falciparum is the parasite that causes a lethal human malaria. The discovery of new ncRNAs in this organism may help in the development of new treatments. This work does a research of computational techniques for the ncRNA prediction and, by using P. falciparum as target, proposes a prediction methodology which is also applicable to compositionally biased genomes. The emphasis of this study was the prediction of family-specific ncRNAs, by using the telomerase RNA component as target. This is an important RNA that has a high mutation rate, being difficult to predict. This RNA has not been identified in P. falciparum, yet. However, biological evidences indicate this RNA is present, functional and might be essential for the parasite, being a drug target. In addition, this work presents preliminary results about the prediction of general ncRNAs in P. falciparum by using a comparative approach.