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Caracterização de isolados de Corynespora cassiicola e avaliação da sensibilidade in vitro a fungicidas / Characterization of Corynespora cassiicola isolates and evaluation of in vitro sensitivity to fungicides

Aguiar, Frederick Mendes 13 May 2015 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-05-12T16:45:26Z No. of bitstreams: 1 2015_FrederickMendesAguiar.pdf: 1843726 bytes, checksum: 4fb24b86358626af48318bf95c8540c0 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-05-24T21:25:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_FrederickMendesAguiar.pdf: 1843726 bytes, checksum: 4fb24b86358626af48318bf95c8540c0 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T21:25:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_FrederickMendesAguiar.pdf: 1843726 bytes, checksum: 4fb24b86358626af48318bf95c8540c0 (MD5) / A macha-alvo, causada pelo fungo Corynespora cassiicola, tornou-se uma das mais importantes doenças da parte aérea do tomateiro e pepineiro em diversas regiões produtoras do Brasil e do mundo nos últimos anos. Além do tomate e pepino, este fungo apresenta uma grande diversidade de hospedeiras sendo relatado em mais de 350 espécies de plantas, distribuídas por mais de 80 países. Os isolados deste fungo também apresentam uma grande diversidade morfológica, principalmente em relação à coloração da colônia, tamanho e formato dos conídios, dificultando ainda mais sua identificação e caracterização. Outra dificuldade relacionada à mancha-alvo é a ausência de cultivares comerciais resistentes e de fungicidas recomendados para o tomate e o pepino no Brasil, sendo um grande desafio para seu controle. Em função dos problemas apresentados, esta tese teve como objetivo investigar a variabilidade genética, morfométrica e patogênica entre isolados de Corynespora de diferentes plantas hospedeiras e regiões geográficas e verificar in vitro a sensibilidade micelial de isolados de Corynespora a diferentes fungicidas. Na caracterização molecular todos os isolados avaliados foram identificados como pertencentes à espécie C. cassiicola. Quanto à distribuição e a resolução intraespecífica dos isolados avaliados, as sequências obtidas das regiões genômicas ITS e fator de elongação 1-α apresentaram limitada resolução intraespecífica dos isolados quanto à hospedeira de origem e região geográfica de coleta nas respectivas árvores filogenéticas. Já a árvore filogenética com as sequências do gene β-tubulina apresentou melhor distribuição dos isolados quanto à hospedeira de origem, com formação de dois clados distintos, cada um representado em sua maioria por isolados provenientes da cultura do tomate e do pepino. Os treze isolados de C. cassiicola utilizados na caracterização morfométrica apresentaram grande variabilidade quanto à cor da colônia, com a ocorrência de seis diferentes cores; quanto à textura micelial, os isolados dividiram em sete com textura fina e seis com textura cotonosa; e quanto ao formato da colônia, com predominância da forma poligonal. A taxa de crescimento micelial foi de 6,05 mm/d. As dimensões dos conídios variaram de 7,39 a 386,05 μm de comprimento, 5,8 a 14,08 μm de largura e 0 a 24 para o número de pseudoseptos. Os três isolados de C. cassiicola avaliados confirmaram patogenicidade às suas hospedeiras de origem. Somente oito espécies de plantas avaliadas não apresentaram suscetibilidade aos isolados. Após caracterização molecular, morfométrica e patogênica dos isolados de C. cassiicola avaliados, concluiu-se que, exceto para a região β-tubulina, nenhuma relação entre a hospedeira de origem e a região geográfica de coleta dos isolados foi estabelecida neste estudo. No teste de sensibilidade a fungicidas, em ensaios preliminares foi obtida a dose efetiva capaz de inibir o crescimento micelial de C. cassiicola em 50% (DE50). Nos resultados, os fungicidas clorotalonil e carbendazim apresentaram altos valores da DE50 para a maioria dos isolados avaliados, com média superior a 50 mg.L-1. Para o fungicida tebuconazole, os valores da DE50 variaram de 0,50 a 18,79 mg.L-1. Já para os fungicidas pyrimethanil, fludioxonil e cyprodinil, verificou-se menores valores da DE50 quando comparados aos fungicidas anteriores. Após estes ensaios, as concentrações obtidas foram de 1 mg.L-1 para o fungicida fludioxonil, 3 mg.L-1 para cyprodinil, 5 mg.L-1 para boscalid e fluopyram, 10 mg.L-1 para tebuconazole, azoxystrobin e pyrimethanil e 50 mg.L-1 para clorotalonil e carbendazim. Os resultados obtidos no teste de inibição do crescimento micelial (ICM) de 55 isolados de C. cassiicola, mostraram uma variação entre os fungicidas e os isolados avaliados. O fungicida fludioxonil na concentração de 1 mg.L-1 apresentou maior valor de ICM quando comparado aos demais fungicidas avaliados, com valor médio de 85,69%. Já o fungicida clorotalonil apresentou menor valor de ICM, com média de 31,56%. O isolado EH-1710 apresentou maior valor de ICM de 74,14%, já o isolado EH-2125 apresentou o menor valor entre os isolados avaliados, com média de 34,57%. Os resultados obtidos evidenciam uma grande expectativa de efeitos satisfatórios do fungicida fludioxonil no controle da mancha-alvo. Já os fungicidas carbendazim, pyrimethanil, azoxystrobin e, principalmente, clorotalonil apresentam grande possibilidade de desenvolvimento de resistência dos isolados de C. cassiicola. / Target spot, caused by the fungus Corynespora cassiicola, has been one of the most important disease of the aerial parts of the tomato and cucumber plants in different regions of Brazil and world in the last years. Besides the tomato and cucumber, this fungus has a big host diversity, detected in more than 350 plants, distributed by more than 80 countries. The isolates of this fungus also have a big morfological diversity, mainly in relation to colony colour, conidia size and shape. These characters difficult its identification and characterization to species level. Another difficult concerning to target spot is the absence of resistant cultivars and fungicides recommended for tomato and cucumber in Brazil, representing a big challenge for its control. In function on the presented problems, this thesis aimed to investigate the genetic variability, morphometric and pathogenic among Corynespora isolates from different geographic regions and test the in vitro mycelial sensitivity of Corynespora isolates to different fungicides. In the molecular characterization all isolates were identified as C. cassiicola. As to distribution and intraspecific resolution of isolates, the sequences obtained from genomic regions ITS and elongation factor 1-α showed limited intraspecific resolution of the isolates as to host of origin and geographical region of collection in its phylogenetic trees. The phylogenetic tree with the sequences of β-tubulin gene showed better distribution of isolates as to its host of origin. In this tree it was formed two distinct clades, each one represented mostly by isolates from tomato and cucumber crop. Thirteen isolates of C. cassiicola used in morphometric characterization showed big variability as to color, with occurrence of six different colors; as to texture, with isolates divided into seven presenting fine texture and six with cottony texture; and as to colony shape, with predominance of polygonal shape. The mycelial growth rate was 6.05 mm/d. The dimensions of the conidia ranged from 7.39 to 386.05 mm in length, 5.8 to 14.08 mm in width and 0 to 24 for the number of pseudosepts. The three isolates of C. cassiicola tested confirmed pathogenicity to its host of origin. Only eight species of plants tested didn't show susceptibility to isolates. After molecular, morphometric and pathogenic characterization of isolates of C. cassiicola tested, was concluded that, except for β-tubulin region, no relationship between host of origin and geographical region of isolates was established in this study. In the fungicidal sensitivity test was performed in preliminary tests to determine the actual dose able of inhibiting the mycelial growth of C. cassiicola by 50% (ED50). In the results, the fungicide chlorothalonil and carbendazim showed great ED50 values to majority of isolates, with average higher to 50 mg.L-1. For the tebuconazole fungicide the values of ED50 varied from 0.50 to 18.79 mg L-1. The pyrimethanil, cyprodinil and fludioxonil fungicides presented lower values of DE50 when compared to the former fungicides. After these tests, the ED50 concentrations found were 1 mg.L-1 to fludioxonil, 3 mg.L-1 to cyprodinil, 5 mg l-1 to boscalid and Fluopyram, 10 mg.L-1 to tebuconazole, azoxystrobin and pyrimethanil and 50 mg L-1 to chlorothalonil and carbendazim. The results obtained in the inhibition test of mycelial growth (ICM) of 55 isolates of C. cassiicola, showed a variation among fungicides and isolates tested. The fludioxonil fungicide at a concentration of 1 mg L-1 showed higher ICM when compared to fungicides tested, with average of 85.69%. Already chlorothalonil fungicide showed the lowest ICM values with average of 31.56%. EH-1710 showed higher ICM of 74.14% and the isolate EH-2125 showed the lowest value of ICM among the isolates tested, with average of 34.57%. The results show a great expectation of good effects of fludioxonil fungicide on target spot control. Already carbendazim fungicides, pyrimethanil, azoxystrobin and chlorothalonil showed great possibility of development of resistance of isolates of C. cassiicola.
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Phytophthora infestans: Sobrevivência em restos culturais, hospedeiros alternativos e dinâmica temporal de esporângios no ar / Phytophthora infestans: Sobrevivência em restos culturais, hospedeiros alternativos e dinâmica temporal de esporângios no ar

Lima, Marcello Arrais 29 March 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-03T16:25:19Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 264169 bytes, checksum: 7e0b0fa3ed22dc10518d5006802eb10c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-03T16:25:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 264169 bytes, checksum: 7e0b0fa3ed22dc10518d5006802eb10c (MD5) Previous issue date: 2005-03-29 / A requeima, causada por Phytophthora infestans, é uma doença destrutiva da batateira e do tomateiro. Há poucas informações quanto a potenciais fontes de inóculo primário do patógeno no Brasil. Os objetivos deste trabalho foram: determinar o tempo de sobrevivência do patógeno em hastes, folíolos e frutos de tomateiro em solo; verificar a especificidade de P. infestans por meio de teste centrífugo-filogenético com a inclusão de espécies nativas do Brasil e estudar a dinâmica temporal do inóculo de P. infestans no ar. Avaliou-se a sobrevivência em restos culturais de tomateiro, tanto em casa de vegetação como no campo. A sobrevivência do patógeno em restos culturais foi inferior a 100 e 35 dias em casa de vegetação e no campo, respectivamente. Em casa de vegetação, a quantidade de estruturas do patógeno visualizadas em microscópio estereoscópico foi maior em tratamentos mantidos em solo seco, que aqueles mantidos em solo úmido. Dois isolados de P. infestans, da linhagem clonal US-1, obtidos de tomateiro, e dois de BR-1, obtidos de batateira, foram inoculados em plantas de 43 espécies. Além das plantas de batata e tomate, apenas plantas de Petunia hybrida e Nicotiana benthamiana foram suscetíveis ao patógeno. A ocorrência de esporângios de P. infestans foi monitorada em condições de campo com armadilhas Rotorod, Burkard e plantas de tomate e batata. Esporângios foram observados ao longo de todo o ano de 2004 e início de 2005. A captura de esporângios de P. infestans realizada pela Burkard foi maior no período das 6:00 às 18:00 h. Conclui-se que o inóculo advindo do ar é mais importante para o início de epidemias de requeima, que aquele em restos de cultura. / Tomato and potato late blight, caused by Phytophthora infestans, is one of the most important diseases of these crops in Brazil. Despite its importance, little is known about inoculum dynamics in tropical/subtropical areas, particularly in Brazil. The objectives of this study were: to determine survival period of P. infestans on stems, leaflets, and tomato fruits buried or not in soil; to assess the specificity of P. infestans to different hosts, mainly towards solanaceous species commonly found in Brazil and to study aerial inoculum (sporangia) temporal dynamics. Survival of P. infestans associated with tomato plant parts under greenhouse and field conditions was less than 100 and 35 days, respectively. Under greenhouse, pathogen structures were more promptly identified on crop debris kept on dry than on wet soil conditions. Isolates of two clonal lineages of P. infestans, US-1 and BR-1, isolated from tomato or potato, respectively, were inoculated on 43 plant species. Only two species, Petunia hybrida and Nicotiana benthamiana, were susceptible to P. infestans. Sporangia were monitored by Rotorod and Burkard spore traps and also by tomato and potato trap plants. Sporangia were captured in most weeks throughout 2004 and in the first two weeks of 2005. Most airborne inoculum captured with the Burkard trap was between 6:00 and 18:00 h. Airborne inoculum is abundant and is more important to late blight outbreaks than inoculum produced in crop debris. / Dissertação importada do Alexandria
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Seleção de isolados de Trichoderma spp. antagonistas a Sclerotinia sclerotiorum / Selection of isolates of Trichoderma spp. antagonists to Sclerotinia sclerotiorum

Fagundes, Inaia Rhavene Freire 21 July 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-04-18T16:16:44Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 350102 bytes, checksum: f63374577f4c51e4a93a1ed9f2503a88 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-18T16:16:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 350102 bytes, checksum: f63374577f4c51e4a93a1ed9f2503a88 (MD5) Previous issue date: 2015-07-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Trichoderma spp., antagonistas a vários fitopatógenos, são comumente isoladas do solo, da rizosfera, e como endofíticos. Nosso objetivo foi selecionar isolados de Trichoderma spp. nas culturas do feijão e da soja em Minas Gerais e avaliar o antagonismo a S. sclerotiorum, agente causal do mofo-branco de ambas as culturas. Obtiveram-se 48 isolados, sendo 30 da rizosfera, 11 epifíticos, quatro endofíticos e três de restos culturais. Com base no sequenciamento das regiões ITS, TEF1-α e RPB2, incluíram-se os isolados em oito espécies de Trichoderma: 29 como T. harzianum; 5 como T. koningiopsis; 4 como T. hamatum; 4 como T. atroviride; 2 como T. asperelloides; 2 como T. longibrachiatum; 1 como T. asperellum e 1 como T. neokoningii. Oito isolados inibiram completamente o crescimento do patógeno em teste de pareamento. Oito isolados foram os mais eficientes no crescimento em meio de cultura. Vinte e quatro isolados foram os mais eficientes em parasitar escleródios no solo, com 79-99% de eficiência. Em ágar-água, 31 isolados inibiram a germinação miceliogênica entre 78-100%, e sete isolados inibiram a germinação carpogênica em mais de 85%. Sete isolados inibiram 100% a infecção em folíolos destacados e um isolado inibiu em 79% a infecção em hastes destacadas. Dois isolados de T. harzianum, UN34 e IM2, foram os mais promissores: UN34 por reduzir a sobrevivência e as germinações miceliogênica e carpogênica de escleródios; e IM2 por reduzir a infecção em folíolos e hastes destacados. De acordo com os resultados, existe um potencial dos isolados de Trichoderma spp. no controle biológico de S. sclerotiorum. / Trichoderma spp., antagonists to plant pathogens, are commonly isolated from soil, rhizosphere, and as endophytic. We aimed to select Trichoderma spp. isolates from bean and soybean crops in Minas Gerais and to evaluate their antagonism to S. sclerotiorum, the causal agent of white mold on both crops. We got 48 isolates: 30 rhizospheric, 11 epiphytic, four endophytic, and three isolates from crop debris. Based on the sequencing of ITS, TEF1-α, and RPB2 regions, the isolates were classified in eight Trichoderma species: 29 as T. harzianum, 5 as T. koningiopsis, 4 as T. hamatum, 4 as T. atroviride, 2 as T. asperelloides; 2 as T. longibrachiatum, 1 as T. asperellum, and 1 as T. neokoningii. Eight isolates completely inhibited pathogen growth in dual culture test. Eight isolates were the most efficient in growing in culture medium. Twenty-four isolates were the best in parasitizing sclerotia in soil, with 79-99% of efficiency. In water-agar, 31 isolates inhibited miceliogenic germination from 78-100%, and seven isolates inhibited the carpogenic germination by more than 85%. Seven isolates inhibited 100% infection on detached leaflets and one isolate inhibited 79% infection on detached stems. Two isolates of T. harzianum, UN34 and IM2, were the most promising: UN34 for reducing the survival and both miceliogenic and carpogenic germination of sclerotia; and IM2 for reducing infection in both leaflets and stems. According to the results, there is a potential of the isolates of Trichoderma spp. in the biocontrol of S. sclerotiorum.
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Comportamento de genótipos de cana-de-açúcar em relação ao complexo broca-podridão causado pela ação de Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) e microorganismos

Lopes, Diego Olympio Peixoto [UNESP] 30 July 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-30Bitstream added on 2014-06-13T18:53:09Z : No. of bitstreams: 1 lopes_dop_me_jabo.pdf: 210065 bytes, checksum: 48eb9836716b3396e8c0118a59f5aae2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O comportamento de genótipos de cana-de-açúcar em relação ao complexo infeccioso causado pelo ataque da broca Diatraea saccharalis e microorganismos, os danos provocados pelo complexo broca-podridão a cada genótipo e a influência do período em que a cultura permanece em campo sobre as infestações da praga foram avaliados em ensaios plantados simultaneamente e colhidos em duas e três épocas. Os tratamentos foram representados pelos genótipos de elite do Programa de Melhoramento Genético do Centro de Cana-de-açúcar do Instituto Agronômico de Campinas (IAC): IACSP99-1306, IACSP98-2072, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 e pela cultivar RB867515, que estavam presentes em todos os experimentos. Na Usina Moema, além dos genótipos citados anteriormente foram adicionados também RB966928; CTC17; IACSP95-3028 e RB855453, na primeira época; RB92579; IACSP95-5000; CTC15 e SP81-3250, na segunda época; e RB876030, IAC87-3396, RB935744 e SP83-2847, na terceira época de avaliação. Já na Usina Guarani, no ensaio a ser colhido na primeira época foram adicionados os genótipos RB855453; CTC17; CTC9 e RB966928; RB935744, CTC14, CTC19 e RB832847 também foram estudados na segunda época. Todos os genótipos foram muito infectados pelo complexo broca-podridão, porém houve diferenças significativas entre eles. Os genótipo IACSP00-8198 e IACSP98-5008 apresentaram as maiores intensidades de infecção, enquanto o IACSP993357, a menor. Apesar dos ensaios colhidos em agosto e outubro tenham ficado em campo 3 e 5 meses, respectivamente, mais do que o ensaio colhido em maio, não houve diferenças entre eles... / The behavior of sugar cane genotypes in relation to the infection complex caused by the attack of sugarcane borer stalk Diatraea saccharalis and microorganisms, the damages caused by the infection complex to each genotype and the influence of the period that the crop remains in field on the infestation of the pest were evaluated in experiments that were planted simultaneously and harvested in two and three different times. The treatments were represented by elite genotypes Breeding Program Center Cane sugar Agronomic Institute of Campinas (IAC): IACSP99-1306-2072 IACSP98, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 and by the cultivar RB867515 that were present in all experiments. In the Moema Mill, besides the aforementioned genotypes were also added RB966928; CTC17; IACSP95-3028; RB855453 and in the first season, the RB92579; IACSP95-5000; CTC15 and SP81-3250, in the second season, and RB876030, IAC87-3396 , RB935744 and SP83-2847, at the third time of evaluation. In the Guarani Mill, the test to be harvested in the first season were added genotypes RB855453; CTC17; CTC9 and RB966928, and RB935744, CTC14, CTC19 and RB832847, were studied in the second season. All genotypes were hard attacked by the complex drill-rot, however had significant differences between them. The genotype and IACSP98 IACSP00-8198-5008 showed the highest intensity of infestation, while IACSP993357, the lowest. Despite the trials harvested in August and October have been in field 3 and 5 months, respectively, more than the essay collected in May, there were no differences between them and the intensity of infection since, between May and October and the rainfall conditions... (Complete abstract click electronic access below)
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Resistência de cultivares de feijoeiro, dinâmica populacional de Bemisia tabaci (Genn., 1889) (Hemiptera: Aleyrodidae) e incidência de mosaico dourado

Silva, Anderson Gonçalves da [UNESP] 31 August 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-08-31Bitstream added on 2014-06-13T20:22:55Z : No. of bitstreams: 1 silva_ag_dr_jabo.pdf: 647938 bytes, checksum: 3b718d0c65a493dab88d05553311e64a (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A cultura do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) pode ser infestada por insetos que afetam a produção antes e após a colheita, tendo como estimativa de perdas causadas nos rendimentos pelas pragas variando de 33 a 86%. Dentre essas pragas a mosca-branca Bemisia tabaci (Genn., 1889) biótipo B (Hemiptera: Aleyrodidae) merece destaque. Esta ocasiona danos diretos decorrentes de sua alimentação e indiretos que ocorrem por meio da excreção açucarada de honeydew ou “mela” e simbiose com a fumagina. No entanto, o dano mais sério causado pela B. tabaci biótipo B é a transmissão de viroses como o mosaico-dourado-do-feijoeiro, provocando perdas econômicas que podem variar de 30% a 100%. Dessa forma, os objetivos da presente pesquisa foram: avaliar a resistência de cultivares de feijoeiro a B. tabaci biótipo B, discriminar as cultivares quanto aos tipos de resistência envolvidas, classificá-las quanto ao grau de resistência, estudar a não preferência para oviposição e biologia da mosca-branca nas cultivares selecionadas dos ensaios de campo, avaliar a influência dos fatores abióticos (precipitação pluviométrica e temperatura) na dinâmica populacional da praga, além de avaliar a incidência de mosaico dourado na área experimental. Os ensaios foram instalados de junho de 2010 a abril de 2012, todos conduzidos no Departamento de Fitossanidade da FCAV/UNESP – Campus de Jaboticabal, SP. O estudo consistiu de duas etapas, a campo e em casa de vegetação. Para os testes de campo foram utilizadas as cultivares (tratamentos): IAC-Formoso, IAC-Diplomata, IAC-Una, IAC-Alvorada, IAC-Harmonia, IAC-Galante, IAC-Carioca-Eté, IAC-Centauro, IAC-Carioca-Tybatã, BRS-Supremo, BRS-Requinte, BRS-Pontal, BRS-Cometa, IAPAR-81, IPR-Siriri, IPR-Eldorado, Guará, IPR-139 e Pérola. Posteriormente, as cultivares... / Common bean crop (Phaseolus vulgaris L.) may be attacked by insects, affecting the production before and after the harvest, with the estimative of losses caused by the pests ranging from 33 to 86%. Among these pests, the whitefly Bemisia tabaci (Genn., 1889) biotype B (Hemiptera: Aleyrodidae) stands out. It causes direct damages due to its feeding and indirect through sugary excretion of honeydew and symbiosis with sooty mold. However, the most serious damage caused by B. tabaci biotype B is the transmission of viruses such as the bean golden mosaic, causing economic losses ranging from 30 to 100%. Thus, the objectives of this research were: to evaluate the resistance of bean cultivars to B. tabaci biotype B, discriminate the cultivars regarding the type of resistance involved, classify them regarding the degree of resistance, study the non-preference for oviposition and biology of the whitefly on the cultivars screened from the field assays, assess the influence of abiotic factors (rainfall and temperature) on the population dynamics of the pest, in addition to evaluate the incidence of golden mosaic on the experimental area. The experiments were set up from June 2010 to April 2012, all carried out in the experimental area of the Departamento de Fitossanidade at FCAV/UNESP – Campus of Jaboticabal, SP. The study consisted of two stages, in the field and greenhouse. For the field tests, the cultivars (treatments) were used: IAC-Formoso, IAC-Diplomata, IAC-Una, IAC-Alvorada, IAC-Harmonia, IAC-Galante, IAC-Carioca-Eté, IAC-Centauro, IAC-Carioca-Tybatã, BRS-Supremo, BRS-Requinte, BRS-Pontal, BRS-Cometa, IAPAR-81, IPR-Siriri, IPR-Eldorado, Guará, IPR-139 and Pérola. After, the cultivars screened in the field experiments were used in greenhouse tests, studying the non-preference for oviposition and antibiosis... (Complete abstract click electronic access below)
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Seleção fenotípica e identificação de snps em regiões genômicas ligados a resistência à ferrugem em Eucalyptus grandis / Phenotypic selection and identification of snps in genomic regions associated with resistance to rust in Eucalyptus grandis

Pereira, Gleice Viviane Nunes [UNESP] 26 March 2015 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-08-20T17:10:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-26. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:25:53Z : No. of bitstreams: 1 000844642.pdf: 1476912 bytes, checksum: 23696bd53d8521611ee359e3a454c41b (MD5) / Amplamente disseminada pelo Brasil, causando enormes prejuízos em viveiros e plantios comerciais, a ferrugem do eucalipto, incitada por Puccinia psidii, é atualmente umas das principais doenças da cultura do eucalipto. A busca por progênies resistentes é facilitada quando existem informações a respeito do controle genético da resistência e estratégias de seleção, como a seleção assistida por marcadores moleculares. Assim, objetivou-se estimar parâmetros genéticos, avaliar o ganho genético por meio da seleção para resistência parcial à ferrugem causada por P. psidii em progênies F1 de Eucalyptus grandis, bem como a identificação de SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) nos genes quitinase e 1,3 β-glucanase relacionados à resistência. O trabalho foi dividido em dois capítulos. O primeiro capítulo foi realizado no município de Itararé-SP, onde foram instalados dois experimentos com 88 progênies F1 de Eucalyptus grandis. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com quatro repetições, sendo cinco plantas por parcela, totalizando 1760 plantas por campo experimental. Aos 30 dias após o plantio, foi realizada a primeira avaliação quanto à ocorrência da ferrugem, mediante a escala de notas. Foram realizadas quatro avaliações mensais no período de setembro a dezembro de 2014. As estimativas dos componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas pelo método REML/BLUP, empregando-se o programa genético-estatístico SELEGEN-REML/BLUP. Os parâmetros genéticos encontrados demonstraram pouca variabilidade genética e alta resistência à ferrugem. Os ganhos de seleção foram satisfatórios para essa fase da seleção. O segundo capítulo foi realizado no Laboratório de Biotecnologia e Genética Molecular, pertencente ao Departamento de Genética do Instituto de Biociências, da UNESP, câmpus de Botucatu ... / Widely disseminated in Brazil, causing huge losses in nurseries and commercial plantations, eucalyptus rust, incited by Puccinia psidii, is currently one of the main diseases of eucalyptus plantation. The search for resistant progenies is facilitated when information regarding the genetic control of resistance and selection trategies as an assisted selection by molecular markers are available. This study objective was to estimate genetic parameters, assess the genetic gain by selection for partial resistance to rust caused by P. psidii in Eucalyptus grandis of F1 progenies, as well as identification of SNPs (single nucleotide polymorphisms) in genes chitinase and β-1,3-glucanase related to resistance. This study was divided into two chapters. The first chapter was conducted in the city of Itararé-SP, which were installed two experiments with 88 F1 progenies of Eucalyptus grandis. The experimental design utilized was a randomized complete block design with four replications and five plants per plot, totaling 1760 plants per experimental field. At 30 days after planting was carried out the first assessment regarding the occurrence of rust, by the rating scale. Four monthly evaluations were carried out from September to December ...
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Seleção fenotípica e identificação de snps em regiões genômicas ligados a resistência à ferrugem em Eucalyptus grandis /

Pereira, Gleice Viviane Nunes. January 2015 (has links)
Orientador: Edson Luiz Furtado / Coorientadora: Celso Luis Marino / Banca: Marcia Regina Costa / Banca: Quelmo Silva de Novaes / Banca: Adriana Zanin Kronka / Banca: Ana Carolina Firmino / Resumo: Amplamente disseminada pelo Brasil, causando enormes prejuízos em viveiros e plantios comerciais, a ferrugem do eucalipto, incitada por Puccinia psidii, é atualmente umas das principais doenças da cultura do eucalipto. A busca por progênies resistentes é facilitada quando existem informações a respeito do controle genético da resistência e estratégias de seleção, como a seleção assistida por marcadores moleculares. Assim, objetivou-se estimar parâmetros genéticos, avaliar o ganho genético por meio da seleção para resistência parcial à ferrugem causada por P. psidii em progênies F1 de Eucalyptus grandis, bem como a identificação de SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) nos genes quitinase e 1,3 β-glucanase relacionados à resistência. O trabalho foi dividido em dois capítulos. O primeiro capítulo foi realizado no município de Itararé-SP, onde foram instalados dois experimentos com 88 progênies F1 de Eucalyptus grandis. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com quatro repetições, sendo cinco plantas por parcela, totalizando 1760 plantas por campo experimental. Aos 30 dias após o plantio, foi realizada a primeira avaliação quanto à ocorrência da ferrugem, mediante a escala de notas. Foram realizadas quatro avaliações mensais no período de setembro a dezembro de 2014. As estimativas dos componentes de variância e parâmetros genéticos foram obtidas pelo método REML/BLUP, empregando-se o programa genético-estatístico SELEGEN-REML/BLUP. Os parâmetros genéticos encontrados demonstraram pouca variabilidade genética e alta resistência à ferrugem. Os ganhos de seleção foram satisfatórios para essa fase da seleção. O segundo capítulo foi realizado no Laboratório de Biotecnologia e Genética Molecular, pertencente ao Departamento de Genética do Instituto de Biociências, da UNESP, câmpus de Botucatu ... / Abstract: Widely disseminated in Brazil, causing huge losses in nurseries and commercial plantations, eucalyptus rust, incited by Puccinia psidii, is currently one of the main diseases of eucalyptus plantation. The search for resistant progenies is facilitated when information regarding the genetic control of resistance and selection trategies as an assisted selection by molecular markers are available. This study objective was to estimate genetic parameters, assess the genetic gain by selection for partial resistance to rust caused by P. psidii in Eucalyptus grandis of F1 progenies, as well as identification of SNPs (single nucleotide polymorphisms) in genes chitinase and β-1,3-glucanase related to resistance. This study was divided into two chapters. The first chapter was conducted in the city of Itararé-SP, which were installed two experiments with 88 F1 progenies of Eucalyptus grandis. The experimental design utilized was a randomized complete block design with four replications and five plants per plot, totaling 1760 plants per experimental field. At 30 days after planting was carried out the first assessment regarding the occurrence of rust, by the rating scale. Four monthly evaluations were carried out from September to December ... / Doutor
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Critérios para aplicação de fungicidas visando ao controle de doenças foliares do feijoeiro comum e análise econômica / Criteria for application of fungicides to the control of leves diseases of the common bean and economic analysis

Krieger, Izabel 24 February 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-08T16:44:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV07MA017.pdf: 316351 bytes, checksum: 90f3d3dd654e7567ae2c313d163704f6 (MD5) Previous issue date: 2006-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The indications for the beginning of the application of fungicides to control the common bean diseases are scarce and few precise, following different criteria, as: growth stages, fixed program of calendar, information on climatic conditions, inoculum density and disease intensity in the plant.Most of these cases, the applications of fungicides are made in preventively, without disease occurrence. This fact has taken an irrational use of fungicides, with the increase of the cost of production and threat to the environment. The objective of this work was compared criteria for the decision of the fungicide application to control anthracnose, angular leaf spot and rust of the common bean.The experiments was carry out in a commercial field in Vacaria/RS, during the growing season of 2005, under no-till system and crop rotation, with plots the 3 x 5 m, in a randomized block design with four replications Three cultivars were evaluated, using two fungicides per cultivar: BRS Campeiro (triphenyltin hydroxide and azoxystrobin + cyproconazol), IPR Uirapuru (tiophanate methyl + chlorothalonil and tetraconazol) and BRS Valente (tryfloxystrobin + propiconazol and tebuconazol).The criteria for the fungicide application was: fixed calendar (FC), growth stage (GS) and threshold (LDE) of 10 % and 20 % of disease incidence. Weekly evaluation was carry out for disease incidence and severity of 20 trifoliolate leves at first trifoliolate leaf until physiological maturation. The values of disease incidence and severity were submitted to area under disease progress curve (AUDPC).The central plants of a square meter in each parcels were used to yield calculation and grain pathology. An economic analysis was carry through on the basis of the costs of the six fungicides, the kneading of three types of sprayer (mounted, towed and Uniport model) and the fixed and changeable costs of the tractor. The data of the AUDPC, yield, mass of thousand grains and seed´s pathology were submitted to analysis of variance and the averages compared by Tukey test at 5% of probability. In the FC and the GS criteria, three applications of fungicides were used, being the two first application with the fungicides to anthracnose and angular leaf spot disease and the last one to rust. For the LDE 10 % and LDE 20 % criteria it was only one application to control the rust disease. Due to seeds sanity by crop rotation and to the irregularity of pluvial precipitations, it was not detected anthracnose and angular leaf spot at none time of evaluation. Amongst the fungi diseases, the rust was detected only after the fourth evaluation. The data of the AUDPC for rust disease in the three cultivars was low. The cultivar IPR Uirapuru it was more susceptible to the rust disease, while the BRS Campeiro more tolerant. Significant differences was not detected in the grains yield and the mass of a thousand grains between treatments and cultivars. Colletotrichum lindemunthianum and Phaeisariopsis griseola was not detected in the grains, indicating the grains sanity was a consequence of plants health during the growth season. The yield of BRS Campeiro cultivar (67 kg or R$ 78,15), has not covered by the cost of the fungicide applications. Instead, in the IPU Uirapuru cultivar, with high economic production (124 kg or R$ 144,66), the cost of the fungicide applications to disease control it was covered by one application only in determinate cases, considering the types of fungicides e sprayers. It was concluded that preventive applications in F.C. and G.S. are unnecessary when the source of primary inoculum of anthracnose and angular leaf spot will be eliminated and the intensity the rust will be low / As indicações para o início da aplicação de fungicidas no feijoeiro comum são escassas e pouco precisas, seguindo diferentes critérios, como: estádios fenológicos, programa fixo de calendário, informações sobre condições climáticas, densidade de inóculo na área e intensidade da doença na planta. Na maioria destes casos as aplicações de fungicidas são feitas de modo preventivo, sem a ocorrência da doença. Este fato tem levado ao uso irracional de fungicidas, com o aumento do custo de produção e ameaça ao meio ambiente. O presente trabalho teve como objetivo comparar critérios para tomada de decisão de aplicações de fungicidas visando o controle da antracnose, mancha angular e ferrugem do feijoeiro comum. Os experimentos foram conduzidos em lavoura comercial, em Vacaria, RS, na safra 2005, com parcelas de 3 x 5 m, em delineamento de blocos casualizados, com quatro repetições. Foram avaliadas três cultivares, sendo aplicados dois fungicidas por cultivar: BRS Campeiro (trifenil hidróxido de estanho e azoxistrobina + ciproconazole), IPR Uirapuru (tiofanato metílico + clorotalonil e tetraconazole) e BRS Valente (trifloxystrobina + propiconazole e tebuconazole). Os critérios para a aplicação foram: calendário fixo (CF), estádio de desenvolvimento (ED) e limiar de dano econômico (LDE) de 10 % e 20 % de incidência. Semanalmente avaliou-se a incidência e a severidade, coletando-se 20 trifólios ao acaso por parcela, desde o primeiro trifólio até a maturação fisiológica. Os valores de incidência e severidade foram submetidos à área abaixo da curva de progresso de doença (AACPD). Foram colhidas manualmente todas as plantas em um metro quadrado no centro de cada parcela para o cálculo da produtividade e para a patologia dos grãos. Por último, foi realizada uma análise econômica, avaliando os custos dos seis fungicidas utilizados neste trabalho, o amassamento feito por três tipos de pulverizadores (montado, rebocado e um autopropelido modelo Uniport) e os custos fixos e variáveis do trator. Os dados da AACPD, produtividade, massa de mil grãos e patologia de sementes foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey a 5 % de probabilidade. No CF e ED foram realizadas três aplicações de fungicidas, sendo que as duas primeiras com os fungicidas direcionados à antracnose e mancha angular e a última aplicação, com os fungicidas para a ferrugem. No LDE 10 % e LDE 20 % foi realizada somente uma aplicação com os fungicidas direcionados para a ferrugem. Devido à sanidade das sementes, uso da rotação de culturas e aliada à irregularidade das precipitações pluviais, não foi detectado antracnose e mancha angular em nenhuma época de avaliação. Dentre as doenças fúngicas, detectou-se somente a ferrugem a partir da quarta avaliação. Os dados da AACPD para ferrugem demonstraram que a intensidade da doença nas três cultivares foram baixos. A cultivar IPR Uirapuru foi mais suscetível à ferrugem, enquanto a BRS Campeiro mais tolerante. Não foram detectadas diferenças significativas no rendimento de grãos e na massa de mil grãos entre os tratamentos nas três cultivares de feijão. Na patologia dos grãos, não foram detectados os fungos Colletotrichum lindemunthianum e Phaeoisariopsis griseola, indicando que a sanidade dos grãos foi um reflexo da sanidade das plantas durante período de cultivo. Na produtividade, o ganho obtido na cultivar BRS Campeiro (67 kg ou R$ 78,15), não cobre o custo de uma única entrada para a aplicação dos fungicidas testados na lavoura. Na IPR Uirapuru, com maior ganho econômico (124 kg ou R$ 144,66), o custo do controle foi coberto somente com uma aplicação e em determinados casos, a considerar o fungicida e o tipo de pulverizador. Concluiu-se que aplicações preventivas no C.F. e E.D são desnecessárias quando a fonte de inoculo primário da antracnose e mancha angular for eliminada e a intensidade da ferrugem for baixa
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Comportamento de genótipos de cana-de-açúcar em relação ao complexo broca-podridão causado pela ação de Diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) e microorganismos /

Lopes, Diego Olympio Peixoto. January 2012 (has links)
Orientador: Antonio Carlos Busoli / Coorientador: Leila Luci Dinardo Miranda / Coorientador: Arlindo Leal Boiça Junior / Banca: Sérgio Antônio De Bortoli / Banca: Ivan Antônio dos Anjos / Resumo: O comportamento de genótipos de cana-de-açúcar em relação ao complexo infeccioso causado pelo ataque da broca Diatraea saccharalis e microorganismos, os danos provocados pelo complexo broca-podridão a cada genótipo e a influência do período em que a cultura permanece em campo sobre as infestações da praga foram avaliados em ensaios plantados simultaneamente e colhidos em duas e três épocas. Os tratamentos foram representados pelos genótipos de elite do Programa de Melhoramento Genético do Centro de Cana-de-açúcar do Instituto Agronômico de Campinas (IAC): IACSP99-1306, IACSP98-2072, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 e pela cultivar RB867515, que estavam presentes em todos os experimentos. Na Usina Moema, além dos genótipos citados anteriormente foram adicionados também RB966928; CTC17; IACSP95-3028 e RB855453, na primeira época; RB92579; IACSP95-5000; CTC15 e SP81-3250, na segunda época; e RB876030, IAC87-3396, RB935744 e SP83-2847, na terceira época de avaliação. Já na Usina Guarani, no ensaio a ser colhido na primeira época foram adicionados os genótipos RB855453; CTC17; CTC9 e RB966928; RB935744, CTC14, CTC19 e RB832847 também foram estudados na segunda época. Todos os genótipos foram muito infectados pelo complexo broca-podridão, porém houve diferenças significativas entre eles. Os genótipo IACSP00-8198 e IACSP98-5008 apresentaram as maiores intensidades de infecção, enquanto o IACSP993357, a menor. Apesar dos ensaios colhidos em agosto e outubro tenham ficado em campo 3 e 5 meses, respectivamente, mais do que o ensaio colhido em maio, não houve diferenças entre eles... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The behavior of sugar cane genotypes in relation to the infection complex caused by the attack of sugarcane borer stalk Diatraea saccharalis and microorganisms, the damages caused by the infection complex to each genotype and the influence of the period that the crop remains in field on the infestation of the pest were evaluated in experiments that were planted simultaneously and harvested in two and three different times. The treatments were represented by elite genotypes Breeding Program Center Cane sugar Agronomic Institute of Campinas (IAC): IACSP99-1306-2072 IACSP98, IACSP99-3357, IACSP98-5008, IACSP98-5012, IACSP96-7603, IACSP00-8198 and by the cultivar RB867515 that were present in all experiments. In the Moema Mill, besides the aforementioned genotypes were also added RB966928; CTC17; IACSP95-3028; RB855453 and in the first season, the RB92579; IACSP95-5000; CTC15 and SP81-3250, in the second season, and RB876030, IAC87-3396 , RB935744 and SP83-2847, at the third time of evaluation. In the Guarani Mill, the test to be harvested in the first season were added genotypes RB855453; CTC17; CTC9 and RB966928, and RB935744, CTC14, CTC19 and RB832847, were studied in the second season. All genotypes were hard attacked by the complex drill-rot, however had significant differences between them. The genotype and IACSP98 IACSP00-8198-5008 showed the highest intensity of infestation, while IACSP993357, the lowest. Despite the trials harvested in August and October have been in field 3 and 5 months, respectively, more than the essay collected in May, there were no differences between them and the intensity of infection since, between May and October and the rainfall conditions... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Resistência de cultivares de feijoeiro, dinâmica populacional de Bemisia tabaci (Genn., 1889) (Hemiptera: Aleyrodidae) e incidência de mosaico dourado /

Silva, Anderson Gonçalves da. January 2012 (has links)
Orientador: Arlindo Leal Boiça Junior / Coorientador: Paulo Roberto Silva Farias / Banca: Alisson Fernando Chiorato / Banca: José Roberto Scarpellini / Banca: Júlio César Galli / Banca: Nilza Maria Martinelli / Resumo: A cultura do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) pode ser infestada por insetos que afetam a produção antes e após a colheita, tendo como estimativa de perdas causadas nos rendimentos pelas pragas variando de 33 a 86%. Dentre essas pragas a mosca-branca Bemisia tabaci (Genn., 1889) biótipo B (Hemiptera: Aleyrodidae) merece destaque. Esta ocasiona danos diretos decorrentes de sua alimentação e indiretos que ocorrem por meio da excreção açucarada de honeydew ou "mela" e simbiose com a fumagina. No entanto, o dano mais sério causado pela B. tabaci biótipo B é a transmissão de viroses como o mosaico-dourado-do-feijoeiro, provocando perdas econômicas que podem variar de 30% a 100%. Dessa forma, os objetivos da presente pesquisa foram: avaliar a resistência de cultivares de feijoeiro a B. tabaci biótipo B, discriminar as cultivares quanto aos tipos de resistência envolvidas, classificá-las quanto ao grau de resistência, estudar a não preferência para oviposição e biologia da mosca-branca nas cultivares selecionadas dos ensaios de campo, avaliar a influência dos fatores abióticos (precipitação pluviométrica e temperatura) na dinâmica populacional da praga, além de avaliar a incidência de mosaico dourado na área experimental. Os ensaios foram instalados de junho de 2010 a abril de 2012, todos conduzidos no Departamento de Fitossanidade da FCAV/UNESP - Campus de Jaboticabal, SP. O estudo consistiu de duas etapas, a campo e em casa de vegetação. Para os testes de campo foram utilizadas as cultivares (tratamentos): IAC-Formoso, IAC-Diplomata, IAC-Una, IAC-Alvorada, IAC-Harmonia, IAC-Galante, IAC-Carioca-Eté, IAC-Centauro, IAC-Carioca-Tybatã, BRS-Supremo, BRS-Requinte, BRS-Pontal, BRS-Cometa, IAPAR-81, IPR-Siriri, IPR-Eldorado, Guará, IPR-139 e Pérola. Posteriormente, as cultivares... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Common bean crop (Phaseolus vulgaris L.) may be attacked by insects, affecting the production before and after the harvest, with the estimative of losses caused by the pests ranging from 33 to 86%. Among these pests, the whitefly Bemisia tabaci (Genn., 1889) biotype B (Hemiptera: Aleyrodidae) stands out. It causes direct damages due to its feeding and indirect through sugary excretion of honeydew and symbiosis with sooty mold. However, the most serious damage caused by B. tabaci biotype B is the transmission of viruses such as the bean golden mosaic, causing economic losses ranging from 30 to 100%. Thus, the objectives of this research were: to evaluate the resistance of bean cultivars to B. tabaci biotype B, discriminate the cultivars regarding the type of resistance involved, classify them regarding the degree of resistance, study the non-preference for oviposition and biology of the whitefly on the cultivars screened from the field assays, assess the influence of abiotic factors (rainfall and temperature) on the population dynamics of the pest, in addition to evaluate the incidence of golden mosaic on the experimental area. The experiments were set up from June 2010 to April 2012, all carried out in the experimental area of the Departamento de Fitossanidade at FCAV/UNESP - Campus of Jaboticabal, SP. The study consisted of two stages, in the field and greenhouse. For the field tests, the cultivars (treatments) were used: IAC-Formoso, IAC-Diplomata, IAC-Una, IAC-Alvorada, IAC-Harmonia, IAC-Galante, IAC-Carioca-Eté, IAC-Centauro, IAC-Carioca-Tybatã, BRS-Supremo, BRS-Requinte, BRS-Pontal, BRS-Cometa, IAPAR-81, IPR-Siriri, IPR-Eldorado, Guará, IPR-139 and Pérola. After, the cultivars screened in the field experiments were used in greenhouse tests, studying the non-preference for oviposition and antibiosis... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

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