Long-lived individuals of the opportunistic fungal pathogen Armillaria gallica arise in single mating events, and then grow vegetatively to occupy large territories including multiple woody substrates. In effect, this leaves a spatial record of mutation, the detection of which would allow new inferences about how fungal individuals grow and infect their hosts. In this thesis, I first identified a large individual of A. gallica in eastern Ontario. I then searched for genetic variation within this individual by focusing on the tandemly repeated rRNA gene cluster and four microsatellite markers that are variable in the A. gallica population. I discovered a loss of heterozygosity (LOH) in the rRNA gene-cluster region, forming two genotypes that show significant spatial clustering in a Mantel test. My M.Sc. thesis research serves as a baseline for a genome-wide study of the mutational dynamic within the vegetative growth phase of this large and old Armillaria individual.

Long-lived individuals of the opportunistic fungal pathogen Armillaria gallica arise in single mating events, and then grow vegetatively to occupy large territories including multiple woody substrates. In effect, this leaves a spatial record of mutation, the detection of which would allow new inferences about how fungal individuals grow and infect their hosts. In this thesis, I first identified a large individual of A. gallica in eastern Ontario. I then searched for genetic variation within this individual by focusing on the tandemly repeated rRNA gene cluster and four microsatellite markers that are variable in the A. gallica population. I discovered a loss of heterozygosity (LOH) in the rRNA gene-cluster region, forming two genotypes that show significant spatial clustering in a Mantel test. My M.Sc. thesis research serves as a baseline for a genome-wide study of the mutational dynamic within the vegetative growth phase of this large and old Armillaria individual.

Dans ce travail, la variabilité de la composition phénolique et des activités antioxydantes de 5 espèces extrêmophiles tunisiennes (T. gallica, L.guyonianum, M. edule, P. equisetiforme et P. laevigata) a été étudiée. Les résultats ont montré que T. gallica est la plus riche en polyphénols totaux et que M. edule possède le contenu les plus élevé en flavonoïdes. En outre, la plus forte teneur en tanins condensés est trouvée chez P. equisetiforme. L. guyonianum s’est distinguée par son potentiel antioxydant puissant. L’analyse par CLHP a dévoilé la présence de l’acide rosmarinique, et des 2 flavonoïdes catéchine et isorhamnétine-3-O-rutinoside dans l’extrait de T. gallica. Les flavonoïdes majoritaires identifiés chez L.guyonianum sont la quercétine, la catéchine et l’isorhamnétine-3-O-rutinoside. L’étude a également montré que les extraits de T. gallica (TGE) et de L. guyonianum (LGE) exercent un effet cytoprotecteur sur les cellules IEC-6 stimulées par le H2O2. Le prétraitement avec TGE ou LGE à 0,25 μg.ml-1 a entrainé la restauration de la morphologie normale des IEC-6 et l'amplification de leur prolifération. En présence deTGE, l'activité CAT a été normalisée et la teneur en MDA a diminué. Alors qu’en présence de LGE, l’activité SODT a été améliorée et le pool cellulaire en GSH a augmenté. En outre, TGE et LGE ont induit la déphosphorylation de la JNK-MAPK pour réduire la mort cellulaire. D’un autre côté, l’effet préventif de l’administration de TGE et de LGE sur les dommages oxydatifs induits par le sepsis a été démontré. Dans les groupes de rats prétraités avec TGE et LGE, la perte de poids a diminué et le taux de survie a augmenté.Dans le groupe T30, l'activité SODT des EDL et des SOL a été significativement plus élevée que celle du groupe septique. Dans le même groupe T30, l’activité Mn-SOD des EDL et des SOL a été supérieure par rapport à l'isoforme SODT. Dans les groupes L300 et L30, l’activité CAT des EDL, des DIA et des SOL a été supérieure à celle du groupe septique. Les taux de GSH plasmatique ont augmenté dans les groupes T300 et L30. Dans les groupes L300 et T30, les activités AST et ALT ont diminué par comparaison au groupe S. En conclusion, l’administration des extraits de T. gallica et de L. guyonianum améliorent les capacités antioxydantes des muscles squelettiques et respiratoires, et préviennent les lésions hépatiques chez les rats septiques. / In this work, the variability of phenolic composition and antioxidant activities of 5 Tunisian extremophilic species (T. gallica, L. guyonianum, M. edule, P. equisetiforme and P. laevigata) was studied. Main results showed that T. gallica was the richest in total polyphenols. M. edule had the highest flavonoids content. In addition, the highest condensed tanins content was found in P. equisetiform.L. guyonianum was distinguished by its powerful antioxidant potential. HPLC analysis showed that T. gallica contained essentially rosmarinic acid, and the 2 flavonoids catechin and isorhamnetin-3-Orutinoside.The major flavonoids identified in L. guyonianum are quercetin, catechin, and isorhamnetin-3-O-rutinoside. The study showed that extracts of T. gallica (TGE) and L. guyonianum (LGE) exerted a cytoprotective effect on H2O2-stimulated IEC-6 cells. Pretreatment with TGE or LGE at 0.25 μg.ml-1 resulted in the re-establishment of normal cell morphology and the amplification of cell proliferation. In the presence of TGE, CAT activity was normalized and MDA content decreased. In the presence of LGE, SODT activity was improved and the GSH content increased. TGE and LGE induced JNK dephosphorylation to reduce cell death. In addition, the preventive effect of TGE and LGE administration on sepsis-induced oxidative damage was demonstrated. In TGE and LGE pretreated groups, weight loss decreased and survival rate increased. In T30 group, SODT activity of EDL and SOL was higher than those of the septic group. In the same group T30, Mn-SOD activities of EDL and SOL were higher than SODT. In L300 and L30 groups, CAT activities of EDL, DIA and SOL were higher than those of the septic group.Plasma GSH levels increased in the T300 and L30 groups. AST and ALT activities decreased in L300 and T30 groups. Altogether, the administration of T. gallica and L. guyonianum extracts improves the antioxidant capacities of skeletal and respiratory muscles and prevents hepatic injury in septic rats.

京都大学 / 0048 / 新制・課程博士 / 博士(農学) / 甲第21156号 / 農博第2282号 / 新制||農||1059(附属図書館) / 学位論文||H30||N5130(農学部図書室) / 京都大学大学院農学研究科森林科学専攻 / (主査)教授 吉村 剛, 教授 杉山 淳司, 教授 本田 与一 / 学位規則第4条第1項該当 / Doctor of Agricultural Science / Kyoto University / DFAM

Le genre de la chronique, inauguré, chez les chrétiens latinophones, par saint Jérôme (qui, lui-même, traduisit et compléta, vers 380, les Canons chronologiques d'Eusèbe de Césarée), a longtemps été tenu, du moins en France, et malgré son foisonnement remarquable, comme une forme historiographique tout à fait mineure, dont les notations laconiques apportaient peu à notre connaissance des événements et de leur perception par les contemporains. Pourtant, les trois premiers continuateurs de Jérôme : Prosper d'Aquitaine, l'"Anonyme gaulois de 452", et l'évêque galicien Hydace, révèlent, à l'analyse, une conscience aiguë des transformations majeures qui affectent l'Occident romain au Ve siècle, prélude à l'émergence des "royaumes barbares". Le présent travail tente de réévaluer l'intérêt de telles sources : tout en examinant la structure et les caractères de leurs chroniques respectives, il s'attache, plus globalement, à approfondir la réflexion sur le sens que ces auteurs donnèrent à leur époque, à la croisée de l'Antiquité finissante et du très haut Moyen Age. L'étude s'appuie sur des textes revus, avec traductions françaises intégrales et inédites. / The chronicle genre, initiated among Latin-speaking Christians by Saint Jerome (who translated and supplemented Eusebius of Caesarea's Chronological Canons, ca. 380 CE), has been regarded for a long time – at least in France, and despite its remarkable flowering – as a very minor form of historiography : its laconic notes are thought to be of meagre interest for our knowledge of events and how contemporaries understood them. However, the first three continuators of Jerome : Prosper of Aquitaine, the "Gallic Anonymous of 452", and the Galician bishop Hydatius, as a matter of fact, reveal an acute sense of the major transformations affecting the Roman West in the fifth century – that is, the dawn of the "Barbarian Kingdoms". This work attempts to offer a reappraisal of this kind of sources : while discussing the structure and characteristics of each chronicle, it is more generally aimed to investigate more thoroughly the significance these authors attached to their own time, at the crossroads between later Antiquity and the earlier Middle Ages. The study is based on revised texts, with fresh and unabridged translations into French.

Le phénomène naturel d’érosion des berges peut menacer des infrastructures humaines. Des protections végétales peuvent être installées afin de mimer les dynamiques de végétation et armer la berge grâce aux racines. Cependant, les changements climatiques globaux sont susceptibles d’entraîner et d’aggraver les sécheresses, ce qui va stresser les végétaux présents et compromettre la bonne réussite des ouvrages de génie végétal. La principale question est donc « Quelles sont les caractéristiques biotechniques et les facultés d’acclimatation à la sécheresse de boutures de Salicaceae et Tamaricaceae, espèces utilisées ou potentiellement utilisables en génie végétal ? ». L’étude de différentes populations d’espèces classiquement utilisées que sont les saules démontre une résistance à la sécheresse plus efficace des populations méridionales tandis que les productions de biomasses restent plus élevées chez les populations septentrionales. L’étude des traits biotechniques et du comportement racinaire d’espèces potentielles appartenant aux Tamaricaceae (Tamarix gallica et Myricaria germanica) montre un taux élevé de reprise au bouturage, une forte production de biomasses et une stratégie de prospection racinaire différente des saules, ce qui leur confère une résistance à la sécheresse accrue. Ceci confirme une utilisation possible de ces espèces dans des ouvrages de génie végétal soumis à sécheresse. / The natural phenomenon of riverbank erosion can threaten human stakes. Vegetative bioengineering protections can be installed to imitate the vegetation dynamics and anchor the soil bank thanks to roots. However, global climate change could induce and increase droughts, what is going to stress plants and to compromise the bioengineering works success. The main question is thus " what are the biotechnical capabilities and the drought acclimatization faculties of cuttings of Salicaceae and Tamaricaceae, species used or potentially useful in bioengineering? ". The study of different populations of species such as willows demonstrates a more effective drought resistance of the Southern populations whereas the biomass productions remain higher with the Northern populations. The study of the biotechnical traits and the root behavior potentially useful species such as Tamaricaceae (Tamarix gallica and Myricaria germanica) show a high resprouting rate, a high biomass production and a prospecting root strategy different from willows. This results confer them a better drought resistance. This confirms a possible use of these species in vegetative bioengineering works subjected to drought.

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Le phénomène naturel d'érosion des berges peut menacer des infrastructures humaines. Des protections végétales peuvent être installées afin de mimer les dynamiques de végétation et armer la berge grâce aux racines. Cependant, les changements climatiques globaux sont susceptibles d'entraîner et d'aggraver les sécheresses, ce qui va stresser les végétaux présents et compromettre la bonne réussite des ouvrages de génie végétal. La principale question est donc " Quelles sont les caractéristiques biotechniques et les facultés d'acclimatation à la sécheresse de boutures de Salicaceae et Tamaricaceae, espèces utilisées ou potentiellement utilisables en génie végétal ? ". L'étude de différentes populations d'espèces classiquement utilisées que sont les saules démontre une résistance à la sécheresse plus efficace des populations méridionales tandis que les productions de biomasses restent plus élevées chez les populations septentrionales. L'étude des traits biotechniques et du comportement racinaire d'espèces potentielles appartenant aux Tamaricaceae (Tamarix gallica et Myricaria germanica) montre un taux élevé de reprise au bouturage, une forte production de biomasses et une stratégie de prospection racinaire différente des saules, ce qui leur confère une résistance à la sécheresse accrue. Ceci confirme une utilisation possible de ces espèces dans des ouvrages de génie végétal soumis à sécheresse.