Resumo: A avaliação do contexto genético de organismos, bem como sua correspondência geográfica, formam um potencial para estudos biogeográficos históricos e filogeográficos. A interação Cecropia-Azteca é bastante conhecida por ser amplamente distribuída nos trópicos e pode servir de modelo para estudos populacionais e de coevolução. Este estudo tratou da interação entre Cecropia e Azteca, sua distribuição geográfica potencial e real e implicações genéticas e ecológicas dessa interação. Para este fim o trabalho foi divido em dois capítulos, o primeiro objetivou avaliar a distribuição geográfica de espécies do gênero Cecropia e formigas do gênero Azteca associadas. Buscou-se descrever a estrutura populacional de C. pachystachya, C. glaziovii e C. saxatilis nos locais de ocorrência, foram verificados quais os pares mutualísticos formados entre Cecropia-Azteca e foi produzido um mapa de distribuição potencial baseando-se na teoria de nicho ecológico. No segundo capítulo objetivou-se descrever a estrutura genética de C. pachystachya e C. glaziovii com marcadores ISSR-PCR, avaliar a variabilidade genética de Azteca com o gene do DNA mitocondrial COI e interpretar sobre possíveis efeitos de processos coevolutivos no sistema Cecropia-Azteca. O estudo abrangeu áreas da porção Sul da Mata Atlantica e região central do Cerrado. No primeiro capítulo indivíduos de Cecropia e Azteca foram amostrados em 19 pontos sendo onze na Mata Atlântica e oito no Cerrado. Em cada ponto de coleta foram amostrados 20 indivíduos de Cecropia e 20 exemplares de Azteca correspondente a cada árvore, buscando a rainha para fins de identificação. As árvores foram medidas em altura, circunferência a altura do peito (CAP) e número de ramificações, para interpretação de estrutura populacional. Utilizouse ainda dados de ocorrência das espécies de Cecropia estudadas para uma modelagem de distribuição potencial baseada na teoria de nicho, utilizando o aplicativo openModeller e o algoritmo MaxEnt para gerar um mapa para cada espécie. A distribuição observada mostrou que C.pachistachya é a mais amplamente distribuída, sendo observada em formações de Cerrado e de Mata Atlântica, C. glaziovii foi observada apenas em Mata Atlântica e C. saxatilis exclusivamente em Cerrado. A maioria de indivíduos das três espécies estudadas, estavam na faixa etária juvenil e adulta, férteis e plenamente estabelecidos, apesar de estarem em classes iniciais de tamanho. Os pares mutualísticos encontrados foram de C. pachystachya com A. alfari, C. saxatilis com A. alfari e C. glaziovii com A. muelleri. A espécie A. alfari se mostrou mais generalista na interação, ocorrendo em duas das espécies de Cecropia. A espécie A. muelleri foi mais específica, pois as formigas são mais agressivas e protetoras dos ninhos, sendo que esses ninhos provocam deformações no fuste principal das plantas de C. glaziovii. Os mapas de distribuição potencial gerados mostraram mais coerência com a distribuição observada para C. pachystachya e C. saxatilis do que para C. glaziovii, considerando as limitações do modelo, pois é sujeito aos dados de ocorrência que podem ter erros e também limitações do próprio algoritmo. No capítulo dois, para extração de DNA, amplificação através de PCR-ISSR e interpretação genéticopopulacional, utilizou-se oito populações de C. pachystachya e quatro populações de C. glaziovii coletando uma folha de cada uma das 20 plantas. Quatro primers amplificaram adequadamente para 94 indivíduos de C. pachystachya de Mata Atlântica e Cerrado e 36 de C. glaziovii de Mata Atlântica. Foram selecionados 50 exemplares de Azteca coletados e após a identificação foram submetidos ao sequenciamento do gene (COI), para inferência sobre variabilidade genética. As duas espécies de Cecropia mostraram baixa diversidade genética e a distribuição da variação se mostrou maior dentro das populações do que entre as populações, mostrando baixa estruturação genética correspondente às localidades de ocorrência. Existem efeitos de um conjunto de fatores homogeneizadores dessas populações referentes à sua biologia aliados a descontinuidade de coleta, bem como o número baixo de primers, que podem ter influenciado nesse resultado. Azteca mostrou uma separação em duas linhagens diferentes, porém essas linhagens não correspondem as duas espécies do estudo, misturando ambas e ainda, sem correspondência com a estrutura geográfica. Além disso, os agrupamentos não foram coerentes com a distribuição geográfica das amostras, talvez por existir espécies crípticas não detectadas morfologicamente ou por limitação na resolução do marcador, que isolado pode não ser adequado para algumas interpretações. As análises interpretadas em conjunto podem sugerir que estejam ocorrendo eventos coevolutivos que influenciem reciprocamente os mutualistas e resultem em consequências ecológicas e genéticas evidenciadas na falta de estrutura genética de Cecropia e na falta de padrões coerentes de variabilidade em Azteca de acordo com a estruturação geográfica.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2003-06-27Bitstream added on 2014-06-13T20:48:31Z : No. of bitstreams: 1 azevedo_ts_me_rcla.pdf: 6028275 bytes, checksum: 89a45984fe1260b3f0ad749c8f7b7012 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho apresenta uma discussão sobre os conceitos fundamentais utilizados em pesquisas voltadas ao estudo de ecologia de paisagem, através da dimensão fractal. Neste trabalho são revistos tópicos básicos sobre ecologia da paisagem e geometria fractal. Discutimos ainda, algumas aplicações da geometria fractal na identificação de impactos ambientais em paisagens. Apresentamos um estudo de caso avaliando a influencia da resolução espacial e do tamanho da área mapeada na estimativa da dimensão fractal (D) de paisagens ripárias. Para verificar esta influência selecionamos quatro métodos fractais baseados na relação área-perímetro. Os resultados mostram que a resolução espacial interfere na estimativa de D dos fragmentos de matas ciliares. Observamos através da simulação da resolução espacial, dos fragmentos de matas ciliares, que as resoluções de 1000m, 500m, 100m e 50m apresentam diferenças significativas na estimativa de D e somente a partir de 50m de resolução, os valores de D não apresentam variações significativas. Este mesmo comportamento foi apresentado pelos quatro métodos utilizados. Entretanto o método desenvolvido por Lovejoy (1982) foi o que apresentou a maior variação na estimativa de D (15,7%), quando comparada com a variação da estimativa de D, dos outros três métodos desenvolvidos por Mandelbrot (1983) e Clark (1995), que apresentaram 8,5%, 8,2% e 8,8% respectivamente. Em relação à extensão da área mapeada na estimativa da dimensão fractal não apresenta variação significativa. Os resultados referentes à evolução espaço temporal das matas ciliares no período de 1962 a 1995, mostrou que D não teve grande variação. Entretanto, quando avaliamos a dimensão fractal dos fragmentos florestais de matas ciliares correlacionadas à unidades geomorfológicas, apresentou variações significativas... / This paper presents a theoretical discussion about landscape ecology and fractal geometry. Basic topics of landscape ecology and fractal geometry are reviewed, and different ways of interpreting landscape ecology by using fractal geometry as an index of environmental change are herein proposed. This paper also presents a study case to evaluate the influence of spatial resolution and the extent of the Fractal Dimension (D) of riparian landscapes. Four fractal methods were selected to analyze such an influence. To compare the influence of resolution and extent of D, statistical inference was used. The results showed that the resolution altered the fractal estimate of riparian landscapes, i. e. the fractal indices are sensitive to the spatial resolution change. The results also showed that resolutions with 1000m, 500m, 100m and 50m are those which are more sensitive to fractal estimates, and that only from the 50m resolution on is this effect not present, although this behavior is noted in all methods studied. The Lovejoy's Fractal Method, however, is the one that presents the greatest variance when compared to the Mandelbrot's and Clark's Fractal Methods. The variance of the Lovejoy's Fractal Method is 15,7 % while variances verified by other methods are 8,5 %, 8,2% and 8,8%, respectively. Extent change was not found to have any sensitive influence on the estimative of fractal dimension. The results of spatial and temporal change of the riparian landscapes in the 1962 - 1995 period showed that D are not present variation. Although when evaluate the variation of fractal dimension correlated with geomorphological units presents significative variations. This variation is related with an environmental regulator of the variation of D in the time.

O gênero Diploneis caracteriza-se principalmente por apresentar valvas com canais longitudinais bem desenvolvidos adjacentes à rafe, ornamentados por uma a várias fileiras de poros. Ocorre predominantemente em ambientes marinhos e salobros e vem sendo amplamente citado para áreas úmidas costeiras e marismas. Entretanto, na maioria das citações, os táxons não são identificados em nível infra-genérico, tem identificação incerta ou não são apresentadas descrições, comentários, dimensões ou ilustrações. O objetivo deste estudo é ampliar o conhecimento de Diploneis presente em marismas no extremo sul do Brasil, realizando a descrição taxonômica dos táxons, fornecendo dados a respeito da morfologia e ultraestrutura das valvas, a ocorrência dos mesmos nas diferentes zonas de salinidade na área de estudo e sua distribuição geográfica em escala mundial. Foram realizadas coletas de plâncton, bentos e epifíton entre 2009 a 2011 e 2015, em duas áreas de marismas no extremo sul do Estado do Rio Grande do Sul, uma no Parque Nacional da Lagoa do Peixe e outra adjacente ao estuário da Lagoa dos Patos. O material foi preparado e analisado em microscópio óptico (MO) e em microscópio eletrônico de varredura (MEV). Foram identificados 13 táxons, destacando-se D. novaeseelandiae Hustedt como primeiro registro para a região neotropical; D. aestuari, D. nitenscens e D. zannii como primeiros registros para o estado do Rio Grande do Sul e D. nitescens, D. subovalis e D. zanii como primeiros registros para marismas em escala mundial. D. interrupta e D. aestuari são consideradas como primeiras citações para marismas do sul do Brasil. Foi realizada uma análise detalhada da ultraeestrutura de D. novaeseelandiae e de D. interrupta em MEV, a qual possibilitou descrever pela primeira vez a morfologia e a ultraestrutura das estrias, canais longitudinais e da rafe, ampliando a diagnose destas espécies. Também é apresentada de forma pioneira a descrição das valvas de D. litoralis var. clathrata e de D. zannii em MEV. A maioria dos táxons apresentou ampla distribuição nas duas áreas de estudo e ocorreram em diferentes zonas de salinidade, demonstrando que se trata de um gênero bem adaptado à região de marismas, pelo fato de tolerarem ampla variação de salinidade. O presente estudo vem contribuir para o conhecimento da biodiversidade de microalgas em região de marismas no sul do Brasil e ressalta a importância da análise da ultraestrutura das valvas para a taxonomia de Diploneis.

A região de estudo está localizada na porção nordeste do Estado de Roraima, na região do Médio e Alto Rio Surumu, entre as coordenadas 3º 58’ – 4º 27’ N e 60º 13’ – 61º 16’ W e inserida em uma paisagem dominada por formações de savanas. Um total de 95 espécimens de pequenos mamíferos terrestres foram capturados, divididos entre 6 espécies (Monodelphis brevicaudata (Didelphimorphia), Oligoryzomys sp., Sigmodon alstoni, Rhipidomys nitela, Proechimys cf guyannensis e Zygodontomys brevicauda (Rodentia, Sigmodontinae), através de um esforço de 9.479 armadilhas/dia sendo o sucesso de capturas de 1%. As estações de captura positivas, e parte das estações com ausência de captura, foram descritas considerando variáveis quantitativas e qualitativas. As probabilidades de ocorrência das espécies em conjunto e de Z. brevicauda, separadamente, foram calculadas via Regressão Logística utilizando as características estruturais dos hábitats. Um mapa de vegetação foi gerado a partir de imagem de satélite LANDSAT-TM, onde 14 classes de cobertura vegetal foram identificadas. As probabilidades foram associadas às diferentes classes e permitiram a espacialização da distribuição potencial das espécies considerando o mosaico de hábitats da região As espécies, quando vistas em conjunto, evidenciaram restrições de uso das formações fechadas tais como as zonas internas das Matas Ciliares. As zonas de transição entre as formações arbóreas e as formações abertas de savana apresentaram alta probabilidade de ocorrência de pequenos mamíferos. Z. brevicauda, uma espécie reconhecida como um elemento característico das formações abertas, apresentou restrições de ocorrência em grande parte da sua extensão. Os modelos de distribuição potencial para Z. brevicauda destacam apenas os hábitats de borda como as classes com maior potencial de ocorrência.

O gênero Diploneis caracteriza-se principalmente por apresentar valvas com canais longitudinais bem desenvolvidos adjacentes à rafe, ornamentados por uma a várias fileiras de poros. Ocorre predominantemente em ambientes marinhos e salobros e vem sendo amplamente citado para áreas úmidas costeiras e marismas. Entretanto, na maioria das citações, os táxons não são identificados em nível infra-genérico, tem identificação incerta ou não são apresentadas descrições, comentários, dimensões ou ilustrações. O objetivo deste estudo é ampliar o conhecimento de Diploneis presente em marismas no extremo sul do Brasil, realizando a descrição taxonômica dos táxons, fornecendo dados a respeito da morfologia e ultraestrutura das valvas, a ocorrência dos mesmos nas diferentes zonas de salinidade na área de estudo e sua distribuição geográfica em escala mundial. Foram realizadas coletas de plâncton, bentos e epifíton entre 2009 a 2011 e 2015, em duas áreas de marismas no extremo sul do Estado do Rio Grande do Sul, uma no Parque Nacional da Lagoa do Peixe e outra adjacente ao estuário da Lagoa dos Patos. O material foi preparado e analisado em microscópio óptico (MO) e em microscópio eletrônico de varredura (MEV). Foram identificados 13 táxons, destacando-se D. novaeseelandiae Hustedt como primeiro registro para a região neotropical; D. aestuari, D. nitenscens e D. zannii como primeiros registros para o estado do Rio Grande do Sul e D. nitescens, D. subovalis e D. zanii como primeiros registros para marismas em escala mundial. D. interrupta e D. aestuari são consideradas como primeiras citações para marismas do sul do Brasil. Foi realizada uma análise detalhada da ultraeestrutura de D. novaeseelandiae e de D. interrupta em MEV, a qual possibilitou descrever pela primeira vez a morfologia e a ultraestrutura das estrias, canais longitudinais e da rafe, ampliando a diagnose destas espécies. Também é apresentada de forma pioneira a descrição das valvas de D. litoralis var. clathrata e de D. zannii em MEV. A maioria dos táxons apresentou ampla distribuição nas duas áreas de estudo e ocorreram em diferentes zonas de salinidade, demonstrando que se trata de um gênero bem adaptado à região de marismas, pelo fato de tolerarem ampla variação de salinidade. O presente estudo vem contribuir para o conhecimento da biodiversidade de microalgas em região de marismas no sul do Brasil e ressalta a importância da análise da ultraestrutura das valvas para a taxonomia de Diploneis.

A região de estudo está localizada na porção nordeste do Estado de Roraima, na região do Médio e Alto Rio Surumu, entre as coordenadas 3º 58’ – 4º 27’ N e 60º 13’ – 61º 16’ W e inserida em uma paisagem dominada por formações de savanas. Um total de 95 espécimens de pequenos mamíferos terrestres foram capturados, divididos entre 6 espécies (Monodelphis brevicaudata (Didelphimorphia), Oligoryzomys sp., Sigmodon alstoni, Rhipidomys nitela, Proechimys cf guyannensis e Zygodontomys brevicauda (Rodentia, Sigmodontinae), através de um esforço de 9.479 armadilhas/dia sendo o sucesso de capturas de 1%. As estações de captura positivas, e parte das estações com ausência de captura, foram descritas considerando variáveis quantitativas e qualitativas. As probabilidades de ocorrência das espécies em conjunto e de Z. brevicauda, separadamente, foram calculadas via Regressão Logística utilizando as características estruturais dos hábitats. Um mapa de vegetação foi gerado a partir de imagem de satélite LANDSAT-TM, onde 14 classes de cobertura vegetal foram identificadas. As probabilidades foram associadas às diferentes classes e permitiram a espacialização da distribuição potencial das espécies considerando o mosaico de hábitats da região As espécies, quando vistas em conjunto, evidenciaram restrições de uso das formações fechadas tais como as zonas internas das Matas Ciliares. As zonas de transição entre as formações arbóreas e as formações abertas de savana apresentaram alta probabilidade de ocorrência de pequenos mamíferos. Z. brevicauda, uma espécie reconhecida como um elemento característico das formações abertas, apresentou restrições de ocorrência em grande parte da sua extensão. Os modelos de distribuição potencial para Z. brevicauda destacam apenas os hábitats de borda como as classes com maior potencial de ocorrência.

Resumo: Esta pesquisa tem como principal objetivo aplicar as tecnologias de sistema de informações geográficas (SIG) e o Geoprocessamento em especial o PHILCARTO (sofware de cartografia temática) associada à metodologia da modelização gráfica, como ferramenta de apoio a decisões quanto a políticas de planejamento de reorganização territorial. Para tal aplicação foi contemplado o território do Paraná, cuja pesquisa trilhou por quatro etapas principais: (i) levantamento dos dados socioeconômicos; (ii) criação da base cartográfica; (iii) criação da base de dados provenientes de Agências de pesquisa como IBGE, IPARDES, PNUD entre outras; (iv) criação de mapas temáticos. Após a obtenção de diferentes variáveis, foi construído o modelo teórico - modelização gráfica - a partir de modelos elementares combinados entre si, formando uma estrutura complexa, a qual constitui uma imagem sintética dos pontos e eixos fortes e de fraquezas do território paranaense. Dentre as variáveis levantadas, decidiu-se por: a) a organização do território paranaense com o levantamento de dados sobre indicadores tidos como tradicionais (IDH, Saúde, Educação); b) a gênese, a organização e a integração das microrregiões paranaenses; c) as redes que compõem o território, dentre elas: rodovias, ferrovias, usinas, universidades públicas; d) dinâmicas rurais, industriais e de comércio que alavancam o desenvolvimento econômico do estado; e) levantamento dos programas em curso que levem a melhorar os índices de fraqueza do território paranaense: bolsa família, Brasil alfabetizado, programas da SUDESUL.

O gênero Diploneis caracteriza-se principalmente por apresentar valvas com canais longitudinais bem desenvolvidos adjacentes à rafe, ornamentados por uma a várias fileiras de poros. Ocorre predominantemente em ambientes marinhos e salobros e vem sendo amplamente citado para áreas úmidas costeiras e marismas. Entretanto, na maioria das citações, os táxons não são identificados em nível infra-genérico, tem identificação incerta ou não são apresentadas descrições, comentários, dimensões ou ilustrações. O objetivo deste estudo é ampliar o conhecimento de Diploneis presente em marismas no extremo sul do Brasil, realizando a descrição taxonômica dos táxons, fornecendo dados a respeito da morfologia e ultraestrutura das valvas, a ocorrência dos mesmos nas diferentes zonas de salinidade na área de estudo e sua distribuição geográfica em escala mundial. Foram realizadas coletas de plâncton, bentos e epifíton entre 2009 a 2011 e 2015, em duas áreas de marismas no extremo sul do Estado do Rio Grande do Sul, uma no Parque Nacional da Lagoa do Peixe e outra adjacente ao estuário da Lagoa dos Patos. O material foi preparado e analisado em microscópio óptico (MO) e em microscópio eletrônico de varredura (MEV). Foram identificados 13 táxons, destacando-se D. novaeseelandiae Hustedt como primeiro registro para a região neotropical; D. aestuari, D. nitenscens e D. zannii como primeiros registros para o estado do Rio Grande do Sul e D. nitescens, D. subovalis e D. zanii como primeiros registros para marismas em escala mundial. D. interrupta e D. aestuari são consideradas como primeiras citações para marismas do sul do Brasil. Foi realizada uma análise detalhada da ultraeestrutura de D. novaeseelandiae e de D. interrupta em MEV, a qual possibilitou descrever pela primeira vez a morfologia e a ultraestrutura das estrias, canais longitudinais e da rafe, ampliando a diagnose destas espécies. Também é apresentada de forma pioneira a descrição das valvas de D. litoralis var. clathrata e de D. zannii em MEV. A maioria dos táxons apresentou ampla distribuição nas duas áreas de estudo e ocorreram em diferentes zonas de salinidade, demonstrando que se trata de um gênero bem adaptado à região de marismas, pelo fato de tolerarem ampla variação de salinidade. O presente estudo vem contribuir para o conhecimento da biodiversidade de microalgas em região de marismas no sul do Brasil e ressalta a importância da análise da ultraestrutura das valvas para a taxonomia de Diploneis.

A região de estudo está localizada na porção nordeste do Estado de Roraima, na região do Médio e Alto Rio Surumu, entre as coordenadas 3º 58’ – 4º 27’ N e 60º 13’ – 61º 16’ W e inserida em uma paisagem dominada por formações de savanas. Um total de 95 espécimens de pequenos mamíferos terrestres foram capturados, divididos entre 6 espécies (Monodelphis brevicaudata (Didelphimorphia), Oligoryzomys sp., Sigmodon alstoni, Rhipidomys nitela, Proechimys cf guyannensis e Zygodontomys brevicauda (Rodentia, Sigmodontinae), através de um esforço de 9.479 armadilhas/dia sendo o sucesso de capturas de 1%. As estações de captura positivas, e parte das estações com ausência de captura, foram descritas considerando variáveis quantitativas e qualitativas. As probabilidades de ocorrência das espécies em conjunto e de Z. brevicauda, separadamente, foram calculadas via Regressão Logística utilizando as características estruturais dos hábitats. Um mapa de vegetação foi gerado a partir de imagem de satélite LANDSAT-TM, onde 14 classes de cobertura vegetal foram identificadas. As probabilidades foram associadas às diferentes classes e permitiram a espacialização da distribuição potencial das espécies considerando o mosaico de hábitats da região As espécies, quando vistas em conjunto, evidenciaram restrições de uso das formações fechadas tais como as zonas internas das Matas Ciliares. As zonas de transição entre as formações arbóreas e as formações abertas de savana apresentaram alta probabilidade de ocorrência de pequenos mamíferos. Z. brevicauda, uma espécie reconhecida como um elemento característico das formações abertas, apresentou restrições de ocorrência em grande parte da sua extensão. Os modelos de distribuição potencial para Z. brevicauda destacam apenas os hábitats de borda como as classes com maior potencial de ocorrência.

Orientador: Claudia Maria Bauzer Medeiros / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-07-27T09:27:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Matias_SandrodePaula_M.pdf: 16947439 bytes, checksum: 08f41069a3254703fced5a47ceffd816 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: O SINBIOTASP é o sistema de informação para biodiversidade atualmente sendo desenvolvido como parte do programa BIOTA/FAPESP. Esta dissertação está voltada ao problema da implementação adequada de mecanismos para processamento de consultas no SINBIOTASP. Este tópico apresenta vários desafios tanto do ponto de vista de formulação das consultas quanto de seu processamento, pela variedade e volume dos dados considerados e pela gama de perfis de usuários do sistema. As principais contribuições deste trabalho são: o levantamento de características de processamento de consultas de diversos sistemas de informação ambiental disponíveis na Web; uma proposta de sistematização dos tipos de consultas comuns em projetos de biodiversidade, sob critérios de processamento e interface; e a especificação de um conjunto básico de operadores espaciais, bem como interfaces para as consultas, envolvendo mapas e dados textuais, no contexto da informação ambiental para a biodiversidade. Como contribuição final, esta análise foi validada pelo desenvolvimento do módulo Species Mapper do SINBIOTASP, que permite o processamento via Web de consultas sobre coletas e distribuição de espécies. / Abstract: SINBIOTASP is the biodiversity information system being developed as part of the BIOTA/FAPESP program. This thesis is focused in the implementation issues of the query processing of the SINBIOTASP system. This subject presents many challenges in the formulation and the processing of the queries, due to the variety and the volume of the data and to the wide range of system user profiles. The main contributions of this work are: a survey of the query processing features of many environmental information systems on the Web; a systematization of the query types which are typical of biodiversity application, considering processing and interface criteria; and specification of a basic set of spatial operators, as well general query interfaces, involving maps and textual data, in the context of biodiversity environmental information systems. As a final contribution, this analysis was validated by the development of the Species Mapper module of SINBIOTASP, which allows Web query processing on collection and distribution of species. / Mestrado / Mestre em Ciência da Computação