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Perfil transcricional de genes relacionados à dormência em gemas de macieira

Falavigna, Vítor da Silveira January 2012 (has links)
A macieira (Malus x domestica Borkh.) é uma frutífera de clima temperado que possui grande importância econômica mundialmente, sendo sua produtividade intimamente relacionada à saída do processo de dormência hibernal. Este processo pode ser definido como a incapacidade da planta iniciar o crescimento meristemático mesmo sob condições favoráveis e os mecanismos de controle molecular da dormência em macieiras ainda são pouco compreendidos. O objetivo do presente trabalho foi investigar o perfil gênico diferencial entre cultivares de macieiras contrastantes para requerimento de frio. As cultivares selecionadas foram Gala e sua mutante espontânea Castel Gala, as quais apresentam alto e baixo requerimento de frio, respectivamente. A técnica de hibridização supressiva subtrativa (SSH) permitiu a identificação de 28 genes candidatos à regulação da dormência. Análises de RT-qPCR foram realizadas visando a validação da expressão diferencial dos genes selecionados, assim como caracterizá-los transcricionalmente em três cultivares distintas durante um ciclo de crescimento e de dormência. Dos 28 genes candidatos, 17 apresentaram o mesmo perfil diferencial identificado por SSH. Um acúmulo sazonal de transcritos durante o inverno foi identificado para alguns genes e as cultivares de maior requerimento de frio apresentaram acúmulo de transcritos por mais tempo. Este perfil permitiu-nos sugerir que estes genes podem estar atuando na regulação dos processos de dormência e de aclimatação ao frio. Dos 17 genes validados, aqueles codificadores de proteínas DAM, desidrinas, GAST1, LTI65, NAC, histonas variantes H2A.Z e RAP2.12 apresentaram os maiores contrastes transcricionais entre as cultivares analisadas durante o inverno e constituem-se como fortes candidatos a participantes do processo de progressão da dormência em macieiras. Finalmente, a família de genes codificadores de desidrinas de macieira teve seus membros identificados e caracterizados transcricionalmente. Análises in silico permitiram a identificação de oito modelos gênicos preditos de desidrinas no genoma de macieira. As cadeias peptídicas deduzidas foram classificadas conforme a presença dos segmentos conservados YnSKn. Um perfil sazonal de regulação da expressão foi identificado, com a presença de um pico de acúmulo de transcritos durante o inverno, o que sugere a presença de um mecanismo similar de regulação entre genes de desidrinas de macieira. / Apple tree (Malus x domestica Borkh.) is a temperate fruit crop of great economic importance worldwide and its productivity is related with the release from a bud dormancy process. This process is defined as the plant inability to initiate growth from meristems under favorable conditions and molecular information about dormancy control in apple trees is limited. The aim of the present work was to investigate the differential gene expression profiles between apple tree cultivars contrasting in chilling requirement for breaking dormancy. The selected apple cultivars were Gala and its derived bud sport Castel Gala, which displays high and low chilling requirement, respectively. A suppression subtractive hybridization (SSH) assay yielded 28 candidate genes putatively associated to dormancy cycling. RT-qPCR analyses were performed in order to validate the differential expression profiles and also to transcriptionally characterize the selected genes in three distinct apple tree cultivars during a growth to dormancy cycle. Among the 28 candidate genes, 17 confirmed the differential expression profile predicted by SSH. A seasonal transcript accumulation during the winter was identified to some genes, with high chilling requirement cultivars presenting higher levels of transcripts. This profile allowed us to suggest that these genes may be acting on dormancy regulation and cold acclimation. Out of the 17 candidate genes, those coding for DAM, dehydrins, GAST1, LTI65, NAC, histone variants H2A.Z and RAP2.12 displayed major differences in gene expression between cultivars through the winter and are strong candidates to play key roles on dormancy progression in apple trees. Finally, we identified and transcriptionally characterized the dehydrin gene family in apple trees. In silico analyses allowed us to identify eight predicted gene models for dehydrins in the apple genome. Deduced polypeptides were classified according to the presence of the conserved YnSKn segments. A seasonal regulation of gene expression was observed, with higher transcript accumulation during the winter. This data suggests that a similar mechanism of transcript regulation is acting through the apple dehydrin genes.
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Germinação e produção de mudas de Dipteryx lacunifera Ducke / Germination and production of Dipteryx lacunifera Ducke

Silva, Kerly Franciele Belussi [UNESP] 03 March 2017 (has links)
Submitted by KERLY FRANCIELE BELUSSI SILVA null (kerly_franciele@hotmail.com) on 2017-04-28T16:05:55Z No. of bitstreams: 1 Dissertação de mestrado- Kerly.pdf: 1877642 bytes, checksum: 1f941366ee0165a25a86c92ead32f2fe (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-05-03T16:04:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_kfb_me_ilha.pdf: 1877642 bytes, checksum: 1f941366ee0165a25a86c92ead32f2fe (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-03T16:04:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_kfb_me_ilha.pdf: 1877642 bytes, checksum: 1f941366ee0165a25a86c92ead32f2fe (MD5) Previous issue date: 2017-03-03 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Os estudos sobre a germinação de sementes são essenciais para se proporem técnicas eficientes para a exploração das espécies nativas. O objetivo desse trabalho foi avaliar o efeito de diferentes métodos de superação de dormência na germinação de Dipteryx lacunifera (Castanha do Gurguéia), em dois tipos de substratos, bem como, o desenvolvimento inicial de mudas em solo enriquecido com diferentes compostos. Os experimentos foram conduzidos em casa de vegetação do tipo Pad&Fan, na UNESP, no Campus de Ilha Solteira – SP. As sementes foram provenientes de frutos oriundos de plantas nativas do município de Bom Jesus- PI. Experimento I: Foram avaliados os efeitos de tratamentos de quebra de dormência em 2 tipos de substratos (substrato comercial e areia lavada) na germinação de sementes/diásporos, em delineamento inteiramente casualizado; Experimento II: Avaliados os efeitos de 4 tratamentos (T1 – solo+ areia; T2 - solo + areia + composto orgânico; T3 - solo + composto da carcaça de frango; T4- solo + areia + composto da carcaça de peixe) no desenvolvimento de mudas. As médias dos tratamentos e suas interações com diferenças significativas pelo teste F na análise de variância foram submetidas ao teste Tukey ao nível de significância de 5%. Os dados foram transformados para análise em √(x+0,5). A remoção do endocarpo deixa as sementes vulneráveis as condições adversas. A embebição das sementes/diásparo em água não proporcionou ganhos em germinação. Os tratamentos T1, T2 e T4 favorecem o desenvolvimento de mudas de D. lacunifera. / Studies on seed germination are essential in order to propose efficient techniques for the exploitation of native species. The objective of this work was to evaluate the effect of different methods of dormancy overcoming the germination of Dipteryx lacunifera (Gurguéia nut) on two types of substrates, as well as the initial development of seedlings in soil enriched with different compounds. The experiment was conducted in a greenhouse of the Pad&Fan type, at UNESP, Campus de Ilha Solteira – SP. The seeds were obtained from fruits coming from native plants of Bom Jesus-PI. Experiment I: The effect of treatments of dormancy breaking on 2 types of substrates (commercial substrate and washed sand) in the germination of seeds /diaspore , in a completely randomized design. Experiment II: The effect of 4 treatments (T1 - soil + sand, T2 - soil + sand + organic composting, T3 - soil + chicken carcass composting, T4 - soil + sand + fish carcass composting), in the development of seedlings. The treatment means and their interactions with significant differences by the F test in the analysis of variance were submitted to the Tukey test at 5% significance level. The data has been transformed for analysis on √� + 0,5 Removal of the endocarp leaves the vulnerable seeds to adverse conditions. Soaking of the seeds / diaspare in water did not provide gains in germination. The treatments T1, T2 and T4 favor the development of D. lacunifera seedlings.
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Perfil transcricional de genes relacionados à dormência em gemas de macieira

Falavigna, Vítor da Silveira January 2012 (has links)
A macieira (Malus x domestica Borkh.) é uma frutífera de clima temperado que possui grande importância econômica mundialmente, sendo sua produtividade intimamente relacionada à saída do processo de dormência hibernal. Este processo pode ser definido como a incapacidade da planta iniciar o crescimento meristemático mesmo sob condições favoráveis e os mecanismos de controle molecular da dormência em macieiras ainda são pouco compreendidos. O objetivo do presente trabalho foi investigar o perfil gênico diferencial entre cultivares de macieiras contrastantes para requerimento de frio. As cultivares selecionadas foram Gala e sua mutante espontânea Castel Gala, as quais apresentam alto e baixo requerimento de frio, respectivamente. A técnica de hibridização supressiva subtrativa (SSH) permitiu a identificação de 28 genes candidatos à regulação da dormência. Análises de RT-qPCR foram realizadas visando a validação da expressão diferencial dos genes selecionados, assim como caracterizá-los transcricionalmente em três cultivares distintas durante um ciclo de crescimento e de dormência. Dos 28 genes candidatos, 17 apresentaram o mesmo perfil diferencial identificado por SSH. Um acúmulo sazonal de transcritos durante o inverno foi identificado para alguns genes e as cultivares de maior requerimento de frio apresentaram acúmulo de transcritos por mais tempo. Este perfil permitiu-nos sugerir que estes genes podem estar atuando na regulação dos processos de dormência e de aclimatação ao frio. Dos 17 genes validados, aqueles codificadores de proteínas DAM, desidrinas, GAST1, LTI65, NAC, histonas variantes H2A.Z e RAP2.12 apresentaram os maiores contrastes transcricionais entre as cultivares analisadas durante o inverno e constituem-se como fortes candidatos a participantes do processo de progressão da dormência em macieiras. Finalmente, a família de genes codificadores de desidrinas de macieira teve seus membros identificados e caracterizados transcricionalmente. Análises in silico permitiram a identificação de oito modelos gênicos preditos de desidrinas no genoma de macieira. As cadeias peptídicas deduzidas foram classificadas conforme a presença dos segmentos conservados YnSKn. Um perfil sazonal de regulação da expressão foi identificado, com a presença de um pico de acúmulo de transcritos durante o inverno, o que sugere a presença de um mecanismo similar de regulação entre genes de desidrinas de macieira. / Apple tree (Malus x domestica Borkh.) is a temperate fruit crop of great economic importance worldwide and its productivity is related with the release from a bud dormancy process. This process is defined as the plant inability to initiate growth from meristems under favorable conditions and molecular information about dormancy control in apple trees is limited. The aim of the present work was to investigate the differential gene expression profiles between apple tree cultivars contrasting in chilling requirement for breaking dormancy. The selected apple cultivars were Gala and its derived bud sport Castel Gala, which displays high and low chilling requirement, respectively. A suppression subtractive hybridization (SSH) assay yielded 28 candidate genes putatively associated to dormancy cycling. RT-qPCR analyses were performed in order to validate the differential expression profiles and also to transcriptionally characterize the selected genes in three distinct apple tree cultivars during a growth to dormancy cycle. Among the 28 candidate genes, 17 confirmed the differential expression profile predicted by SSH. A seasonal transcript accumulation during the winter was identified to some genes, with high chilling requirement cultivars presenting higher levels of transcripts. This profile allowed us to suggest that these genes may be acting on dormancy regulation and cold acclimation. Out of the 17 candidate genes, those coding for DAM, dehydrins, GAST1, LTI65, NAC, histone variants H2A.Z and RAP2.12 displayed major differences in gene expression between cultivars through the winter and are strong candidates to play key roles on dormancy progression in apple trees. Finally, we identified and transcriptionally characterized the dehydrin gene family in apple trees. In silico analyses allowed us to identify eight predicted gene models for dehydrins in the apple genome. Deduced polypeptides were classified according to the presence of the conserved YnSKn segments. A seasonal regulation of gene expression was observed, with higher transcript accumulation during the winter. This data suggests that a similar mechanism of transcript regulation is acting through the apple dehydrin genes.
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Caracterização e padrão de expressão gênica relacionados ao degrane e dormência de sementes em arroz vermelho / Characterization and pattern of gene expression related to the shattering and seed dormancy in red rice

Markus, Catarine January 2013 (has links)
O arroz vermelho é considerado daninho principalmente devido às características de degrane e dormência das sementes, que contribuem para a perpetuação desta espécie na lavoura de arroz. A melhor compreensão destes mecanismos poderá ser utilizada para desenvolver tecnologias que proporcionam o controle desta planta daninha. O objetivo desta dissertação foi avaliar a expressão gênica e variação nucleotídica de genes relacionados ao degrane e dormência em sementes de arroz vermelho. O estudo foi realizado com a espécie silvestre O. glaberrima, cultivares de arroz e ecótipos de arroz vermelho provindos do sul do Brasil. A caracterização fenotípica mostrou que os ecótipos de arroz vermelho apresentam alto nível de degrane em comparação com cultivares de arroz, que possuem pouca variabilidade desta característica. Já a dormência das sementes apresentou grande variabilidade nos ecótipos de arroz vermelho e mostrou-se reduzida nas cultivares de arroz analisadas. A expressão do gene OsXTH8 teve relação direta com o caráter degrane. De forma contrária, a expressão do gene OsCel9D foi relacionada com a repressão deste caráter nos genótipos avaliados. O gene Sh4 não apresentou relação com o processo de degrane. Os genótipos Batatais, Nipponbare, AV 503 e O. glaberrima não apresentaram a mutação G237T no gene Sh4, indicando que este gene não possui envolvimento com o processo de domesticação dos genótipos avaliados. Com relação à dormência das sementes, a expressão do gene OsCYP707A5 não foi associada com essa característica em nenhum dos momentos avaliados. Aos 14 dias após a antese e em sementes maduras, os genes Sdr4 e OsMADS29 apresentam, respectivamente, relação positiva e negativa com a dormência das sementes de arroz vermelho. Durante o processo de germinação das sementes a expressão do gene OsMADS29 apresentou efeito negativo, enquanto que o gene Sdr4 mostrou relação positiva com o caráter dormência. Desta forma, os resultados encontrados sobre a dormência de sementes de arroz vermelho em comparação aos dados descritos na literatura para arroz cultivado são diferentes para o gene OsCYP707A5 e são similares para os genes Sdr4 e OsMADS29. O gene Sh4 não está associado ao degrane de sementes em arroz vermelho, contrariamente ao indicado em arroz cultivado. Os genes OsXTH8 e OsCel9D, até então pouco relacionados ao degrane de sementes, estão associados à ocorrência desta característica em arroz vermelho. / Red rice is the most important weed of the rice crop due to the occurrence of of seed shattering and seed dormancy. The better understanding of regulation of these process can be used to develop biotechnological and management technologies to mitigate the red rice infestation in rice fields. The aim of this study was to evaluate the variability of gene expression and nucleotide composition of genes related to seed shattering and seed dormancy in red rice. The study was based on red rice ecotypes, O. glaberrima and rice varieties from southern Brazil. The seed shattering of the red rice ecotypes was higher in comparison with the rice varieties, that have little variability of this trait. In contrast, seed dormancy had great variability in red rice ecotypes and this was reduced in the rice varieties. The expression of the gene OsXTH8 was directly associated with the seed shattering. Otherwise, the OsCel9D expression was related with the suppression of this characteristic. The gene Sh4 was not associated with the seed shattering. The genotypes Batatais, Nipponbare, AV 503 and O. Glaberrima didn’t show the G237T mutation in exon one of the gene Sh4, indicating that this gene has no involvement with the process of domestication of analyzed genotypes. In respect to seed dormancy, the gene expression of OsCYP707A5 was not related with this trait in any of the seed development and germination evaluated stages. At 14 days after anthesis and in mature seeds the genes OsMADS29 and Sdr4 were, respectively, positive and negative related with seed dormancy. During seeds germination, the gene Sdr4 had a positive effect on seed dormancy of red rice, and OsMADS29 gene had negative relationship with that character. During the seed germination the genes OsCYP707A5, OsMADS29 and Sdr4 were not associated, negative and positively related with seed dormancy of red rice. The seed dormancy in red rice in comparison to the described results for cultivated rice is differently related for the OsCYP707A5 gene, and is similarly associated for the genes Sdr4 and OsMADS29. In opposition with what was found in cultivated rice, the Sh4 gene is not associated with seed abscission process in red rice. The OsXTH8 and OsCel9D genes, not previously associated with seed shattering in rice cultivars, are associated with these trait in red rice.
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Uso de indutores de brotação nas cultivares de videira niagara rosada e cabernet sauvignon / Use of breathing inductors in niagara rosada and cabernet sauvignon vine cultivars

Coser, Giovanni Marcello de Angeli Gilli 30 July 2018 (has links)
Submitted by Giovanni Marcello de Angeli Gilli Cóser (gigilli@live.com) on 2018-09-27T19:29:54Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao_GIOVANNI MARCELLO DE ANGELI GILLI COSER.pdf: 857854 bytes, checksum: bdc61e1ef7b26aa50af9ac27305cf374 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Lucia Martins Frederico null (mlucia@fca.unesp.br) on 2018-09-27T19:43:56Z (GMT) No. of bitstreams: 1 coser_gmag_me_botfca.pdf: 857854 bytes, checksum: bdc61e1ef7b26aa50af9ac27305cf374 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-27T19:43:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 coser_gmag_me_botfca.pdf: 857854 bytes, checksum: bdc61e1ef7b26aa50af9ac27305cf374 (MD5) Previous issue date: 2018-07-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Objetivou-se avaliar a eficiência de produtos alternativos para indução da brotação das cultivares de videira Niagara Rosada e Cabernet Sauvignon, como o Erger®, Bluprins® e Orobor® em diferentes doses e combinações destes produtos, comparando-os com o método convencional pelo uso do Dormex® (cianamida hidrogenada). Foram realizados, no ciclo de produção 2016/2017, dois ensaios em condições de clima subtropical no Estado de São Paulo, um em Botucatu e outro no município de São Manuel, utilizando a cultivar de uva para mesa Niagara Rosada. Outros dois ensaios foram realizados no Estado do Rio Grande do Sul em um pomar comercial localizado no município de Flores da Cunha, com a cultivar vinífera Cabernet Sauvignon. Concluiu-se que em Botucatu, o tratamento Erger® 5% + nitrato de cálcio 4% apresentou efeito significativo para produção e produtividade estimada, isso comparado com os tratamentos de Dormex® 5%. Já em São Manuel, a dose de 2,5% de Erger® + nitrato de cálcio 4% resultou em produção semelhante ao tratamento convencional com Dormex®, sendo apresentada melhor qualidade de fruto com a dose de 3,0% de Erger® + nitrato de cálcio 4%. Para os ensaios no Rio Grande do Sul, o tratamento Erger® 2,5% + nitrato de cálcio 4% apresentou efeito significativo, tanto na produção, quanto na produtividade do número de cachos por plantas, comparado com os tratamentos de Dormex® 4%. Já no segundo ensaio, o tratamento Dormex® 2% + Erger® 2% apresentou os maiores valores para a produção, produtividade estimada e número de cachos, indicando a possibilidade de combinação de indutores de brotação para melhoria da resposta produtiva de videiras ‘Cabernet Sauvignon’.
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Dormência natural e ação de giberelina e hidrazida maleica em genótipos de Ipomoea batatas (L.) Lam. / not available

Rita de Fatima Alves Luengo 12 May 1994 (has links)
Os objetivos do presente estudo foram selecionar genótipos de Ipomoea batatas (L.) Lam. com brotamento tardio, que evitam perda pós-colheita devido ao brotamento quando se armazena batata-doce, e estudar o efeito de giberelina e hidrazida maleica sobre a dormência de genótipos de batata-doce com dormência curta e prolongada. Os experimentos foram conduzidos em Brasília (DF) no período de 1990 a 1993 com os cultivares Brazlândia Branca, Brazlândia Roxa, Brazlândia Rosada, Coquinho, Rio Doce e genótipos do banco de germoplasma de batata-doce da EMBRAPA-CNPH. As raízes foram armazenadas por três meses, à temperatura de 25+- 20° C e umidade relativa de 70 a 90%, pois temperaturas superiores a 15,5° C e umidade relativa elevada estimulam o brotamento da batata-doce. A aplicação de hidrazida maleica foi realizada no campo, sobre a parte aérea das plantas, 40 dias antes da colheita nas concentrações 2000mg.L-1, 3500mg.L-1 e 5000mg.L-1 e a aplicação de giberelina foi por imersão das raízes, após a colheit, nas concentrações 5mg.L-1, 10mg.L-1, 15mg.L-1. As características avaliadas foram número de brotações, altura da maior brotação, peso da matéria fresca e respiração. Os resultados obtidos permitiram concluir que existe variabilidade genética entre genótipos de batata- doce em relação à dormência; o cultivar comercial com menor dormência foi Brazlândia Roxa; o cultivar com maior dormência foi Rio Doce. Não foi observado efeito da aplicação de hidrazida maleica a 2000mg.L-1, 3500mg. L-1 e 5000mg.L-1 nem da aplicação de giberelina a 5mg.L-1, 10mg.L-1, 15mg.L-1 na dormência dos cultivares Brazlândia Roxa (dormência curta) e Rio Doce (dormência prolongada). O cultivar Rio Doce apresenta taxas respiratórias mais elevadas que os cultivares Brazlândia Roxa, Coquinho e Princesa. Quando tratado com giberelina, há diminuição nas taxas respiratórias. O cultivar Brazlândia Roxa apresenta médias de matéria fresca superiores em relação ao cultivar Rio Doce, que mostra-se mais sensível à deterioração. / not available
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Caracterização e padrão de expressão gênica relacionados ao degrane e dormência de sementes em arroz vermelho / Characterization and pattern of gene expression related to the shattering and seed dormancy in red rice

Markus, Catarine January 2013 (has links)
O arroz vermelho é considerado daninho principalmente devido às características de degrane e dormência das sementes, que contribuem para a perpetuação desta espécie na lavoura de arroz. A melhor compreensão destes mecanismos poderá ser utilizada para desenvolver tecnologias que proporcionam o controle desta planta daninha. O objetivo desta dissertação foi avaliar a expressão gênica e variação nucleotídica de genes relacionados ao degrane e dormência em sementes de arroz vermelho. O estudo foi realizado com a espécie silvestre O. glaberrima, cultivares de arroz e ecótipos de arroz vermelho provindos do sul do Brasil. A caracterização fenotípica mostrou que os ecótipos de arroz vermelho apresentam alto nível de degrane em comparação com cultivares de arroz, que possuem pouca variabilidade desta característica. Já a dormência das sementes apresentou grande variabilidade nos ecótipos de arroz vermelho e mostrou-se reduzida nas cultivares de arroz analisadas. A expressão do gene OsXTH8 teve relação direta com o caráter degrane. De forma contrária, a expressão do gene OsCel9D foi relacionada com a repressão deste caráter nos genótipos avaliados. O gene Sh4 não apresentou relação com o processo de degrane. Os genótipos Batatais, Nipponbare, AV 503 e O. glaberrima não apresentaram a mutação G237T no gene Sh4, indicando que este gene não possui envolvimento com o processo de domesticação dos genótipos avaliados. Com relação à dormência das sementes, a expressão do gene OsCYP707A5 não foi associada com essa característica em nenhum dos momentos avaliados. Aos 14 dias após a antese e em sementes maduras, os genes Sdr4 e OsMADS29 apresentam, respectivamente, relação positiva e negativa com a dormência das sementes de arroz vermelho. Durante o processo de germinação das sementes a expressão do gene OsMADS29 apresentou efeito negativo, enquanto que o gene Sdr4 mostrou relação positiva com o caráter dormência. Desta forma, os resultados encontrados sobre a dormência de sementes de arroz vermelho em comparação aos dados descritos na literatura para arroz cultivado são diferentes para o gene OsCYP707A5 e são similares para os genes Sdr4 e OsMADS29. O gene Sh4 não está associado ao degrane de sementes em arroz vermelho, contrariamente ao indicado em arroz cultivado. Os genes OsXTH8 e OsCel9D, até então pouco relacionados ao degrane de sementes, estão associados à ocorrência desta característica em arroz vermelho. / Red rice is the most important weed of the rice crop due to the occurrence of of seed shattering and seed dormancy. The better understanding of regulation of these process can be used to develop biotechnological and management technologies to mitigate the red rice infestation in rice fields. The aim of this study was to evaluate the variability of gene expression and nucleotide composition of genes related to seed shattering and seed dormancy in red rice. The study was based on red rice ecotypes, O. glaberrima and rice varieties from southern Brazil. The seed shattering of the red rice ecotypes was higher in comparison with the rice varieties, that have little variability of this trait. In contrast, seed dormancy had great variability in red rice ecotypes and this was reduced in the rice varieties. The expression of the gene OsXTH8 was directly associated with the seed shattering. Otherwise, the OsCel9D expression was related with the suppression of this characteristic. The gene Sh4 was not associated with the seed shattering. The genotypes Batatais, Nipponbare, AV 503 and O. Glaberrima didn’t show the G237T mutation in exon one of the gene Sh4, indicating that this gene has no involvement with the process of domestication of analyzed genotypes. In respect to seed dormancy, the gene expression of OsCYP707A5 was not related with this trait in any of the seed development and germination evaluated stages. At 14 days after anthesis and in mature seeds the genes OsMADS29 and Sdr4 were, respectively, positive and negative related with seed dormancy. During seeds germination, the gene Sdr4 had a positive effect on seed dormancy of red rice, and OsMADS29 gene had negative relationship with that character. During the seed germination the genes OsCYP707A5, OsMADS29 and Sdr4 were not associated, negative and positively related with seed dormancy of red rice. The seed dormancy in red rice in comparison to the described results for cultivated rice is differently related for the OsCYP707A5 gene, and is similarly associated for the genes Sdr4 and OsMADS29. In opposition with what was found in cultivated rice, the Sh4 gene is not associated with seed abscission process in red rice. The OsXTH8 and OsCel9D genes, not previously associated with seed shattering in rice cultivars, are associated with these trait in red rice.
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Estabelecimento e superação de dormência em sementes de Erythrina speciosa Andrews /

Molizane, Debora Manzano. January 2012 (has links)
Orientador: Caludio José Barbeiro / Coorientador: Pricila Greyse dos Santos Julio / Banca: Claudio José Barbedo / Banca: Gisela Ferreira / Resumo: Durante o processo de maturação, algumas espécies desenvolvem tegumento impermeável a água, fato muito comum na família das leguminosas. Essa impermeabilidade caracteriza um tipo de dormência dentre os menos compreendidos da biologia das sementes. O tegumento impermeável à água e gases é o principal modulador na interação entre os tecidos internos da semente e o meio e é classificado como dormência exógena-física. As sementes com esse tipo de entrave não iniciam o processo de germinação sem algum tipo de facilitador para a entrada de água, que neste estudo foi realizado com ácido sulfúrico. Pouco se sabe a respeito dos efeitos deletérios da ação desse ácido no tegumento da semente. Erythrina speciosa é uma espécie comum da mata Atlântica cujas sementes apresentam tegumento impermeável à absorção de água. Neste trabalho, foram coletados frutos e sementes de seis estádios de maturação, em dois anos consecutivos, e analisados quanto ao estabelecimento e superação da dormência, pela imersão das sementes em ácido sulfúrico concentrado por até 60 minutos, avaliando-se as sementes física, fisiológica e anatomicamente. Sementes dos diferentes estádios de maturação apresentaram progressiva redução do teor de água e aumento da massa seca, seguindo os padrões das sementes ortodoxas. O aumento observado no tempo médio de germinação demonstrou que a dormência se instala lentamente. Diferenças anatômicas mais evidentes foram observadas entre os estádios 2 e 3, os quais correspondem à fase em que o crescimento da semente cessa e há deposição de liginina para a formação das paredes secundárias. Diferenças também foram observadas nos estádios finais de maturação, quando há diminuição expressiva do teor de água, para os quais verificou-se aumento dos espaços... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: During the maturation process, some species develop coat impermeability to water, it 's very common in the legume family. This impermeability features a type of dormancy among the least understood of the biology of seed. The coats are impermeable to water and gases is the main modulating the interaction between the internal tissues of the seed and the environment and is classified as a dormancy-physical. The seed with this obstacle does not start the germination process without some kind of facilitator for water uptake, which in this study was performed with sulfuric acid. Little is known about the deleterious effects of the action of this acid in the seed coat. Erythrina speciosa is a common species of the atlantic forest whose seed coats are impermeable to water absorption. In this paper, fruits and seeds were collected from six different maturation stages in two consecutive years and analyzed to establish and break dormancy, seeds by soaking in concentrated sulfuric acid for 60 minutes while the seeds physical, physiological and anatomically. Seeds of different maturation stages showed progressive reduction of water content and dry mass increase, following the standards of orthodox seeds. The increase in mean germination time showed that the numbness settles slowly. More obvious anatomical differences were observed between stages 2 and 3, which correspond to the phase where growth ceases and no seed deposition liginina to the formation of secondary walls. Differences were also observed in the later stages of ripening, when there is a significant decrease of water content for which there was an increase in intercellular spaces. The seed coat impermeability to water settled at the final stage of maturation with stiffening layer macrosclereids. In all stages of maturation was possible to observe the lucid line, below the cuticle... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Expressão de genes em sementes de lobeira (Solanum Lycocarpum St Hill) submetidas ao condicionamento fisiológico /

Souza, Bruna Luiza de, 1988. January 2014 (has links)
Orientador: Edivaldo Aparecido Amaral da Silva / Banca: Juliana Pereira Bravo / Banca: Edson Seizo Mori / Resumo: Sementes de Solanum lycocarpum, lobeira, apresentam resistência mecânica ao crescimento do embrião causada por polissacarídeos da parede celular presentes no endosperma micropilar. Para que a germinação ocorra é necessário que haja a hidrólise desses polissacarídeos para promover enfraquecimento do endosperma, permitindo crescimento do embrião. Assim, enzimas associadas com o crescimento do embrião e enfraquecimento do endosperma podem ser importantes durante a germinação. O condicionamento fisiológico é uma técnica que aumenta a velocidade e a uniformidade da germinação e promove a superação da dormência de algumas espécies. Logo, o objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do hidrocondicionamento na qualidade fisiológica das sementes e estudar a expressão de genes associados com o crescimento do embrião e degradação do endosperma micropilar em sementes de Solanum lycocarpum. As sementes de lobeira foram submetidas ao hidrocondicionamento e condicionamento com PEG (-0,2 MPa) e avaliadas com relação a sua qualidade fisiológica, determinando-se; porcentagem de germinação, índice de velocidade de germinação (IVG), tempo médio de germinação e frequência relativa da germinação. A expressão gênica foi realizada usando a técnica de PCR em tempo real. Para isso, o RNA foi extraído e cDNA foi confeccionado. Os genes estudados no embrião foram expansina (EXP8 e EXP10), α-galactosidase (LeaGal) e poligalacturonase(XOPG1), e no endosperma micropilar foram a α-galactosidase (LeaGal), β-manosidase (LeMside1), endo-β-mananase (LeMAN2) e poligalacturonase ... / Abstract: Priming is a technique that increases the speed and uniformity of germination and promotes the break of dormancy in some species. Therefore, the aim of this study was to evaluate the effect of priming on seed quality and to study the expression of genes associated with embryo growth and degradation of the micropylar endosperm of seeds of Solanum lycocarpum. The seeds were subjected hydropriming and osmoprimig conditioning with PEG (-0.2 MPa ). There were evaluated the germination percentage, the germination speed index (GSI ), the average time to germination and relative frequency of germination. The gene expression was performed using the real-time PCR technique. For this, RNA was extracted and cDNA synthesis was performed. The genes studied in the embryo were expansins (EXP8 and EXP10 ), α-galactosidase (LeaGal) and polygalacturonase ( XOPG1 ), and in the micropylar endosperm were α - galactosidase(LeaGal), β- mannosidase (LeMside1) , endo-β- mannanase ( LeMAN2 ) and polygalacturonase(XOPG1). The highest speed, lowest average time to germination and ... / Mestre
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Expressão de genes em sementes de lobeira (Solanum Lycocarpum St Hill) submetidas ao condicionamento fisiológico

Souza, Bruna Luiza de [UNESP] 11 March 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:17Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-03-11Bitstream added on 2014-06-13T18:48:50Z : No. of bitstreams: 1 000752466.pdf: 1219268 bytes, checksum: 46a6451baf87c6f487174495f002af34 (MD5) / Sementes de Solanum lycocarpum, lobeira, apresentam resistência mecânica ao crescimento do embrião causada por polissacarídeos da parede celular presentes no endosperma micropilar. Para que a germinação ocorra é necessário que haja a hidrólise desses polissacarídeos para promover enfraquecimento do endosperma, permitindo crescimento do embrião. Assim, enzimas associadas com o crescimento do embrião e enfraquecimento do endosperma podem ser importantes durante a germinação. O condicionamento fisiológico é uma técnica que aumenta a velocidade e a uniformidade da germinação e promove a superação da dormência de algumas espécies. Logo, o objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do hidrocondicionamento na qualidade fisiológica das sementes e estudar a expressão de genes associados com o crescimento do embrião e degradação do endosperma micropilar em sementes de Solanum lycocarpum. As sementes de lobeira foram submetidas ao hidrocondicionamento e condicionamento com PEG (-0,2 MPa) e avaliadas com relação a sua qualidade fisiológica, determinando-se; porcentagem de germinação, índice de velocidade de germinação (IVG), tempo médio de germinação e frequência relativa da germinação. A expressão gênica foi realizada usando a técnica de PCR em tempo real. Para isso, o RNA foi extraído e cDNA foi confeccionado. Os genes estudados no embrião foram expansina (EXP8 e EXP10), α-galactosidase (LeaGal) e poligalacturonase(XOPG1), e no endosperma micropilar foram a α-galactosidase (LeaGal), β-manosidase (LeMside1), endo-β-mananase (LeMAN2) e poligalacturonase... / Priming is a technique that increases the speed and uniformity of germination and promotes the break of dormancy in some species. Therefore, the aim of this study was to evaluate the effect of priming on seed quality and to study the expression of genes associated with embryo growth and degradation of the micropylar endosperm of seeds of Solanum lycocarpum. The seeds were subjected hydropriming and osmoprimig conditioning with PEG (-0.2 MPa ). There were evaluated the germination percentage, the germination speed index (GSI ), the average time to germination and relative frequency of germination. The gene expression was performed using the real-time PCR technique. For this, RNA was extracted and cDNA synthesis was performed. The genes studied in the embryo were expansins (EXP8 and EXP10 ), α-galactosidase (LeaGal) and polygalacturonase ( XOPG1 ), and in the micropylar endosperm were α - galactosidase(LeaGal), β- mannosidase (LeMside1) , endo-β- mannanase ( LeMAN2 ) and polygalacturonase(XOPG1). The highest speed, lowest average time to germination and ...

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