Dans cette thèse nous étudions le lien entre structure de marché et productivité. Une place particulière dans nos arguments est réservée à certaines caractéristiques propres à la manufacture : économies d'échelles, hétérogénéité des firmes et asymétries dans la connaissance de l'état de l'art technologique. Nous visons à comprendre comment les changements de la structure de marché, qu'ils soient orientés vers l'extérieur ou vers l'intérieur d'une économie, canalisent les incitations des firmes à obtenir des gains de productivité. La première partie de la thèse analyse l'effet de la politique commerciale sur la productivité des firmes. A l'aide d'un panel de firmes chiliennes (chapitre1) et d'un modèle théorique en économie ouverte (chapitre2), nous cherchons à expliquer des évolutions hétérogènes de la productivité des firmes. La seconde partie se focalise sur le lien entre structure de marché et innovation. A l'aide de données au niveau industriel pour un échantillon de pays de l'OCDE, nous testons l'effet de la concurrence et de la réglementation des marchés sur l'innovation, effet qui est mesuré conditionnellement à la proximité d'une industrie vis-à-vis de la frontière technologique (chapitre3). Finalement, nous proposons un modèle à échelles de qualité pour montrer comment la réglementation peut jouer un rôle important dans l'intensité de la recherche au niveau agrégé. Cet argument est testé au niveau industriel pour notre échantillon d'industrie de l'OCDE.