Submitted by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-12T14:04:28Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) THAIS MARIA BENTO PIRES LOPA.pdf: 1723701 bytes, checksum: 15bddce3f3af02db9d84d441abc84c12 (MD5) / Approved for entry into archive by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2016-09-12T14:05:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) THAIS MARIA BENTO PIRES LOPA.pdf: 1723701 bytes, checksum: 15bddce3f3af02db9d84d441abc84c12 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-12T14:05:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) THAIS MARIA BENTO PIRES LOPA.pdf: 1723701 bytes, checksum: 15bddce3f3af02db9d84d441abc84c12 (MD5) Previous issue date: 2015-09-15 / As raças sintéticas, oriundas do cruzamento do Bos taurus indicus com Bos taurus taurus, como o Braford, vêm conquistando muitos criadores pela capacidade de adaptação a diversos ambientes, mantendo bom desempenho produtivo e reprodutivo. Atualmente, devido aos altos custos, a busca por eficiência no sistema de produção é crescente e selecionar animais pelo melhor desempenho, priorizando as características de maior retorno econômico, mostra-se de extrema importância. A ferramenta utilizada para aumentar a frequência dos alelos favoráveis numa população é o melhoramento genético. Entretanto, este processo pode levar a alterações significativas na estrutura genética da população resultando num aumento da homozigose, endogamia e diminuição da diversidade genética da população. Esta é muito importante pois otimiza a capacidade de adaptação e chance de sobrevivência, sendo fundamental para manter o progresso genético.. Por estes motivos, é fundamental monitorar a estrutura genética das populações sob seleção para manter baixas as taxas de endogamia e garantir o progresso genético. A partir dessa premissa se objetivou caracterizar a estrutura populacional da raça Braford, com um histórico de seleção de mais de 30 anos, verificando as principais variáveis influenciadas pelas estratégias de seleção como endogamia, tamanho efetivo populacional (Ne) e intervalo de gerações. Verificar o perfil genético dos dez principais touros pais através da comparação das médias das diferenças esperadas na progênie (DEPs) dos seus descendentes (7.142 filhos) com a população avaliada no programa genético PampaPlus para as características de peso ao nascer (PN), peso a desmama (PD), peso ao sobreano (PS), perímetro escrotal (PE) e para o índice de classificação final do programa (IQG), verificando os níveis médios de endogamia fornecidos pelo programa. O arquivo de pedigree contêm 278.095 informações e os resultados da análise populacional foi obtido através do programa de análise populacional POPREP. O estudo demonstrou que a integridade do pedigree está melhorando no decorrer dos anos, o que beneficia a acurácia das avaliações genéticas. O intervalo médio de gerações foi de 5,8 anos e se observou um gradual aumento da idade média dos pais ao nascimento dos filhos, maior longevidade reprodutiva das matrizes e baixa reposição dos reprodutores. O aumento do coeficiente de endogamia por ano é consideravelmente baixo, 0,000116, porém o número de animais endogâmicos está crescendo com um coeficiente médio de endogamia nos últimos cinco anos (2008 a 2013) de 4,8%, e deve ser monitorado para não afetar o progresso genético da população. O Ne através do censo dos pais e coeficiente de endogamia individual foi de 3.363 e 160 respectivamente, valores estes distantes do limite considerado preocupante, indicando haver variabilidade genética. No perfil genético dos touros pais se observou superioridade em 50% dessas linhagens mostrando progresso genético dentro da raça. O nível médio de endogamia dos descendentes apurado (0,0085) indica que os criadores ainda podem utilizar a genética destas linhagens, pois há diferenças entre elas. O aumento do número de criadores e de animais registrados indica expansão da raça, porém apenas 30% dos criatórios de Braford fazem avaliação genética. Concluindo-se que muito ainda pode ser feito no melhoramento genético do Braford, pois os parâmetros populacionais encontram-se preservados e os ganhos genéticos podem ser incrementados através de um trabalho de seleção orientado. / Synthetic breeds produced by crossing Bos taurus indicus and Bos taurus taurus, as the Braford, have gained many breeders due to their resilience to perform under harsh environments and good productive and reproductive performance. Currently, due to high production costs, the search for efficiency in beef cattle production systems is increasing and selection of animals for performance, prioritizing traits of higher economic value has proved to be extremely important. The tool used to increase the frequency of favorable alleles in a population is the genetic improvement. However, this process can lead to significant changes in the genetic structure of populations resulting in increased homozygosity, inbreeding and reduction of genetic diversity, which is very important to optimize the adaptability and allow sustained genetic progress. For these reasons, it is essential to monitor the genetic structure of populations under selection in order to maintain low inbreeding rates and ensure genetic progress. Given this premise, the main goal of this work was to characterize the population structure of Brazilian Braford breed included in its studbook in order to quantify the variables that might be influenced by the selection strategies such as inbreeding, effective population size (Ne) and generation interval; assess the genetic profile of the top ten Braford bulls by comparing the averages of expected progeny differences (EPDs) with the population evaluated in the genetic program PampaPlus for birth weight (BW), weaning weight (WW), yearling weight (YW), yearling scrotal (SC), final index ranking (FIR) and the average levels of inbreeding provided by the program. The pedigree file containing 278,095 records was analyzed and the parameters were computed using the program POPREP. The study showed that pedigree integrity is improving over the years, which benefits the accuracy of genetic evaluations. The average generation interval was 5.8 years and it was observed a gradual increase in the average age of parents at the birth of their progeny, an increase in reproductive longevity of dams and low sire replacement. The increase in the inbreeding coefficient over the years is considerably low (F = 0.000116, but the number of inbred animals is growing with an average coefficient of inbreeding in the last five years years (2008 to 2013) of 4.8% and it should be monitored in the population to not affect the genetic progress. The effective population size calculated trough the census of parents and individual inbreeding coefficient were 3.363 and 160 respectively, being distant from the limit considered dangerous and indicating the existence of good genetic variability for effective selection. The genetic profile of the ten main bulls showed superiority in 50% of the lines indicating genetic progress within the breed. The progenies´ inbreeding coefficient (F = 0.0085) indicates that breeders can use these genetic lines since there are genetic variation among them. The increase in the number of breeders and purebred animals indicates expansion of the breed. Notwithstanding, only 30% of the Braford breeders are enrolled in the Braford improvement program. In conclusion, the Braford population studied has plenty of genetic variation to be used in selection and there is a good potential of genetic gains to be achieved through genetic improvement programs.