La biogenèse des ribosomes est un processus hautement complexe impliquant plusieurs centaines de facteurs de synthèse dont la finalité est la production de toutes les protéines de la cellule. Chaque étapes de la ribogenèse est une source potentielle d’erreur et est vérifiée par des mécanismes de contrôle de qualité redondants et rigoureux. <p><p>Dans la première partie de ma thèse, j’ai collaboré à une meilleure compréhension d’une des voies de la surveillance nucléolaire, celle qui dégrade les pré-ribosomes défectueux recrutée à partir de l’extrémité 3’ des ARN ribosomiques (ARNr). Suite à une erreur d’assemblage, les pré-ARNr sont polyadénylés par le complexe nucléaire TRAMP, ce dernier est recruté cotranscriptionnellement. Les ARNr polyadénylés deviennent alors des substrats pour l’exosome et sont dégradés. <p><p>On ignore comment la synthèse des ARNr, leur maturation et la surveillance nucléolaire sont intégrées mais on suspecte l’existence d’une interface physico-fonctionnelle à l’ADNr. Dans une deuxième partie de ce travail, nous avons testé si des cofacteurs de l’exosome, les protéines Nrd1/Nab3 étaient impliquées dans la surveillance des pré-ARNr. Nous rapportons que, chez la levure S. cerevisiae, le facteur d’élongation Spt5 interagit avec l’ARN polymérase (Pol) I et avec Nrd1. L’interaction entre Spt5 et ces deux protéines requiert la présence d’un domaine particulier situé à l’extrémité C-terminal ressemblant au « Carboxy-terminal domain » (CTD) de la Pol II appelé « Carboxy terminal repeat » (CTR). Spt4/Spt5 et Nrd1/Nab3 interagissent fonctionnellement avec Rrp6, sous-unité catalytique de l’exosome. Ces complexes colocalisent à l’ADNr, comme déterminé par ChIP. Des mutations dans le domaine de liaison à l’ARN (RRM – « RNA recognition motif ») de Nrd1 mais pas dans son domaine de liaison au CTD (CID – « carboxy-terminal interacting domain ») de la Pol II et dans le RRM de Nab3 mènent à l’accumulation de transcrits ribosomiques aberrants polyadénylés. Ceci indique que Nrd1/Nab3 contribue au recrutement de la surveillance nucléolaire à la Pol en cours d’élongation pour « scruter » les transcrits ribosomiques naissants. <p><p>Nous proposons un modèle dans lequel Nrd1/Nab3 sont recrutées à la machinerie d’élongation de la transcription via leur interaction avec Spt5 afin de surveiller la synthèse des transcrits ribosomiques. Si un problème dans la fabrication des transcrits naissants a lieu, des sites de liaison pour Nrd1/Nab3 sur les pré-ARNr normalement recouverts de facteurs de synthèse seraient dénudés. Ceci marquerait les transcrits ribosomiques aberrants et entrainerait leur dégradation par les machineries de dégradation TRAMP et exosome. <p> / Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Les médias sociaux sont créés et utilisés pour des activités variées menées individuellement ou de manière collaborative et exploitent différents outils et ressources. Les médias sociaux sont intrinsèquement contextuels; le contexte étant défini comme une activité spécifique menée dans un but particulier avec des ressources et des outils choisis, ainsi qu'avec des personnes sélectionnées. Ces contextes peuvent être répartis sur différentes plates-formes que les utilisateurs doivent exploiter conjointement ou entre lesquelles ils doivent échanger leurs données pour collaborer selon leurs besoins spécifiques. Chaque tâche qu'une personne accomplit est unique. Il est donc essentiel pour les utilisateurs de pouvoir personnaliser les espaces qu'ils exploitent dans les médias sociaux en fonction de leurs besoins spécifiques; non seulement en y ajoutant ou supprimant des ressources et en les partageant, mais aussi en modifiant la palette des outils disponibles et en adaptant la visualisation ou les fonctionnalités de l'interface. Cette thèse explore les challenges liés à la contextualisation, à la portabilité et à la personnalisation des médias réseaux en considérant les questions de recherche suivantes: Comment peut-on modéliser un contexte utilisateur dans les médias sociaux? Comment peut-on favoriser la portabilité: c'est-à-dire comment permettre l'accès à un même espace partagé depuis différents médias sociaux ou comment permettre le transfert d'un espace d'un média social à un autre? Comment peut-on permettre une personnalisation aisée d'un espace partagé? Dans la première partie de la thèse, le concept d'espacematérialisant un contexte utilisateur et représentant un environnent personnel est formellement défini. Ensuite, une extension du standard OpenSocial est proposée pour permettre la mise en ouvre du concept d'espace au moyen d'une spécification et d'une API (interface de programmation applicative). Finalement, une manière de construire des applicationsWeb contextuelles comme outils utilisateur s'adaptant au contexte est proposée. Dans la deuxième partie de la thèse, la notion de configuration d'espaces collaboratifs modulables basée sur un langage dédié est introduite. La manière de transférer des espaces partagés grâce à OpenSocial est démontrée. Ceci comprend la classification de différentes méthodes de migration et des scénarii de transfert d'espaces. De plus, le concept d'interface portable indépendante des plates-formes est proposé. Dans la troisième partie de la thèse, la plasticité en tant que mesure de la capacité d'une plate-forme à être personnalisée en fonction des besoins utilisateurs est définie. Ensuite, le concept d'enveloppe de personnalisation graphique et fonctionnelle des interfaces est proposé. Enfin, des solutions simples d'aggrégation de ressources distribuées en nuage et des mécanismes ouverts de partage trans-organisationnels sont développés.