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Both microarray and RNA-seq technologies are powerful tools which are commonly used in differential expression (DE) analysis. Gene expression levels are compared across treatment groups to determine which genes are differentially expressed. With both technologies, filtering and normalization are important steps in data analysis. In this thesis, real datasets are used to compare current analysis methods of two-color microarray and RNA-seq experiments. A variety of filtering, normalization and statistical approaches are evaluated. The results of this study show that although there is still no widely accepted method for the analysis of these types of experiments, the method chosen can largely impact the number of genes that are declared to be differentially expressed.

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De récentes données suggèrent un rôle clé des longs ARNs non codants (lncRNAs) dans le développement et l’apparition de certaines maladies. Les lncRNAs se sont avérés difficiles à étudier en raison de leur faible niveau d’expression souvent tissu-spécifique, du manque de conservation de leur séquence, et du manque d’outils d’analyse spécifiques. Nous avons émis l’hypothèse que les méthodes d’étude des ARNs messagers peuvent être adaptées aux lncRNAs. Pour valider cette hypothèse, nos objectifs sont : 1-l’utilisation des nouvelles approches dérivées du système CRISPR/Cas9 pour activer et inhiber l’expression génique et 2-l’utilisation des méthodes conventionnelles de surexpression pour étudier les lncRNAs. Dans le cadre de cette étude, nous nous sommes concentrés sur un nouveau lncRNA, appelé Tuna (Tcl1 Upstream Neuron-Associated lncRNA). Ce lncRNA est nécessaire au maintien des cellules souches embryonnaires, mais aussi à leur différenciation vers le lignage neural. Résultats : la nouvelle approche CRISPR-a/i permet d’activer/inhiber le promoteur de Tuna et de réguler l’expression endogène de celui-ci. Ce système s’étant révélé efficace pour Tuna, cela suggère qu’il peut être appliqué à l’étude d’autres lncRNAs. D’autre part, la particularité de cet ARN est qu’il contient une région conservée entre les espèces d’environ 200 nucléotides, correspondant à un ORF pour un peptide de 48 acides aminés. En utilisant des méthodes conventionnelles de marquage par FLAG, on démontre que Tuna code pour ce peptide. Par ailleurs, en supprimant un site de liaison à la protéine HUR dans la région 3’UTR, on altère l’expression du peptide. Cela suggère que ce site est important pour la régulation de la traduction du peptide encodé par Tuna. En conclusion, nos résultats montrent que certaines méthodes d’étude des ARNs messagers sont transposables aux lncRNAs. Cependant, du fait des caractéristiques propres à ces derniers, d’autres approches sont à envisager pour mieux saisir leurs mécanismes. En perspective, ces méthodes vont permettre de mieux comprendre la fonction de Tuna dans les différents états cellulaires où il est exprimé.

This mixed method study is made up of a narrative study carried out with children and an interview study with practitioner psychologists. The narrative study examined the effects of narrative types, namely a picture book story, a first person narrative and a third person narrative, and age, 7, 9 and 11, on children's use of emotion descriptive words. The lengths of the three story types were used as covariates. A 3*3 ANCOVA was carried out showing that neither the tasks, nor the children’s age, have an effect on children's performance. However, the results show a significant, though small, interaction between age and story type effects when the covariates were jointly controlled for. The limited nature of significant findings is explained. A thematic analysis was carried out with the interview study data. This part of the study inquired about the experience and expectations of practitioner psychologists working therapeutically with children. The focus was mainly on the emotional expression of their young clients. Three main themes emerged including an adultomorphic tendency, developmental uniformity and the importance of a therapeutic relationship.

The main focus of this investigation was to examine the automaticity of facial expression recognition through valence judgments in a modified photo-word Stroop paradigm. Positive and negative words were superimposed across male and female faces expressing positive (happy) and negative (angry, sad) emotions. Subjects categorized the valence of each stimulus. Gender biases in judgments of expressions (better recognition for male angry and female sad expressions) and the valence hypothesis of hemispheric advantages for emotions (left hemisphere: positive; right hemisphere: negative) were also examined. Four major findings emerged. First, the valence of expressions was processed automatically (robust interference effects). Second, male faces interfered with processing the valence of words. Third, no posers' gender biases were indicated. Finally, the emotionality of facial expressions and words was processed similarly by both hemispheres.

Nous nous proposons dans notre thèse de relire les textes philosophiques de Maurice Merleau-Ponty, en soulignant l’importance de la problématique de l’« expression » pour la compréhension de sa pensée, en particulier celle des années 40 et 50. Le but principal de nos recherches est dès lors de caractériser celle-ci comme une « philosophie de l’expression ». Autrement dit, nous tenterons de montrer dans notre thèse que la notion d’expression marque profondément – mais souvent implicitement – toute sa réflexion philosophique des années 40 et 50 telle qu’elle se développe notamment dans la Phénoménologie de la perception et La prose du monde.Notre recherche présente deux originalités majeures : la première consiste à définir l’expression comme un acte d’« auto-réalisation ». L’expression n’est pas à considérer chez Merleau-Ponty comme la « traduction d’une pensée déjà claire » mais comme un acte singulier par lequel la pensée se réalise ou s’effectue pour la première fois.La seconde originalité consiste en une étude globale de La prose du monde. Cet ouvrage – inachevé et jamais publié du vivant de l’auteur mais dans lequel la problématique de l’expression est abordée de manière plus explicite que dans d’autres textes – représente une période féconde dans l’évolution de la pensée de Merleau-Ponty, entre sa période « existentialiste » et sa période « ontologique ». Toutefois, probablement à cause de son caractère inachevé et inorganisé, les études entièrement consacrées à ce livre sont encore très peu nombreuses aujourd’hui. Notre travail constitue donc la première tentative d’embrasser les diverses questions de La prose du monde dans sa totalité. / In this thesis, we intend to reread the philosophical texts of Maurice Merleau-Ponty, emphasizing the importance of the issue of ‘‘expression’’ in his philosophy. The main aim of this research is therefore to characterize his thought – particularly during the 1940s and 1950s – as ‘‘philosophy of expression’’. In other words, we attempt to show that his philosophical reflection during the 1940s and 50s – developed particularly in the Phenomenology of perception and The prose of the world – is deeply (but often implicitly) marked by the notion of ‘‘expression’’.Our research has two main contributions : firstly, we define the notion of expression as an act of ‘‘auto-realization’’. In Merleau-Ponty’s philosophy, ‘‘expression’’ does not mean the ‘‘translation of a clearly defined thought’’, but it refers to a very specific act through which the thought realizes itself for the first time.Secondly, we comprehensively investigate The prose of the world, an unfinished work published posthumously and in which the issue of ‘‘expression’’ appears more clearly than in any other texts. This text epitomises a fertile period in the work of Merleau-Ponty, between his ‘‘existential’’ and ‘‘ontological’’ periods. However, probably due to its unfinished and disorganized character, The prose of the world has to date received little critical attention. Our study is therefore the first attempt to cover the various issues raised by this work in its totality.