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Régression linéaire bayésienne sur données fonctionnelles / Functional Bayesian linear regression

Grollemund, Paul-Marie 22 November 2017 (has links)
Un outil fondamental en statistique est le modèle de régression linéaire. Lorsqu'une des covariables est une fonction, on fait face à un problème de statistique en grande dimension. Pour conduire l'inférence dans cette situation, le modèle doit être parcimonieux, par exemple en projetant la covariable fonctionnelle dans des espaces de plus petites dimensions.Dans cette thèse, nous proposons une approche bayésienne nommée Bliss pour ajuster le modèle de régression linéaire fonctionnel. Notre modèle, plus précisément la distribution a priori, suppose que la fonction coefficient est une fonction en escalier. A partir de la distribution a posteriori, nous définissons plusieurs estimateurs bayésiens, à choisir suivant le contexte : un estimateur du support et deux estimateurs, un lisse et un estimateur constant par morceaux. A titre d'exemple, nous considérons un problème de prédiction de la production de truffes noires du Périgord en fonction d'une covariable fonctionnelle représentant l'évolution des précipitations au cours du temps. En terme d'impact sur les productions, la méthode Bliss dégage alors deux périodes de temps importantes pour le développement de la truffe.Un autre atout du paradigme bayésien est de pouvoir inclure de l'information dans la loi a priori, par exemple l'expertise des trufficulteurs et des biologistes sur le développement de la truffe. Dans ce but, nous proposons deux variantes de la méthode Bliss pour prendre en compte ces avis. La première variante récolte de manière indirecte l'avis des experts en leur proposant de construire des données fictives. La loi a priori correspond alors à la distribution a posteriori sachant ces pseudo-données.En outre, un système de poids relativise l'impact de chaque expert ainsi que leurs corrélations. La seconde variante récolte explicitement l'avis des experts sur les périodes de temps les plus influentes sur la production et si cet l'impact est positif ou négatif. La construction de la loi a priori repose alors sur une pénalisation des fonctions coefficients en contradiction avec ces avis.Enfin, ces travaux de thèse s'attachent à l'analyse et la compréhension du comportement de la méthode Bliss. La validité de l'approche est justifiée par une étude asymptotique de la distribution a posteriori. Nous avons construit un jeu d'hypothèses spécifique au modèle Bliss, pour écrire une démonstration efficace d'un théorème de Wald. Une des difficultés est la mauvaise spécification du modèle Bliss, dans le sens où la vraie fonction coefficient n'est sûrement pas une fonction en escalier. Nous montrons que la loi a posteriori se concentre autour d'une fonction coefficient en escalier, obtenue par projection au sens de la divergence de Kullback-Leibler de la vraie fonction coefficient sur un ensemble de fonctions en escalier. Nous caractérisons cette fonction en escalier à partir du design et de la vraie fonction coefficient. / The linear regression model is a common tool for a statistician. If a covariable is a curve, we tackle a high-dimensional issue. In this case, sparse models lead to successful inference, for instance by expanding the functional covariate on a smaller dimensional space.In this thesis, we propose a Bayesian approach, named Bliss, to fit the functional linear regression model. The Bliss model supposes, through the prior, that the coefficient function is a step function. From the posterior, we propose several estimators to be used depending on the context: an estimator of the support and two estimators of the coefficient function: a smooth one and a stewpise one. To illustrate this, we explain the black Périgord truffle yield with the rainfall during the truffle life cycle. The Bliss method succeeds in selecting two relevant periods for truffle development.As another feature of the Bayesian paradigm, the prior distribution enables the integration of preliminary judgments in the statistical inference. For instance, the biologists’ knowledge about the truffles growth is relevant to inform the Bliss model. To this end, we propose two modifications of the Bliss model to take into account preliminary judgments. First, we indirectly collect preliminary judgments using pseudo data provided by experts. The prior distribution proposed corresponds to the posterior distribution given the experts’ pseudo data. Futhermore, the effect of each expert and their correlations are controlled with weighting. Secondly, we collect experts’ judgments about the most influential periods effecting the truffle yield and if the effect is positive or negative. The prior distribution proposed relies on a penalization of coefficient functions which do not conform to these judgments.Lastly, the asymptotic behavior of the Bliss method is studied. We validate the proposed approach by showing the posterior consistency of the Bliss model. Using model-specific assumptions, efficient proof of the Wald theorem is given. The main difficulty is the misspecification of the model since the true coefficient function is surely not a step function. We show that the posterior distribution contracts on a step function which is the Kullback-Leibler projection of the true coefficient function on a set of step functions. This step function is derived from the true parameter and the design.
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Functional Data Models for Raman Spectral Data and Degradation Analysis

Do, Quyen Ngoc 16 August 2022 (has links)
Functional data analysis (FDA) studies data in the form of measurements over a domain as whole entities. Our first focus is on the post-hoc analysis with pairwise and contrast comparisons of the popular functional ANOVA model comparing groups of functional data. Existing contrast tests assume independent functional observations within group. In reality, this assumption may not be satisfactory since functional data are often collected continually overtime on a subject. In this work, we introduce a new linear contrast test that accounts for time dependency among functional group members. For a significant contrast test, it can be beneficial to identify the region of significant difference. In the second part, we propose a non-parametric regression procedure to obtain a locally sparse estimate of functional contrast. Our work is motivated by a biomedical study using Raman spectroscopy to monitor hemodialysis treatment near real-time. With contrast test and sparse estimation, practitioners can monitor the progress of the hemodialysis within session and identify important chemicals for dialysis adequacy monitoring. In the third part, we propose a functional data model for degradation analysis of functional data. Motivated by degradation analysis application of rechargeable Li-ion batteries, we combine state-of-the-art functional linear models to produce fully functional prediction for curves on heterogenous domains. Simulation studies and data analysis demonstrate the advantage of the proposed method in predicting degradation measure than existing method using aggregation method. / Doctor of Philosophy / Functional data analysis (FDA) studies complex data structure in the form of curves and shapes. Our work is motivated by two applications concerning data from Raman spectroscopy and battery degradation study. Raman spectra of a liquid sample are curves with measurements over a domain of wavelengths that can identify chemical composition and whose values signify the constituent concentrations in the sample. We first propose a statistical procedure to test the significance of a functional contrast formed by spectra collected at beginning and at later time points during a dialysis session. Then a follow-up procedure is developed to produce a sparse representation of the contrast functional contrast with clearly identified zero and nonzero regions. The use of this method on contrast formed by Raman spectra of used dialysate collected at different time points during hemodialysis sessions can be adapted for evaluating the treatment efficacy in real time. In a third project, we apply state-of-the-art methodologies from FDA to a degradation study of rechargeable Li-ion batteries. Our proposed methods produce fully functional prediction of voltage discharge curves allowing flexibility in monitoring battery health.

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