Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2012-07-20T20:52:35Z No. of bitstreams: 1 Joilton. Distribuição clonal de cepas de Escherichia coli isoladas em infecções do trato urinário adquiridas na comunidade.pdf: 892150 bytes, checksum: f9c041684e517924fdabc9c5c88c11ad (MD5) / Made available in DSpace on 2012-07-20T20:52:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joilton. Distribuição clonal de cepas de Escherichia coli isoladas em infecções do trato urinário adquiridas na comunidade.pdf: 892150 bytes, checksum: f9c041684e517924fdabc9c5c88c11ad (MD5) Previous issue date: 2010 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, Bahia, Brasil / A infecção do trato urinário adquirida na comunidade (ITU-AC) situa-se entre as mais freqüentes infecções bacterianas do ser humano e uma das principais razões para o uso de antibióticos. A Escherichia coli causa aproximadamente 80% destas infecções. Estudos recentes sugerem que as mudanças na prevalência da resistência aos antimicrobianos entre os isolados de E. coli na comunidade são mais influenciados pelo aparecimento e desaparecimento transitório de grupos clonais do que pela pressão seletiva exercida com o uso indiscriminado de determinados antimicrobianos. Objetivos: Avaliar a clonalidade das cepas de E. coli isoladas em ITU-AC, investigando o papel da clonalidade destas cepas na persistência e disseminação da resistência à ciprofloxacina. Material e Métodos: Das 463 cepas de E. coli isoladas consecutivamente de pacientes com ITU-AC atendidos em dois serviços ambulatoriais em Salvador/BA no período de 2001 a 2002, foi selecionada uma amostra de cepas resistentes à Ciprofloxacina (n=45) e outra de cepas sensíveis a todos os antimicrobianos testados (n=43). Os testes de susceptibilidade foram realizados conforme recomenda o Clinical and Laboratory Standards Institute e a clonalidade das cepas foi analisada através da comparação dos padrões de eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE), utilizando os critérios de Tennover como estabelecido pelo Centers for Disease Control and Prevention. Resultado: Os principais grupos clonais entre as cepas resistentes à ciprofloxacina foram G, A e D que corresponderam a 42% destas e apenas a 7% das cepas sensíveis (p< 0, 001). Conclusão: Nossos dados mostram a predominância de alguns grupos clonais entre os isolados de E. coli resistentes à ciprofloxacina. Sugerindo, portanto, que a expansão de determinados clones pode desempenhar papel importante na disseminação de resistência bacteriana em ITUs-AC. / Community-acquired urinary tract infection (CA-UTI) is among the most frequent bacterial infections in humans and a major reason for antibiotic use. Escherichia coli causes approximately 80% of these infections. Recent studies suggest that changes in the prevalence of antimicrobial resistance among isolates of E. coli in the community are more influenced by appearance and disappearance of transient clonal groups than by selective pressure from indiscriminate use of certain antimicrobials. Objectives: To evaluate the clonality of strains of E. coli isolated from CA-UTI, investigating the role of clonality of these strains in the persistence and spread of resistance to ciprofloxacin. Methods: Of 463 strains of E. coli isolated consecutively from patients with CA-UTI treated at two outpatient services in Salvador, Bahia from 2001 to 2002, we selected a sample of strains resistant to ciprofloxacin (n = 45) and another sample of strains susceptible to all antimicrobials tested (n = 43). The susceptibility tests were performed as recommended by the Clinical and Laboratory Standards Institute and clonality of the strains was analyzed by comparing the electrophoresis patterns of pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) using the criteria of Tennover as established by Centers for Disease Control and Prevention. Results: The main clonal groups of strains resistant to ciprofloxacin were G, A and D which accounted for 42% of them and comprised only 7% of susceptible strains (p <0.001). Conclusion: Our data show the predominance of some clonal groups among isolates of E. coli resistant to ciprofloxacin. Thus suggesting that the expansion of certain clones may play an important role in the spread of bacterial resistance in CA-UTI.

Bacterial resistance is one of the worldwide public health issues. This work aimed to genetically characterize species of the family Enterobacteriaceae phenotipic producing ESBL and KPC obtained from patients of Alagoas. Bacteria were identified by semi-automated tests. Confirmed as producing ESBL and KPC by phenotypic screening tests. The antimicrobial in vitro susceptibility test was performed by disk-diffusion method. DNA was extracted by boiling method at 95ºC. The resistance genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV e blaKPC were identified with specific primers and genetic typing was performed by PCR with the microsatellite (GTG)5. 254 isolates of enterobacteria were obtained, of which 92,12% (234/254) had some of the genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV or blaKPC, 87,18% (204/234) ESBL (blaTEM, blaCTX-M, blaSHV) and 12,82% (30/234) KPC (blaKPC). Of these 234 isolates, 4,7% (11/234) were community-acquired infections with genes that express ESBL and 95,3% (223/234) of hospital infections, of which 86,55% (193/223) ESBL and 13,45% (30/223) KPC. BlaCTX-M (> 80%) was the most frequent type gene in enterobacteria. Urinary infections were the most frequent cases of infection in the community by Escherichia coli (54,55%) and Klebsiella pneumoniae (39,46%) in the hospital. BlaKPC was identified only in bacteria of hospital infections, especially in K. pneumoniae (30%). At the ICUs (38,57%) were obtained the most number of isolates producing ESBL and KPC. These enterobacteria showed multidrug resistance phenotypes with high levels for aminoglycosides, fluoroquinolones and sulfamethoxazole/trimethoprim. Associations between genotypes and antibiotic resistance were observed. Cases of clonal spread were identified in the hospital of Alagoas by enterobacteria producing ESBL and KPC. There is a predominance of genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV and blaKPC among isolates of enterobacteria resistant to beta-lactam, with the prevalence of the genetic element blaCTX-M. The clonal spread have contributed to the high levels of beta-lactam resistance among isolates of enterobacteria at hospitals in this study. / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / A resistência bacteriana representa um dos problemas mundiais de saúde pública. Este trabalho teve como objetivo caracterizar geneticamente espécies da família Enterobacteriaceae produtoras fenotípicas de ESBL e KPC obtidas de pacientes de Alagoas. As bactérias foram identificadas por testes semi-automatizados. Confirmadas como produtoras de ESBL e KPC por testes fenotípicos de triagem. O teste de susceptibilidade in vitro aos antimicrobianos foi realizado pelo método de disco-difusão. O DNA foi extraído pelo método de fervura à 95ºC. Os genes de resistência blaTEM, blaCTX-M, blaSHV e blaKPC foram identificados com oligonucleotídeos específicos e a tipagem genética foi realizada pela PCR com o microssatélite (GTG)5. Foram obtidos 254 isolados de enterobactérias, dos quais 92,12% (234/254) apresentaram alguns dos genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV ou blaKPC, sendo 87,18% (204/234) ESBL (blaTEM, blaCTX-M, blaSHV) e 12,82% (30/234) KPC (blaKPC). Desses 234 isolados, 4,7% (11/234) foram de infecções comunitárias com os genes que expressam ESBL e 95,3% (223/234) de infecções hospitalares, dos quais 86,55% (193/223) ESBL e 13,45% (30/223) KPC. BlaCTX-M (> 80%) foi o tipo gênico mais frequente nas enterobactérias. As infecções urinárias foram os casos mais frequentes de infecção na comunidade por Escherichia coli (54,55%) e Klebsiella pneumoniae (39,46%) no ambiente hospitalar. BlaKPC foi identificado apenas em bactérias causadoras de infecção hospitalar, principalmente em K. pneumoniae (30%). Nas UTIs (38,57%) foram obtidos o maior número de isolados produtores de ESBL e KPC. Estas enterobactérias apresentaram fenótipos de multidroga resistência com elevados níveis para os aminoglicosídeos, fluoroquinolonas e sulfametoxazol/trimetoprim. Associações entre os genótipos e à resistência aos antibióticos foram observadas. Casos de disseminação clonal foram identificados no ambiente hospitalar de Alagoas por enterobactérias produtoras de ESBL e KPC. Há uma predominância dos genes blaTEM, blaSHV, blaCTX-M e blaKPC entre os isolados de enterobactérias resistentes aos beta-lactâmicos, com prevalência do elemento genético blaCTX-M. A disseminação clonal tem contribuído para os elevados níveis de resistência aos beta-lactâmicos entre os isolados de enterobactérias nos hospitais deste estudo.