Thesis (doctoral)--Joensuun yliopisto, 2004. / Includes bibliographical references (p. 174-181) and indexes.

Thesis (doctoral)--Joensuun yliopisto, 2004. / Includes bibliographical references (p. 174-181) and indexes.

The fish order Pleuronectiformes (flatfishes) include over 800 fish species, and are generally considered to be monophyletic. Phylogenetic relationships within the order remain largely unresolved, particularly for the Paralichthyidae, a very poorly defined family. In addition to the lack of consensus on intrarelationships within this order, flatfish diversification patterns are still poorly understood. Here we want to test the hypothesis that (i) a densely sampled phylogenetic tree will help to unravel the phylogenetic relationships within flatfish, and (ii) that the formation of the Isthmus of Panama has played a role in the diversification of flatfish, following their distribution in both oceans, Atlantic and Pacific. Maximum likelihood and Bayesian analyzes were performed on a dataset consisting of nine mitochondrial and nuclear loci on a set of 309 flatfish species. The heterogeneity of substitution rates, known to cause phylogenetic errors in large multigene alignments, can be corrected by data partitioning, or by using heterogeneous site models. Very few studies have compared the effects of using these approaches. We present a robust phylogenetic tree with different heterogeneous and well-supported models, and the intraordinal relationships of flatfish are discussed in light of these results. We present evidence for three new suborders within the flatfishes. The monophyletic status of most families is corroborated. The family Paralichthyidae and the family Poecilopsettidae were found to be polyphyletic. Heterogeneous models have not been able to solve the deeper relationships between flatfish. We also show that flatfish diversification occurred in a few families in at least two stages, related to distinct geological events.

O objetivo do presente estudo foi avaliar, quantitativa e qualitativamente, por meio de microtomografia computadorizada, o percentual de volume e de redução de debris dentinários acumulados (DDA) no sistema de canais radiculares com istmos de raízes mesiais de molares inferiores submetidos à: irrigação por pressão apical positiva; irrigação ultrassônica passiva; finalização do preparo com Self-Adjusting File e finalização do preparo com XP-endo Finisher. Quarenta raízes mesiais de molares inferiores, com curvatura moderada, e presença de dois canais mesiais com istmo único e contínuo verificada por escaneamento em microtomográfo, foram selecionadas. Os canais foram preparados pela técnica de instrumentação reciprocante (WaveOne Small e Primary). Em seguida, a composição dos grupos experimentais foi realizada por meio da técnica de amostragem estratificada, de acordo com o protocolo de irrigação final ou de finalização de preparo biomecânico, em quatro grupos (n=10): Pressão Apical Positiva (PAP), Irrigação Ultrassônica Ativa (IUP), Self-Adjusting File (SAF), e a XP-endo Finisher (XPF). Os protocolos foram realizados durante 2 minutos com 5,5 mL de hipoclorito de sódio a 2,5%. Os espécimes foram submetidos aos exames microtomográfico inicial, após o preparo e após os protocolos de irrigação final ou de finalização do preparo para análise de DDA. A porcentagem de volume e redução de DDA após os protocolos de irrigação final ou de finalização do preparo biomecânico foram comparados estatisticamente entre os grupos por meio de ANOVA e pós-teste de Tukey, com nível de significância de 5%. Foi possível observar redução de DDA após os protocolos de irrigação final e de finalização do preparo biomecânico em todos os grupos avaliados. Os grupos IUP e XPF apresentaram as menores médias de volume e de percentual de volume (%vol) de DDA (0,05±0,06mm³ e 0,61±0,75%; e 0,08±0,09mm³ e 0,81±1,03%, respectivamente) comparados aos grupos PAP e SAF (0,36±0,13mm³ e 3,73±1,59%; e 0,47±0,23mm³ e 4,31±1,87%, respectivamente) (p<0,05). Ainda, o percentual de redução de DDA foi maior nos grupos IUP e XPF (94,05±7,21% e 89,67±10,96%, respectivamente) quando comparados aos grupos PAP e SAF (45,74±15,76% e 41,26±9,96%, respectivamente) (p<0,05). Não houve diferença estatística entre os grupos IUP e XPF; e entre os grupos PAP e SAF (p>0,05). Qualitativamente, os DDA remanescentes foram localizados principalmente no terço apical após o protocolo com IUP; no terço cervical após protocolo com XPF e nos terços médio e apical após protocolos com PAP e SAF. Conclui-se que os protocolos de irrigação ultrassônica passiva e de finalização do preparo com XP-endo Finisher apresentaram maiores remoções de debris dentinários do sistema de canais radiculares com istmos comparados aos protocolos de irrigação por pressão apical positiva e de finalização de preparo com SAF. / The aim of this study was to evaluate, quantitatively and qualitatively, the percent volume and percent reduction of accumulated hard-tissue debris (AHTD) from root canal system with isthmuses of mesial roots of mandibular molars subjected to different final irrigation and final shaping protocols, using micro-computed tomography (micro-CT) analysis. Forty mesial roots of mandibular molars with moderate curvature and two mesial canals with a single and continuous isthmus detected by micro-CT scanning were selected. The canals were prepared by reciprocating instrumentation technique (WaveOne Small and Primary). Then, the composition of the experimental groups was performed by a stratified sampling method, resulting in four groups (n=10), according to the final irrigation or final shaping protocol: Apical Positive Pressure (APP), Passive Ultrasonic Irrigation (PUI), Self-adjusting File (SAF) and XP-endo Finisher (XPF). The protocols were performed with 5.5 mL of 2.5% NaOCl per canal during 2 minutes. The specimens were subjected to preoperative and following preparation, final irrigation or final shaping micro-CT scanning for AHTD analysis. The percent volume and percent reduction of AHTD after final irrigation or final shaping were statistically compared among groups using ANOVA and post hoc Tukey test with a 5% significance level. It was observed a reduction in the percentage of AHTD after final irrigation or final shaping in all groups. The PUI and XPF groups showed the lowest mean of volume and percent volume (%vol) of AHTD (0.05±0.06mm³ and 0.61±0.75%; and 0.08±0.09mm³ and 0.81±1.03%, respectively) when compared with APP and SAF groups (0.36±0.13mm³ and 3.73±1.59%; and 0.47±0.23mm³ and 4.31±1.87%, respectively) (p<0.05). Furthermore, the percent reduction of AHTD was greater in PUI and XPF groups (94.05±7.21% and 89.67±10.96%, respectively) compared with APP and SAF groups (45.74±15.76% and 41.26±9.96%, respectively) (p<0.05). No statistically significant differences were found when comparing PUI and XPF groups or APP and SAF groups (p>0.05). Qualitatively, the remaining DDA were mainly located in the apical third after the protocol with IUP; the cervical third after protocol XPF and in the middle and apical thirds after protocols PAP and SAF. It may be concluded that the passive ultrasound irrigation and final shaping with XP-endo Finisher protocols showed greater AHTD reduction from root canal system with isthmuses of mesial roots of mandibular molars than apical positive pressure and final shaping with SAF.

O objetivo deste estudo foi avaliar, por meio de imagens obtidas a partir da microtomografia computadorizada (micro-ct), a morfologia interna de canais radiculares distais de molares inferiores. Cem imagens de raízes distais de primeiros e segundos molares inferiores foram obtidas com os microtomógrafos (Skyscan 1176 e 1174, Bélgica) utilizando uma resolução de 18.1&#x3BC;m. Após, a reconstrução das imagens foram feitos os modelos 3D com ajuda da ferramenta CTan e CTvol para a visualização e padronização segundo a classificação de Vertucci. Os seguintes parâmetros foram estudados: classificação morfológica, prevalência do canal principal e ramificações, classificação e prevalência de istmos, forma dos canais, diâmetro apical por meio das distâncias mesiodistais e vestibulolinguais e avaliação do volume apical. Para a avaliação do número, forma dos canais e a presença de istmos foi feito um registro de 9 cortes de cada imagem desde 1,0 até 5,0 mm apicais, considerando 0,5 mm aquém do comprimento real do canal. Para fazer a mensuração do diâmetro mesiodistal e vestibulolingual foi alinhada cada imagem por meio do programa DataViewer e depois foram feitas as anotações das medidas dos canais nos 5,0 mm apicais. O volume apical foi calculado de acordo com a ferramenta 3D Analysis do software CTan. Os resultados foram submetidos ao análise descritiva com o cálculo da porcentagem de ocorrência. Os resultados mostraram que a morfologia do canal mais prevalente foi a tipo I de Vertucci (76%), seguida do tipo V de Vertucci (11%). A forma do canal mais comum foi a circular de 1,0 a 3,5 mm, seguido pela oval de 4,0 a 5,0 mm. A presença de um canal único foi a mais prevalente nos níveis de 1,0 a 5,0 mm. O istmo mais observado foi o do tipo I de Hsu & Kim (86%) no nivel de 1,0 mm, seguido do tipo 5 (39%) a 5,0 mm. Na mensuração das distâncias, a vestibulolingual foi maior que a mesiodistal e o volume aumentou de apical para cervical. Conclui-se que nos canais distais a classificação de Vertucci mais comum foi a tipo I, seguida do tipo V; a presença de um canal único foi o mais prevalente tanto nos níveis de 1,0 como 5,0 mm; quanto a forma do canal, a circular foi a mais predominante desde 1,0 a 3,5 mm (65%), seguida pela forma oval em 4,0 a 5,0 mm (40%); a forma achatada foi a menos prevalente em todos os níveis. A presença de istmos mais observada foi a do tipo I, nos níveis de 1,0 a 5,0 mm. As medidas das distâncias vestibulo-linguais foram maiores em todos os níveis da raiz comparadas com as medidas mesio-distais, e o volume aumentou de apical para cervical. / The objective of this study to evaluate by means of images obtained from computed microtomography (micro-ct), the morphology of the distal root canals of mandibular molars. One hundred images of distal roots of first and second lower molars were obtained with the microtomography (Skyscan 1176 and 1174, Belgium) using a resolution of 18.1 &#x3BC;m. After the reconstruction of the images were analyzed with CTan and CTvol to viewing and standardization according to the classification of Vertucci. The following parameters were evaluated: morphological classification, prevalence the principal canals and ramifications, classification and prevalence isthmus, shape of the canals, through apical diameter mesio-distal and bucco-lingual interval and apical volume. For evaluation of the number, shape of the canals and the presence of isthmus were searched 9 sections of each image from apical 1.0 to 5.0 mm, 0.5 mm before the canals length. To measure mesio-distal and bucco-lingual diameter each image ranged up through DataViewer and then made notations of measurements of the canals in the apical 5.0 mm. The apical volume was calculated in according to the 3D Analysis. The results were subjected to descriptive analysis with the calculation of the percentage of occurrence. The results showed that the morphology the most prevalent was canal type I the Vertucci (76%), followed by type V the Vertucci (11%). The most common canal shape was circular 1.0 to 3.5 mm, followed by the oval in 4.0 mm to 5.0 mm. The presence of a single canal was the most prevalent in levels of 1.0 to 5.0 mm. The isthmus was the most frequently observed type I of the Hsu & Kim (86%) in the level of 1.0 mm, followed by type V (39%) to 5.0 mm. In the measurements of distances, the bucco-lingual was greater than the mesio- distal and volume increased from apical to cervical. The most common Vertuccis classification of the distal canal was the type I, followed by type V; the presence of a single canal was the most prevalent in the levels of 1.0 to 5.0 mm; in the shape of canal, the circular shape was the most common from 1.0 to 3.5 mm (65%), followed by oval shape at 4.0 to 5.0 mm (40%), the flattened shape was less frequent in all levels. The presence of isthmuses most observed was the type I, at levels of 1.0 to 5.0 mm. The measures of bucco-lingual interval were greater at all levels of the root compared to mesio-distal measures, and the volume increased from apical to cervical.

In cattle, the oviduct plays an important role in the reproductive process. Oviductal secretions characterize the environment where storage and sperm capacitation, fertilization, and early embryo development take place. Because molecular control of bovine oviduct receptivity is poorly understood, this Thesis proposed a model of receptivity based on the manipulation of pre-ovulatory follicle growth (POF) used to study the effects of periovulatory endocrine profile on oviductal physiology. Growth of POF in Nelore cows (Bos indicus) was manipulated to produce two groups: cows with large POF and large corpus luteum (LF-LCL; higher fertility) and cows with small POF and small CL (SF-SCL; Lower fertility). Ampulla and isthmus samples were collected on day 4 after induction of ovulation with GnRH. In the first study, the transcriptome of the ipsilateral to CL ampulla and isthmus was determined by RNAseq, the regional expression of genes was studied by qPCR, and the distribution of the PGR and ER proteins was assessed by immunohistochemistry. Greater abundance of PGR and ER was found in the oviduct of the LF-LCL animals indicating that there is a greater availability of receptors and, possibly, of signaling-mechanisms stimulated by steroids in both oviductal regions. The transcripts profile showed enriched oviductal functional characteristics that could affect its embryo receptivity. These characteristics include changes in morphology i.e. branching morphogenesis, and changes in cell functioning i.e. cell secretion, that were enriched in the LF-LCL group. In the second study, after morphological analyses, it was concluded that the ampulla of the LF-LCL animals presented more primary folds, a larger perimeter of the luminal epithelium, and a higher proportion of secretory and proliferating cells, when compared to SF-SCL group. There was no difference in isthmus morphology between groups. In the third study, the extracellular matrix remodeling was reserched. It was concluded that in the isthmus region of the LF-LCL animals, there is less type 1 collagen fibers and greater abundance of proteins involved in extracellular matrix remodeling. In the fourth study, it was determined that the periovulatory endocrine milieu affects the expression of components of the microRNAs biosynthesis pathway and the microRNAs profile, both different between groups. Finally, in the fifth study, 205 metabolites were quantified in the oviductal fluid and 37 were found to be in different concentrations when both groups were compared. It was concluded that oviduct of cows of higher fertility presents a profile of transcripts, proteins, and metabolites that is associated with morphological and functional characteristics favorable to the survival and development of the embryo. / Em fêmeas bovinas, o oviduto apresenta um importante papel no processo reprodutivo. As secreções ovidutais representam o ambiente onde ocorrem o armazenamento e a capacitação espermática, a fecundação e o desenvolvimento embrionário inicial. O controle molecular da receptividade do oviduto em bovinos é pouco conhecido. Na presente tese, empregou-se um modelo de receptividade baseado na manipulação do crescimento do folículo pré-ovulatório (FPO) para o estudo dos efeitos do perfil endócrino periovulatório na fisiologia do oviduto. O crescimento do FPO de vacas Nelore (Bos indicus) foi manipulado com o objetivo de produzir dois grupos: vacas com FPO e corpo lúteo (CL) grandes (FG-CLG; maior fertilidade) e vacas com FPO e CL pequenos (FP-CLP; menor fertilidade). Amostras da ampola e istmo foram coletadas no dia 4 após da indução da ovulação com GnRH. No primeiro estudo, o transcriptoma da ampola e istmo do lado ipsolateral ao CL foi determinado por RNAseq, à expressão gênica regional e a distribuição das proteínas PGR e ER foram analisadas por qPCR e imunohistoquímica, respectivamente. Houve maior abundância de PGR e ER no oviduto dos animais do grupo FG-CLG, o que indica uma maior disponibilidade de receptores e possivelmente, de mecanismos intracelulares de sinalização estimulados pelos esteroides em ambas as regiões. O perfil global de transcritos mostrou enriquecimento de características funcionais do oviduto que poderiam afetar sua receptividade ao embrião. Tais características incluem mudanças morfológicas, como a ramificação morfogênica, e celulares, como a secreção, que foram aumentadas no grupo FG-CLG. No segundo estudo, após analisarem-se características morfológicas dos tecidos, concluiu-se que a ampola dos animais FG-CLG apresentou maior número de pregas primárias, maior perímetro do epitélio luminal, e maior proporção de células secretoras e de células em proliferação quando comparado aos animais do grupo FP-CLP. Não houve diferença na morfologia do istmo entre os grupos. No terceiro estudo, foi analisado o processo de remodelamento de matriz extracelular. Concluiu-se que no istmo dos animais do grupo FG-CLG existe menor quantidade de fibras de colágeno tipo 1 e maior abundância de proteínas envolvidas no remodelamento de matriz. No quarto estudo, determinou-se que o perfil endócrino periovulatório afeta a expressão de componentes da via de biossíntese e o perfil de microRNAs, que são diferentes entre os grupos. Finalmente, no quinto estudo, foram quantificados 205 metabólitos no fluido ovidutal dos animais. Destes, 37 encontram-se em concentrações diferentes entre os grupos. Concluiu-se que o oviduto de vacas de maior fertilidade apresenta um perfil de transcritos, proteínas e metabólitos que está associado a características morfológicas e funcionais favoráveis à sobrevivência e desenvolvimento do embrião.

This Ph.D. dissertation integrates stable isotope and trace element geochemistry in modern and fossil gastropod shells to study low-latitude marine paleoenvironments. First, stable isotopes (delta18O and delta13C) and Sr/Ca ratios are used to examine low-latitude temperature and salinity variations recorded in Plio-Pleistocene (3.5-1.6 Ma) fossils from western Florida during periods of high-latitude warming and "global" cooling. The middle Pliocene Pinecrest Beds (Units 7 and 4) and the overlaying Plio-Pleistocene Caloosahatchee Formation generate significantly different delta18O-derived paleotemperatures but identical Sr/Ca ratios. High delta18O values, together with low delta13C values and brackish fauna, indicate that Unit 4 was deposited in a lagoonal environment similar to modern Florida Bay. In contrast, relatively low delta18O and high delta13C values in Unit 7 and Caloosahatchee Formation represent deposition in an open-marine environment. The observed Unit 7 and Caloosahatchee paleotemperatures are inconsistent with middle Pliocene warming event, but consistent with the Plio-Pleistocene cooling trend. To quantify modern upwelling and freshening signals and contrast these signals between the tropical eastern Pacific (TEP) and southwestern Caribbean (SWC), methodologies are developed for reconstructing seasonal upwelling and freshening patterns from modern tropical gastropod shells from Panama using: 1) paired oxygen and carbon isotopic profiles and delta18O-delta13C (delta-delta) correlations, and 2) deviation from baseline delta18O values that represent conditions free of seasonal upwelling or freshening influences. Shell delta18O values normalized to the baseline faithfully record modern conditions of little or no upwelling in SWC and Gulf of Chiriqui, and strong upwelling in the Gulf of Panama, as well as strong freshwater input in most areas. The baseline and delta-delta methods are applied to identify and quantify changes in upwelling and freshening in the Neogene TEP and SWC seawaters associated with the final closure of Central American Isthmus. The records reveal significant upwelling in late Miocene SWC and mid Pliocene TEP waters, strong freshening in SWC waters from 5.7-2.2 Ma, and minimal seasonal upwelling and/or freshening variations in Plio-Pleistocene SWC waters. The reconstructed paleotemperatures agree with the global cooling trend through the late Miocene, but lack evidence for middle Pliocene warming or late Neogene global cooling.

O objetivo do presente estudo foi avaliar, quantitativa e qualitativamente, por meio de microtomografia computadorizada, o percentual de volume e de redução de debris dentinários acumulados (DDA) no sistema de canais radiculares com istmos de raízes mesiais de molares inferiores submetidos à: irrigação por pressão apical positiva; irrigação ultrassônica passiva; finalização do preparo com Self-Adjusting File e finalização do preparo com XP-endo Finisher. Quarenta raízes mesiais de molares inferiores, com curvatura moderada, e presença de dois canais mesiais com istmo único e contínuo verificada por escaneamento em microtomográfo, foram selecionadas. Os canais foram preparados pela técnica de instrumentação reciprocante (WaveOne Small e Primary). Em seguida, a composição dos grupos experimentais foi realizada por meio da técnica de amostragem estratificada, de acordo com o protocolo de irrigação final ou de finalização de preparo biomecânico, em quatro grupos (n=10): Pressão Apical Positiva (PAP), Irrigação Ultrassônica Ativa (IUP), Self-Adjusting File (SAF), e a XP-endo Finisher (XPF). Os protocolos foram realizados durante 2 minutos com 5,5 mL de hipoclorito de sódio a 2,5%. Os espécimes foram submetidos aos exames microtomográfico inicial, após o preparo e após os protocolos de irrigação final ou de finalização do preparo para análise de DDA. A porcentagem de volume e redução de DDA após os protocolos de irrigação final ou de finalização do preparo biomecânico foram comparados estatisticamente entre os grupos por meio de ANOVA e pós-teste de Tukey, com nível de significância de 5%. Foi possível observar redução de DDA após os protocolos de irrigação final e de finalização do preparo biomecânico em todos os grupos avaliados. Os grupos IUP e XPF apresentaram as menores médias de volume e de percentual de volume (%vol) de DDA (0,05±0,06mm³ e 0,61±0,75%; e 0,08±0,09mm³ e 0,81±1,03%, respectivamente) comparados aos grupos PAP e SAF (0,36±0,13mm³ e 3,73±1,59%; e 0,47±0,23mm³ e 4,31±1,87%, respectivamente) (p<0,05). Ainda, o percentual de redução de DDA foi maior nos grupos IUP e XPF (94,05±7,21% e 89,67±10,96%, respectivamente) quando comparados aos grupos PAP e SAF (45,74±15,76% e 41,26±9,96%, respectivamente) (p<0,05). Não houve diferença estatística entre os grupos IUP e XPF; e entre os grupos PAP e SAF (p>0,05). Qualitativamente, os DDA remanescentes foram localizados principalmente no terço apical após o protocolo com IUP; no terço cervical após protocolo com XPF e nos terços médio e apical após protocolos com PAP e SAF. Conclui-se que os protocolos de irrigação ultrassônica passiva e de finalização do preparo com XP-endo Finisher apresentaram maiores remoções de debris dentinários do sistema de canais radiculares com istmos comparados aos protocolos de irrigação por pressão apical positiva e de finalização de preparo com SAF. / The aim of this study was to evaluate, quantitatively and qualitatively, the percent volume and percent reduction of accumulated hard-tissue debris (AHTD) from root canal system with isthmuses of mesial roots of mandibular molars subjected to different final irrigation and final shaping protocols, using micro-computed tomography (micro-CT) analysis. Forty mesial roots of mandibular molars with moderate curvature and two mesial canals with a single and continuous isthmus detected by micro-CT scanning were selected. The canals were prepared by reciprocating instrumentation technique (WaveOne Small and Primary). Then, the composition of the experimental groups was performed by a stratified sampling method, resulting in four groups (n=10), according to the final irrigation or final shaping protocol: Apical Positive Pressure (APP), Passive Ultrasonic Irrigation (PUI), Self-adjusting File (SAF) and XP-endo Finisher (XPF). The protocols were performed with 5.5 mL of 2.5% NaOCl per canal during 2 minutes. The specimens were subjected to preoperative and following preparation, final irrigation or final shaping micro-CT scanning for AHTD analysis. The percent volume and percent reduction of AHTD after final irrigation or final shaping were statistically compared among groups using ANOVA and post hoc Tukey test with a 5% significance level. It was observed a reduction in the percentage of AHTD after final irrigation or final shaping in all groups. The PUI and XPF groups showed the lowest mean of volume and percent volume (%vol) of AHTD (0.05±0.06mm³ and 0.61±0.75%; and 0.08±0.09mm³ and 0.81±1.03%, respectively) when compared with APP and SAF groups (0.36±0.13mm³ and 3.73±1.59%; and 0.47±0.23mm³ and 4.31±1.87%, respectively) (p<0.05). Furthermore, the percent reduction of AHTD was greater in PUI and XPF groups (94.05±7.21% and 89.67±10.96%, respectively) compared with APP and SAF groups (45.74±15.76% and 41.26±9.96%, respectively) (p<0.05). No statistically significant differences were found when comparing PUI and XPF groups or APP and SAF groups (p>0.05). Qualitatively, the remaining DDA were mainly located in the apical third after the protocol with IUP; the cervical third after protocol XPF and in the middle and apical thirds after protocols PAP and SAF. It may be concluded that the passive ultrasound irrigation and final shaping with XP-endo Finisher protocols showed greater AHTD reduction from root canal system with isthmuses of mesial roots of mandibular molars than apical positive pressure and final shaping with SAF.

O objetivo deste estudo foi avaliar, por meio de imagens obtidas a partir da microtomografia computadorizada (micro-ct), a morfologia interna de canais radiculares distais de molares inferiores. Cem imagens de raízes distais de primeiros e segundos molares inferiores foram obtidas com os microtomógrafos (Skyscan 1176 e 1174, Bélgica) utilizando uma resolução de 18.1&#x3BC;m. Após, a reconstrução das imagens foram feitos os modelos 3D com ajuda da ferramenta CTan e CTvol para a visualização e padronização segundo a classificação de Vertucci. Os seguintes parâmetros foram estudados: classificação morfológica, prevalência do canal principal e ramificações, classificação e prevalência de istmos, forma dos canais, diâmetro apical por meio das distâncias mesiodistais e vestibulolinguais e avaliação do volume apical. Para a avaliação do número, forma dos canais e a presença de istmos foi feito um registro de 9 cortes de cada imagem desde 1,0 até 5,0 mm apicais, considerando 0,5 mm aquém do comprimento real do canal. Para fazer a mensuração do diâmetro mesiodistal e vestibulolingual foi alinhada cada imagem por meio do programa DataViewer e depois foram feitas as anotações das medidas dos canais nos 5,0 mm apicais. O volume apical foi calculado de acordo com a ferramenta 3D Analysis do software CTan. Os resultados foram submetidos ao análise descritiva com o cálculo da porcentagem de ocorrência. Os resultados mostraram que a morfologia do canal mais prevalente foi a tipo I de Vertucci (76%), seguida do tipo V de Vertucci (11%). A forma do canal mais comum foi a circular de 1,0 a 3,5 mm, seguido pela oval de 4,0 a 5,0 mm. A presença de um canal único foi a mais prevalente nos níveis de 1,0 a 5,0 mm. O istmo mais observado foi o do tipo I de Hsu & Kim (86%) no nivel de 1,0 mm, seguido do tipo 5 (39%) a 5,0 mm. Na mensuração das distâncias, a vestibulolingual foi maior que a mesiodistal e o volume aumentou de apical para cervical. Conclui-se que nos canais distais a classificação de Vertucci mais comum foi a tipo I, seguida do tipo V; a presença de um canal único foi o mais prevalente tanto nos níveis de 1,0 como 5,0 mm; quanto a forma do canal, a circular foi a mais predominante desde 1,0 a 3,5 mm (65%), seguida pela forma oval em 4,0 a 5,0 mm (40%); a forma achatada foi a menos prevalente em todos os níveis. A presença de istmos mais observada foi a do tipo I, nos níveis de 1,0 a 5,0 mm. As medidas das distâncias vestibulo-linguais foram maiores em todos os níveis da raiz comparadas com as medidas mesio-distais, e o volume aumentou de apical para cervical. / The objective of this study to evaluate by means of images obtained from computed microtomography (micro-ct), the morphology of the distal root canals of mandibular molars. One hundred images of distal roots of first and second lower molars were obtained with the microtomography (Skyscan 1176 and 1174, Belgium) using a resolution of 18.1 &#x3BC;m. After the reconstruction of the images were analyzed with CTan and CTvol to viewing and standardization according to the classification of Vertucci. The following parameters were evaluated: morphological classification, prevalence the principal canals and ramifications, classification and prevalence isthmus, shape of the canals, through apical diameter mesio-distal and bucco-lingual interval and apical volume. For evaluation of the number, shape of the canals and the presence of isthmus were searched 9 sections of each image from apical 1.0 to 5.0 mm, 0.5 mm before the canals length. To measure mesio-distal and bucco-lingual diameter each image ranged up through DataViewer and then made notations of measurements of the canals in the apical 5.0 mm. The apical volume was calculated in according to the 3D Analysis. The results were subjected to descriptive analysis with the calculation of the percentage of occurrence. The results showed that the morphology the most prevalent was canal type I the Vertucci (76%), followed by type V the Vertucci (11%). The most common canal shape was circular 1.0 to 3.5 mm, followed by the oval in 4.0 mm to 5.0 mm. The presence of a single canal was the most prevalent in levels of 1.0 to 5.0 mm. The isthmus was the most frequently observed type I of the Hsu & Kim (86%) in the level of 1.0 mm, followed by type V (39%) to 5.0 mm. In the measurements of distances, the bucco-lingual was greater than the mesio- distal and volume increased from apical to cervical. The most common Vertuccis classification of the distal canal was the type I, followed by type V; the presence of a single canal was the most prevalent in the levels of 1.0 to 5.0 mm; in the shape of canal, the circular shape was the most common from 1.0 to 3.5 mm (65%), followed by oval shape at 4.0 to 5.0 mm (40%), the flattened shape was less frequent in all levels. The presence of isthmuses most observed was the type I, at levels of 1.0 to 5.0 mm. The measures of bucco-lingual interval were greater at all levels of the root compared to mesio-distal measures, and the volume increased from apical to cervical.

In cattle, the oviduct plays an important role in the reproductive process. Oviductal secretions characterize the environment where storage and sperm capacitation, fertilization, and early embryo development take place. Because molecular control of bovine oviduct receptivity is poorly understood, this Thesis proposed a model of receptivity based on the manipulation of pre-ovulatory follicle growth (POF) used to study the effects of periovulatory endocrine profile on oviductal physiology. Growth of POF in Nelore cows (Bos indicus) was manipulated to produce two groups: cows with large POF and large corpus luteum (LF-LCL; higher fertility) and cows with small POF and small CL (SF-SCL; Lower fertility). Ampulla and isthmus samples were collected on day 4 after induction of ovulation with GnRH. In the first study, the transcriptome of the ipsilateral to CL ampulla and isthmus was determined by RNAseq, the regional expression of genes was studied by qPCR, and the distribution of the PGR and ER proteins was assessed by immunohistochemistry. Greater abundance of PGR and ER was found in the oviduct of the LF-LCL animals indicating that there is a greater availability of receptors and, possibly, of signaling-mechanisms stimulated by steroids in both oviductal regions. The transcripts profile showed enriched oviductal functional characteristics that could affect its embryo receptivity. These characteristics include changes in morphology i.e. branching morphogenesis, and changes in cell functioning i.e. cell secretion, that were enriched in the LF-LCL group. In the second study, after morphological analyses, it was concluded that the ampulla of the LF-LCL animals presented more primary folds, a larger perimeter of the luminal epithelium, and a higher proportion of secretory and proliferating cells, when compared to SF-SCL group. There was no difference in isthmus morphology between groups. In the third study, the extracellular matrix remodeling was reserched. It was concluded that in the isthmus region of the LF-LCL animals, there is less type 1 collagen fibers and greater abundance of proteins involved in extracellular matrix remodeling. In the fourth study, it was determined that the periovulatory endocrine milieu affects the expression of components of the microRNAs biosynthesis pathway and the microRNAs profile, both different between groups. Finally, in the fifth study, 205 metabolites were quantified in the oviductal fluid and 37 were found to be in different concentrations when both groups were compared. It was concluded that oviduct of cows of higher fertility presents a profile of transcripts, proteins, and metabolites that is associated with morphological and functional characteristics favorable to the survival and development of the embryo. / Em fêmeas bovinas, o oviduto apresenta um importante papel no processo reprodutivo. As secreções ovidutais representam o ambiente onde ocorrem o armazenamento e a capacitação espermática, a fecundação e o desenvolvimento embrionário inicial. O controle molecular da receptividade do oviduto em bovinos é pouco conhecido. Na presente tese, empregou-se um modelo de receptividade baseado na manipulação do crescimento do folículo pré-ovulatório (FPO) para o estudo dos efeitos do perfil endócrino periovulatório na fisiologia do oviduto. O crescimento do FPO de vacas Nelore (Bos indicus) foi manipulado com o objetivo de produzir dois grupos: vacas com FPO e corpo lúteo (CL) grandes (FG-CLG; maior fertilidade) e vacas com FPO e CL pequenos (FP-CLP; menor fertilidade). Amostras da ampola e istmo foram coletadas no dia 4 após da indução da ovulação com GnRH. No primeiro estudo, o transcriptoma da ampola e istmo do lado ipsolateral ao CL foi determinado por RNAseq, à expressão gênica regional e a distribuição das proteínas PGR e ER foram analisadas por qPCR e imunohistoquímica, respectivamente. Houve maior abundância de PGR e ER no oviduto dos animais do grupo FG-CLG, o que indica uma maior disponibilidade de receptores e possivelmente, de mecanismos intracelulares de sinalização estimulados pelos esteroides em ambas as regiões. O perfil global de transcritos mostrou enriquecimento de características funcionais do oviduto que poderiam afetar sua receptividade ao embrião. Tais características incluem mudanças morfológicas, como a ramificação morfogênica, e celulares, como a secreção, que foram aumentadas no grupo FG-CLG. No segundo estudo, após analisarem-se características morfológicas dos tecidos, concluiu-se que a ampola dos animais FG-CLG apresentou maior número de pregas primárias, maior perímetro do epitélio luminal, e maior proporção de células secretoras e de células em proliferação quando comparado aos animais do grupo FP-CLP. Não houve diferença na morfologia do istmo entre os grupos. No terceiro estudo, foi analisado o processo de remodelamento de matriz extracelular. Concluiu-se que no istmo dos animais do grupo FG-CLG existe menor quantidade de fibras de colágeno tipo 1 e maior abundância de proteínas envolvidas no remodelamento de matriz. No quarto estudo, determinou-se que o perfil endócrino periovulatório afeta a expressão de componentes da via de biossíntese e o perfil de microRNAs, que são diferentes entre os grupos. Finalmente, no quinto estudo, foram quantificados 205 metabólitos no fluido ovidutal dos animais. Destes, 37 encontram-se em concentrações diferentes entre os grupos. Concluiu-se que o oviduto de vacas de maior fertilidade apresenta um perfil de transcritos, proteínas e metabólitos que está associado a características morfológicas e funcionais favoráveis à sobrevivência e desenvolvimento do embrião.