Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-12-17T16:32:54Z No. of bitstreams: 2 michel_marques_farah.pdf: 437133 bytes, checksum: efc5c1b8937d6edbcc7aaf0f1481a293 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-12-17T16:33:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 michel_marques_farah.pdf: 437133 bytes, checksum: efc5c1b8937d6edbcc7aaf0f1481a293 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-17T16:33:19Z (GMT). No. of bitstreams: 2 michel_marques_farah.pdf: 437133 bytes, checksum: efc5c1b8937d6edbcc7aaf0f1481a293 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2010 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / A simula??o de dados apresenta diversas vantagens, como proporcionar a obten??o de respostas ? sele??o e diminuir o tempo necess?rio para a avalia??o das metodologias estudadas no melhoramento gen?tico animal. Por?m, os trabalhos que utilizam simula??o empregam v?rios termos como simula??o estoc?stica, simula??o determin?stica, simula??o de Monte Carlo, simula??o em n?vel de gene e simula??o em n?vel de indiv?duo e, muitas vezes, estes termos s?o utilizados de maneiras diferentes ou em outras condi??es, causando uma diverg?ncia nos termos utilizados. Assim, os objetivos deste trabalho foram agrupar, definir e diferenciar os termos t?cnicos utilizados nos trabalhos de simula??o em melhoramento gen?tico animal e comparar e definir as propriedades dos procedimentos de simula??o em n?vel de indiv?duo e em n?vel de gene. Foram desenvolvidos tr?s cen?rios de simula??o, em n?vel de indiv?duo, em n?vel de gene com e sem marcador utilizando o software LZ5. Foram simuladas tr?s popula??es de su?nos para cada cen?rio e com diferentes herdabilidades (0,12, 0,27 e 0,47). A popula??o-base foi constitu?da de 1500 animais, sendo 750 machos e 750 f?meas e para as duas simula??es em n?vel de gene foi considerado um genoma de 2800 cM e 18 cromossomos de tamanhos aleat?rios, as caracter?sticas foram governadas por 500 locos polig?nicos dial?licos, com freq??ncias al?licas iguais e taxa de recombina??o de 0,01. Para a simula??o em n?vel de gene com marcadores, ainda foram distribu?dos marcadores distanciados igualmente a 50 cM e distribu?dos aleatoriamente 5 QTLs por todo o genoma. Os valores amostrados apresentaram bem semelhantes para os tr?s tipos de simula??o, apresentando um aumento das vari?ncias aditiva e fenot?pica e da herdabilidade nas primeiras gera??es e depois decrescendo ao longo das gera??es. J? para a m?dia fenot?pica, houve um ganho gen?tico por gera??o, indicando que todos os m?todos utilizados s?o eficientes para a obten??o de dados simulados. Assim, a vantagem da simula??o em n?vel de gene ? que ? poss?vel simular marcadores moleculares e QTLs, enquanto a simula??o em n?vel de indiv?duo ? muito eficiente para obten??o de dados como o valor gen?tico do indiv?duo e da m?dia fenot?pica da popula??o em um per?odo de tempo muito menor, pois demanda menos recursos computacionais e de algoritmos estruturados para desenvolver quando comparado com a simula??o em n?vel de gene. Portanto, define-se simula??o em n?vel de indiv?duo como uma metodologia de simula??o que consiste em gerar valores gen?ticos (G) a partir de uma distribui??o normal com m?dia e vari?ncia previamente definidas; enquanto para a simula??o em n?vel de gene a metodologia consiste em gerar os valores dos efeitos de cada loco polig?nico e seus QTLs, a partir de uma distribui??o normal com m?dia e vari?ncia previamente definidas para cada componente, e pela soma destes, obt?m-se o G de cada indiv?duo da popula??o. Para a gera??o do efeito residual (E) as duas metodologias de simula??o s?o feitas da mesma forma, gerando-se um efeito aleat?rio amostrado, tamb?m, de uma distribui??o normal e assim obt?m-se os valores fenot?picos (P) de cada indiv?duo pela soma destes dois componentes (G+E). / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2010. / ABSTRACT The simulation data has several advantages, such as providing the obtaining responses to selection and reduce the time required for evaluation methodologies studied in animal breeding. However, simulation studies employ various terms such as simulation stochastic, deterministic simulation, Monte Carlo simulation, simulation level of gene and simulation at the individual level and often these terms are used in different ways or in other conditions, causing a divergence in the terms used. Thus, the objectives were cluster, define and differentiate the technical terms used in the work of simulation in animal breeding and compare and define the properties procedures for simulation-level and individual-level gene. There had been developed three scenarios for simulation at the individual-level and level gene, with and without marker, using the software LZ5. There had been simulated three pig populations for each scenario, with different heritabilities (0.12, 0.27 and 0.47). The base population consisted of 1500 animals, 750 males and 750 females and for both simulations at the level of the gene was considered a genome of 2800 cM, and 18 chromosomes in random sizes, the characteristics were governed by 500 loci diallelic polygenic, with equal allele frequencies and recombination rate of 0.01. For the simulation Level with gene markers, were also distributed bookmarks equally spaced at 50 cM and five QTL distributed randomly across the genome. The sampled values were very similar for the three types of simulation, an increase of additive variance and phenotype and heritability in the first generations and then decreasing to over the generations. As for the average phenotype was a genetic per generation, indicating that all methods used are efficient for obtain simulated data. Thus, the advantage of gene-level simulation is that it can simulate molecular markers and QTLs, while the simulation at individual level is very efficient for obtaining data as the individual's genetic value and phenotypic average of the population over a period of much less time, since it requires less computational resources and algorithms structured to develop, when compared with the simulation-level gene. Therefore, it is defined as the individual level simulation a methodology simulation that generates breeding values (G) from a normal distribution with mean and variance as previously defined; and the gene level simulation is defined as a methodology that generates the values of effects of each locus and their polygenic QTLs from a normal distribution with mean and variance previously defined for each component, and the sum of these gives the G of each individual in the population. For the generation of residual effect (E) the two simulation methodologies are made in the same way, generating a random effects sampled also a normal distribution and so it was obtained the phenotypic values (P) of each individual by summing these two components (G+E).

Orientador: Guilherme Monteiro Tosoni / Resumo: O objetivo deste estudo foi avaliar a confiabilidade de dois métodos radiográficos de determinação da maturação esquelética das vértebras cervicais e a concordância com o método baseado nas imagens radiográficas de mão e punho. Foram analisadas imagens radiográficas digitais cefalométricas laterais e de mão e punho de 120 indivíduos, com idades variando entre 6 e 18 anos. Para o estudo da repetibilidade e reprodutibilidade, as imagens radiográficas foram interpretadas por 4 examinadores (2 radiologistas e 2 ortodontistas) em dois momentos distintos de acordo com os métodos de Hassel e Farman (VC1) e Baccetti et al. (VC2). Para o estudo de concordância, o método de Fishman também foi realizado pelos quatro examinadores. Para as análises estatísticas foi utilizada estatística Kappa (ҡ), com ponderação linear, seguida do cálculo dos intervalos de confiança (IC95%) e Coeficiente de Correlação Intraclasse (CCI). Os resultados da análise intra-examinador indicaram calibração "quase perfeita" para os quatro examinadores (ҡ>0,81) em todos os métodos de análise. Os limites inferiores dos IC estiveram todos acima de 0,71 para a análise inter-examinador. Os valores de CCI para reprodutibilidade inter-examinador foram considerados "excelentes" para os limites inferiores de todos os IC (≥0,91). Embora a proporção total de diagnósticos concordantes (acurácia) obtida nos métodos VC1 e VC2 tenha sido, respectivamente, 42% e 50% para os ortodontistas e 42% e 40% para os radiologistas, o cruza... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this study was to evaluate the reliability of two radiographic methods to determine the skeletal maturation of the cervical vertebrae and the concordance with the method based on hand and wrist radiographic images. Were analyzed lateral cephalogram, hand and wrist digital radiographic images of 120 individuals, ranging from 6 to 18 years. For the study of repeatability and reproducibility, the images were interpreted by 4 examiners (2 radiologists and 2 orthodontists) on distinct moments, according to the methods of Hassel e Farman (CV1) and Bacetti et al. (CV2). For the concordance study, the Fishman method was also applied. Statistical analysis was performed using Kappa (ҡ), with linear weighting, followed by the calculation of confidence intermission (CI95%) and the Intraclass Correlation Coefficient (ICC). The intra-examiner analysis results indicated 'almost perfect' calibration for the examiners (ҡ>0,81) in all methods. The lower limits of Cis were all above 0.71 for the interexaminer analysis. ICC values for inter-examiner reproducibility were considered 'excellent' for the lower limits of all Cis (≥0.91). Although the total proportion of concordant diagnosis (accuracy) obtained on CV1 and CV2 methods was 42% and 50% for orthodontists and 42% and 40% for radiologists, the crossing of all Cis95% showed no significant difference. Both methods of determination of skeletal maturation of the cervical vertebrae are reliable, since they presented excellent repeatability and reproducibility. These methods showed substantial concordance with the method using radiographic images of the hand and wrist. Moreover, orthodontists and radiologists interpreted them with the same precision / Mestre

Made available in DSpace on 2015-03-13T17:08:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PaolaF_ate_Cap4.pdf: 1280968 bytes, checksum: 66cf6acbdf671531fe325f80fb3ce840 (MD5) Previous issue date: 2005-06-30 / The current work was developed on the dune systems of the Parque das Dunas and Barreira do Inferno. These places are located in the cities of Natal and Parnamirim (RN, Brazil), respectively. This project has the purpose of developing the deterministic model on a specific blowout at Parque das Dunas, based in the geophysical interpretations of the lines gotten with the Ground Penetration Radar and the planialtimetric acquisitions of the topographical surface of the land. Also analyses of the vulnerability/susceptibility of these dune systems had been done in relation to the human pressures. To develop its deterministic model, it is necessary to acquire inner and outer geometries of the cited blowout. In order to depict inner geometries underneath the surface are used the GPR observing the altimetric control for topographical correction of the GPR lines. As for the outer geometries, the geodesic GPS gives us the planialtimetric points (x, y and z points) with milimetric precision, resulting in high-resolution surfaces. Using interpolation methods of the planialtimetric points was possible create Digital Elevations Models (DEM?s) of these surfaces. As a result, 1,161.4 meters of GPR lines were acquired on the blowout at the Parque das Dunas and 3,735.27 meters on the blowout at the Barreira do Inferno. These lines had been acquired with a 200 MHz antenna, except the 7 and 8 lines, for which we had been used a 100 MHz antenna. The gotten data had been processed and interpreted, being possible to identify boundary surfaces of first, second and third order. The first order boundary surface is related with the contact of the rocks of the Barreiras Group with the aeolian deposits. These deposits had been divided in two groups (Group 1 and Group 2) which are related with the geometry of stratum and the dip of its stratifications. Group 1 presented stratum of sigmoidal and irregular geometries and involved bodies where the reflectors had presented dips that had varied of 20 to the 28 degrees for the Parque das Dunas blowout and of 22 to the 29 degrees for the Barreira do Inferno blowout. Usually, it was limited in the base for the first order surface and in the top for the second order surface. Group 2 presented stratum of trough, wedge or lens geometries, limited in the base for the second order vi surface, where the corresponding deposits had more shown smoothed reflectors or with dips of low angle. The Deterministic and Digital Elevation Models had been developed from the integration and interpretation of the 2D data with the GOCAD? program. In Digital Elevations Models it was possible to see, for the localities, corridor or trough-shaped blowouts. In Deterministic Model it was possible to see first and second order boundary surfaces. For the vulnerability/susceptibility of the dune systems it was applied the methodology proposal by Boder? al (1991); however the same one did not show adequate because it evaluates actual coastal dunes. Actual coastal dunes are dunes that are presented in balance with the current environmental conditions. Therefore, a new methodology was proposal which characterizes the supplying and activity sedimentary, as well as the human pressures. For the methodology developed in this work, both the localities had presented a good management. The Parque das Dunas was characterized as a relic dune system and the Barreira do Inferno was characterized as a palimpsestic dune system. Also two Thematic Maps had been elaborated for the environmental characterization of the studied dune systems, with software ArcGis 8.3, and its respective data bases / O presente trabalho foi realizado no Sistema de Dunas do Parque das Dunas e Barreira do Inferno, localizados, respectivamente, nos munic?pios de Natal e Parnamirim, estado do Rio Grande do Norte. O objetivo deste trabalho foi elaborar um modelo determin?stico em uma fei??o erosional, denominada de ruptura de defla??o, localizada no Parque das Dunas, com base nas interpreta??es geof?sicas das linhas obtidas com o GPR (Radar de Penetra??o no Solo) e do levantamento plani-altim?trico da superf?cie topogr?fica do terreno. Foram tamb?m realizadas an?lises da vulnerabilidade/suscetibilidade destes sistemas dunares frente ?s press?es antr?picas. Para a elabora??o do modelo foi necess?rio ? aquisi??o das geometrias internas e externas da ruptura de defla??o. As geometrias internas foram obtidas com o GPR, observando-se o controle altim?trico para corre??o topogr?fica dos radargramas ou linhas de GPR. As superf?cies externas foram adquiridas a partir dos levantamentos planialtim?tricos de precis?o com o GPS Geod?sico. Estas superf?cies foram superpostas a imagens Ikonos para gera??o do Modelo Digital de Terreno (MDT) de alta precis?o. Foram levantadas, no total, dezesseis linhas de GPR, sendo oito para cada localidade o que totalizou 1.161,4 metros para a ruptura de defla??o do Parque das Dunas e 3.735,27 metros para a ruptura da Barreira do Inferno. Os levantamentos foram realizados com a antena de 200 MHz, com exce??o das linhas 7 e 8 da Barreira do Inferno, para as quais foram utilizadas antenas de 100 MHz. Os dados obtidos foram processados e interpretados, sendo poss?vel identificar superf?cies limitantes de primeira, segunda e terceira ordem. A superf?cie limitante de primeira ordem est? relacionada com o contato das rochas do Grupo Barreiras com os dep?sitos e?licos. Esses dep?sitos foram divididos em dois grupos (Grupo 1 e Grupo 2) os quais est?o relacionados com a geometria dos estratos e do mergulho das suas estratifica??es (?ngulo dos refletores). O Grupo 1 apresentou estratos de geometria sigmoidal e irregular e envolveu corpos onde os refletores apresentaram mergulhos que variaram de 20 ? 28 graus para a ruptura de defla??o no Parque das Dunas e de 22 ? 29 graus para a ruptura de defla??o na Barreira do Inferno. Frequentemente estava limitado na base pela superf?cie de primeira ordem e no topo pela superf?cie de segunda ordem. O Grupo 2 apresentou estratos de geometrias acanaladas, em cunha ou lenticular, limitado naiv base pela superf?cie de segunda ordem, onde os dep?sitos correspondentes mostraram refletores mais aplainados ou com mergulho de baixo ?ngulo. Os Modelos Determin?stico e Digital de Terreno (MDT) foram gerados a partir da integra??o e interpreta??o dos dados 2D disponibilizados espacialmente com o software GoCad 2.0.8 ?. No MDT foi poss?vel identificar, para ambas as localidades, rupturas de defla??o do tipo corredor e no Modelo Determin?stico foi poss?vel evidenciar as superf?cies limitantes de primeira e segunda ordem. Em rela??o ? vulnerabilidade/suscetibilidade do sistema de dunas frente as press?es antr?picas, foi aplicada a metodologia proposta por Boder? et al (1991), no entanto, a mesma n?o mostrou-se adequada, pois avalia dunas costeiras atuais, ou seja, dunas que apresentam-se em equil?brio com as condi??es ambientais atuais. Assim, foi proposta uma nova metodologia a qual caracteriza, alem das press?es antr?picas, o abastecimento e atividade sedimentar. Para a metodologia desenvolvida neste trabalho, ambas as localidades enquadraram-se dentro do est?gio de equil?brio frente ?s press?es antr?picas, sendo o Parque das Dunas caracterizado como um campo dunar rel?quia e a Barreira do Inferno, como um campo dunar palimpsestico. Foram tamb?m confeccionados para a caracteriza??o ambiental dos sistemas de dunas estudados dois Mapas Tem?ticos, com o software ArcGis 8.3., e seus respectivos bancos de dados