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La déramification des polysaccharides définit un mécanisme universel et polyphylétique pour la synthèse d’amidon chez les bactéries et les eucaryotes / Polysaccharide debranching defines a universal and polyphyletic mechanism for starch accumulation in bacteria and eukaryotes

Cenci, Ugo Pierre 18 October 2013 (has links)
L'amidon est un agrégat insoluble de granules semi-cristallines, contrairement aux particules hydrosolubles de glycogènes. Chez les eucaryotes photosynthétiques, le passage à l'accumulation de l'amidon est survenu après l'endosymbiose du plaste, à partir d'un réseau métabolique synthétisant du glycogène cytosolique chez l'hôte. Cela a impliqué le recrutement d'une enzyme de débranchement d'origine Chlamydienne, un parasite intracellulaire obligatoire. Cette enzyme de débranchement est considérée comme responsable de l'enlèvement des branches mal placées au niveau d’un précurseur qui, autrement, donne un polysaccharide soluble dans l'eau. Désormais, nous présentons l'implication de l'enzyme de débranchement de l'amidon dans l'agrégation de granules semi-cristallines de cyanobactéries unicellulaires qui accumulent à la fois du glycogène et des grains d'amidon semi-cristallins. Nous montrons, à travers cette thèse, qu'une enzyme de nature analogue à l'enzyme de débranchement de la plante, mais d'une origine bactérienne différente, a été recrutée pour la même fonction dans ces organismes. Nous remarquons que les deux enzymes de cyanobactéries et de plantes ont évolué séparément pour donner de l'amidon à partir d'une enzyme impliquée dans le catabolisme du glycogène. La nature polyphylétique de la transition à partir du glycogène à l'amidon, dans les Archaeplastida et les cyanobactéries, ainsi que l'évolution convergente d'un mécanisme biochimique commun, suggèrent que le débranchement des polysaccharides au cours de leur synthèse définit une exigence universelle de l'évolution du métabolisme de l'amidon dans les cellules vivantes. / Starch, unlike hydrosoluble glycogen particles aggregates into insoluble, semi-crystalline granules. In photosynthetic eukaryotes, the transition to starch accumulation occurred after plastid endosymbiosis from a pre-existing cytosolic host glycogen metabolism network. This involved the recruitment of a debranching enzyme of chlamydial pathogen origin. The latter is thought to be responsible for removing misplaced branches that would otherwise yield a water-soluble polysaccharide. We now report the implication of starch debranching enzyme in the aggregation of semi-crystalline granules of single-cell cyanobacteria that accumulate both glycogen and starch-like polymers. We show that an enzyme of analogous nature to the plant debranching enzyme but of a different bacterial origin was recruited for the same purpose in these organisms. Remarkably both the plant and cyanobacterial enzymes have evolved a novel yet identical substrate specificity from a preexisting enzyme which originally displayed the much narrower substrate preferences required for glycogen catabolism. The polyphyletic nature of the transition from glycogen to starch in Archaeplastida and cyanobacteria together with the convergent evolution of a common biochemical mechanism suggest that polysaccharide debranching defines a universal requirement for the evolution of starch metabolism in living cells.
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La connexion au quotidien : réflexion sur nos temporalités

Migault, Ariane 07 1900 (has links)
Dans les médias d’information, il est de plus en plus régulièrement question, recherches scientifiques à l’appui, du danger que poserait la connexion pour tous ceux et celles qui passent trop de temps branché.e.s à des appareils numériques. Une charge normative est ainsi apposée sur la connexion et le temps. Ce mémoire explore la conception de la connexion par les personnes qui la vivent et l’interrogent au quotidien. L’objectif est aussi de comprendre comment celle-ci pourrait orienter leurs expériences du temps ou comment elle pourrait être tributaire des temporalités induites par la société. La méthodologie de cette recherche exploratoire a pris la forme d’entrevues semi-dirigées menées à Montréal auprès de quatre personnes « connectées » et réfléchissant la connexion au quotidien. Nous nous rencontrions une fois par semaine pendant un mois et les participant.e.s remplissaient régulièrement un journal de bord qu’iels me présentaient ensuite, pour amorcer nos rendez-vous. À la lumière de l’analyse des transcriptions d’entrevues, je suggère que les participant.e.s ont en commun différentes approches de la dé-connexion. Cette dernière peut se conceptualiser en termes d’infrastructures, d’artefacts et de symboles. Aussi, différentes temporalités parcourent, modulent et son modulées par la dé-connexion vécue comme un moyen de s’intégrer socialement et de viser un idéal de connexion (temporellement) équilibré. / Based on various scientific studies, news media discourse address more and more regularly the danger posed by connection to all of those who spend too much time using digital devices. A normative load is therefore placed on connection and time. This research project aims to: a) explore what connection means to people whose daily lives involve being connected and questioning their connection; and b) to understand how their approach to connection may orient their experiences of time while at the same time being affected by the temporalities around which today’s societies are organized. The methodological approach that guides this exploratory research features semi-structured interviews conducted in Montreal with four “connected” people who questioned the place of connection in their daily lives. We met once a week for a month and the participants regularly filled out a logbook which they then presented to me at the beginning of each of our conversations. Based on the analysis of interview transcripts, I suggest that the participants share different approaches to dis-connection. The latter can be conceptualized in terms of infrastructure, artifacts and symbols. Also different temporalities modulate and are modulated by this dis-connection as people experience it as a means to fit in, and to aim for an ideal (time) balanced practice.

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